MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Rickettsia philipii str. 364D chromosome

Total Repeats: 590

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016930	AAAGTA	2	12	1229	1240	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711744
2	NC_016930	CAAAAC	2	12	5070	5081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379711747
3	NC_016930	CAAAAT	2	12	5923	5934	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379711747
4	NC_016930	ACCGTA	2	12	7195	7206	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379711750
5	NC_016930	AAAGAC	2	12	10780	10791	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016930	AGAAAA	2	12	13742	13753	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379711757
7	NC_016930	ATTAAA	2	12	14918	14929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711759
8	NC_016930	TTTAAA	2	12	16515	16526	50 %	50 %	0 %	0 %	379711761
9	NC_016930	CTAATT	2	12	16564	16575	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379711761
10	NC_016930	CTATAT	2	12	17179	17190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379711761
11	NC_016930	ATTTAG	2	12	20749	20760	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379711763
12	NC_016930	ATTTAG	2	12	21901	21912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379711763
13	NC_016930	GCATTA	2	12	22884	22895	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379711763
14	NC_016930	TCCGAT	2	12	23001	23012	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379711763
15	NC_016930	AAATGC	2	12	23077	23088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711763
16	NC_016930	ATTTAA	2	12	23390	23401	50 %	50 %	0 %	0 %	379711763
17	NC_016930	AGAAAA	2	12	24394	24405	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379711764
18	NC_016930	CAAATA	2	12	25172	25183	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016930	TAAAGT	2	12	25335	25346	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016930	TTTAGG	2	12	26713	26724	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016930	CATATA	2	12	31775	31786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379711776
22	NC_016930	AATACA	2	12	35347	35358	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379711781
23	NC_016930	TTTTTG	2	12	35919	35930	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016930	AAGAAA	2	12	36834	36845	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016930	ATCTTT	2	12	39252	39263	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016930	ATATTA	2	12	43374	43385	50 %	50 %	0 %	0 %	379711789
27	NC_016930	AAAGCT	2	12	43558	43569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711789
28	NC_016930	ATTAAT	2	12	44120	44131	50 %	50 %	0 %	0 %	379711789
29	NC_016930	TTTTTA	2	12	45100	45111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379711791
30	NC_016930	AGTATT	2	12	49538	49549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016930	ATTGCT	2	12	53950	53961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711798
32	NC_016930	ATTTAT	2	12	54537	54548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711799
33	NC_016930	ATAAGG	2	12	54736	54747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379711799
34	NC_016930	AACACC	2	12	55258	55269	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016930	TCTTGG	2	12	56185	56196	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379711800
36	NC_016930	ATCAGA	2	12	58574	58585	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711805
37	NC_016930	AAAACA	2	12	62356	62367	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	379711807
38	NC_016930	ATAAAA	2	12	66716	66727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016930	TAATAT	2	12	67567	67578	50 %	50 %	0 %	0 %	379711814
40	NC_016930	CAGCAA	2	12	68236	68247	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379711815
41	NC_016930	ATAGTG	2	12	68567	68578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711815
42	NC_016930	AAAAAG	2	12	69395	69406	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379711815
43	NC_016930	TATAGT	2	12	72596	72607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379711819
44	NC_016930	GAAAGA	2	12	72677	72688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379711819
45	NC_016930	TACCCT	2	12	74239	74250	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379711822
46	NC_016930	ATCCTG	2	12	74261	74272	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379711822
47	NC_016930	AAAGCT	2	12	74680	74691	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711822
48	NC_016930	GTAATA	2	12	75319	75330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379711822
49	NC_016930	AGTAAA	2	12	83977	83988	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711831
50	NC_016930	TCAAAA	2	12	85582	85593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379711832
51	NC_016930	AAGGAC	2	12	85902	85913	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016930	CGTGAT	2	12	86869	86880	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379711834
53	NC_016930	TTGATT	2	12	89329	89340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379711835
54	NC_016930	GAAGCA	2	12	90421	90432	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379711836
55	NC_016930	TTTTAA	2	12	90694	90705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016930	TAAAAA	2	12	93426	93437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016930	TTTTTA	2	12	95796	95807	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379711841
58	NC_016930	CCTATA	2	12	100578	100589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711847
59	NC_016930	ACCTAT	2	12	100811	100822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711847
60	NC_016930	ACCGCT	2	12	102156	102167	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379711848
61	NC_016930	TCAAGA	2	12	111303	111314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379711854
62	NC_016930	TAGCGG	2	12	116789	116800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379711859
63	NC_016930	CTCAAT	2	12	120107	120118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016930	TATAAA	2	12	120610	120621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711863
65	NC_016930	TTTATT	2	12	122306	122317	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379711865
66	NC_016930	TAAAAT	2	12	126301	126312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711871
67	NC_016930	CTTTGT	2	12	133501	133512	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379711883
68	NC_016930	TTGCTA	2	12	135591	135602	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711884
69	NC_016930	AAGATA	2	12	135756	135767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711884
70	NC_016930	CTTTAG	2	12	135918	135929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711884
71	NC_016930	TTTAGT	2	12	136577	136588	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379711884
72	NC_016930	TAATGC	2	12	140282	140293	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379711886
73	NC_016930	AAAGAT	2	12	141105	141116	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711886
74	NC_016930	TAAAGA	2	12	141329	141340	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711886
75	NC_016930	TTTATC	2	12	154053	154064	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379711893
76	NC_016930	GATTTT	2	12	154347	154358	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379711894
77	NC_016930	TTTTGG	2	12	154802	154813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379711894
78	NC_016930	CTTTTG	2	12	156906	156917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379711896
79	NC_016930	GTAAAA	2	12	158230	158241	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711897
80	NC_016930	CAATAT	2	12	161107	161118	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016930	ATTGAG	2	12	161459	161470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379711902
82	NC_016930	CTTCAT	2	12	161685	161696	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379711902
83	NC_016930	TCAATT	2	12	163461	163472	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379711904
84	NC_016930	AAAGAA	2	12	164101	164112	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379711904
85	NC_016930	TCAAGC	2	12	164118	164129	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379711904
86	NC_016930	GTTGAG	2	12	164685	164696	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379711905
87	NC_016930	AAGTAA	2	12	166478	166489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711906
88	NC_016930	TTTTAA	2	12	167877	167888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016930	TAGAGC	2	12	169305	169316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379711911
90	NC_016930	AATTTA	2	12	171630	171641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016930	GAACAA	2	12	172827	172838	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379711915
92	NC_016930	TGCAGT	2	12	172970	172981	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379711915
93	NC_016930	ATAAAA	2	12	174244	174255	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379711915
94	NC_016930	TTTTTA	2	12	175307	175318	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379711916
95	NC_016930	CTGTAG	2	12	178333	178344	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379711921
96	NC_016930	TTAAAA	2	12	180586	180597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711922
97	NC_016930	GCTATT	2	12	182433	182444	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711922
98	NC_016930	TCCATG	2	12	189417	189428	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379711924
99	NC_016930	GATGTT	2	12	190442	190453	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379711925
100	NC_016930	AAAAAT	2	12	192919	192930	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379711928
101	NC_016930	AAGAAT	2	12	194730	194741	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379711928
102	NC_016930	CCCTAA	2	12	207226	207237	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379711941
103	NC_016930	TATTTA	2	12	208374	208385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016930	CTTTAG	2	12	211650	211661	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711944
105	NC_016930	ATATTT	2	12	212639	212650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379711944
106	NC_016930	GTTTCA	2	12	215937	215948	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379711948
107	NC_016930	AAAAGC	2	12	217113	217124	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379711949
108	NC_016930	TTTCTT	2	12	218563	218574	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379711951
109	NC_016930	TTTTCT	2	12	218583	218594	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379711951
110	NC_016930	AAATTA	2	12	219742	219753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379711953
111	NC_016930	AGTTAA	2	12	221684	221695	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379711954
112	NC_016930	TCATAA	2	12	223676	223687	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379711955
113	NC_016930	TAATAT	2	12	223781	223792	50 %	50 %	0 %	0 %	379711955
114	NC_016930	TAAATT	2	12	225377	225388	50 %	50 %	0 %	0 %	379711957
115	NC_016930	CACTAC	2	12	226883	226894	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016930	TCTGTC	2	12	231233	231244	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016930	AAAGCA	2	12	232924	232935	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379711969
118	NC_016930	CTTCTA	2	12	237962	237973	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379711974
119	NC_016930	ATCTCA	2	12	240729	240740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379711976
120	NC_016930	TTCTTT	2	12	242122	242133	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379711977
121	NC_016930	TACTTC	2	12	244448	244459	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379711981
122	NC_016930	TATTTT	2	12	253669	253680	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016930	CAATAT	2	12	253993	254004	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379711991
124	NC_016930	TAATTA	2	12	254594	254605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016930	GCACCG	2	12	261755	261766	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379712000
126	NC_016930	CTTTAA	2	12	262081	262092	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016930	AAATAA	2	12	262224	262235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016930	AAAATG	2	12	262290	262301	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016930	GCACCG	2	12	263555	263566	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	379712003
130	NC_016930	TTACTC	2	12	264470	264481	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379712005
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132	NC_016930	ATGACG	2	12	271014	271025	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_016930	ATTGCA	2	12	274317	274328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_016930	TTAAAG	2	12	277157	277168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379712016
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138	NC_016930	TAAAAT	2	12	283140	283151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016930	CCTGAA	2	12	284767	284778	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_016930	CCTGAA	2	12	291908	291919	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379712032
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144	NC_016930	TTTTGC	2	12	297514	297525	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379712038
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149	NC_016930	ATCTTT	2	12	306536	306547	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_016930	TTGTTC	2	12	306995	307006	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379712048
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233	NC_016930	TTGGCG	2	12	494477	494488	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
234	NC_016930	AAATTT	2	12	494525	494536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_016930	ATCAAA	2	12	500434	500445	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379712260
236	NC_016930	GGTGAT	2	12	503968	503979	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379712262
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238	NC_016930	ATCAGT	2	12	509307	509318	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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357	NC_016930	CCATCA	2	12	756928	756939	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379712524
358	NC_016930	TTAGGC	2	12	757249	757260	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379712524
359	NC_016930	TTTACT	2	12	758976	758987	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379712527
360	NC_016930	TATATT	2	12	764514	764525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
361	NC_016930	TAATGT	2	12	764696	764707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379712534
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370	NC_016930	TAACAT	2	12	782210	782221	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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382	NC_016930	AAATTT	2	12	809319	809330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_016930	ACCGCT	2	12	988705	988716	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379712778
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461	NC_016930	GCCATG	2	12	993140	993151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_016930	TGAAAT	2	12	994911	994922	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379712788
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464	NC_016930	TTTAAA	2	12	1000435	1000446	50 %	50 %	0 %	0 %	379712792
465	NC_016930	ATATCC	2	12	1001470	1001481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
466	NC_016930	ATTAGG	2	12	1007814	1007825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
467	NC_016930	AATTAT	2	12	1010494	1010505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_016930	ATCAAT	2	12	1011442	1011453	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
469	NC_016930	CATTGT	2	12	1012365	1012376	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
470	NC_016930	AATATG	2	12	1017278	1017289	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
471	NC_016930	CAAGCT	2	12	1027238	1027249	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379712813
472	NC_016930	TCTCAA	2	12	1028190	1028201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379712814
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474	NC_016930	TTACCG	2	12	1035115	1035126	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379712817
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