MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 936

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016929	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016929	ATTT	2	8	1384	1391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016929	AGAA	2	8	8743	8750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016929	ATTT	2	8	8841	8848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016929	TAAG	2	8	9891	9898	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016929	TAAA	2	8	10109	10116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016929	TAAA	2	8	10136	10143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016929	AGAA	2	8	10319	10326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016929	TAAT	2	8	13045	13052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016929	AAGC	2	8	13409	13416	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016929	AGTA	2	8	13453	13460	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016929	AATA	2	8	13522	13529	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016929	TAAG	2	8	13597	13604	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016929	ATGA	2	8	13705	13712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016929	CTAC	2	8	13807	13814	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016929	GTCA	2	8	13963	13970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016929	TAAT	2	8	14557	14564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016929	TTAT	2	8	14602	14609	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016929	TAAT	2	8	14639	14646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016929	ATCT	2	8	19558	19565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016929	TTAT	2	8	19757	19764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016929	ATAA	3	12	19857	19868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016929	ACTT	2	8	19916	19923	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016929	TTAA	2	8	23107	23114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016929	TTTA	2	8	25289	25296	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016929	AATT	2	8	27787	27794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016929	ATTA	2	8	27906	27913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016929	AAAT	2	8	28183	28190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016929	TAGA	2	8	28384	28391	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016929	TATT	2	8	28425	28432	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016929	TTAT	2	8	30292	30299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016929	ATTT	2	8	30650	30657	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016929	ATTA	2	8	30724	30731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016929	AAGT	2	8	30858	30865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016929	CTAG	2	8	31306	31313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016929	TTAA	2	8	31340	31347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016929	ATTT	2	8	31384	31391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016929	TGAA	2	8	31861	31868	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016929	ATTT	2	8	33301	33308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016929	ATTA	3	12	33350	33361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016929	TAAA	2	8	33373	33380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016929	TTAC	2	8	33847	33854	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016929	TTTA	2	8	35282	35289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016929	AAGT	2	8	35701	35708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016929	AGTA	2	8	36068	36075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016929	CTAG	2	8	36380	36387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016929	AGCA	2	8	36643	36650	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016929	TATT	2	8	43542	43549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016929	TTTA	2	8	43935	43942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016929	GTTT	2	8	43945	43952	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016929	TTAA	2	8	49768	49775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016929	TAAA	2	8	54112	54119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016929	ATTG	2	8	56555	56562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016929	TAAT	2	8	56718	56725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016929	AATT	2	8	57807	57814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016929	AGTA	2	8	57961	57968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016929	TAAA	2	8	58078	58085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016929	TAAT	2	8	58219	58226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016929	TGTT	2	8	58288	58295	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016929	TTAT	2	8	58424	58431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016929	TTAT	2	8	58653	58660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016929	TTTA	2	8	58689	58696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016929	AAAT	2	8	58763	58770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016929	CAAT	2	8	64011	64018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016929	AAAG	2	8	64417	64424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016929	TAAA	2	8	69498	69505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016929	GTAG	2	8	70116	70123	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016929	ATAA	2	8	70472	70479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016929	GTAA	2	8	77594	77601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016929	ATTA	2	8	79244	79251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016929	TAAG	2	8	79887	79894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016929	AATG	2	8	80508	80515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016929	ATTA	2	8	80543	80550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016929	TAAC	2	8	80555	80562	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016929	GCAA	2	8	82392	82399	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016929	ATCC	2	8	83215	83222	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016929	TAAA	2	8	84138	84145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016929	AATT	2	8	84311	84318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016929	CTGC	2	8	84325	84332	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016929	TCTA	2	8	89431	89438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016929	ATTA	2	8	95043	95050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016929	TAAA	2	8	95127	95134	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016929	TCTA	2	8	96579	96586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016929	AGTT	2	8	96754	96761	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016929	TAAT	2	8	99287	99294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016929	TTTG	2	8	99363	99370	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016929	ATTA	2	8	102963	102970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016929	ACAT	2	8	103073	103080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016929	TAGT	2	8	105778	105785	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016929	AATC	2	8	106052	106059	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016929	ATAA	2	8	106326	106333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016929	GATA	2	8	106523	106530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016929	TGTT	2	8	110406	110413	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016929	CAAG	2	8	110563	110570	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016929	ATTA	2	8	112426	112433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016929	TGCC	2	8	112898	112905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016929	ACTT	2	8	130533	130540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016929	ACTT	2	8	130764	130771	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016929	GTAA	2	8	130775	130782	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016929	ATAA	2	8	130868	130875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016929	ATTA	2	8	131042	131049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016929	TATT	2	8	131082	131089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016929	TAAT	2	8	131426	131433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016929	AAAG	2	8	131547	131554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016929	TTTA	2	8	132064	132071	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016929	GGCA	2	8	138039	138046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016929	TGAT	2	8	149620	149627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016929	TATT	2	8	153359	153366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016929	TAAT	2	8	156374	156381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016929	GTGA	2	8	156700	156707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016929	TAAA	2	8	157624	157631	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016929	TTTA	2	8	159068	159075	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016929	TAAA	2	8	160396	160403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016929	TCAG	2	8	160861	160868	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016929	TAAG	2	8	170505	170512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016929	AGCA	2	8	175778	175785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016929	TTGT	2	8	182253	182260	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016929	TGAT	2	8	185768	185775	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016929	TAAT	2	8	189478	189485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016929	ACAA	2	8	190798	190805	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016929	AATT	2	8	193410	193417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016929	ATAA	2	8	194560	194567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016929	GATT	2	8	196650	196657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016929	TTTA	2	8	197296	197303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016929	TTTA	2	8	198624	198631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016929	ATTA	2	8	198704	198711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016929	AGAA	2	8	198788	198795	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016929	GAAA	2	8	201282	201289	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016929	TCTA	2	8	202030	202037	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016929	TAGG	2	8	202167	202174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016929	GCAA	2	8	202574	202581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016929	ACAA	2	8	212140	212147	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016929	ACAA	2	8	212157	212164	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016929	CTAC	2	8	216456	216463	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016929	TAAG	2	8	217402	217409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016929	TTTC	2	8	219364	219371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016929	GAAT	2	8	219799	219806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016929	CATG	2	8	221334	221341	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016929	TTTC	2	8	221383	221390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016929	CAAA	2	8	221467	221474	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016929	AAAC	2	8	221600	221607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016929	AAAG	2	8	221727	221734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016929	ACAT	2	8	223286	223293	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016929	ATTC	2	8	224305	224312	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016929	ATAC	2	8	225021	225028	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016929	AATT	2	8	225330	225337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016929	CATT	2	8	228742	228749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016929	ATCA	2	8	230587	230594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016929	TTAC	2	8	230790	230797	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016929	AATA	2	8	231049	231056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016929	TAAT	2	8	231495	231502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016929	GATT	2	8	231838	231845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_016929	CATG	2	8	232583	232590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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