MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 4554

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016915	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016915	TGT	2	6	940	945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016915	GTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016915	TAT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016915	TTC	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016915	TCT	2	6	7693	7698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016915	AAT	2	6	7736	7741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016915	GCT	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016915	GAC	2	6	7830	7835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016915	CAA	3	9	7849	7857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016915	TAT	2	6	8964	8969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016915	CAA	2	6	8971	8976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016915	ATG	2	6	9015	9020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016915	AGC	2	6	9032	9037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016915	ATA	2	6	9062	9067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016915	CAA	2	6	9137	9142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016915	AAG	2	6	9211	9216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016915	TAA	2	6	9277	9282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016915	TAA	2	6	9298	9303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016915	TAA	2	6	9547	9552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016915	AGA	2	6	9631	9636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016915	TAT	2	6	10305	10310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016915	AAC	2	6	10311	10316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016915	TTG	2	6	10419	10424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016915	AAT	2	6	10514	10519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016915	ATC	2	6	10550	10555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016915	GTT	2	6	10570	10575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016915	GTA	2	6	10657	10662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016915	ACT	2	6	10703	10708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016915	TTG	2	6	10718	10723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016915	CTT	2	6	10768	10773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016915	TAT	2	6	10850	10855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016915	ATA	2	6	10971	10976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016915	TAC	2	6	10981	10986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016915	AAC	2	6	11044	11049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016915	ATT	2	6	11082	11087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016915	TAT	2	6	11098	11103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016915	TGG	2	6	11259	11264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016915	AGA	2	6	11360	11365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016915	CAT	2	6	11436	11441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016915	TTA	2	6	11475	11480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016915	ATA	2	6	11543	11548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016915	TTA	2	6	12783	12788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016915	TAA	2	6	14863	14868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016915	GTT	2	6	14884	14889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016915	GAA	2	6	14902	14907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016915	TTG	2	6	17983	17988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016915	GTC	2	6	18001	18006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016915	ATT	2	6	18077	18082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016915	TTA	2	6	18249	18254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016915	TTA	2	6	18259	18264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016915	TTA	2	6	18333	18338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016915	ATT	2	6	19410	19415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016915	TAC	2	6	19778	19783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016915	TCC	2	6	19787	19792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016915	AAT	2	6	19903	19908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016915	TTG	2	6	19989	19994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016915	AAT	2	6	20029	20034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016915	ATT	2	6	20071	20076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016915	ACC	2	6	25968	25973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016915	AAT	2	6	26048	26053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016915	CAC	2	6	26067	26072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016915	TAC	2	6	26284	26289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016915	AAT	2	6	26425	26430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016915	CTT	2	6	26754	26759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016915	AAT	2	6	26833	26838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016915	AGT	2	6	26952	26957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016915	TAA	2	6	27016	27021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016915	TAA	2	6	27037	27042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016915	GAT	2	6	28131	28136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016915	GTA	2	6	28203	28208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016915	ATG	2	6	28219	28224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016915	ATA	2	6	28416	28421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016915	TAT	2	6	28560	28565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016915	ATG	2	6	28701	28706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016915	TAA	2	6	30032	30037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016915	CGA	2	6	31189	31194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016915	TTA	2	6	32109	32114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016915	TAA	2	6	32170	32175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016915	ATA	2	6	32202	32207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016915	GGA	2	6	32244	32249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016915	CTC	2	6	32860	32865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016915	ACT	2	6	32962	32967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016915	CAA	2	6	32994	32999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016915	ATA	2	6	34725	34730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016915	ATT	2	6	35049	35054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016915	AAT	2	6	36155	36160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016915	TTC	3	9	36572	36580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016915	TGA	2	6	36670	36675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016915	GAT	2	6	36745	36750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016915	AAT	2	6	37368	37373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016915	TAT	2	6	37407	37412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016915	TAA	2	6	37716	37721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016915	ATC	2	6	37759	37764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016915	ATT	2	6	37768	37773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016915	CTT	2	6	37853	37858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016915	ATT	2	6	37893	37898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016915	TTC	2	6	37911	37916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016915	TAA	2	6	37925	37930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016915	ATT	2	6	37969	37974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016915	TCC	2	6	38001	38006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_016915	TTG	2	6	38122	38127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016915	ATT	2	6	38133	38138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016915	AAT	2	6	38206	38211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016915	ATT	2	6	38253	38258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016915	GTT	2	6	38324	38329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016915	ACC	2	6	38389	38394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016915	ATA	2	6	38461	38466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016915	TTA	2	6	38533	38538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016915	CGC	2	6	38602	38607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016915	AAT	2	6	38696	38701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016915	GAG	2	6	38832	38837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016915	GTG	2	6	38878	38883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016915	TTA	2	6	38919	38924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016915	AAT	2	6	38949	38954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016915	ATA	2	6	38980	38985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016915	CAC	2	6	39729	39734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016915	ATT	2	6	39840	39845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016915	ATA	2	6	39849	39854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016915	GAA	2	6	39865	39870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016915	AAT	2	6	39881	39886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016915	TCT	2	6	39967	39972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016915	GAA	2	6	40039	40044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016915	ATT	2	6	40045	40050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016915	ATA	2	6	40076	40081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016915	TTC	2	6	40107	40112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016915	ATT	2	6	40225	40230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016915	CTT	2	6	40247	40252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016915	TAA	2	6	40292	40297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016915	CTT	2	6	40309	40314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016915	AGT	2	6	40331	40336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016915	AGC	2	6	40427	40432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016915	TTG	2	6	40468	40473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016915	TTG	2	6	40499	40504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016915	TAA	2	6	40595	40600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016915	CTT	2	6	40732	40737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016915	TAT	2	6	40780	40785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016915	TAA	2	6	41043	41048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016915	AGA	2	6	41169	41174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016915	TCT	2	6	41265	41270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016915	TAA	2	6	41280	41285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016915	CTT	2	6	41406	41411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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