MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016928	ATAAAT	2	12	3318	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016928	TTTAAA	2	12	4238	4249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016928	TAAATC	2	12	17927	17938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016928	TTTAAA	2	12	35123	35134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016928	TTAAAC	2	12	50845	50856	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016928	AATTTA	2	12	52621	52632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016928	GTAGTG	2	12	52664	52675	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016928	GAAATA	2	12	79691	79702	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016928	AATATA	2	12	100768	100779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016928	TTAAAT	2	12	112588	112599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016928	TTAACA	2	12	113944	113955	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016928	AATTAT	2	12	132297	132308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016928	GTTTTT	2	12	152242	152253	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016928	GATTTT	2	12	169215	169226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016928	ATTAAT	2	12	177654	177665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016928	TTTATA	2	12	199079	199090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016928	ATTAAT	2	12	199102	199113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016928	ATATGA	2	12	244609	244620	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016928	AGTGGA	2	12	259550	259561	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016928	ATATAG	2	12	280780	280791	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016928	ATTTTC	2	12	286097	286108	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016928	ATAATT	2	12	287047	287058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016928	AACGAT	2	12	294387	294398	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016928	TAACTT	3	18	302764	302781	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016928	GAAAAA	2	12	352629	352640	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016928	TTGTAA	2	12	361086	361097	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016928	TAATAT	2	12	369386	369397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016928	TAAAGA	2	12	403356	403367	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016928	ATTAAT	2	12	419798	419809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016928	GATTTT	2	12	421551	421562	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016928	ATTGTT	2	12	424180	424191	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016928	TATAAT	2	12	427723	427734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016928	TAAAAT	2	12	429502	429513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016928	TTGAAA	2	12	432155	432166	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016928	TGTATA	2	12	446472	446483	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016928	TTTTTA	2	12	460140	460151	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016928	AAAATG	2	12	465570	465581	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016928	ACGTTG	2	12	485988	485999	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016928	AAAATA	2	12	486712	486723	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016928	TTATAA	2	12	505786	505797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016928	AAATTT	2	12	512544	512555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016928	TTATAA	2	12	568736	568747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016928	GTTATA	2	12	569406	569417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016928	CTTAAA	2	12	577838	577849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016928	ACATGT	2	12	587804	587815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016928	ATTGCG	2	12	619357	619368	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016928	TAAAAT	2	12	639433	639444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016928	TTTTAA	2	12	646699	646710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016928	CATTAT	2	12	662889	662900	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016928	CATCAA	2	12	673352	673363	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016928	TAATTT	2	12	677592	677603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016928	TGAATA	2	12	694069	694080	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016928	GGATTC	2	12	705421	705432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016928	TTAAAA	2	12	720217	720228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016928	TAGTTA	2	12	724639	724650	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016928	TAATTA	2	12	735445	735456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016928	TTTTTA	2	12	742844	742855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016928	TGAAAA	2	12	751087	751098	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016928	TAGAAT	2	12	838541	838552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016928	TAAAAA	2	12	840671	840682	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016928	TATCAA	2	12	847226	847237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016928	AATATA	2	12	848601	848612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016928	TCATTT	2	12	856996	857007	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016928	AAATTA	2	12	883416	883427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016928	AATGAT	2	12	892465	892476	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016928	TAAAAT	2	12	900036	900047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016928	ATTTAT	2	12	914226	914237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016928	TTTAAT	2	12	975326	975337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016928	AACGGA	2	12	1009532	1009543	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016928	CATTTA	2	12	1039736	1039747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016928	ATCATA	2	12	1041640	1041651	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016928	TATGTA	2	12	1061777	1061788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016928	TTTTCT	2	12	1061872	1061883	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016928	TTTATA	2	12	1097650	1097661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016928	CTTAGG	2	12	1103196	1103207	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016928	GAATTA	2	12	1104167	1104178	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016928	ATTTTT	2	12	1121557	1121568	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016928	ATAATT	2	12	1122354	1122365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016928	TCATTA	2	12	1127438	1127449	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016928	TAATGA	2	12	1135528	1135539	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016928	ATTTAT	2	12	1154774	1154785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016928	AAATTT	2	12	1159504	1159515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016928	AAGTAA	2	12	1181198	1181209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016928	TCGTTT	2	12	1185670	1185681	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016928	TTAATT	2	12	1196387	1196398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016928	TCAAAA	2	12	1197231	1197242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016928	AATTAA	2	12	1199323	1199334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016928	TGATTT	2	12	1204289	1204300	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016928	GAAATT	2	12	1243289	1243300	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016928	AATGAT	2	12	1256063	1256074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016928	GAAAAA	2	12	1267458	1267469	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016928	TTTCAT	2	12	1286345	1286356	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016928	TATATT	2	12	1291539	1291550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016928	ATGTAT	2	12	1317239	1317250	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016928	AAAGAA	2	12	1317473	1317484	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016928	TTAAAG	2	12	1321050	1321061	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016928	CTATAA	2	12	1322442	1322453	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016928	TTAAAG	2	12	1322854	1322865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016928	TTAAAG	2	12	1323788	1323799	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016928	ATTAAA	2	12	1349576	1349587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016928	ATATAA	2	12	1357398	1357409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016928	GTTTTA	2	12	1387201	1387212	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016928	TAAAAT	2	12	1402779	1402790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016928	TATCTT	2	12	1424617	1424628	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016928	TTGATT	2	12	1424680	1424691	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016928	ATTCTA	2	12	1432381	1432392	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016928	AATAAA	2	12	1435231	1435242	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016928	TATTCT	2	12	1482744	1482755	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016928	TACTTG	2	12	1492992	1493003	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016928	CATTCA	2	12	1496210	1496221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016928	TTAATC	2	12	1506483	1506494	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016928	TGAAAA	2	12	1525898	1525909	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016928	AATATA	2	12	1573140	1573151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016928	AATAAA	2	12	1592347	1592358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016928	ATAAAA	2	12	1596134	1596145	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016928	ACAAGA	2	12	1601711	1601722	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016928	TTATAG	2	12	1623744	1623755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016928	AATTTA	2	12	1631779	1631790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016928	AGCCAA	2	12	1659664	1659675	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016928	TTGACT	2	12	1659683	1659694	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016928	TTTAAC	2	12	1664567	1664578	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016928	TTATAA	2	12	1667236	1667247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016928	ACCTTT	2	12	1677193	1677204	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016928	AATTAA	2	12	1707876	1707887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016928	TAAAAC	2	12	1711016	1711027	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016928	AATTTA	2	12	1720823	1720834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016928	ATTTTC	2	12	1726858	1726869	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016928	TTTTAG	2	12	1733328	1733339	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016928	TAAAAA	2	12	1760009	1760020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016928	TTTCAT	2	12	1779883	1779894	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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133	NC_016928	TATCAA	2	12	1819347	1819358	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.