MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus M013 chromosome

Total Repeats: 36341

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016928	TAT	2	6	667	672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
2	NC_016928	CAA	2	6	705	710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019813
3	NC_016928	TGT	2	6	743	748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019813
4	NC_016928	TAC	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019813
5	NC_016928	GAA	2	6	783	788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
6	NC_016928	TAA	2	6	803	808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019813
7	NC_016928	ACA	2	6	831	836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019813
8	NC_016928	AAC	2	6	851	856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019813
9	NC_016928	ATT	2	6	995	1000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
10	NC_016928	TCA	2	6	1052	1057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019813
11	NC_016928	ATA	2	6	1066	1071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019813
12	NC_016928	TTA	2	6	1123	1128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
13	NC_016928	TTA	2	6	1188	1193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
14	NC_016928	GAT	2	6	1197	1202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019813
15	NC_016928	AAG	2	6	1234	1239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
16	NC_016928	AGA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
17	NC_016928	TTG	2	6	1366	1371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019813
18	NC_016928	CCA	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019813
19	NC_016928	AGA	2	6	1414	1419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
20	NC_016928	GAA	3	9	1425	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
21	NC_016928	CCA	2	6	1446	1451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019813
22	NC_016928	ATT	2	6	1538	1543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019813
23	NC_016928	CTG	2	6	1570	1575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019813
24	NC_016928	GAA	2	6	1776	1781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
25	NC_016928	TGG	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019813
26	NC_016928	AGA	2	6	1844	1849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
27	NC_016928	AAG	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019813
28	NC_016928	ATT	2	6	2207	2212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
29	NC_016928	TTA	2	6	2213	2218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
30	NC_016928	AAC	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019814
31	NC_016928	AGT	2	6	2406	2411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
32	NC_016928	TTG	2	6	2429	2434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019814
33	NC_016928	TTA	2	6	2557	2562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
34	NC_016928	AGA	2	6	2757	2762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019814
35	NC_016928	TCA	2	6	2783	2788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019814
36	NC_016928	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019814
37	NC_016928	TCT	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019814
38	NC_016928	ATT	2	6	2910	2915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
39	NC_016928	ACA	2	6	2935	2940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019814
40	NC_016928	TTA	2	6	3019	3024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019814
41	NC_016928	GGT	2	6	3034	3039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019814
42	NC_016928	TGA	2	6	3066	3071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
43	NC_016928	GTT	2	6	3073	3078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019814
44	NC_016928	TCT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019814
45	NC_016928	AGA	2	6	3117	3122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019814
46	NC_016928	GGT	2	6	3145	3150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019814
47	NC_016928	ATG	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019814
48	NC_016928	TTC	2	6	3229	3234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019814
49	NC_016928	GAC	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019814
50	NC_016928	AGA	2	6	3580	3585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019815
51	NC_016928	ACC	2	6	3711	3716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019815
52	NC_016928	ATC	2	6	3729	3734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019815
53	NC_016928	TTG	2	6	3737	3742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019815
54	NC_016928	AGT	2	6	3760	3765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019815
55	NC_016928	GAA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019815
56	NC_016928	AAG	2	6	4455	4460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019816
57	NC_016928	GTA	2	6	4463	4468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019816
58	NC_016928	ATT	2	6	4511	4516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019816
59	NC_016928	TGG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019816
60	NC_016928	ATG	2	6	4721	4726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019817
61	NC_016928	AGA	2	6	5034	5039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019817
62	NC_016928	CTC	2	6	5060	5065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379019817
63	NC_016928	GAC	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019817
64	NC_016928	CTG	2	6	5108	5113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019817
65	NC_016928	AAT	2	6	5161	5166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019817
66	NC_016928	CAG	2	6	5227	5232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019817
67	NC_016928	AAG	2	6	5333	5338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019817
68	NC_016928	ATT	2	6	5351	5356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019817
69	NC_016928	ATA	2	6	5429	5434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019817
70	NC_016928	GAT	2	6	5482	5487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019817
71	NC_016928	TTA	3	9	5617	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019817
72	NC_016928	GAT	2	6	5647	5652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019817
73	NC_016928	TTA	2	6	5668	5673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019817
74	NC_016928	ACA	2	6	5828	5833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019818
75	NC_016928	ATA	2	6	5960	5965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019818
76	NC_016928	GTT	2	6	6007	6012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019818
77	NC_016928	TGG	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019818
78	NC_016928	TGG	2	6	6162	6167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019818
79	NC_016928	TCA	2	6	6184	6189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019818
80	NC_016928	TCA	2	6	6249	6254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019818
81	NC_016928	AAG	2	6	6290	6295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019818
82	NC_016928	TGA	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019818
83	NC_016928	AGA	2	6	6471	6476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019818
84	NC_016928	ATG	2	6	6545	6550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019818
85	NC_016928	TCA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019818
86	NC_016928	GAT	2	6	6577	6582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019818
87	NC_016928	GGT	2	6	6667	6672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019818
88	NC_016928	AGA	2	6	6747	6752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019818
89	NC_016928	ATT	2	6	6888	6893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019818
90	NC_016928	TAT	2	6	6960	6965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019818
91	NC_016928	GGC	2	6	6966	6971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379019818
92	NC_016928	TGC	2	6	6984	6989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019818
93	NC_016928	CGT	2	6	7012	7017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019818
94	NC_016928	GAA	2	6	7081	7086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019818
95	NC_016928	TTA	2	6	7360	7365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019818
96	NC_016928	TTC	2	6	7369	7374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379019818
97	NC_016928	TAT	2	6	7462	7467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019818
98	NC_016928	ACA	2	6	7582	7587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019818
99	NC_016928	AGA	2	6	7701	7706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019818
100	NC_016928	TCG	2	6	7911	7916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019819
101	NC_016928	TTG	2	6	8081	8086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019819
102	NC_016928	GCA	3	9	8125	8133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379019819
103	NC_016928	TAA	2	6	8190	8195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019819
104	NC_016928	ATG	2	6	8222	8227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019819
105	NC_016928	TTA	2	6	8272	8277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019819
106	NC_016928	CCA	2	6	8323	8328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379019819
107	NC_016928	CTG	2	6	8432	8437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019819
108	NC_016928	GAA	2	6	8521	8526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019819
109	NC_016928	TTG	2	6	8549	8554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019819
110	NC_016928	TGA	2	6	8652	8657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019819
111	NC_016928	CAT	2	6	8759	8764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019819
112	NC_016928	TTA	2	6	8807	8812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019819
113	NC_016928	AAG	2	6	8819	8824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019819
114	NC_016928	ATT	2	6	8834	8839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019819
115	NC_016928	GTT	2	6	8857	8862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019819
116	NC_016928	AGA	2	6	8863	8868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019819
117	NC_016928	ATT	2	6	8953	8958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019819
118	NC_016928	CAA	2	6	9007	9012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019819
119	NC_016928	TTA	2	6	9115	9120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019819
120	NC_016928	TGA	2	6	9153	9158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019819
121	NC_016928	TTA	2	6	9166	9171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019819
122	NC_016928	TGA	2	6	9216	9221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019819
123	NC_016928	CGT	2	6	9223	9228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379019819
124	NC_016928	AGA	2	6	9282	9287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019819
125	NC_016928	ATA	2	6	9311	9316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379019819
126	NC_016928	GTG	2	6	9362	9367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019819
127	NC_016928	GTG	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019819
128	NC_016928	GAA	2	6	9397	9402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019819
129	NC_016928	ATG	2	6	9557	9562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019819
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131	NC_016928	GTG	2	6	9635	9640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379019819
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256	NC_016928	ATT	2	6	18397	18402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019826
257	NC_016928	AAC	2	6	18450	18455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379019826
258	NC_016928	TAC	2	6	18494	18499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379019826
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260	NC_016928	AGA	2	6	18609	18614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379019826
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263	NC_016928	TAT	2	6	18809	18814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379019826
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280	NC_016928	TGA	2	6	20233	20238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379019827
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288	NC_016928	TTG	2	6	20442	20447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379019827
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