MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 1305

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016928	GTTGAA	2	12	3217	3228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
2	NC_016928	TGGCGG	2	12	6138	6149	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379019818
3	NC_016928	GTTATC	2	12	8066	8077	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019819
4	NC_016928	CAGATA	2	12	8975	8986	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019819
5	NC_016928	CAAGCT	2	12	9034	9045	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379019819
6	NC_016928	GTAATG	2	12	10022	10033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019819
7	NC_016928	AGATGA	2	12	10416	10427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019819
8	NC_016928	ACAATT	2	12	12019	12030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379019821
9	NC_016928	TTAGCA	2	12	12113	12124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379019821
10	NC_016928	GCTTTA	2	12	18205	18216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019826
11	NC_016928	TTTGAA	2	12	19026	19037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019826
12	NC_016928	TAAAGG	2	12	21073	21084	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019828
13	NC_016928	TTGAAG	2	12	21270	21281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019828
14	NC_016928	TGATTG	2	12	22474	22485	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379019829
15	NC_016928	TGAAAT	2	12	22805	22816	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019829
16	NC_016928	AAGGAA	2	12	23244	23255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019830
17	NC_016928	TGAATT	2	12	26166	26177	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019831
18	NC_016928	ATTTCA	2	12	28650	28661	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019833
19	NC_016928	GTTCTG	2	12	29949	29960	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	379019834
20	NC_016928	ATCAGC	2	12	31964	31975	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379019836
21	NC_016928	AAAAGA	2	12	34593	34604	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379019838
22	NC_016928	TTTTGA	2	12	35381	35392	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379019839
23	NC_016928	TAAACA	2	12	35801	35812	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379019840
24	NC_016928	TGGTAG	2	12	36467	36478	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379019840
25	NC_016928	ATGCCT	2	12	39121	39132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379019843
26	NC_016928	TGAAGA	2	12	39309	39320	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019843
27	NC_016928	GAACAA	2	12	43959	43970	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379019848
28	NC_016928	CAAACA	2	12	44042	44053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019848
29	NC_016928	GTTTAA	2	12	45075	45086	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019850
30	NC_016928	AATGAA	2	12	48041	48052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379019853
31	NC_016928	ACAACT	2	12	50106	50117	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379019854
32	NC_016928	CATAAC	2	12	51187	51198	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	379019855
33	NC_016928	TAAAAA	2	12	53177	53188	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379019857
34	NC_016928	AAATTA	2	12	54645	54656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019860
35	NC_016928	AAAATT	2	12	55034	55045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019860
36	NC_016928	GAACAA	2	12	61868	61879	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379019866
37	NC_016928	AAGTGA	2	12	62340	62351	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019867
38	NC_016928	ATCTAA	2	12	64444	64455	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379019869
39	NC_016928	TTCATT	2	12	68433	68444	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379019871
40	NC_016928	ATAGTA	2	12	72437	72448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019873
41	NC_016928	TTCCAT	2	12	74878	74889	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379019875
42	NC_016928	ACAAGA	2	12	76476	76487	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379019876
43	NC_016928	AAATGG	2	12	77842	77853	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019877
44	NC_016928	TAGAAA	2	12	79116	79127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379019878
45	NC_016928	ACCCTT	2	12	82899	82910	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379019884
46	NC_016928	TTTTAA	2	12	87343	87354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019889
47	NC_016928	AGAAAA	2	12	87547	87558	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379019889
48	NC_016928	GAATGT	2	12	87580	87591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019889
49	NC_016928	CGAAAT	2	12	88052	88063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019890
50	NC_016928	GATGTC	2	12	89007	89018	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379019891
51	NC_016928	GTTAGA	2	12	91501	91512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019892
52	NC_016928	AAAAGA	2	12	91554	91565	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379019892
53	NC_016928	TACAAG	2	12	94309	94320	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019895
54	NC_016928	GTAGAA	2	12	98231	98242	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019899
55	NC_016928	AACCAC	2	12	99066	99077	50 %	0 %	0 %	50 %	379019899
56	NC_016928	AACCGA	2	12	102382	102393	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379019901
57	NC_016928	AGCAAA	2	12	106843	106854	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379019904
58	NC_016928	ATAGAT	2	12	107283	107294	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019904
59	NC_016928	TATCAT	2	12	108050	108061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019905
60	NC_016928	TAAATA	2	12	109977	109988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019906
61	NC_016928	TTTTTC	2	12	112493	112504	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379019908
62	NC_016928	TAAGCC	2	12	114354	114365	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379019910
63	NC_016928	ATCGCA	2	12	115569	115580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379019911
64	NC_016928	TTTGAA	2	12	116600	116611	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019912
65	NC_016928	TGAAGA	2	12	126392	126403	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019919
66	NC_016928	TTTCAT	2	12	127073	127084	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379019920
67	NC_016928	AGAATG	2	12	129042	129053	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019922
68	NC_016928	ATTTTT	2	12	129287	129298	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379019923
69	NC_016928	TGTATA	2	12	131938	131949	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019925
70	NC_016928	TCGAAA	2	12	133439	133450	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019927
71	NC_016928	CTATTG	2	12	136025	136036	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379019929
72	NC_016928	CATATG	2	12	137228	137239	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379019930
73	NC_016928	CAGATT	2	12	143934	143945	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379019935
74	NC_016928	TGAAAG	2	12	153112	153123	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379019943
75	NC_016928	GATATG	2	12	160616	160627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019948
76	NC_016928	ATTTGA	2	12	164522	164533	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019951
77	NC_016928	TATAAA	2	12	165053	165064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019952
78	NC_016928	ACAAAG	2	12	173735	173746	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379019960
79	NC_016928	TGTAAT	2	12	174759	174770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019961
80	NC_016928	AAAGAT	2	12	175748	175759	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379019963
81	NC_016928	CAATAT	2	12	178218	178229	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379019964
82	NC_016928	TTGGTA	2	12	182072	182083	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379019969
83	NC_016928	AATTTA	2	12	182191	182202	50 %	50 %	0 %	0 %	379019969
84	NC_016928	CTATTA	2	12	188490	188501	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019972
85	NC_016928	TATGAT	2	12	190024	190035	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379019972
86	NC_016928	ATTGAA	2	12	190475	190486	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019972
87	NC_016928	AGCAAC	2	12	196426	196437	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379019976
88	NC_016928	CACCTT	2	12	198478	198489	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379019978
89	NC_016928	ACCTTT	2	12	198983	198994	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379019978
90	NC_016928	GTAAAT	2	12	202715	202726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019981
91	NC_016928	ATTTTA	2	12	204309	204320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019983
92	NC_016928	TATCTT	2	12	208923	208934	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379019986
93	NC_016928	GAGTTT	2	12	213848	213859	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379019989
94	NC_016928	CCCTGA	2	12	216363	216374	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379019991
95	NC_016928	TCCTGA	2	12	217182	217193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379019991
96	NC_016928	AAATAT	2	12	217600	217611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019992
97	NC_016928	TCAATT	2	12	219333	219344	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019993
98	NC_016928	AATATG	2	12	220633	220644	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379019994
99	NC_016928	AGATCA	2	12	221583	221594	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379019994
100	NC_016928	AAAAAT	2	12	224125	224136	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379019996
101	NC_016928	AAAGGA	2	12	225984	225995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019998
102	NC_016928	ACATTT	2	12	226322	226333	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379019998
103	NC_016928	TTCTTG	2	12	231251	231262	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379020002
104	NC_016928	GGACGT	2	12	241858	241869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379020011
105	NC_016928	CATAAA	2	12	247982	247993	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379020015
106	NC_016928	AAAACT	2	12	248057	248068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379020015
107	NC_016928	TGGTAT	2	12	271134	271145	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379020033
108	NC_016928	TATAGA	2	12	274488	274499	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379020037
109	NC_016928	ACGATG	2	12	281116	281127	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379020042
110	NC_016928	AGAATC	2	12	288675	288686	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379020047
111	NC_016928	AAGTAA	2	12	292098	292109	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379020052
112	NC_016928	ATAAAG	2	12	293079	293090	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379020053
113	NC_016928	GACATT	2	12	294740	294751	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379020054
114	NC_016928	GATTTC	2	12	296559	296570	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379020056
115	NC_016928	TTCATA	2	12	297129	297140	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379020057
116	NC_016928	GATTAT	2	12	301538	301549	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379020061
117	NC_016928	ATGGTG	2	12	301671	301682	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379020061
118	NC_016928	CAGCAA	2	12	302058	302069	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379020061
119	NC_016928	AAATGC	2	12	303092	303103	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379020062
120	NC_016928	TAATGG	2	12	303272	303283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379020062
121	NC_016928	TCTTCA	2	12	307644	307655	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379020066
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456	NC_016928	CTACAC	2	12	869446	869457	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	379020591
457	NC_016928	GATACA	2	12	874704	874715	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379020601
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