MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016914	TA	3	6	8947	8952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016914	TA	3	6	12542	12547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016914	TA	3	6	19600	19605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016914	AT	3	6	19830	19835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016914	AT	3	6	20115	20120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016914	TA	3	6	25905	25910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016914	AT	3	6	26759	26764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016914	AG	3	6	27157	27162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016914	AT	4	8	28674	28681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016914	AT	3	6	34722	34727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016914	GT	3	6	36539	36544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016914	AT	3	6	38761	38766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016914	GA	3	6	38894	38899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016914	AT	3	6	40225	40230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016914	AT	3	6	40377	40382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016914	TA	3	6	40584	40589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016914	AT	3	6	40708	40713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016914	TA	5	10	40962	40971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016914	TA	3	6	41414	41419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016914	AT	3	6	41483	41488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016914	AT	3	6	42628	42633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016914	TA	3	6	43874	43879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016914	AT	3	6	43880	43885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016914	AT	3	6	48677	48682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016914	AT	3	6	49798	49803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016914	AT	3	6	51180	51185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016914	TA	3	6	52052	52057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016914	AT	3	6	52636	52641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016914	AT	3	6	58508	58513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016914	CT	3	6	58686	58691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016914	CT	4	8	59147	59154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016914	TA	3	6	59420	59425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016914	CT	3	6	62430	62435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016914	TA	3	6	64691	64696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016914	AT	4	8	64754	64761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016914	AG	3	6	65156	65161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016914	AT	3	6	72353	72358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016914	AT	3	6	73653	73658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016914	TA	4	8	83463	83470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016914	AT	4	8	86478	86485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016914	TA	3	6	86675	86680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016914	AT	3	6	87028	87033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016914	TA	3	6	87155	87160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016914	TC	3	6	87765	87770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016914	TA	3	6	88462	88467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016914	AT	3	6	95215	95220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016914	AT	3	6	95233	95238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016914	AT	3	6	95254	95259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016914	AT	3	6	95301	95306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016914	AT	3	6	97043	97048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016914	TA	3	6	103268	103273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016914	TC	3	6	106649	106654	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016914	AT	4	8	106858	106865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016914	TA	3	6	107238	107243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016914	AT	3	6	113282	113287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016914	TA	3	6	114793	114798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016914	AT	3	6	114941	114946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016914	TA	3	6	121969	121974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016914	AT	3	6	122000	122005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016914	GT	3	6	125081	125086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016914	AT	3	6	125269	125274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016914	AT	3	6	131395	131400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016914	TA	3	6	131516	131521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016914	TA	3	6	131625	131630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016914	CG	3	6	148026	148031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016914	TA	3	6	151571	151576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016914	AT	3	6	151788	151793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016914	TA	3	6	152061	152066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016914	TA	3	6	152939	152944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016914	TA	3	6	153905	153910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016914	AT	3	6	154340	154345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016914	AT	3	6	154356	154361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016914	TA	3	6	154641	154646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016914	AT	3	6	155990	155995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016914	AC	3	6	156100	156105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016914	TA	3	6	156425	156430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016914	AT	3	6	156458	156463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016914	AT	4	8	163368	163375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016914	TA	3	6	165449	165454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016914	AT	4	8	165460	165467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016914	TA	4	8	173075	173082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016914	TA	4	8	173870	173877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016914	AG	3	6	174302	174307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016914	AG	3	6	177189	177194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016914	AT	3	6	179631	179636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016914	TC	3	6	180336	180341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016914	TA	3	6	181473	181478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016914	TA	3	6	186045	186050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016914	AT	5	10	194497	194506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016914	TA	3	6	195040	195045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016914	AT	3	6	206382	206387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016914	AT	3	6	207497	207502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016914	AT	3	6	210432	210437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016914	TA	3	6	210903	210908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016914	TA	3	6	210917	210922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016914	TC	4	8	212143	212150	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016914	TG	3	6	222030	222035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016914	TA	3	6	225349	225354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016914	TA	3	6	225394	225399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016914	TA	3	6	225582	225587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016914	TA	3	6	225685	225690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016914	AT	3	6	227077	227082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016914	TA	3	6	227199	227204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016914	GA	3	6	229589	229594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016914	CT	3	6	230029	230034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016914	TA	3	6	231004	231009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016914	AT	3	6	232614	232619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016914	AT	3	6	233565	233570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016914	AT	3	6	250084	250089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016914	AG	3	6	250579	250584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016914	AG	3	6	251138	251143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016914	TA	3	6	254167	254172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016914	TA	3	6	254256	254261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016914	AT	3	6	255319	255324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016914	TA	4	8	255338	255345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016914	AG	3	6	257809	257814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016914	TA	3	6	258825	258830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016914	AG	4	8	259001	259008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016914	AT	3	6	259401	259406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016914	TA	3	6	259947	259952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016914	AT	3	6	260020	260025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016914	AT	3	6	261260	261265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016914	GA	3	6	262099	262104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016914	AT	5	10	262453	262462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016914	AT	3	6	263144	263149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016914	AG	3	6	265200	265205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016914	AG	3	6	265778	265783	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016914	AT	4	8	266118	266125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016914	TA	3	6	266437	266442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016914	TA	4	8	270093	270100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016914	TA	4	8	270107	270114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016914	AT	3	6	272434	272439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016914	TC	3	6	275766	275771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016914	CT	3	6	275827	275832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016914	AT	3	6	275888	275893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016914	GA	3	6	277162	277167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016914	AT	3	6	277237	277242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016914	AT	3	6	278188	278193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016914	TA	3	6	278357	278362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016914	CT	3	6	281637	281642	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016914	TA	3	6	282060	282065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016914	AT	3	6	282067	282072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016914	TA	3	6	283214	283219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016914	TG	3	6	283252	283257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016914	AT	3	6	283265	283270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016914	CT	3	6	286661	286666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016914	GA	3	6	287788	287793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016914	GC	3	6	288394	288399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016914	TG	3	6	288960	288965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_016914	TG	3	6	301827	301832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016914	AT	3	6	302682	302687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016914	AT	3	6	302698	302703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016914	TA	3	6	306507	306512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_016914	AT	3	6	307124	307129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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