MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia canadensis str. CA410 chromosome

Total Repeats: 2741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016929	TA	3	6	786	791	50 %	50 %	0 %	0 %	379022405
2	NC_016929	AT	3	6	1630	1635	50 %	50 %	0 %	0 %	379022407
3	NC_016929	TA	3	6	1748	1753	50 %	50 %	0 %	0 %	379022407
4	NC_016929	TA	3	6	2632	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	379022408
5	NC_016929	TG	3	6	2748	2753	0 %	50 %	50 %	0 %	379022408
6	NC_016929	AT	3	6	2892	2897	50 %	50 %	0 %	0 %	379022408
7	NC_016929	AT	3	6	3428	3433	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
8	NC_016929	AG	3	6	3514	3519	50 %	0 %	50 %	0 %	379022409
9	NC_016929	TG	3	6	4073	4078	0 %	50 %	50 %	0 %	379022409
10	NC_016929	AT	3	6	4175	4180	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
11	NC_016929	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	379022409
12	NC_016929	AT	3	6	4485	4490	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
13	NC_016929	AG	3	6	4504	4509	50 %	0 %	50 %	0 %	379022409
14	NC_016929	AG	3	6	4825	4830	50 %	0 %	50 %	0 %	379022409
15	NC_016929	TA	3	6	4877	4882	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
16	NC_016929	AT	3	6	5069	5074	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
17	NC_016929	AT	3	6	6097	6102	50 %	50 %	0 %	0 %	379022409
18	NC_016929	AT	3	6	6321	6326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016929	TC	3	6	6888	6893	0 %	50 %	0 %	50 %	379022410
20	NC_016929	TA	3	6	8197	8202	50 %	50 %	0 %	0 %	379022412
21	NC_016929	AT	3	6	8769	8774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016929	AT	4	8	9872	9879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016929	TA	4	8	10159	10166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016929	TA	3	6	10236	10241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016929	AT	3	6	10359	10364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016929	TA	3	6	11057	11062	50 %	50 %	0 %	0 %	379022415
27	NC_016929	TA	3	6	11086	11091	50 %	50 %	0 %	0 %	379022415
28	NC_016929	TA	3	6	12182	12187	50 %	50 %	0 %	0 %	379022416
29	NC_016929	CT	3	6	12366	12371	0 %	50 %	0 %	50 %	379022416
30	NC_016929	AT	3	6	12564	12569	50 %	50 %	0 %	0 %	379022416
31	NC_016929	AT	3	6	12984	12989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016929	TA	3	6	13299	13304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016929	TA	3	6	13368	13373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016929	AT	3	6	13663	13668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016929	TG	3	6	14010	14015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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37	NC_016929	AT	3	6	14577	14582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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41	NC_016929	AT	3	6	17450	17455	50 %	50 %	0 %	0 %	379022418
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43	NC_016929	TA	3	6	18714	18719	50 %	50 %	0 %	0 %	379022418
44	NC_016929	AT	3	6	18771	18776	50 %	50 %	0 %	0 %	379022418
45	NC_016929	TA	3	6	19126	19131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016929	TA	3	6	20430	20435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016929	TA	3	6	20809	20814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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49	NC_016929	AT	3	6	20945	20950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016929	GA	3	6	20952	20957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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54	NC_016929	AG	3	6	23146	23151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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63	NC_016929	TA	3	6	28202	28207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016929	TA	3	6	28221	28226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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109	NC_016929	AT	3	6	54932	54937	50 %	50 %	0 %	0 %	379022448
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111	NC_016929	TA	4	8	55617	55624	50 %	50 %	0 %	0 %	379022448
112	NC_016929	AT	3	6	55909	55914	50 %	50 %	0 %	0 %	379022448
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116	NC_016929	AT	3	6	57815	57820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016929	AT	3	6	58001	58006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016929	AT	3	6	58487	58492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016929	AT	3	6	58605	58610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_016929	AT	3	6	64056	64061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016929	TA	3	6	64339	64344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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