MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 2825

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016915	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	379018507
2	NC_016915	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	379018507
3	NC_016915	ACTA	2	8	3303	3310	50 %	25 %	0 %	25 %	379018508
4	NC_016915	CAAA	2	8	3348	3355	75 %	0 %	0 %	25 %	379018508
5	NC_016915	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	379018508
6	NC_016915	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	379018508
7	NC_016915	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	379018508
8	NC_016915	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	379018508
9	NC_016915	ATAA	2	8	6891	6898	75 %	25 %	0 %	0 %	379018510
10	NC_016915	ATTT	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	379018511
11	NC_016915	CTGT	2	8	8116	8123	0 %	50 %	25 %	25 %	379018512
12	NC_016915	CCTC	2	8	9942	9949	0 %	25 %	0 %	75 %	379018514
13	NC_016915	CAAT	2	8	9989	9996	50 %	25 %	0 %	25 %	379018514
14	NC_016915	TTTA	2	8	11815	11822	25 %	75 %	0 %	0 %	379018516
15	NC_016915	GATT	2	8	12257	12264	25 %	50 %	25 %	0 %	379018517
16	NC_016915	AAAT	2	8	12265	12272	75 %	25 %	0 %	0 %	379018517
17	NC_016915	AATT	2	8	12292	12299	50 %	50 %	0 %	0 %	379018517
18	NC_016915	TTAA	2	8	12473	12480	50 %	50 %	0 %	0 %	379018517
19	NC_016915	ATGA	2	8	13172	13179	50 %	25 %	25 %	0 %	379018518
20	NC_016915	TAAA	2	8	14195	14202	75 %	25 %	0 %	0 %	379018519
21	NC_016915	TAAA	2	8	14354	14361	75 %	25 %	0 %	0 %	379018519
22	NC_016915	TCAT	2	8	14475	14482	25 %	50 %	0 %	25 %	379018519
23	NC_016915	CTTT	2	8	14609	14616	0 %	75 %	0 %	25 %	379018519
24	NC_016915	GCAA	2	8	14949	14956	50 %	0 %	25 %	25 %	379018520
25	NC_016915	TCTT	2	8	15026	15033	0 %	75 %	0 %	25 %	379018520
26	NC_016915	AGTA	2	8	15284	15291	50 %	25 %	25 %	0 %	379018521
27	NC_016915	GCTT	2	8	15810	15817	0 %	50 %	25 %	25 %	379018522
28	NC_016915	AATT	2	8	16159	16166	50 %	50 %	0 %	0 %	379018522
29	NC_016915	AATA	2	8	16783	16790	75 %	25 %	0 %	0 %	379018523
30	NC_016915	TCTA	2	8	17250	17257	25 %	50 %	0 %	25 %	379018523
31	NC_016915	ACGT	2	8	17673	17680	25 %	25 %	25 %	25 %	379018523
32	NC_016915	CTTG	2	8	17788	17795	0 %	50 %	25 %	25 %	379018523
33	NC_016915	AGTA	2	8	18856	18863	50 %	25 %	25 %	0 %	379018525
34	NC_016915	ATTA	2	8	18881	18888	50 %	50 %	0 %	0 %	379018525
35	NC_016915	AATA	2	8	18925	18932	75 %	25 %	0 %	0 %	379018525
36	NC_016915	CTTT	2	8	18970	18977	0 %	75 %	0 %	25 %	379018525
37	NC_016915	TAAA	2	8	19161	19168	75 %	25 %	0 %	0 %	379018525
38	NC_016915	AGAT	2	8	19349	19356	50 %	25 %	25 %	0 %	379018525
39	NC_016915	TAAA	2	8	19514	19521	75 %	25 %	0 %	0 %	379018526
40	NC_016915	GATA	2	8	19595	19602	50 %	25 %	25 %	0 %	379018526
41	NC_016915	GTAA	2	8	21151	21158	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
42	NC_016915	AGAT	2	8	21405	21412	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
43	NC_016915	AGCA	2	8	21524	21531	50 %	0 %	25 %	25 %	379018527
44	NC_016915	AAAT	2	8	21567	21574	75 %	25 %	0 %	0 %	379018527
45	NC_016915	AATG	2	8	21768	21775	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
46	NC_016915	ATTA	2	8	22069	22076	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
47	NC_016915	ATAG	2	8	22117	22124	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
48	NC_016915	ATAG	2	8	22129	22136	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
49	NC_016915	CGTT	2	8	22547	22554	0 %	50 %	25 %	25 %	379018527
50	NC_016915	TAGT	2	8	22994	23001	25 %	50 %	25 %	0 %	379018527
51	NC_016915	AAGC	2	8	23725	23732	50 %	0 %	25 %	25 %	379018527
52	NC_016915	TAAA	2	8	24077	24084	75 %	25 %	0 %	0 %	379018527
53	NC_016915	AAGT	2	8	24590	24597	50 %	25 %	25 %	0 %	379018527
54	NC_016915	TTCA	2	8	25139	25146	25 %	50 %	0 %	25 %	379018527
55	NC_016915	AATA	2	8	25632	25639	75 %	25 %	0 %	0 %	379018527
56	NC_016915	TAAA	2	8	25778	25785	75 %	25 %	0 %	0 %	379018527
57	NC_016915	ATGT	2	8	26578	26585	25 %	50 %	25 %	0 %	379018529
58	NC_016915	TTAT	2	8	26632	26639	25 %	75 %	0 %	0 %	379018529
59	NC_016915	AGCA	2	8	26706	26713	50 %	0 %	25 %	25 %	379018529
60	NC_016915	TAAT	2	8	27507	27514	50 %	50 %	0 %	0 %	379018530
61	NC_016915	AAGA	2	8	27659	27666	75 %	0 %	25 %	0 %	379018530
62	NC_016915	AAAT	2	8	27751	27758	75 %	25 %	0 %	0 %	379018530
63	NC_016915	ATTA	2	8	27779	27786	50 %	50 %	0 %	0 %	379018530
64	NC_016915	TCTA	2	8	29475	29482	25 %	50 %	0 %	25 %	379018534
65	NC_016915	ATTT	2	8	29519	29526	25 %	75 %	0 %	0 %	379018534
66	NC_016915	TGTC	2	8	29583	29590	0 %	50 %	25 %	25 %	379018534
67	NC_016915	ATAC	2	8	30180	30187	50 %	25 %	0 %	25 %	379018536
68	NC_016915	ATAA	2	8	30604	30611	75 %	25 %	0 %	0 %	379018536
69	NC_016915	CACT	2	8	30698	30705	25 %	25 %	0 %	50 %	379018536
70	NC_016915	TATT	2	8	31522	31529	25 %	75 %	0 %	0 %	379018538
71	NC_016915	AATT	2	8	33156	33163	50 %	50 %	0 %	0 %	379018540
72	NC_016915	TACC	2	8	33246	33253	25 %	25 %	0 %	50 %	379018540
73	NC_016915	GTTA	2	8	33628	33635	25 %	50 %	25 %	0 %	379018540
74	NC_016915	AAAC	2	8	35055	35062	75 %	0 %	0 %	25 %	379018542
75	NC_016915	TTAG	2	8	35231	35238	25 %	50 %	25 %	0 %	379018542
76	NC_016915	TTGC	2	8	35526	35533	0 %	50 %	25 %	25 %	379018542
77	NC_016915	TTCC	2	8	35766	35773	0 %	50 %	0 %	50 %	379018542
78	NC_016915	TGTT	2	8	36234	36241	0 %	75 %	25 %	0 %	379018543
79	NC_016915	TTGT	2	8	36840	36847	0 %	75 %	25 %	0 %	379018545
80	NC_016915	TATT	2	8	36919	36926	25 %	75 %	0 %	0 %	379018545
81	NC_016915	GTAA	2	8	36930	36937	50 %	25 %	25 %	0 %	379018545
82	NC_016915	GAAA	2	8	42821	42828	75 %	0 %	25 %	0 %	379018548
83	NC_016915	ATTT	2	8	42865	42872	25 %	75 %	0 %	0 %	379018548
84	NC_016915	ACAA	2	8	43132	43139	75 %	0 %	0 %	25 %	379018548
85	NC_016915	AAAT	2	8	43336	43343	75 %	25 %	0 %	0 %	379018549
86	NC_016915	TAAC	2	8	45221	45228	50 %	25 %	0 %	25 %	379018551
87	NC_016915	ATTC	2	8	45649	45656	25 %	50 %	0 %	25 %	379018551
88	NC_016915	ATGT	2	8	46005	46012	25 %	50 %	25 %	0 %	379018552
89	NC_016915	ATTT	2	8	46163	46170	25 %	75 %	0 %	0 %	379018552
90	NC_016915	TTAC	2	8	46242	46249	25 %	50 %	0 %	25 %	379018552
91	NC_016915	ATCA	2	8	46919	46926	50 %	25 %	0 %	25 %	379018553
92	NC_016915	TGCC	2	8	47229	47236	0 %	25 %	25 %	50 %	379018553
93	NC_016915	TATC	2	8	47788	47795	25 %	50 %	0 %	25 %	379018553
94	NC_016915	TTAA	2	8	47811	47818	50 %	50 %	0 %	0 %	379018553
95	NC_016915	TTGC	2	8	49279	49286	0 %	50 %	25 %	25 %	379018555
96	NC_016915	TGTT	2	8	49648	49655	0 %	75 %	25 %	0 %	379018556
97	NC_016915	AAGT	2	8	49685	49692	50 %	25 %	25 %	0 %	379018556
98	NC_016915	CTTG	2	8	50152	50159	0 %	50 %	25 %	25 %	379018557
99	NC_016915	TAAA	2	8	52807	52814	75 %	25 %	0 %	0 %	379018559
100	NC_016915	GAGG	2	8	52833	52840	25 %	0 %	75 %	0 %	379018559
101	NC_016915	ATTG	2	8	53216	53223	25 %	50 %	25 %	0 %	379018559
102	NC_016915	TTAT	2	8	53430	53437	25 %	75 %	0 %	0 %	379018559
103	NC_016915	TGCT	2	8	53512	53519	0 %	50 %	25 %	25 %	379018559
104	NC_016915	GTGA	2	8	53619	53626	25 %	25 %	50 %	0 %	379018559
105	NC_016915	CCGC	2	8	54386	54393	0 %	0 %	25 %	75 %	379018559
106	NC_016915	GTTC	2	8	54397	54404	0 %	50 %	25 %	25 %	379018559
107	NC_016915	GACC	2	8	54415	54422	25 %	0 %	25 %	50 %	379018559
108	NC_016915	AAAT	2	8	55135	55142	75 %	25 %	0 %	0 %	379018559
109	NC_016915	TAAG	2	8	55545	55552	50 %	25 %	25 %	0 %	379018560
110	NC_016915	ATAA	2	8	56172	56179	75 %	25 %	0 %	0 %	379018561
111	NC_016915	CTTT	2	8	56872	56879	0 %	75 %	0 %	25 %	379018561
112	NC_016915	ACTT	2	8	57383	57390	25 %	50 %	0 %	25 %	379018562
113	NC_016915	TTGC	2	8	57841	57848	0 %	50 %	25 %	25 %	379018562
114	NC_016915	ATAA	2	8	57873	57880	75 %	25 %	0 %	0 %	379018562
115	NC_016915	ATAA	2	8	57927	57934	75 %	25 %	0 %	0 %	379018562
116	NC_016915	CATC	2	8	58064	58071	25 %	25 %	0 %	50 %	379018562
117	NC_016915	ATTT	3	12	58240	58251	25 %	75 %	0 %	0 %	379018562
118	NC_016915	GTTA	2	8	58986	58993	25 %	50 %	25 %	0 %	379018564
119	NC_016915	AGAA	2	8	59619	59626	75 %	0 %	25 %	0 %	379018565
120	NC_016915	AAAG	2	8	59999	60006	75 %	0 %	25 %	0 %	379018566
121	NC_016915	TAAA	2	8	60066	60073	75 %	25 %	0 %	0 %	379018566
122	NC_016915	AAGA	2	8	61187	61194	75 %	0 %	25 %	0 %	379018568
123	NC_016915	AGTC	2	8	61422	61429	25 %	25 %	25 %	25 %	379018568
124	NC_016915	TAAT	2	8	61838	61845	50 %	50 %	0 %	0 %	379018568
125	NC_016915	ATTA	2	8	61914	61921	50 %	50 %	0 %	0 %	379018568
126	NC_016915	ATCT	2	8	62171	62178	25 %	50 %	0 %	25 %	379018568
127	NC_016915	GAAT	2	8	62735	62742	50 %	25 %	25 %	0 %	379018569
128	NC_016915	CAAG	2	8	62966	62973	50 %	0 %	25 %	25 %	379018569
129	NC_016915	ATGG	2	8	63289	63296	25 %	25 %	50 %	0 %	379018569
130	NC_016915	AAGA	2	8	63574	63581	75 %	0 %	25 %	0 %	379018569
131	NC_016915	GAAA	2	8	63660	63667	75 %	0 %	25 %	0 %	379018569
132	NC_016915	TTAA	2	8	65349	65356	50 %	50 %	0 %	0 %	379018572
133	NC_016915	GGAA	2	8	65405	65412	50 %	0 %	50 %	0 %	379018572
134	NC_016915	GCAT	2	8	65457	65464	25 %	25 %	25 %	25 %	379018572
135	NC_016915	TGCT	2	8	65684	65691	0 %	50 %	25 %	25 %	379018572
136	NC_016915	AATT	2	8	66507	66514	50 %	50 %	0 %	0 %	379018574
137	NC_016915	TGTT	2	8	66767	66774	0 %	75 %	25 %	0 %	379018574
138	NC_016915	TGAT	2	8	67316	67323	25 %	50 %	25 %	0 %	379018574
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