MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 4459

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016914	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016914	TGT	2	6	940	945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016914	GTT	2	6	6060	6065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016914	TAT	2	6	6339	6344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016914	TTC	2	6	6365	6370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016914	TCT	2	6	7693	7698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016914	AAT	2	6	7736	7741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016914	GCT	2	6	7818	7823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016914	GAC	2	6	7830	7835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016914	CAA	3	9	7849	7857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016914	TAT	2	6	8964	8969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016914	CAA	2	6	8971	8976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016914	ATG	2	6	9015	9020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016914	AGC	2	6	9032	9037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016914	ATA	2	6	9062	9067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016914	CAA	2	6	9137	9142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016914	AAG	2	6	9212	9217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016914	TAA	2	6	9450	9455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016914	AGA	2	6	9534	9539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016914	TAT	2	6	10207	10212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016914	AAC	2	6	10213	10218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016914	TTG	2	6	10321	10326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016914	AAT	2	6	10413	10418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016914	ATC	2	6	10449	10454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016914	GTT	2	6	10469	10474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016914	GGT	2	6	10501	10506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016914	GTA	2	6	10556	10561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016914	ACT	2	6	10602	10607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016914	TTG	2	6	10617	10622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016914	CTT	2	6	10667	10672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016914	TAT	2	6	10749	10754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016914	ATA	2	6	10870	10875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016914	TAC	2	6	10880	10885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016914	AAC	2	6	10944	10949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016914	ATT	2	6	10982	10987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016914	TAT	2	6	10998	11003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016914	TGG	2	6	11159	11164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016914	AGA	2	6	11260	11265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016914	CAT	2	6	11336	11341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016914	TTA	2	6	11375	11380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016914	ATA	2	6	11443	11448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016914	TTA	2	6	12360	12365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016914	GTG	2	6	12464	12469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016914	TCG	2	6	12572	12577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016914	TTA	2	6	12682	12687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016914	TAA	2	6	14763	14768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016914	GTT	2	6	14784	14789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016914	GAA	2	6	14802	14807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016914	GTC	2	6	17901	17906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016914	ATT	2	6	17976	17981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016914	TTA	2	6	18148	18153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016914	TTA	2	6	18158	18163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016914	TTA	2	6	18232	18237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016914	ATT	2	6	19308	19313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016914	GTA	2	6	19530	19535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016914	AAT	2	6	19801	19806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016914	TTG	2	6	19887	19892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016914	AAT	2	6	19927	19932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016914	ATT	2	6	19969	19974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016914	ACC	2	6	26009	26014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016914	AAT	2	6	26089	26094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016914	CAC	2	6	26108	26113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016914	TAC	2	6	26325	26330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016914	AAT	2	6	26466	26471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016914	CTT	2	6	26794	26799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016914	AAT	2	6	26873	26878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016914	AGT	2	6	26992	26997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016914	TAA	2	6	27056	27061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016914	TAA	2	6	27077	27082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016914	GAT	2	6	28171	28176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016914	GTA	2	6	28243	28248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016914	ATG	2	6	28259	28264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016914	ATA	2	6	28456	28461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016914	TAT	2	6	28600	28605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016914	ATG	2	6	28741	28746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016914	TAA	2	6	30072	30077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016914	CGA	2	6	31229	31234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016914	TTA	2	6	32149	32154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016914	TAA	2	6	32210	32215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016914	ATA	2	6	32242	32247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016914	GGA	2	6	32284	32289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016914	CTC	2	6	32900	32905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016914	ACT	2	6	33002	33007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016914	CAA	2	6	33034	33039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016914	ATA	2	6	34761	34766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016914	ATT	2	6	35085	35090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016914	AAT	2	6	36191	36196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016914	CTT	2	6	36548	36553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016914	TTC	3	9	36608	36616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016914	TGA	2	6	36706	36711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016914	GAT	2	6	36781	36786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016914	AAT	2	6	37404	37409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016914	CGC	2	6	38656	38661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016914	TAT	2	6	38862	38867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016914	GAG	2	6	38886	38891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016914	GTG	2	6	38931	38936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016914	TTA	2	6	38972	38977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016914	AAT	2	6	39002	39007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016914	ATA	2	6	39033	39038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016914	CAC	2	6	39782	39787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016914	ATT	2	6	39893	39898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016914	ATA	2	6	39902	39907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016914	GAA	2	6	39918	39923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016914	AAT	2	6	39934	39939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016914	TCT	2	6	40020	40025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016914	GAA	2	6	40092	40097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016914	ATT	2	6	40098	40103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016914	ATA	2	6	40129	40134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016914	TTC	2	6	40160	40165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016914	ATT	2	6	40278	40283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016914	CTT	2	6	40300	40305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016914	TAA	2	6	40345	40350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016914	CTT	2	6	40362	40367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016914	AGT	2	6	40384	40389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016914	AGC	2	6	40480	40485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016914	TTG	2	6	40521	40526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016914	TTG	2	6	40552	40557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016914	TAA	2	6	40648	40653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016914	TAT	2	6	40833	40838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016914	AAT	2	6	40889	40894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016914	TAA	2	6	41096	41101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016914	CTT	2	6	41451	41456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016914	ATC	2	6	41545	41550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016914	TCA	2	6	41673	41678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016914	ATT	2	6	41702	41707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016914	ACT	2	6	41728	41733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016914	TCT	2	6	42112	42117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016914	TTA	2	6	42145	42150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016914	AAT	2	6	42159	42164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016914	TCT	2	6	42261	42266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016914	CAT	2	6	42275	42280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016914	ATT	2	6	42317	42322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016914	TTG	3	9	42375	42383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016914	CTA	2	6	42410	42415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016914	GTT	2	6	42500	42505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016914	TAA	2	6	42513	42518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016914	TAA	2	6	42546	42551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016914	GAT	2	6	42613	42618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016914	TAT	2	6	42649	42654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016914	TAA	2	6	42665	42670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016914	ATT	2	6	43900	43905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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415	NC_016914	AAT	2	6	130384	130389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_016914	TTG	2	6	130396	130401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_016914	CAT	2	6	130747	130752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_016914	AAT	2	6	131572	131577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_016914	TAA	2	6	151543	151548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_016914	GAA	2	6	152108	152113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
450	NC_016914	ATA	2	6	152121	152126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_016914	TAC	2	6	152168	152173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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457	NC_016914	TAA	2	6	152396	152401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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473	NC_016914	ATA	2	6	153238	153243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_016914	ATT	2	6	153248	153253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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