MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 1077

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016929	TAATA	2	10	672	681	60 %	40 %	0 %	0 %	379022405
2	NC_016929	TTTTA	2	10	2672	2681	20 %	80 %	0 %	0 %	379022408
3	NC_016929	TTATT	2	10	3023	3032	20 %	80 %	0 %	0 %	379022408
4	NC_016929	GGTCA	2	10	4305	4314	20 %	20 %	40 %	20 %	379022409
5	NC_016929	TTTAG	2	10	4574	4583	20 %	60 %	20 %	0 %	379022409
6	NC_016929	ATAAA	2	10	5508	5517	80 %	20 %	0 %	0 %	379022409
7	NC_016929	ATGGG	2	10	9291	9300	20 %	20 %	60 %	0 %	379022413
8	NC_016929	AGCAG	2	10	9623	9632	40 %	0 %	40 %	20 %	379022413
9	NC_016929	TTAAT	2	10	9766	9775	40 %	60 %	0 %	0 %	379022413
10	NC_016929	AGATA	2	10	10341	10350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016929	AAAGT	2	10	11745	11754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016929	ATTTT	2	10	12245	12254	20 %	80 %	0 %	0 %	379022416
13	NC_016929	TTTTA	2	10	12768	12777	20 %	80 %	0 %	0 %	379022416
14	NC_016929	AAAGA	2	10	15526	15535	80 %	0 %	20 %	0 %	379022418
15	NC_016929	AAGAA	2	10	15762	15771	80 %	0 %	20 %	0 %	379022418
16	NC_016929	AAGAA	2	10	15814	15823	80 %	0 %	20 %	0 %	379022418
17	NC_016929	AGATA	2	10	16108	16117	60 %	20 %	20 %	0 %	379022418
18	NC_016929	CCAAA	2	10	16277	16286	60 %	0 %	0 %	40 %	379022418
19	NC_016929	AAAAT	2	10	17427	17436	80 %	20 %	0 %	0 %	379022418
20	NC_016929	AGGAA	2	10	17794	17803	60 %	0 %	40 %	0 %	379022418
21	NC_016929	TAAAT	2	10	22319	22328	60 %	40 %	0 %	0 %	379022420
22	NC_016929	AATAA	2	10	24088	24097	80 %	20 %	0 %	0 %	379022424
23	NC_016929	CTATA	2	10	24496	24505	40 %	40 %	0 %	20 %	379022425
24	NC_016929	TAATA	2	10	24719	24728	60 %	40 %	0 %	0 %	379022425
25	NC_016929	TATCA	2	10	26388	26397	40 %	40 %	0 %	20 %	379022427
26	NC_016929	TATTT	2	10	27372	27381	20 %	80 %	0 %	0 %	379022427
27	NC_016929	ATTTA	2	10	27833	27842	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016929	TTATC	2	10	28165	28174	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016929	GATTG	2	10	28275	28284	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016929	ACCAT	2	10	29216	29225	40 %	20 %	0 %	40 %	379022428
31	NC_016929	AATAT	2	10	30355	30364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016929	ACGTT	2	10	30494	30503	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016929	TAATT	2	10	30618	30627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016929	TAAGT	2	10	33393	33402	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016929	TTTCA	2	10	34453	34462	20 %	60 %	0 %	20 %	379022434
36	NC_016929	ATTTT	2	10	35001	35010	20 %	80 %	0 %	0 %	379022434
37	NC_016929	TCTTT	2	10	37382	37391	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016929	TTTAA	2	10	37566	37575	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016929	TTGAT	2	10	38791	38800	20 %	60 %	20 %	0 %	379022435
40	NC_016929	ATATG	2	10	38984	38993	40 %	40 %	20 %	0 %	379022435
41	NC_016929	CTTTT	2	10	39472	39481	0 %	80 %	0 %	20 %	379022435
42	NC_016929	ATTAT	2	10	39891	39900	40 %	60 %	0 %	0 %	379022435
43	NC_016929	ACTTA	2	10	45504	45513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016929	TTGAT	2	10	46431	46440	20 %	60 %	20 %	0 %	379022442
45	NC_016929	TACCT	2	10	46846	46855	20 %	40 %	0 %	40 %	379022442
46	NC_016929	CATGA	2	10	46910	46919	40 %	20 %	20 %	20 %	379022442
47	NC_016929	TTTGT	2	10	50242	50251	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016929	AACTA	2	10	51669	51678	60 %	20 %	0 %	20 %	379022445
49	NC_016929	ACAAA	2	10	52334	52343	80 %	0 %	0 %	20 %	379022446
50	NC_016929	AAAAC	2	10	52452	52461	80 %	0 %	0 %	20 %	379022446
51	NC_016929	GATAA	2	10	52861	52870	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016929	TATAT	2	10	52955	52964	40 %	60 %	0 %	0 %	379022447
53	NC_016929	TGTTA	2	10	52992	53001	20 %	60 %	20 %	0 %	379022447
54	NC_016929	TTAAA	2	10	54065	54074	60 %	40 %	0 %	0 %	379022447
55	NC_016929	CCATA	2	10	57287	57296	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_016929	ATTTT	2	10	57322	57331	20 %	80 %	0 %	0 %	379022451
57	NC_016929	GGTAA	2	10	58350	58359	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016929	TTTCT	2	10	58470	58479	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016929	GGTTG	2	10	59763	59772	0 %	40 %	60 %	0 %	379022452
60	NC_016929	TTTAT	2	10	60138	60147	20 %	80 %	0 %	0 %	379022452
61	NC_016929	GCTTA	2	10	61316	61325	20 %	40 %	20 %	20 %	379022453
62	NC_016929	ACAAT	2	10	61668	61677	60 %	20 %	0 %	20 %	379022454
63	NC_016929	GTTAT	2	10	62293	62302	20 %	60 %	20 %	0 %	379022455
64	NC_016929	GTAGA	2	10	62599	62608	40 %	20 %	40 %	0 %	379022455
65	NC_016929	GCTAT	2	10	63097	63106	20 %	40 %	20 %	20 %	379022455
66	NC_016929	TAATA	2	10	64077	64086	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016929	CAATG	2	10	64920	64929	40 %	20 %	20 %	20 %	379022457
68	NC_016929	ATAAA	2	10	65383	65392	80 %	20 %	0 %	0 %	379022458
69	NC_016929	ATTAT	2	10	65818	65827	40 %	60 %	0 %	0 %	379022458
70	NC_016929	AATTA	2	10	66088	66097	60 %	40 %	0 %	0 %	379022458
71	NC_016929	ATTTT	2	10	66221	66230	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016929	CAAAT	2	10	66242	66251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016929	GAAAA	2	10	66674	66683	80 %	0 %	20 %	0 %	379022459
74	NC_016929	ACAAT	2	10	69582	69591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016929	TATTT	2	10	74211	74220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016929	GTGAT	2	10	75274	75283	20 %	40 %	40 %	0 %	379022466
77	NC_016929	TGAAA	2	10	77069	77078	60 %	20 %	20 %	0 %	379022466
78	NC_016929	ACTAA	2	10	77413	77422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016929	TTGAT	2	10	78433	78442	20 %	60 %	20 %	0 %	379022467
80	NC_016929	TTGTA	2	10	79206	79215	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016929	ATTTA	2	10	80196	80205	40 %	60 %	0 %	0 %	379022469
82	NC_016929	AGATA	2	10	80447	80456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016929	AATTA	2	10	80566	80575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016929	ATAAA	2	10	84623	84632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016929	TTAGT	2	10	85659	85668	20 %	60 %	20 %	0 %	379022474
86	NC_016929	TTTAT	2	10	87989	87998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016929	AAAAG	2	10	88652	88661	80 %	0 %	20 %	0 %	379022477
88	NC_016929	TAATA	2	10	88877	88886	60 %	40 %	0 %	0 %	379022477
89	NC_016929	ATAAC	2	10	88945	88954	60 %	20 %	0 %	20 %	379022477
90	NC_016929	TCATA	2	10	88974	88983	40 %	40 %	0 %	20 %	379022477
91	NC_016929	ATTAT	2	10	90041	90050	40 %	60 %	0 %	0 %	379022478
92	NC_016929	TCTTG	2	10	90527	90536	0 %	60 %	20 %	20 %	379022478
93	NC_016929	ATTTA	2	10	91876	91885	40 %	60 %	0 %	0 %	379022478
94	NC_016929	ATTTA	2	10	92056	92065	40 %	60 %	0 %	0 %	379022478
95	NC_016929	AATTT	2	10	93624	93633	40 %	60 %	0 %	0 %	379022478
96	NC_016929	ATAAA	2	10	96646	96655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016929	ATATA	2	10	99315	99324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016929	TAGTT	2	10	99872	99881	20 %	60 %	20 %	0 %	379022482
99	NC_016929	ATAAC	2	10	100218	100227	60 %	20 %	0 %	20 %	379022482
100	NC_016929	TAATA	2	10	100983	100992	60 %	40 %	0 %	0 %	379022482
101	NC_016929	TAAAA	2	10	103228	103237	80 %	20 %	0 %	0 %	379022485
102	NC_016929	AAAAT	2	10	103290	103299	80 %	20 %	0 %	0 %	379022485
103	NC_016929	TTTAA	2	10	104000	104009	40 %	60 %	0 %	0 %	379022485
104	NC_016929	TAGTT	2	10	104498	104507	20 %	60 %	20 %	0 %	379022486
105	NC_016929	ATGTT	2	10	107843	107852	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016929	CTTGT	2	10	108399	108408	0 %	60 %	20 %	20 %	379022489
107	NC_016929	TCTTA	2	10	108661	108670	20 %	60 %	0 %	20 %	379022489
108	NC_016929	TATAA	2	10	112359	112368	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016929	TTATA	2	10	112771	112780	40 %	60 %	0 %	0 %	379022496
110	NC_016929	CTTTT	2	10	113289	113298	0 %	80 %	0 %	20 %	379022497
111	NC_016929	GTTTT	2	10	114014	114023	0 %	80 %	20 %	0 %	379022497
112	NC_016929	TTTTA	2	10	114463	114472	20 %	80 %	0 %	0 %	379022497
113	NC_016929	CCTCT	2	10	116549	116558	0 %	40 %	0 %	60 %	379022498
114	NC_016929	TATGT	2	10	116722	116731	20 %	60 %	20 %	0 %	379022498
115	NC_016929	AGGAG	2	10	118021	118030	40 %	0 %	60 %	0 %	379022498
116	NC_016929	GTTTT	2	10	119257	119266	0 %	80 %	20 %	0 %	379022499
117	NC_016929	TGCAG	2	10	119590	119599	20 %	20 %	40 %	20 %	379022499
118	NC_016929	TTGGT	2	10	121881	121890	0 %	60 %	40 %	0 %	379022500
119	NC_016929	CAGAA	2	10	123786	123795	60 %	0 %	20 %	20 %	379022500
120	NC_016929	TTAGT	2	10	124512	124521	20 %	60 %	20 %	0 %	379022501
121	NC_016929	TGCAG	2	10	125491	125500	20 %	20 %	40 %	20 %	379022501
122	NC_016929	ATGGT	2	10	127024	127033	20 %	40 %	40 %	0 %	379022502
123	NC_016929	TTGGC	2	10	127918	127927	0 %	40 %	40 %	20 %	379022502
124	NC_016929	TATTT	2	10	127961	127970	20 %	80 %	0 %	0 %	379022502
125	NC_016929	CAAAG	2	10	128353	128362	60 %	0 %	20 %	20 %	379022502
126	NC_016929	AATTT	2	10	130846	130855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016929	TACTT	2	10	132813	132822	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016929	TATAA	2	10	133132	133141	60 %	40 %	0 %	0 %	379022505
129	NC_016929	AAATA	2	10	133196	133205	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016929	AGTAT	2	10	134073	134082	40 %	40 %	20 %	0 %	379022507
131	NC_016929	CAATA	2	10	135629	135638	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016929	AATTT	2	10	135772	135781	40 %	60 %	0 %	0 %	379022510
133	NC_016929	AGGTG	2	10	135878	135887	20 %	20 %	60 %	0 %	379022510
134	NC_016929	GATTA	2	10	135923	135932	40 %	40 %	20 %	0 %	379022510
135	NC_016929	GCGGG	2	10	137169	137178	0 %	0 %	80 %	20 %	379022511
136	NC_016929	TTCCG	2	10	137539	137548	0 %	40 %	20 %	40 %	379022511
137	NC_016929	TATAT	2	10	143165	143174	40 %	60 %	0 %	0 %	379022518
138	NC_016929	AATTT	2	10	144364	144373	40 %	60 %	0 %	0 %	379022519
139	NC_016929	ATTTT	2	10	144751	144760	20 %	80 %	0 %	0 %	379022519
140	NC_016929	GTGAT	2	10	147890	147899	20 %	40 %	40 %	0 %	379022521
141	NC_016929	AAAAC	2	10	148770	148779	80 %	0 %	0 %	20 %	379022523
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144	NC_016929	ATATC	2	10	153651	153660	40 %	40 %	0 %	20 %	379022528
145	NC_016929	AAGAT	2	10	154498	154507	60 %	20 %	20 %	0 %	379022530
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149	NC_016929	AGTCA	2	10	159356	159365	40 %	20 %	20 %	20 %	379022535
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167	NC_016929	AACTA	2	10	185682	185691	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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242	NC_016929	CGAAG	2	10	270906	270915	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_016929	AAAAT	2	10	280170	280179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_016929	TTTTA	2	10	281261	281270	20 %	80 %	0 %	0 %	379022631
255	NC_016929	ATTAA	2	10	281401	281410	60 %	40 %	0 %	0 %	379022631
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263	NC_016929	TAATT	2	10	297655	297664	40 %	60 %	0 %	0 %	379022645
264	NC_016929	AAAAT	2	10	299128	299137	80 %	20 %	0 %	0 %	379022646
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269	NC_016929	AGCAA	2	10	307078	307087	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
270	NC_016929	ACATT	2	10	307089	307098	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_016929	ATAGT	2	10	308956	308965	40 %	40 %	20 %	0 %	379022657
272	NC_016929	ATTAT	2	10	311500	311509	40 %	60 %	0 %	0 %	379022659
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