MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 2795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016914	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	379017171
2	NC_016914	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	379017171
3	NC_016914	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	379017172
4	NC_016914	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	379017172
5	NC_016914	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	379017172
6	NC_016914	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	379017172
7	NC_016914	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	379017172
8	NC_016914	ATAA	2	8	6891	6898	75 %	25 %	0 %	0 %	379017174
9	NC_016914	ATTT	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	379017175
10	NC_016914	CTGT	2	8	8116	8123	0 %	50 %	25 %	25 %	379017176
11	NC_016914	CCTC	2	8	9845	9852	0 %	25 %	0 %	75 %	379017178
12	NC_016914	CAAT	2	8	9892	9899	50 %	25 %	0 %	25 %	379017178
13	NC_016914	TTTA	2	8	11714	11721	25 %	75 %	0 %	0 %	379017181
14	NC_016914	GATT	2	8	12158	12165	25 %	50 %	25 %	0 %	379017182
15	NC_016914	AAAT	2	8	12166	12173	75 %	25 %	0 %	0 %	379017182
16	NC_016914	AATT	2	8	12193	12200	50 %	50 %	0 %	0 %	379017182
17	NC_016914	ATGA	2	8	13071	13078	50 %	25 %	25 %	0 %	379017183
18	NC_016914	TAAA	2	8	14094	14101	75 %	25 %	0 %	0 %	379017184
19	NC_016914	TAAA	2	8	14253	14260	75 %	25 %	0 %	0 %	379017184
20	NC_016914	TCAT	2	8	14374	14381	25 %	50 %	0 %	25 %	379017184
21	NC_016914	CTTT	2	8	14508	14515	0 %	75 %	0 %	25 %	379017184
22	NC_016914	GCAA	2	8	14849	14856	50 %	0 %	25 %	25 %	379017185
23	NC_016914	TCTT	2	8	14926	14933	0 %	75 %	0 %	25 %	379017185
24	NC_016914	AGTA	2	8	15184	15191	50 %	25 %	25 %	0 %	379017186
25	NC_016914	GCTT	2	8	15710	15717	0 %	50 %	25 %	25 %	379017187
26	NC_016914	AATT	2	8	16059	16066	50 %	50 %	0 %	0 %	379017187
27	NC_016914	AATA	2	8	16683	16690	75 %	25 %	0 %	0 %	379017188
28	NC_016914	TCTA	2	8	17150	17157	25 %	50 %	0 %	25 %	379017188
29	NC_016914	ACGT	2	8	17573	17580	25 %	25 %	25 %	25 %	379017188
30	NC_016914	CTTG	2	8	17688	17695	0 %	50 %	25 %	25 %	379017188
31	NC_016914	AGTA	2	8	18754	18761	50 %	25 %	25 %	0 %	379017190
32	NC_016914	ATTA	2	8	18779	18786	50 %	50 %	0 %	0 %	379017190
33	NC_016914	AATA	2	8	18823	18830	75 %	25 %	0 %	0 %	379017190
34	NC_016914	CTTT	2	8	18868	18875	0 %	75 %	0 %	25 %	379017190
35	NC_016914	TAAA	2	8	19059	19066	75 %	25 %	0 %	0 %	379017190
36	NC_016914	AGAT	2	8	19247	19254	50 %	25 %	25 %	0 %	379017190
37	NC_016914	TAAA	2	8	19412	19419	75 %	25 %	0 %	0 %	379017191
38	NC_016914	GTAA	2	8	21039	21046	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
39	NC_016914	AGAT	2	8	21293	21300	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
40	NC_016914	AGCA	2	8	21412	21419	50 %	0 %	25 %	25 %	379017193
41	NC_016914	AAAT	2	8	21455	21462	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
42	NC_016914	AATG	2	8	21656	21663	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
43	NC_016914	ATTA	2	8	21957	21964	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
44	NC_016914	ATAG	2	8	22005	22012	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
45	NC_016914	ATAG	2	8	22017	22024	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
46	NC_016914	CGTT	2	8	22435	22442	0 %	50 %	25 %	25 %	379017193
47	NC_016914	TAGT	2	8	22882	22889	25 %	50 %	25 %	0 %	379017193
48	NC_016914	AAGC	2	8	23622	23629	50 %	0 %	25 %	25 %	379017193
49	NC_016914	TAAA	2	8	23947	23954	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
50	NC_016914	AAGT	2	8	24457	24464	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
51	NC_016914	AAGT	2	8	24544	24551	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
52	NC_016914	AAGT	2	8	24631	24638	50 %	25 %	25 %	0 %	379017193
53	NC_016914	TTCA	2	8	25180	25187	25 %	50 %	0 %	25 %	379017193
54	NC_016914	AATA	2	8	25673	25680	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
55	NC_016914	TAAA	2	8	25819	25826	75 %	25 %	0 %	0 %	379017193
56	NC_016914	ATGT	2	8	26618	26625	25 %	50 %	25 %	0 %	379017195
57	NC_016914	TTAT	2	8	26672	26679	25 %	75 %	0 %	0 %	379017195
58	NC_016914	AGCA	2	8	26746	26753	50 %	0 %	25 %	25 %	379017195
59	NC_016914	TAAT	2	8	27547	27554	50 %	50 %	0 %	0 %	379017196
60	NC_016914	AAGA	2	8	27699	27706	75 %	0 %	25 %	0 %	379017196
61	NC_016914	AAAT	2	8	27791	27798	75 %	25 %	0 %	0 %	379017196
62	NC_016914	ATTA	2	8	27819	27826	50 %	50 %	0 %	0 %	379017196
63	NC_016914	TCTA	2	8	29515	29522	25 %	50 %	0 %	25 %	379017200
64	NC_016914	ATTT	2	8	29559	29566	25 %	75 %	0 %	0 %	379017200
65	NC_016914	TGTC	2	8	29623	29630	0 %	50 %	25 %	25 %	379017200
66	NC_016914	ATAC	2	8	30220	30227	50 %	25 %	0 %	25 %	379017202
67	NC_016914	ATAA	2	8	30644	30651	75 %	25 %	0 %	0 %	379017202
68	NC_016914	CACT	2	8	30738	30745	25 %	25 %	0 %	50 %	379017202
69	NC_016914	TATT	2	8	31562	31569	25 %	75 %	0 %	0 %	379017204
70	NC_016914	AATT	2	8	33196	33203	50 %	50 %	0 %	0 %	379017206
71	NC_016914	TACC	2	8	33286	33293	25 %	25 %	0 %	50 %	379017206
72	NC_016914	GTTA	2	8	33668	33675	25 %	50 %	25 %	0 %	379017206
73	NC_016914	AAAC	2	8	35091	35098	75 %	0 %	0 %	25 %	379017208
74	NC_016914	TTAG	2	8	35267	35274	25 %	50 %	25 %	0 %	379017208
75	NC_016914	TTGC	2	8	35562	35569	0 %	50 %	25 %	25 %	379017208
76	NC_016914	TTCC	2	8	35802	35809	0 %	50 %	0 %	50 %	379017208
77	NC_016914	TGTT	2	8	36270	36277	0 %	75 %	25 %	0 %	379017209
78	NC_016914	TTGT	2	8	36876	36883	0 %	75 %	25 %	0 %	379017210
79	NC_016914	TATT	2	8	36955	36962	25 %	75 %	0 %	0 %	379017210
80	NC_016914	GTAA	2	8	36966	36973	50 %	25 %	25 %	0 %	379017210
81	NC_016914	AATG	2	8	37738	37745	50 %	25 %	25 %	0 %	379017212
82	NC_016914	GTTT	2	8	38252	38259	0 %	75 %	25 %	0 %	379017212
83	NC_016914	TAAA	2	8	41130	41137	75 %	25 %	0 %	0 %	379017214
84	NC_016914	ATTT	2	8	41235	41242	25 %	75 %	0 %	0 %	379017214
85	NC_016914	GAAA	2	8	42866	42873	75 %	0 %	25 %	0 %	379017216
86	NC_016914	ATTT	2	8	42910	42917	25 %	75 %	0 %	0 %	379017216
87	NC_016914	ACAA	2	8	43177	43184	75 %	0 %	0 %	25 %	379017216
88	NC_016914	AAAT	2	8	43381	43388	75 %	25 %	0 %	0 %	379017217
89	NC_016914	TAAC	2	8	45266	45273	50 %	25 %	0 %	25 %	379017219
90	NC_016914	ATTC	2	8	45695	45702	25 %	50 %	0 %	25 %	379017220
91	NC_016914	ATGT	2	8	46051	46058	25 %	50 %	25 %	0 %	379017221
92	NC_016914	ATTT	2	8	46210	46217	25 %	75 %	0 %	0 %	379017221
93	NC_016914	TTAC	2	8	46289	46296	25 %	50 %	0 %	25 %	379017221
94	NC_016914	ATCA	2	8	46966	46973	50 %	25 %	0 %	25 %	379017222
95	NC_016914	TGCC	2	8	47276	47283	0 %	25 %	25 %	50 %	379017222
96	NC_016914	TATC	2	8	47835	47842	25 %	50 %	0 %	25 %	379017222
97	NC_016914	TTAA	2	8	47858	47865	50 %	50 %	0 %	0 %	379017222
98	NC_016914	TTGC	2	8	49327	49334	0 %	50 %	25 %	25 %	379017224
99	NC_016914	TGTT	2	8	49696	49703	0 %	75 %	25 %	0 %	379017225
100	NC_016914	CTTG	2	8	50200	50207	0 %	50 %	25 %	25 %	379017226
101	NC_016914	TGCT	2	8	50952	50959	0 %	50 %	25 %	25 %	379017228
102	NC_016914	TAAA	2	8	52851	52858	75 %	25 %	0 %	0 %	379017229
103	NC_016914	GAGG	2	8	52877	52884	25 %	0 %	75 %	0 %	379017229
104	NC_016914	ATTG	2	8	53260	53267	25 %	50 %	25 %	0 %	379017229
105	NC_016914	TTAT	2	8	53474	53481	25 %	75 %	0 %	0 %	379017229
106	NC_016914	TGCT	2	8	53556	53563	0 %	50 %	25 %	25 %	379017229
107	NC_016914	GTGA	2	8	53663	53670	25 %	25 %	50 %	0 %	379017229
108	NC_016914	CCGC	2	8	54430	54437	0 %	0 %	25 %	75 %	379017229
109	NC_016914	GTTC	2	8	54441	54448	0 %	50 %	25 %	25 %	379017229
110	NC_016914	GACC	2	8	54459	54466	25 %	0 %	25 %	50 %	379017229
111	NC_016914	AAAT	2	8	55179	55186	75 %	25 %	0 %	0 %	379017229
112	NC_016914	TAAG	2	8	55579	55586	50 %	25 %	25 %	0 %	379017230
113	NC_016914	ATAA	2	8	56206	56213	75 %	25 %	0 %	0 %	379017231
114	NC_016914	CTTT	2	8	56906	56913	0 %	75 %	0 %	25 %	379017231
115	NC_016914	ACTT	2	8	57418	57425	25 %	50 %	0 %	25 %	379017232
116	NC_016914	TTGC	2	8	57876	57883	0 %	50 %	25 %	25 %	379017232
117	NC_016914	ATAA	2	8	57908	57915	75 %	25 %	0 %	0 %	379017232
118	NC_016914	ATAA	2	8	57962	57969	75 %	25 %	0 %	0 %	379017232
119	NC_016914	CATC	2	8	58099	58106	25 %	25 %	0 %	50 %	379017232
120	NC_016914	ATTT	3	12	58275	58286	25 %	75 %	0 %	0 %	379017232
121	NC_016914	AGAA	2	8	59652	59659	75 %	0 %	25 %	0 %	379017234
122	NC_016914	AAAG	2	8	60032	60039	75 %	0 %	25 %	0 %	379017235
123	NC_016914	TAAA	2	8	60099	60106	75 %	25 %	0 %	0 %	379017235
124	NC_016914	AAGA	2	8	61220	61227	75 %	0 %	25 %	0 %	379017237
125	NC_016914	AGTC	2	8	61455	61462	25 %	25 %	25 %	25 %	379017237
126	NC_016914	TAAT	2	8	61871	61878	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
127	NC_016914	ATTA	2	8	61947	61954	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
128	NC_016914	ATCT	2	8	62204	62211	25 %	50 %	0 %	25 %	379017237
129	NC_016914	GAAT	2	8	62768	62775	50 %	25 %	25 %	0 %	379017238
130	NC_016914	CAAG	2	8	62999	63006	50 %	0 %	25 %	25 %	379017238
131	NC_016914	ATGG	2	8	63322	63329	25 %	25 %	50 %	0 %	379017238
132	NC_016914	AAGA	2	8	63607	63614	75 %	0 %	25 %	0 %	379017238
133	NC_016914	GAAA	2	8	63693	63700	75 %	0 %	25 %	0 %	379017238
134	NC_016914	TTAA	2	8	65356	65363	50 %	50 %	0 %	0 %	379017240
135	NC_016914	GGAA	2	8	65412	65419	50 %	0 %	50 %	0 %	379017240
136	NC_016914	GCAT	2	8	65464	65471	25 %	25 %	25 %	25 %	379017240
137	NC_016914	TGCT	2	8	65691	65698	0 %	50 %	25 %	25 %	379017240
138	NC_016914	AATT	2	8	66514	66521	50 %	50 %	0 %	0 %	379017242
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