MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 2506

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016928	CAAAT	2	10	1471	1480	60 %	20 %	0 %	20 %	379019813
2	NC_016928	AATTT	2	10	2519	2528	40 %	60 %	0 %	0 %	379019814
3	NC_016928	CAATT	2	10	2585	2594	40 %	40 %	0 %	20 %	379019814
4	NC_016928	AAATT	2	10	2963	2972	60 %	40 %	0 %	0 %	379019814
5	NC_016928	GAAAA	2	10	3374	3383	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016928	CAAAT	2	10	5993	6002	60 %	20 %	0 %	20 %	379019818
7	NC_016928	TGAAT	2	10	7503	7512	40 %	40 %	20 %	0 %	379019818
8	NC_016928	TGAAC	2	10	7744	7753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016928	TTCAA	2	10	8490	8499	40 %	40 %	0 %	20 %	379019819
10	NC_016928	ATCGC	2	10	10952	10961	20 %	20 %	20 %	40 %	379019820
11	NC_016928	CGTTG	2	10	12495	12504	0 %	40 %	40 %	20 %	379019821
12	NC_016928	GTAGG	2	10	15166	15175	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016928	TTATT	2	10	16205	16214	20 %	80 %	0 %	0 %	379019824
14	NC_016928	TTTGA	2	10	17538	17547	20 %	60 %	20 %	0 %	379019825
15	NC_016928	TCAAT	2	10	19675	19684	40 %	40 %	0 %	20 %	379019827
16	NC_016928	AGTTA	2	10	22853	22862	40 %	40 %	20 %	0 %	379019829
17	NC_016928	ATGTA	2	10	24412	24421	40 %	40 %	20 %	0 %	379019830
18	NC_016928	TCGAT	2	10	24576	24585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016928	ATATT	2	10	25114	25123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016928	ACCAA	2	10	27016	27025	60 %	0 %	0 %	40 %	379019832
21	NC_016928	ATCAA	2	10	27728	27737	60 %	20 %	0 %	20 %	379019832
22	NC_016928	GAAAC	2	10	28349	28358	60 %	0 %	20 %	20 %	379019833
23	NC_016928	GAAGT	2	10	28499	28508	40 %	20 %	40 %	0 %	379019833
24	NC_016928	ATTAT	2	10	30142	30151	40 %	60 %	0 %	0 %	379019834
25	NC_016928	AACGA	2	10	30215	30224	60 %	0 %	20 %	20 %	379019834
26	NC_016928	AAACG	2	10	32048	32057	60 %	0 %	20 %	20 %	379019836
27	NC_016928	AAGGT	2	10	33220	33229	40 %	20 %	40 %	0 %	379019836
28	NC_016928	TATGA	2	10	33417	33426	40 %	40 %	20 %	0 %	379019836
29	NC_016928	GTTGT	2	10	33810	33819	0 %	60 %	40 %	0 %	379019836
30	NC_016928	CATTA	2	10	34647	34656	40 %	40 %	0 %	20 %	379019838
31	NC_016928	CAATT	2	10	35094	35103	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016928	GAATA	2	10	35789	35798	60 %	20 %	20 %	0 %	379019840
33	NC_016928	ATAAA	2	10	36268	36277	80 %	20 %	0 %	0 %	379019840
34	NC_016928	AAATC	2	10	41129	41138	60 %	20 %	0 %	20 %	379019845
35	NC_016928	CAAAC	2	10	41242	41251	60 %	0 %	0 %	40 %	379019845
36	NC_016928	TATGA	2	10	41653	41662	40 %	40 %	20 %	0 %	379019847
37	NC_016928	AAGCT	2	10	42878	42887	40 %	20 %	20 %	20 %	379019847
38	NC_016928	GAAAT	2	10	43357	43366	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016928	CATGG	2	10	44883	44892	20 %	20 %	40 %	20 %	379019850
40	NC_016928	ATGAG	2	10	46680	46689	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016928	TGAAT	2	10	47026	47035	40 %	40 %	20 %	0 %	379019852
42	NC_016928	TTGGT	2	10	47068	47077	0 %	60 %	40 %	0 %	379019852
43	NC_016928	AATAT	2	10	47136	47145	60 %	40 %	0 %	0 %	379019852
44	NC_016928	TTCGT	2	10	47347	47356	0 %	60 %	20 %	20 %	379019852
45	NC_016928	CAAAA	2	10	47707	47716	80 %	0 %	0 %	20 %	379019853
46	NC_016928	AAATT	2	10	49806	49815	60 %	40 %	0 %	0 %	379019854
47	NC_016928	GCCAT	2	10	51038	51047	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016928	TCAAA	2	10	53109	53118	60 %	20 %	0 %	20 %	379019857
49	NC_016928	TGAAA	2	10	53328	53337	60 %	20 %	20 %	0 %	379019858
50	NC_016928	AAAAC	2	10	53692	53701	80 %	0 %	0 %	20 %	379019859
51	NC_016928	AAATC	2	10	54101	54110	60 %	20 %	0 %	20 %	379019859
52	NC_016928	AAACT	2	10	55323	55332	60 %	20 %	0 %	20 %	379019860
53	NC_016928	ATAAA	2	10	55429	55438	80 %	20 %	0 %	0 %	379019860
54	NC_016928	AATAA	2	10	55908	55917	80 %	20 %	0 %	0 %	379019860
55	NC_016928	TATAG	2	10	56105	56114	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016928	AGCTA	2	10	56359	56368	40 %	20 %	20 %	20 %	379019861
57	NC_016928	TAGAT	2	10	56530	56539	40 %	40 %	20 %	0 %	379019861
58	NC_016928	TATGA	2	10	59497	59506	40 %	40 %	20 %	0 %	379019864
59	NC_016928	AAATA	2	10	60686	60695	80 %	20 %	0 %	0 %	379019864
60	NC_016928	TAAAT	2	10	61315	61324	60 %	40 %	0 %	0 %	379019865
61	NC_016928	ATACA	2	10	62045	62054	60 %	20 %	0 %	20 %	379019867
62	NC_016928	TCATA	2	10	64533	64542	40 %	40 %	0 %	20 %	379019869
63	NC_016928	TCGTT	2	10	64776	64785	0 %	60 %	20 %	20 %	379019869
64	NC_016928	AAGGT	2	10	65693	65702	40 %	20 %	40 %	0 %	379019869
65	NC_016928	TGATT	2	10	66727	66736	20 %	60 %	20 %	0 %	379019870
66	NC_016928	ATTTA	2	10	68827	68836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016928	ACGAT	2	10	68923	68932	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016928	TGATT	2	10	69902	69911	20 %	60 %	20 %	0 %	379019872
69	NC_016928	GGGTT	2	10	70098	70107	0 %	40 %	60 %	0 %	379019872
70	NC_016928	GAAAA	2	10	70696	70705	80 %	0 %	20 %	0 %	379019872
71	NC_016928	TCTTT	2	10	73965	73974	0 %	80 %	0 %	20 %	379019875
72	NC_016928	AATTA	2	10	74521	74530	60 %	40 %	0 %	0 %	379019875
73	NC_016928	GTGCT	2	10	75032	75041	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016928	TTGAT	2	10	75262	75271	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016928	GAATG	2	10	75369	75378	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016928	TACAG	2	10	76786	76795	40 %	20 %	20 %	20 %	379019876
77	NC_016928	ATAAA	2	10	77490	77499	80 %	20 %	0 %	0 %	379019876
78	NC_016928	TTTAA	2	10	77784	77793	40 %	60 %	0 %	0 %	379019877
79	NC_016928	AAAAT	2	10	78232	78241	80 %	20 %	0 %	0 %	379019877
80	NC_016928	ATTCC	2	10	79020	79029	20 %	40 %	0 %	40 %	379019878
81	NC_016928	GTATT	2	10	80413	80422	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016928	TGTTT	2	10	80824	80833	0 %	80 %	20 %	0 %	379019881
83	NC_016928	TTTGC	2	10	80910	80919	0 %	60 %	20 %	20 %	379019881
84	NC_016928	ATTTT	2	10	84184	84193	20 %	80 %	0 %	0 %	379019886
85	NC_016928	TATGG	2	10	86197	86206	20 %	40 %	40 %	0 %	379019888
86	NC_016928	TAACT	2	10	86502	86511	40 %	40 %	0 %	20 %	379019888
87	NC_016928	ATTTA	2	10	87196	87205	40 %	60 %	0 %	0 %	379019889
88	NC_016928	CAGAA	2	10	87286	87295	60 %	0 %	20 %	20 %	379019889
89	NC_016928	TAAAT	2	10	87781	87790	60 %	40 %	0 %	0 %	379019889
90	NC_016928	AATTA	2	10	88034	88043	60 %	40 %	0 %	0 %	379019890
91	NC_016928	GGATA	2	10	88574	88583	40 %	20 %	40 %	0 %	379019890
92	NC_016928	CAAAA	2	10	90712	90721	80 %	0 %	0 %	20 %	379019892
93	NC_016928	ATTGC	2	10	96374	96383	20 %	40 %	20 %	20 %	379019898
94	NC_016928	TCATT	2	10	96562	96571	20 %	60 %	0 %	20 %	379019898
95	NC_016928	TGAAA	2	10	98446	98455	60 %	20 %	20 %	0 %	379019899
96	NC_016928	TCAAT	2	10	98818	98827	40 %	40 %	0 %	20 %	379019899
97	NC_016928	GTATT	2	10	99307	99316	20 %	60 %	20 %	0 %	379019900
98	NC_016928	AGATA	2	10	105173	105182	60 %	20 %	20 %	0 %	379019903
99	NC_016928	TAAAA	2	10	105733	105742	80 %	20 %	0 %	0 %	379019903
100	NC_016928	ATACA	2	10	106164	106173	60 %	20 %	0 %	20 %	379019904
101	NC_016928	AAAGA	2	10	107367	107376	80 %	0 %	20 %	0 %	379019904
102	NC_016928	GTAAT	2	10	107586	107595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016928	CAATT	2	10	108018	108027	40 %	40 %	0 %	20 %	379019905
104	NC_016928	TTGCG	2	10	109423	109432	0 %	40 %	40 %	20 %	379019906
105	NC_016928	TTTTC	2	10	110894	110903	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016928	AGTTA	2	10	111631	111640	40 %	40 %	20 %	0 %	379019908
107	NC_016928	TTGCG	2	10	112139	112148	0 %	40 %	40 %	20 %	379019908
108	NC_016928	AGATG	2	10	115004	115013	40 %	20 %	40 %	0 %	379019910
109	NC_016928	GAAAA	2	10	119037	119046	80 %	0 %	20 %	0 %	379019914
110	NC_016928	AATCA	2	10	122226	122235	60 %	20 %	0 %	20 %	379019916
111	NC_016928	ATTTT	2	10	122924	122933	20 %	80 %	0 %	0 %	379019917
112	NC_016928	ATCAC	2	10	124184	124193	40 %	20 %	0 %	40 %	379019918
113	NC_016928	AACGA	2	10	124861	124870	60 %	0 %	20 %	20 %	379019918
114	NC_016928	ACACA	2	10	126917	126926	60 %	0 %	0 %	40 %	379019920
115	NC_016928	GACAA	2	10	128068	128077	60 %	0 %	20 %	20 %	379019921
116	NC_016928	TCTTA	2	10	128851	128860	20 %	60 %	0 %	20 %	379019922
117	NC_016928	ATTAC	2	10	130897	130906	40 %	40 %	0 %	20 %	379019924
118	NC_016928	ATTTT	2	10	131201	131210	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016928	TATCT	2	10	131557	131566	20 %	60 %	0 %	20 %	379019925
120	NC_016928	ATACG	2	10	133990	133999	40 %	20 %	20 %	20 %	379019927
121	NC_016928	TTATA	2	10	134648	134657	40 %	60 %	0 %	0 %	379019928
122	NC_016928	TATAA	2	10	135018	135027	60 %	40 %	0 %	0 %	379019928
123	NC_016928	TTTTA	2	10	135446	135455	20 %	80 %	0 %	0 %	379019928
124	NC_016928	AATAA	2	10	136552	136561	80 %	20 %	0 %	0 %	379019929
125	NC_016928	TACGC	2	10	136819	136828	20 %	20 %	20 %	40 %	379019929
126	NC_016928	TACTT	2	10	137946	137955	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016928	TTTAG	2	10	139772	139781	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016928	TCCCT	2	10	140690	140699	0 %	40 %	0 %	60 %	379019932
129	NC_016928	GCTTT	2	10	142924	142933	0 %	60 %	20 %	20 %	379019934
130	NC_016928	TAATT	2	10	143009	143018	40 %	60 %	0 %	0 %	379019934
131	NC_016928	ATACT	2	10	144190	144199	40 %	40 %	0 %	20 %	379019936
132	NC_016928	TAATA	2	10	145356	145365	60 %	40 %	0 %	0 %	379019937
133	NC_016928	ATTTT	2	10	146347	146356	20 %	80 %	0 %	0 %	379019938
134	NC_016928	TAAAA	2	10	146546	146555	80 %	20 %	0 %	0 %	379019938
135	NC_016928	TTGTA	2	10	148571	148580	20 %	60 %	20 %	0 %	379019940
136	NC_016928	TGCAA	2	10	149576	149585	40 %	20 %	20 %	20 %	379019941
137	NC_016928	ATATG	2	10	151594	151603	40 %	40 %	20 %	0 %	379019942
138	NC_016928	TATGA	2	10	153274	153283	40 %	40 %	20 %	0 %	379019944
139	NC_016928	AATAT	2	10	154280	154289	60 %	40 %	0 %	0 %	379019944
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