MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 18203

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016929	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022405
2	NC_016929	TTC	2	6	33	38	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022405
3	NC_016929	ATA	2	6	262	267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022405
4	NC_016929	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022405
5	NC_016929	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022405
6	NC_016929	TGG	2	6	572	577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022405
7	NC_016929	CTA	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022405
8	NC_016929	AGA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022405
9	NC_016929	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022405
10	NC_016929	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022405
11	NC_016929	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016929	TGT	2	6	878	883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016929	TGC	2	6	914	919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016929	CAG	2	6	925	930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016929	AAT	2	6	1016	1021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016929	ATA	2	6	1179	1184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022406
17	NC_016929	TGA	2	6	1238	1243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022406
18	NC_016929	GTA	2	6	1276	1281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022406
19	NC_016929	AAT	2	6	1289	1294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022406
20	NC_016929	GCA	2	6	1337	1342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022406
21	NC_016929	ATA	2	6	1535	1540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022407
22	NC_016929	GCA	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022407
23	NC_016929	ATA	3	9	1751	1759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022407
24	NC_016929	TGA	2	6	1917	1922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022407
25	NC_016929	GCA	2	6	1930	1935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022407
26	NC_016929	GAA	2	6	1974	1979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022407
27	NC_016929	AAT	2	6	2004	2009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022407
28	NC_016929	AAG	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022407
29	NC_016929	TTA	2	6	2059	2064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022407
30	NC_016929	CTT	2	6	2125	2130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022407
31	NC_016929	TGT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016929	TCC	3	9	2227	2235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016929	TTA	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016929	ATT	2	6	2339	2344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022408
35	NC_016929	AGC	2	6	2526	2531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022408
36	NC_016929	ATA	2	6	2571	2576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022408
37	NC_016929	ATA	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022408
38	NC_016929	TAA	2	6	2740	2745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022408
39	NC_016929	ATG	2	6	2970	2975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022408
40	NC_016929	ATT	2	6	3187	3192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
41	NC_016929	TAT	2	6	3211	3216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
42	NC_016929	ATT	2	6	3225	3230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
43	NC_016929	GAT	2	6	3263	3268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022409
44	NC_016929	AAG	2	6	3297	3302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
45	NC_016929	ATT	2	6	3338	3343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
46	NC_016929	AAT	2	6	3490	3495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
47	NC_016929	CAA	2	6	3503	3508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022409
48	NC_016929	AGA	2	6	3526	3531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
49	NC_016929	AGC	2	6	3541	3546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022409
50	NC_016929	AAC	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022409
51	NC_016929	ATT	2	6	3801	3806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
52	NC_016929	CCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379022409
53	NC_016929	TAT	2	6	4015	4020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
54	NC_016929	GCA	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022409
55	NC_016929	GAA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
56	NC_016929	CTA	2	6	4236	4241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022409
57	NC_016929	CTA	2	6	4291	4296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022409
58	NC_016929	TAA	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
59	NC_016929	GGA	2	6	4700	4705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022409
60	NC_016929	AGG	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022409
61	NC_016929	GGA	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022409
62	NC_016929	GAA	2	6	4919	4924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
63	NC_016929	ATT	2	6	4942	4947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
64	NC_016929	AAG	2	6	4950	4955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
65	NC_016929	GAA	2	6	4967	4972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
66	NC_016929	TAA	2	6	4987	4992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
67	NC_016929	TGG	2	6	4996	5001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022409
68	NC_016929	TAT	2	6	5012	5017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
69	NC_016929	ATC	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022409
70	NC_016929	GAT	2	6	5249	5254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022409
71	NC_016929	GTT	2	6	5372	5377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022409
72	NC_016929	ATA	2	6	5433	5438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
73	NC_016929	ATT	2	6	5484	5489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
74	NC_016929	CAG	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022409
75	NC_016929	GAT	2	6	5525	5530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022409
76	NC_016929	TGC	2	6	5563	5568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022409
77	NC_016929	ATT	2	6	5607	5612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022409
78	NC_016929	TGC	2	6	5620	5625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022409
79	NC_016929	CTA	2	6	5715	5720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022409
80	NC_016929	AGT	2	6	5752	5757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022409
81	NC_016929	TTG	2	6	5814	5819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022409
82	NC_016929	TTG	2	6	5843	5848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379022409
83	NC_016929	ATA	2	6	5865	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
84	NC_016929	TAA	2	6	5934	5939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
85	NC_016929	ATA	2	6	5957	5962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022409
86	NC_016929	GAA	2	6	5963	5968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022409
87	NC_016929	ATG	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022409
88	NC_016929	GAG	2	6	6084	6089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379022409
89	NC_016929	AGT	2	6	6214	6219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016929	AAC	2	6	6253	6258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016929	CTA	3	9	6355	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022410
92	NC_016929	AAT	2	6	6381	6386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022410
93	NC_016929	ATT	2	6	6402	6407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022410
94	NC_016929	TAC	2	6	6563	6568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022410
95	NC_016929	CCG	2	6	6613	6618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379022410
96	NC_016929	ATC	2	6	6619	6624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022410
97	NC_016929	ATT	2	6	6673	6678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022410
98	NC_016929	TAC	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022410
99	NC_016929	ATT	2	6	6735	6740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022410
100	NC_016929	ATT	3	9	6786	6794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022410
101	NC_016929	TAT	2	6	6860	6865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022410
102	NC_016929	GGT	2	6	6916	6921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379022410
103	NC_016929	TAC	2	6	7020	7025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022410
104	NC_016929	CTT	2	6	7317	7322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022411
105	NC_016929	TAG	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022411
106	NC_016929	TTA	2	6	7478	7483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022411
107	NC_016929	CTA	2	6	7506	7511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022411
108	NC_016929	CAT	2	6	7561	7566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022411
109	NC_016929	ATA	3	9	7598	7606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022412
110	NC_016929	GCC	2	6	7645	7650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379022412
111	NC_016929	CGC	2	6	7683	7688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379022412
112	NC_016929	TCC	2	6	7747	7752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379022412
113	NC_016929	CTA	2	6	7778	7783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022412
114	NC_016929	ATA	2	6	7808	7813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022412
115	NC_016929	TCT	2	6	7874	7879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022412
116	NC_016929	TAG	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022412
117	NC_016929	ATT	2	6	7936	7941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022412
118	NC_016929	TGA	2	6	7973	7978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022412
119	NC_016929	CGT	2	6	8046	8051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379022412
120	NC_016929	TAT	2	6	8151	8156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022412
121	NC_016929	TAA	2	6	8163	8168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022412
122	NC_016929	AAT	2	6	8233	8238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022412
123	NC_016929	ATT	2	6	8249	8254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022412
124	NC_016929	AGC	3	9	8386	8394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022412
125	NC_016929	TAG	2	6	8397	8402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022412
126	NC_016929	CTT	2	6	8460	8465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022412
127	NC_016929	ATA	2	6	8519	8524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022412
128	NC_016929	TAC	2	6	8583	8588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022412
129	NC_016929	TGG	3	9	8614	8622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016929	ATA	2	6	8693	8698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016929	TTC	2	6	8888	8893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022413
132	NC_016929	AGA	2	6	8940	8945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022413
133	NC_016929	TGA	2	6	9050	9055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022413
134	NC_016929	CAA	2	6	9058	9063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379022413
135	NC_016929	GTA	2	6	9180	9185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022413
136	NC_016929	AGC	2	6	9220	9225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022413
137	NC_016929	AAG	2	6	9436	9441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022413
138	NC_016929	AAG	2	6	9496	9501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022413
139	NC_016929	TAT	2	6	9527	9532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022413
140	NC_016929	AAT	2	6	9662	9667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022413
141	NC_016929	ATT	2	6	9670	9675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022413
142	NC_016929	TAG	2	6	9725	9730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022413
143	NC_016929	CAG	2	6	9745	9750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379022413
144	NC_016929	TAT	2	6	9824	9829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022413
145	NC_016929	AAT	2	6	9904	9909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016929	GTT	2	6	9968	9973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016929	TAG	2	6	10014	10019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016929	TCT	2	6	10096	10101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016929	GAA	2	6	10246	10251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016929	TAC	2	6	10463	10468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022414
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153	NC_016929	TTC	2	6	10605	10610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022414
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159	NC_016929	TAA	2	6	11144	11149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022415
160	NC_016929	ATT	2	6	11177	11182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022415
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162	NC_016929	ATT	3	9	11228	11236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022415
163	NC_016929	TCT	2	6	11241	11246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379022415
164	NC_016929	TAA	2	6	11291	11296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022415
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247	NC_016929	TAT	2	6	16548	16553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379022418
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251	NC_016929	ATG	2	6	16644	16649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022418
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253	NC_016929	ATA	2	6	16698	16703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022418
254	NC_016929	ATA	2	6	16749	16754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379022418
255	NC_016929	ATG	2	6	16821	16826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022418
256	NC_016929	GAA	2	6	16874	16879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379022418
257	NC_016929	GAT	2	6	16898	16903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379022418
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259	NC_016929	TCA	3	9	17084	17092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379022418
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