MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hlp#2 chromosome

Total Repeats: 2034

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016915	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	379018504
2	NC_016915	TC	3	6	1521	1526	0 %	50 %	0 %	50 %	379018506
3	NC_016915	AT	3	6	1646	1651	50 %	50 %	0 %	0 %	379018506
4	NC_016915	TA	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	379018506
5	NC_016915	GA	3	6	2332	2337	50 %	0 %	50 %	0 %	379018507
6	NC_016915	TA	3	6	2496	2501	50 %	50 %	0 %	0 %	379018507
7	NC_016915	TG	3	6	2612	2617	0 %	50 %	50 %	0 %	379018507
8	NC_016915	AT	3	6	2756	2761	50 %	50 %	0 %	0 %	379018507
9	NC_016915	TC	3	6	3069	3074	0 %	50 %	0 %	50 %	379018508
10	NC_016915	TG	3	6	3437	3442	0 %	50 %	50 %	0 %	379018508
11	NC_016915	GA	3	6	3544	3549	50 %	0 %	50 %	0 %	379018508
12	NC_016915	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	379018508
13	NC_016915	AT	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	379018508
14	NC_016915	AG	3	6	4335	4340	50 %	0 %	50 %	0 %	379018508
15	NC_016915	TA	3	6	4423	4428	50 %	50 %	0 %	0 %	379018508
16	NC_016915	TA	3	6	4675	4680	50 %	50 %	0 %	0 %	379018508
17	NC_016915	AT	3	6	4867	4872	50 %	50 %	0 %	0 %	379018508
18	NC_016915	AT	3	6	5901	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	379018508
19	NC_016915	TA	3	6	6247	6252	50 %	50 %	0 %	0 %	379018509
20	NC_016915	TA	3	6	8519	8524	50 %	50 %	0 %	0 %	379018512
21	NC_016915	GT	3	6	9724	9729	0 %	50 %	50 %	0 %	379018514
22	NC_016915	TA	3	6	9825	9830	50 %	50 %	0 %	0 %	379018514
23	NC_016915	TA	3	6	11623	11628	50 %	50 %	0 %	0 %	379018515
24	NC_016915	AC	3	6	12338	12343	50 %	0 %	0 %	50 %	379018517
25	NC_016915	TA	3	6	12375	12380	50 %	50 %	0 %	0 %	379018517
26	NC_016915	TA	3	6	12641	12646	50 %	50 %	0 %	0 %	379018517
27	NC_016915	TA	3	6	14218	14223	50 %	50 %	0 %	0 %	379018519
28	NC_016915	AG	3	6	14991	14996	50 %	0 %	50 %	0 %	379018520
29	NC_016915	AT	3	6	15404	15409	50 %	50 %	0 %	0 %	379018521
30	NC_016915	AT	3	6	15818	15823	50 %	50 %	0 %	0 %	379018522
31	NC_016915	TA	3	6	15846	15851	50 %	50 %	0 %	0 %	379018522
32	NC_016915	AT	3	6	17319	17324	50 %	50 %	0 %	0 %	379018523
33	NC_016915	TG	3	6	17858	17863	0 %	50 %	50 %	0 %	379018523
34	NC_016915	AT	3	6	19071	19076	50 %	50 %	0 %	0 %	379018525
35	NC_016915	AG	3	6	22832	22837	50 %	0 %	50 %	0 %	379018527
36	NC_016915	CA	3	6	22864	22869	50 %	0 %	0 %	50 %	379018527
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38	NC_016915	TA	3	6	23390	23395	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
39	NC_016915	TA	3	6	23517	23522	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
40	NC_016915	AT	3	6	23560	23565	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
41	NC_016915	TA	3	6	24274	24279	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
42	NC_016915	TA	3	6	24373	24378	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
43	NC_016915	TA	3	6	25451	25456	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
44	NC_016915	AT	3	6	25508	25513	50 %	50 %	0 %	0 %	379018527
45	NC_016915	AT	3	6	28062	28067	50 %	50 %	0 %	0 %	379018531
46	NC_016915	AT	4	8	28286	28293	50 %	50 %	0 %	0 %	379018532
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50	NC_016915	AT	3	6	29873	29878	50 %	50 %	0 %	0 %	379018535
51	NC_016915	AT	3	6	31684	31689	50 %	50 %	0 %	0 %	379018538
52	NC_016915	TG	3	6	31859	31864	0 %	50 %	50 %	0 %	379018538
53	NC_016915	AT	3	6	32494	32499	50 %	50 %	0 %	0 %	379018539
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55	NC_016915	AT	3	6	33782	33787	50 %	50 %	0 %	0 %	379018540
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62	NC_016915	AT	3	6	44019	44024	50 %	50 %	0 %	0 %	379018550
63	NC_016915	AT	3	6	44043	44048	50 %	50 %	0 %	0 %	379018550
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66	NC_016915	AT	3	6	46935	46940	50 %	50 %	0 %	0 %	379018553
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68	NC_016915	TC	3	6	47244	47249	0 %	50 %	0 %	50 %	379018553
69	NC_016915	AT	3	6	47891	47896	50 %	50 %	0 %	0 %	379018553
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84	NC_016915	AT	3	6	62252	62257	50 %	50 %	0 %	0 %	379018568
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102	NC_016915	TA	3	6	71110	71115	50 %	50 %	0 %	0 %	379018578
103	NC_016915	TA	3	6	71342	71347	50 %	50 %	0 %	0 %	379018578
104	NC_016915	AT	3	6	71707	71712	50 %	50 %	0 %	0 %	379018578
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111	NC_016915	AT	3	6	76081	76086	50 %	50 %	0 %	0 %	379018585
112	NC_016915	TA	4	8	76828	76835	50 %	50 %	0 %	0 %	379018585
113	NC_016915	AT	3	6	77315	77320	50 %	50 %	0 %	0 %	379018585
114	NC_016915	TA	3	6	78367	78372	50 %	50 %	0 %	0 %	379018586
115	NC_016915	AT	3	6	79119	79124	50 %	50 %	0 %	0 %	379018587
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119	NC_016915	AT	3	6	81349	81354	50 %	50 %	0 %	0 %	379018589
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123	NC_016915	TA	3	6	82132	82137	50 %	50 %	0 %	0 %	379018590
124	NC_016915	AT	3	6	82462	82467	50 %	50 %	0 %	0 %	379018590
125	NC_016915	AT	3	6	82494	82499	50 %	50 %	0 %	0 %	379018590
126	NC_016915	AG	4	8	82835	82842	50 %	0 %	50 %	0 %	379018591
127	NC_016915	TA	3	6	83945	83950	50 %	50 %	0 %	0 %	379018592
128	NC_016915	AT	3	6	85231	85236	50 %	50 %	0 %	0 %	379018592
129	NC_016915	AT	3	6	86134	86139	50 %	50 %	0 %	0 %	379018594
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