MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 4939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016931	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016931	TGT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016931	ACA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016931	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016931	TAA	2	6	1034	1039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016931	TAA	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016931	CTT	2	6	6197	6202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016931	ATC	2	6	7112	7117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016931	AAG	2	6	7150	7155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016931	GCA	2	6	7182	7187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016931	TTA	3	9	7520	7528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016931	TAT	2	6	7610	7615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016931	CTT	2	6	7624	7629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016931	GGA	2	6	7647	7652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016931	GGA	2	6	7657	7662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016931	GCA	2	6	7673	7678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016931	AAG	2	6	7756	7761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016931	ATA	2	6	8276	8281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016931	ACA	2	6	8338	8343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016931	CTA	2	6	8379	8384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016931	TAT	2	6	8440	8445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016931	TGC	2	6	8467	8472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016931	TCT	2	6	8606	8611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016931	TCT	2	6	8690	8695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016931	AGC	2	6	8848	8853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016931	ATA	2	6	8876	8881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016931	AGT	2	6	11220	11225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016931	CTT	2	6	11233	11238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016931	AGT	2	6	11249	11254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016931	GAC	2	6	11272	11277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016931	ACT	2	6	11312	11317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016931	TAT	2	6	12520	12525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016931	ATT	2	6	12543	12548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016931	AAT	2	6	12570	12575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016931	AGC	2	6	12638	12643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016931	ATA	2	6	12661	12666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016931	TAT	2	6	15027	15032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016931	AAT	2	6	15896	15901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016931	CAA	2	6	16146	16151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016931	CGT	2	6	16222	16227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016931	TAT	2	6	16364	16369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016931	TCT	2	6	16467	16472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016931	ATT	2	6	16903	16908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016931	TAA	2	6	16939	16944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016931	ACC	2	6	17214	17219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_016931	TAC	2	6	17247	17252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016931	TAA	2	6	19184	19189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016931	ACT	2	6	19232	19237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016931	GTA	3	9	20755	20763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016931	TTG	2	6	20788	20793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016931	ACA	2	6	20943	20948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016931	GAT	2	6	20990	20995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016931	TAT	2	6	21522	21527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016931	CAA	2	6	22226	22231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016931	TAT	2	6	22283	22288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016931	ATT	3	9	22298	22306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016931	TAA	2	6	22344	22349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016931	ATT	2	6	22358	22363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016931	ATT	2	6	22377	22382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016931	TGA	2	6	22393	22398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016931	AGA	2	6	22445	22450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016931	AGA	2	6	22493	22498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016931	GCT	2	6	22563	22568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016931	TAT	2	6	22572	22577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016931	ATT	2	6	22582	22587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016931	TAA	2	6	22613	22618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016931	TAA	2	6	22641	22646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016931	ATT	2	6	22961	22966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016931	TAT	2	6	23017	23022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016931	TTA	2	6	23056	23061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016931	ATT	2	6	24331	24336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016931	AAC	2	6	24482	24487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016931	AAG	2	6	25568	25573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016931	CTT	2	6	25598	25603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016931	TAG	2	6	25608	25613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016931	TAA	2	6	26177	26182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016931	CAA	2	6	26321	26326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016931	TAG	2	6	26333	26338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016931	AAT	2	6	26356	26361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016931	TCA	2	6	29119	29124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016931	TTA	2	6	29158	29163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016931	TTA	2	6	29370	29375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016931	ATG	2	6	29529	29534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016931	TCA	2	6	29565	29570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016931	ATG	2	6	29571	29576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016931	AGA	2	6	29629	29634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016931	TTG	2	6	29706	29711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016931	TTG	2	6	29772	29777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016931	TTG	2	6	30017	30022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016931	TGA	2	6	30174	30179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016931	GCA	2	6	30250	30255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016931	AAT	2	6	30258	30263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016931	TAA	2	6	30487	30492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016931	GAA	2	6	30504	30509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016931	GTA	2	6	30659	30664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016931	CAA	2	6	30680	30685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016931	GTT	2	6	30689	30694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016931	TGC	2	6	30750	30755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016931	TAA	2	6	30780	30785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016931	GTT	2	6	30877	30882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016931	TAA	2	6	30944	30949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016931	AAT	2	6	30973	30978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016931	ACG	2	6	31086	31091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016931	GAA	2	6	31106	31111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016931	GAA	2	6	31154	31159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016931	AAT	2	6	31220	31225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016931	TCA	2	6	31264	31269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016931	TAG	2	6	31318	31323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016931	CTG	2	6	31420	31425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016931	GAA	2	6	31602	31607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016931	TGA	2	6	31634	31639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016931	TAA	2	6	31654	31659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016931	CGG	2	6	31682	31687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016931	ATA	2	6	31690	31695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016931	TAA	2	6	31713	31718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016931	AAG	2	6	31794	31799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016931	TAT	3	9	31852	31860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016931	TAT	2	6	31891	31896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016931	AAT	2	6	31897	31902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016931	AGC	2	6	31950	31955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016931	TTA	2	6	31989	31994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016931	GAA	3	9	32076	32084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016931	TAA	2	6	32120	32125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016931	ACT	2	6	32127	32132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016931	TAA	2	6	32667	32672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016931	TAA	2	6	32759	32764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016931	GTT	2	6	32949	32954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016931	ATG	3	9	32965	32973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016931	ACT	2	6	32992	32997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016931	AAG	2	6	33002	33007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016931	CAT	3	9	33018	33026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016931	GAT	2	6	33029	33034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016931	ACT	2	6	33044	33049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016931	ATG	3	9	33655	33663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016931	TAC	2	6	33664	33669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016931	TGC	2	6	35110	35115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016931	TGC	2	6	35203	35208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016931	ATT	2	6	35376	35381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016931	AGA	2	6	35565	35570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016931	TGA	2	6	35674	35679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016931	CAA	2	6	35682	35687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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