MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 2886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016914	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	379017168
2	NC_016914	TC	3	6	1521	1526	0 %	50 %	0 %	50 %	379017170
3	NC_016914	AT	3	6	1646	1651	50 %	50 %	0 %	0 %	379017170
4	NC_016914	TA	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	379017170
5	NC_016914	GA	3	6	2332	2337	50 %	0 %	50 %	0 %	379017171
6	NC_016914	TA	3	6	2496	2501	50 %	50 %	0 %	0 %	379017171
7	NC_016914	TG	3	6	2612	2617	0 %	50 %	50 %	0 %	379017171
8	NC_016914	AT	3	6	2756	2761	50 %	50 %	0 %	0 %	379017171
9	NC_016914	TC	3	6	3069	3074	0 %	50 %	0 %	50 %	379017172
10	NC_016914	TG	3	6	3437	3442	0 %	50 %	50 %	0 %	379017172
11	NC_016914	GA	3	6	3544	3549	50 %	0 %	50 %	0 %	379017172
12	NC_016914	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
13	NC_016914	AT	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
14	NC_016914	AG	3	6	4335	4340	50 %	0 %	50 %	0 %	379017172
15	NC_016914	TA	3	6	4423	4428	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
16	NC_016914	TA	3	6	4675	4680	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
17	NC_016914	AT	3	6	4867	4872	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
18	NC_016914	AT	3	6	5901	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
19	NC_016914	TA	3	6	6247	6252	50 %	50 %	0 %	0 %	379017173
20	NC_016914	TA	3	6	8519	8524	50 %	50 %	0 %	0 %	379017176
21	NC_016914	TA	3	6	8947	8952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016914	GT	3	6	9627	9632	0 %	50 %	50 %	0 %	379017178
23	NC_016914	TA	3	6	9728	9733	50 %	50 %	0 %	0 %	379017178
24	NC_016914	TA	3	6	11523	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	379017180
25	NC_016914	AC	3	6	12239	12244	50 %	0 %	0 %	50 %	379017182
26	NC_016914	TA	3	6	12276	12281	50 %	50 %	0 %	0 %	379017182
27	NC_016914	TA	3	6	12542	12547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016914	TA	3	6	14117	14122	50 %	50 %	0 %	0 %	379017184
29	NC_016914	AG	3	6	14891	14896	50 %	0 %	50 %	0 %	379017185
30	NC_016914	AT	3	6	15304	15309	50 %	50 %	0 %	0 %	379017186
31	NC_016914	AT	3	6	15718	15723	50 %	50 %	0 %	0 %	379017187
32	NC_016914	TA	3	6	15746	15751	50 %	50 %	0 %	0 %	379017187
33	NC_016914	AT	3	6	17219	17224	50 %	50 %	0 %	0 %	379017188
34	NC_016914	TG	3	6	17758	17763	0 %	50 %	50 %	0 %	379017188
35	NC_016914	AT	3	6	18969	18974	50 %	50 %	0 %	0 %	379017190
36	NC_016914	TA	3	6	19600	19605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016914	AT	3	6	19830	19835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016914	AT	3	6	20115	20120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016914	AG	3	6	22720	22725	50 %	0 %	50 %	0 %	379017193
40	NC_016914	CA	3	6	22752	22757	50 %	0 %	0 %	50 %	379017193
41	NC_016914	TC	3	6	23035	23040	0 %	50 %	0 %	50 %	379017193
42	NC_016914	TA	3	6	23278	23283	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
43	NC_016914	TA	3	6	23414	23419	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
44	NC_016914	AT	3	6	23457	23462	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
45	NC_016914	TA	3	6	24141	24146	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
46	NC_016914	TA	3	6	24240	24245	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
47	NC_016914	TA	3	6	25492	25497	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
48	NC_016914	AT	3	6	25549	25554	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
49	NC_016914	TA	3	6	25905	25910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016914	AT	3	6	26759	26764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016914	AG	3	6	27157	27162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016914	AT	3	6	28102	28107	50 %	50 %	0 %	0 %	379017197
53	NC_016914	AT	4	8	28326	28333	50 %	50 %	0 %	0 %	379017198
54	NC_016914	CT	3	6	28419	28424	0 %	50 %	0 %	50 %	379017198
55	NC_016914	AT	4	8	28674	28681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016914	GT	3	6	29100	29105	0 %	50 %	50 %	0 %	379017199
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59	NC_016914	AT	3	6	31724	31729	50 %	50 %	0 %	0 %	379017204
60	NC_016914	TG	3	6	31899	31904	0 %	50 %	50 %	0 %	379017204
61	NC_016914	AT	3	6	32534	32539	50 %	50 %	0 %	0 %	379017205
62	NC_016914	AT	3	6	33264	33269	50 %	50 %	0 %	0 %	379017206
63	NC_016914	AT	3	6	33822	33827	50 %	50 %	0 %	0 %	379017206
64	NC_016914	AT	3	6	33971	33976	50 %	50 %	0 %	0 %	379017206
65	NC_016914	AT	3	6	34722	34727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016914	TC	3	6	35689	35694	0 %	50 %	0 %	50 %	379017208
67	NC_016914	TG	3	6	35811	35816	0 %	50 %	50 %	0 %	379017208
68	NC_016914	GT	3	6	36539	36544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016914	AT	3	6	37552	37557	50 %	50 %	0 %	0 %	379017211
70	NC_016914	AT	3	6	37562	37567	50 %	50 %	0 %	0 %	379017211
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73	NC_016914	AT	3	6	38761	38766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016914	GA	3	6	38894	38899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016914	AT	3	6	40225	40230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016914	AT	3	6	40377	40382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016914	TA	3	6	40584	40589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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79	NC_016914	TA	5	10	40962	40971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016914	TA	3	6	41414	41419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016914	AT	3	6	41483	41488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016914	AT	3	6	42628	42633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016914	AT	3	6	43634	43639	50 %	50 %	0 %	0 %	379017217
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85	NC_016914	TA	3	6	43874	43879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016914	AT	3	6	43880	43885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016914	AT	3	6	44064	44069	50 %	50 %	0 %	0 %	379017218
88	NC_016914	AT	3	6	44088	44093	50 %	50 %	0 %	0 %	379017218
89	NC_016914	CT	3	6	44502	44507	0 %	50 %	0 %	50 %	379017218
90	NC_016914	AT	3	6	46786	46791	50 %	50 %	0 %	0 %	379017222
91	NC_016914	AT	3	6	46982	46987	50 %	50 %	0 %	0 %	379017222
92	NC_016914	TA	4	8	47055	47062	50 %	50 %	0 %	0 %	379017222
93	NC_016914	TC	3	6	47291	47296	0 %	50 %	0 %	50 %	379017222
94	NC_016914	AT	3	6	47938	47943	50 %	50 %	0 %	0 %	379017222
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99	NC_016914	TA	3	6	49647	49652	50 %	50 %	0 %	0 %	379017225
100	NC_016914	AT	3	6	49798	49803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_016914	AT	3	6	51180	51185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016914	TA	3	6	52052	52057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016914	AT	3	6	52636	52641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016914	AT	3	6	53614	53619	50 %	50 %	0 %	0 %	379017229
107	NC_016914	AT	3	6	54553	54558	50 %	50 %	0 %	0 %	379017229
108	NC_016914	AT	3	6	55738	55743	50 %	50 %	0 %	0 %	379017230
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110	NC_016914	AT	3	6	58508	58513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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112	NC_016914	CT	4	8	59147	59154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016914	TA	3	6	59420	59425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016914	AT	3	6	60430	60435	50 %	50 %	0 %	0 %	379017236
115	NC_016914	AT	3	6	61277	61282	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
116	NC_016914	TA	3	6	61418	61423	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
117	NC_016914	AG	3	6	61582	61587	50 %	0 %	50 %	0 %	379017237
118	NC_016914	TA	3	6	62022	62027	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
119	NC_016914	AT	3	6	62285	62290	50 %	50 %	0 %	0 %	379017237
120	NC_016914	CT	3	6	62430	62435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016914	TA	3	6	64691	64696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016914	AT	4	8	64754	64761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016914	AG	3	6	65156	65161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016914	AG	3	6	65215	65220	50 %	0 %	50 %	0 %	379017240
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126	NC_016914	CT	3	6	66723	66728	0 %	50 %	0 %	50 %	379017242
127	NC_016914	AT	3	6	67243	67248	50 %	50 %	0 %	0 %	379017242
128	NC_016914	CT	3	6	67533	67538	0 %	50 %	0 %	50 %	379017242
129	NC_016914	TA	3	6	68269	68274	50 %	50 %	0 %	0 %	379017243
130	NC_016914	TA	3	6	69037	69042	50 %	50 %	0 %	0 %	379017245
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132	NC_016914	AG	3	6	69514	69519	50 %	0 %	50 %	0 %	379017245
133	NC_016914	TA	3	6	69591	69596	50 %	50 %	0 %	0 %	379017245
134	NC_016914	TA	3	6	69670	69675	50 %	50 %	0 %	0 %	379017245
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136	NC_016914	AT	3	6	69902	69907	50 %	50 %	0 %	0 %	379017245
137	NC_016914	AT	3	6	70708	70713	50 %	50 %	0 %	0 %	379017246
138	NC_016914	AT	3	6	70734	70739	50 %	50 %	0 %	0 %	379017246
139	NC_016914	TA	3	6	71114	71119	50 %	50 %	0 %	0 %	379017246
140	NC_016914	TA	3	6	71346	71351	50 %	50 %	0 %	0 %	379017246
141	NC_016914	AT	3	6	71711	71716	50 %	50 %	0 %	0 %	379017246
142	NC_016914	AT	3	6	72353	72358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016914	TA	3	6	73214	73219	50 %	50 %	0 %	0 %	379017248
144	NC_016914	AT	3	6	73653	73658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016914	TC	3	6	74236	74241	0 %	50 %	0 %	50 %	379017250
146	NC_016914	GT	3	6	74541	74546	0 %	50 %	50 %	0 %	379017250
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