MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia massiliae str. AZT80 chromosome

Total Repeats: 14540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016931	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713088
2	NC_016931	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713088
3	NC_016931	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713088
4	NC_016931	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713088
5	NC_016931	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
6	NC_016931	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713088
7	NC_016931	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713088
8	NC_016931	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713088
9	NC_016931	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
10	NC_016931	TAA	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
11	NC_016931	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713088
12	NC_016931	ATA	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713089
13	NC_016931	TGA	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713089
14	NC_016931	GTA	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713089
15	NC_016931	CAA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713089
16	NC_016931	TAA	2	6	1448	1453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713089
17	NC_016931	TCT	2	6	1568	1573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713090
18	NC_016931	ATA	3	9	1832	1840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713090
19	NC_016931	GTA	2	6	1898	1903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713090
20	NC_016931	TGA	2	6	1998	2003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713090
21	NC_016931	GAA	2	6	2055	2060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713090
22	NC_016931	AAT	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713090
23	NC_016931	AAG	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713090
24	NC_016931	TTA	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713090
25	NC_016931	CAA	3	9	2203	2211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713090
26	NC_016931	CGG	2	6	2424	2429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379713091
27	NC_016931	AGC	2	6	2455	2460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713091
28	NC_016931	ATA	2	6	2500	2505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713091
29	NC_016931	ATA	2	6	2638	2643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713091
30	NC_016931	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713091
31	NC_016931	ATG	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713091
32	NC_016931	TAT	2	6	2919	2924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713091
33	NC_016931	TTA	2	6	2933	2938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713091
34	NC_016931	CTC	2	6	3130	3135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379713092
35	NC_016931	ATT	2	6	3141	3146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
36	NC_016931	ATT	2	6	3154	3159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
37	NC_016931	ATT	2	6	3267	3272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
38	NC_016931	AGA	2	6	3440	3445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
39	NC_016931	AGA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
40	NC_016931	AGC	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
41	NC_016931	TGC	2	6	3482	3487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713092
42	NC_016931	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
43	NC_016931	GAG	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
44	NC_016931	TGA	2	6	3784	3789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713092
45	NC_016931	TAT	2	6	3911	3916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
46	NC_016931	GCA	2	6	3939	3944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
47	NC_016931	AGA	2	6	4037	4042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
48	NC_016931	CTA	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713092
49	NC_016931	TAT	2	6	4188	4193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
50	NC_016931	TTA	2	6	4194	4199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
51	NC_016931	TGT	2	6	4214	4219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713092
52	NC_016931	GGA	2	6	4329	4334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
53	NC_016931	ATA	2	6	4408	4413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
54	NC_016931	GGT	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713092
55	NC_016931	GCA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
56	NC_016931	GGA	2	6	4760	4765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
57	NC_016931	GAA	2	6	4782	4787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
58	NC_016931	AAG	2	6	4813	4818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
59	NC_016931	AAT	2	6	4824	4829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
60	NC_016931	GAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
61	NC_016931	TAA	2	6	4850	4855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
62	NC_016931	GAG	2	6	4923	4928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713092
63	NC_016931	GTG	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379713092
64	NC_016931	AAG	2	6	5203	5208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
65	NC_016931	ACG	2	6	5212	5217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713092
66	NC_016931	ATA	2	6	5239	5244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
67	NC_016931	ATT	2	6	5290	5295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
68	NC_016931	TAA	2	6	5312	5317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
69	NC_016931	TGC	2	6	5369	5374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713092
70	NC_016931	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
71	NC_016931	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713092
72	NC_016931	CTA	2	6	5521	5526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713092
73	NC_016931	AGT	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713092
74	NC_016931	CGC	2	6	5584	5589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379713092
75	NC_016931	TTG	2	6	5620	5625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713092
76	NC_016931	TTA	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
77	NC_016931	ATA	2	6	5671	5676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
78	NC_016931	TAA	2	6	5740	5745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
79	NC_016931	ATA	2	6	5763	5768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
80	NC_016931	GAA	2	6	5769	5774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713092
81	NC_016931	ATA	2	6	5817	5822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713092
82	NC_016931	ATG	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713092
83	NC_016931	ATT	2	6	6008	6013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713092
84	NC_016931	GTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713093
85	NC_016931	CTT	2	6	6101	6106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379713093
86	NC_016931	GTT	2	6	6226	6231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713094
87	NC_016931	ATC	2	6	6429	6434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713094
88	NC_016931	ACA	2	6	6451	6456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713094
89	NC_016931	AGC	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713094
90	NC_016931	CTA	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713094
91	NC_016931	GTT	2	6	6635	6640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713094
92	NC_016931	TCA	2	6	6694	6699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713094
93	NC_016931	AGC	3	9	6732	6740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713094
94	NC_016931	ATT	2	6	6922	6927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713094
95	NC_016931	GCT	2	6	7867	7872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713095
96	NC_016931	GCA	2	6	7911	7916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379713095
97	NC_016931	ACA	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713095
98	NC_016931	GAT	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713095
99	NC_016931	GGA	2	6	7994	7999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379713095
100	NC_016931	TAA	2	6	8033	8038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713095
101	NC_016931	GAA	2	6	8039	8044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379713095
102	NC_016931	CAA	2	6	8097	8102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713095
103	NC_016931	ATA	2	6	8170	8175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713095
104	NC_016931	ATT	2	6	9000	9005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713096
105	NC_016931	CTA	2	6	9010	9015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713096
106	NC_016931	TAA	2	6	9182	9187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713096
107	NC_016931	ATA	2	6	9228	9233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713096
108	NC_016931	ATA	2	6	9352	9357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713096
109	NC_016931	ATT	2	6	9383	9388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713096
110	NC_016931	TAA	2	6	9406	9411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713096
111	NC_016931	ATT	2	6	9423	9428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713096
112	NC_016931	TTG	2	6	9496	9501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713097
113	NC_016931	ATG	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713097
114	NC_016931	ATT	2	6	9517	9522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713097
115	NC_016931	ACT	2	6	9556	9561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713097
116	NC_016931	CGG	2	6	9700	9705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379713097
117	NC_016931	TAA	2	6	9715	9720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713097
118	NC_016931	TAG	3	9	9738	9746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379713097
119	NC_016931	AAC	2	6	9864	9869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713097
120	NC_016931	ATC	2	6	9934	9939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713097
121	NC_016931	AAT	2	6	10163	10168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713097
122	NC_016931	TAT	2	6	10264	10269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713097
123	NC_016931	TGC	2	6	10417	10422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379713097
124	NC_016931	ATC	2	6	10450	10455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713097
125	NC_016931	TTA	2	6	10548	10553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713097
126	NC_016931	TAT	2	6	10587	10592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379713097
127	NC_016931	GTT	2	6	10738	10743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379713097
128	NC_016931	AAT	2	6	10820	10825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379713097
129	NC_016931	ATC	2	6	10879	10884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379713097
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131	NC_016931	AAC	2	6	10966	10971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379713097
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