MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 2540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016929	GGCA	2	8	2326	2333	25 %	0 %	50 %	25 %	379022408
2	NC_016929	TTAT	2	8	2833	2840	25 %	75 %	0 %	0 %	379022408
3	NC_016929	TTAT	2	8	3055	3062	25 %	75 %	0 %	0 %	379022408
4	NC_016929	AATA	2	8	5324	5331	75 %	25 %	0 %	0 %	379022409
5	NC_016929	AAGG	2	8	5396	5403	50 %	0 %	50 %	0 %	379022409
6	NC_016929	TCAC	2	8	5551	5558	25 %	25 %	0 %	50 %	379022409
7	NC_016929	TAGT	2	8	6015	6022	25 %	50 %	25 %	0 %	379022409
8	NC_016929	ACCT	2	8	6687	6694	25 %	25 %	0 %	50 %	379022410
9	NC_016929	ATAA	2	8	6778	6785	75 %	25 %	0 %	0 %	379022410
10	NC_016929	ATAA	2	8	6942	6949	75 %	25 %	0 %	0 %	379022410
11	NC_016929	TCAA	2	8	8291	8298	50 %	25 %	0 %	25 %	379022412
12	NC_016929	ATGA	2	8	9120	9127	50 %	25 %	25 %	0 %	379022413
13	NC_016929	CAAA	2	8	9306	9313	75 %	0 %	0 %	25 %	379022413
14	NC_016929	GATC	2	8	9575	9582	25 %	25 %	25 %	25 %	379022413
15	NC_016929	TTGG	2	8	9715	9722	0 %	50 %	50 %	0 %	379022413
16	NC_016929	GTTT	2	8	10475	10482	0 %	75 %	25 %	0 %	379022414
17	NC_016929	GTTT	2	8	10992	10999	0 %	75 %	25 %	0 %	379022415
18	NC_016929	TTAA	2	8	11034	11041	50 %	50 %	0 %	0 %	379022415
19	NC_016929	AATT	2	8	11399	11406	50 %	50 %	0 %	0 %	379022415
20	NC_016929	ATGT	2	8	11646	11653	25 %	50 %	25 %	0 %	379022415
21	NC_016929	CGCA	2	8	12865	12872	25 %	0 %	25 %	50 %	379022416
22	NC_016929	CTTG	2	8	12886	12893	0 %	50 %	25 %	25 %	379022416
23	NC_016929	AAAG	2	8	15336	15343	75 %	0 %	25 %	0 %	379022418
24	NC_016929	AAAC	2	8	15830	15837	75 %	0 %	0 %	25 %	379022418
25	NC_016929	AGAA	2	8	15940	15947	75 %	0 %	25 %	0 %	379022418
26	NC_016929	AGTA	2	8	16006	16013	50 %	25 %	25 %	0 %	379022418
27	NC_016929	AATG	2	8	16084	16091	50 %	25 %	25 %	0 %	379022418
28	NC_016929	AGAA	2	8	16576	16583	75 %	0 %	25 %	0 %	379022418
29	NC_016929	TTAG	2	8	16715	16722	25 %	50 %	25 %	0 %	379022418
30	NC_016929	TAAG	2	8	18165	18172	50 %	25 %	25 %	0 %	379022418
31	NC_016929	GTAT	2	8	18273	18280	25 %	50 %	25 %	0 %	379022418
32	NC_016929	AATA	2	8	18895	18902	75 %	25 %	0 %	0 %	379022418
33	NC_016929	TAAA	2	8	19041	19048	75 %	25 %	0 %	0 %	379022418
34	NC_016929	AATT	2	8	22057	22064	50 %	50 %	0 %	0 %	379022420
35	NC_016929	CGTT	2	8	22197	22204	0 %	50 %	25 %	25 %	379022420
36	NC_016929	TTTA	2	8	22521	22528	25 %	75 %	0 %	0 %	379022421
37	NC_016929	CTAT	2	8	22612	22619	25 %	50 %	0 %	25 %	379022421
38	NC_016929	ATTT	2	8	22655	22662	25 %	75 %	0 %	0 %	379022421
39	NC_016929	TGTC	2	8	22719	22726	0 %	50 %	25 %	25 %	379022421
40	NC_016929	TAAA	2	8	22768	22775	75 %	25 %	0 %	0 %	379022421
41	NC_016929	CATA	2	8	23035	23042	50 %	25 %	0 %	25 %	379022422
42	NC_016929	ATAC	2	8	23293	23300	50 %	25 %	0 %	25 %	379022423
43	NC_016929	ATAA	2	8	23717	23724	75 %	25 %	0 %	0 %	379022423
44	NC_016929	ACTT	2	8	23812	23819	25 %	50 %	0 %	25 %	379022423
45	NC_016929	TGAA	2	8	24163	24170	50 %	25 %	25 %	0 %	379022424
46	NC_016929	TATT	2	8	24684	24691	25 %	75 %	0 %	0 %	379022425
47	NC_016929	ATTT	2	8	25115	25122	25 %	75 %	0 %	0 %	379022425
48	NC_016929	ACAT	2	8	25888	25895	50 %	25 %	0 %	25 %	379022426
49	NC_016929	ACTA	2	8	26158	26165	50 %	25 %	0 %	25 %	379022427
50	NC_016929	AAGC	2	8	27002	27009	50 %	0 %	25 %	25 %	379022427
51	NC_016929	TTTG	2	8	27751	27758	0 %	75 %	25 %	0 %	379022427
52	NC_016929	TTAG	2	8	28660	28667	25 %	50 %	25 %	0 %	379022428
53	NC_016929	TAAT	2	8	28703	28710	50 %	50 %	0 %	0 %	379022428
54	NC_016929	AATT	2	8	28812	28819	50 %	50 %	0 %	0 %	379022428
55	NC_016929	TTCC	2	8	29195	29202	0 %	50 %	0 %	50 %	379022428
56	NC_016929	AGCA	2	8	30096	30103	50 %	0 %	25 %	25 %	379022429
57	NC_016929	TAAT	2	8	30387	30394	50 %	50 %	0 %	0 %	379022430
58	NC_016929	ATGA	2	8	30443	30450	50 %	25 %	25 %	0 %	379022430
59	NC_016929	ACTT	2	8	31942	31949	25 %	50 %	0 %	25 %	379022431
60	NC_016929	AAAT	2	8	31966	31973	75 %	25 %	0 %	0 %	379022431
61	NC_016929	ATAA	2	8	32442	32449	75 %	25 %	0 %	0 %	379022431
62	NC_016929	AGTA	2	8	32934	32941	50 %	25 %	25 %	0 %	379022432
63	NC_016929	ATCA	2	8	34291	34298	50 %	25 %	0 %	25 %	379022434
64	NC_016929	TTAA	2	8	35183	35190	50 %	50 %	0 %	0 %	379022434
65	NC_016929	TAAA	2	8	37819	37826	75 %	25 %	0 %	0 %	379022435
66	NC_016929	AGCA	2	8	37898	37905	50 %	0 %	25 %	25 %	379022435
67	NC_016929	ATTG	2	8	38228	38235	25 %	50 %	25 %	0 %	379022435
68	NC_016929	TTAT	2	8	38442	38449	25 %	75 %	0 %	0 %	379022435
69	NC_016929	TGCT	2	8	38524	38531	0 %	50 %	25 %	25 %	379022435
70	NC_016929	GTGA	2	8	38631	38638	25 %	25 %	50 %	0 %	379022435
71	NC_016929	GGCA	2	8	39004	39011	25 %	0 %	50 %	25 %	379022435
72	NC_016929	GTTC	2	8	39409	39416	0 %	50 %	25 %	25 %	379022435
73	NC_016929	TAAG	2	8	40456	40463	50 %	25 %	25 %	0 %	379022436
74	NC_016929	ATAA	2	8	41142	41149	75 %	25 %	0 %	0 %	379022437
75	NC_016929	GTAC	2	8	41383	41390	25 %	25 %	25 %	25 %	379022437
76	NC_016929	CTTT	2	8	41842	41849	0 %	75 %	0 %	25 %	379022437
77	NC_016929	ATTA	2	8	42046	42053	50 %	50 %	0 %	0 %	379022438
78	NC_016929	ATAA	2	8	42666	42673	75 %	25 %	0 %	0 %	379022438
79	NC_016929	ATAA	2	8	42720	42727	75 %	25 %	0 %	0 %	379022438
80	NC_016929	CCAA	2	8	42849	42856	50 %	0 %	0 %	50 %	379022438
81	NC_016929	CATC	2	8	42857	42864	25 %	25 %	0 %	50 %	379022438
82	NC_016929	ATTT	3	12	43033	43044	25 %	75 %	0 %	0 %	379022438
83	NC_016929	CAAA	2	8	43153	43160	75 %	0 %	0 %	25 %	379022438
84	NC_016929	AGAA	2	8	44197	44204	75 %	0 %	25 %	0 %	379022439
85	NC_016929	AAAG	2	8	44577	44584	75 %	0 %	25 %	0 %	379022440
86	NC_016929	TAAA	2	8	44644	44651	75 %	25 %	0 %	0 %	379022440
87	NC_016929	AAGA	2	8	45972	45979	75 %	0 %	25 %	0 %	379022442
88	NC_016929	TTTG	2	8	46080	46087	0 %	75 %	25 %	0 %	379022442
89	NC_016929	TAAT	2	8	46479	46486	50 %	50 %	0 %	0 %	379022442
90	NC_016929	GAAT	2	8	47366	47373	50 %	25 %	25 %	0 %	379022443
91	NC_016929	AAGT	2	8	47601	47608	50 %	25 %	25 %	0 %	379022443
92	NC_016929	ATGG	2	8	47923	47930	25 %	25 %	50 %	0 %	379022443
93	NC_016929	AAGA	2	8	48208	48215	75 %	0 %	25 %	0 %	379022443
94	NC_016929	GAAA	2	8	48294	48301	75 %	0 %	25 %	0 %	379022443
95	NC_016929	GAGG	2	8	48322	48329	25 %	0 %	75 %	0 %	379022443
96	NC_016929	TATG	2	8	48651	48658	25 %	50 %	25 %	0 %	379022443
97	NC_016929	GCTA	2	8	48789	48796	25 %	25 %	25 %	25 %	379022443
98	NC_016929	TTAA	2	8	49165	49172	50 %	50 %	0 %	0 %	379022444
99	NC_016929	GCAT	2	8	49273	49280	25 %	25 %	25 %	25 %	379022444
100	NC_016929	TGCT	2	8	50919	50926	0 %	50 %	25 %	25 %	379022445
101	NC_016929	TATT	2	8	51005	51012	25 %	75 %	0 %	0 %	379022445
102	NC_016929	ATTT	2	8	51015	51022	25 %	75 %	0 %	0 %	379022445
103	NC_016929	TGTT	2	8	51798	51805	0 %	75 %	25 %	0 %	379022445
104	NC_016929	TGAT	2	8	51874	51881	25 %	50 %	25 %	0 %	379022445
105	NC_016929	TTTG	2	8	52556	52563	0 %	75 %	25 %	0 %	379022446
106	NC_016929	TTAT	2	8	53124	53131	25 %	75 %	0 %	0 %	379022447
107	NC_016929	AACT	2	8	53513	53520	50 %	25 %	0 %	25 %	379022447
108	NC_016929	TATC	2	8	53791	53798	25 %	50 %	0 %	25 %	379022447
109	NC_016929	GAAT	2	8	54290	54297	50 %	25 %	25 %	0 %	379022448
110	NC_016929	TTGG	2	8	54350	54357	0 %	50 %	50 %	0 %	379022448
111	NC_016929	TTAG	2	8	54670	54677	25 %	50 %	25 %	0 %	379022448
112	NC_016929	ATTT	2	8	54761	54768	25 %	75 %	0 %	0 %	379022448
113	NC_016929	TATT	2	8	54823	54830	25 %	75 %	0 %	0 %	379022448
114	NC_016929	GGTT	2	8	55303	55310	0 %	50 %	50 %	0 %	379022448
115	NC_016929	ATAG	2	8	55480	55487	50 %	25 %	25 %	0 %	379022448
116	NC_016929	TCTA	2	8	55932	55939	25 %	50 %	0 %	25 %	379022448
117	NC_016929	TAAT	2	8	55968	55975	50 %	50 %	0 %	0 %	379022448
118	NC_016929	TTAG	2	8	56283	56290	25 %	50 %	25 %	0 %	379022449
119	NC_016929	TTAT	2	8	59448	59455	25 %	75 %	0 %	0 %	379022452
120	NC_016929	GATG	2	8	59497	59504	25 %	25 %	50 %	0 %	379022452
121	NC_016929	TTAC	2	8	59856	59863	25 %	50 %	0 %	25 %	379022452
122	NC_016929	TAAA	2	8	60238	60245	75 %	25 %	0 %	0 %	379022452
123	NC_016929	TTGG	2	8	60541	60548	0 %	50 %	50 %	0 %	379022453
124	NC_016929	TGTT	2	8	61111	61118	0 %	75 %	25 %	0 %	379022453
125	NC_016929	TTCT	2	8	61381	61388	0 %	75 %	0 %	25 %	379022453
126	NC_016929	AATA	2	8	63434	63441	75 %	25 %	0 %	0 %	379022455
127	NC_016929	ATTT	2	8	63601	63608	25 %	75 %	0 %	0 %	379022455
128	NC_016929	AGCA	2	8	63730	63737	50 %	0 %	25 %	25 %	379022455
129	NC_016929	ATTT	2	8	63745	63752	25 %	75 %	0 %	0 %	379022455
130	NC_016929	ATTT	2	8	63915	63922	25 %	75 %	0 %	0 %	379022455
131	NC_016929	AAGT	2	8	64173	64180	50 %	25 %	25 %	0 %	379022456
132	NC_016929	TAAA	2	8	64569	64576	75 %	25 %	0 %	0 %	379022457
133	NC_016929	ATCT	2	8	64749	64756	25 %	50 %	0 %	25 %	379022457
134	NC_016929	GAAA	2	8	64816	64823	75 %	0 %	25 %	0 %	379022457
135	NC_016929	TGGT	2	8	66414	66421	0 %	50 %	50 %	0 %	379022459
136	NC_016929	CAAA	2	8	66442	66449	75 %	0 %	0 %	25 %	379022459
137	NC_016929	GATG	2	8	66800	66807	25 %	25 %	50 %	0 %	379022459
138	NC_016929	TGCT	2	8	66837	66844	0 %	50 %	25 %	25 %	379022459
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