MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hino chromosome

Total Repeats: 2057

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016914	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	379017168
2	NC_016914	TC	3	6	1521	1526	0 %	50 %	0 %	50 %	379017170
3	NC_016914	AT	3	6	1646	1651	50 %	50 %	0 %	0 %	379017170
4	NC_016914	TA	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	379017170
5	NC_016914	GA	3	6	2332	2337	50 %	0 %	50 %	0 %	379017171
6	NC_016914	TA	3	6	2496	2501	50 %	50 %	0 %	0 %	379017171
7	NC_016914	TG	3	6	2612	2617	0 %	50 %	50 %	0 %	379017171
8	NC_016914	AT	3	6	2756	2761	50 %	50 %	0 %	0 %	379017171
9	NC_016914	TC	3	6	3069	3074	0 %	50 %	0 %	50 %	379017172
10	NC_016914	TG	3	6	3437	3442	0 %	50 %	50 %	0 %	379017172
11	NC_016914	GA	3	6	3544	3549	50 %	0 %	50 %	0 %	379017172
12	NC_016914	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
13	NC_016914	AT	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
14	NC_016914	AG	3	6	4335	4340	50 %	0 %	50 %	0 %	379017172
15	NC_016914	TA	3	6	4423	4428	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
16	NC_016914	TA	3	6	4675	4680	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
17	NC_016914	AT	3	6	4867	4872	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
18	NC_016914	AT	3	6	5901	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	379017172
19	NC_016914	TA	3	6	6247	6252	50 %	50 %	0 %	0 %	379017173
20	NC_016914	TA	3	6	8519	8524	50 %	50 %	0 %	0 %	379017176
21	NC_016914	GT	3	6	9627	9632	0 %	50 %	50 %	0 %	379017178
22	NC_016914	TA	3	6	9728	9733	50 %	50 %	0 %	0 %	379017178
23	NC_016914	TA	3	6	11523	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	379017180
24	NC_016914	AC	3	6	12239	12244	50 %	0 %	0 %	50 %	379017182
25	NC_016914	TA	3	6	12276	12281	50 %	50 %	0 %	0 %	379017182
26	NC_016914	TA	3	6	14117	14122	50 %	50 %	0 %	0 %	379017184
27	NC_016914	AG	3	6	14891	14896	50 %	0 %	50 %	0 %	379017185
28	NC_016914	AT	3	6	15304	15309	50 %	50 %	0 %	0 %	379017186
29	NC_016914	AT	3	6	15718	15723	50 %	50 %	0 %	0 %	379017187
30	NC_016914	TA	3	6	15746	15751	50 %	50 %	0 %	0 %	379017187
31	NC_016914	AT	3	6	17219	17224	50 %	50 %	0 %	0 %	379017188
32	NC_016914	TG	3	6	17758	17763	0 %	50 %	50 %	0 %	379017188
33	NC_016914	AT	3	6	18969	18974	50 %	50 %	0 %	0 %	379017190
34	NC_016914	AG	3	6	22720	22725	50 %	0 %	50 %	0 %	379017193
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37	NC_016914	TA	3	6	23278	23283	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
38	NC_016914	TA	3	6	23414	23419	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
39	NC_016914	AT	3	6	23457	23462	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
40	NC_016914	TA	3	6	24141	24146	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
41	NC_016914	TA	3	6	24240	24245	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
42	NC_016914	TA	3	6	25492	25497	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
43	NC_016914	AT	3	6	25549	25554	50 %	50 %	0 %	0 %	379017193
44	NC_016914	AT	3	6	28102	28107	50 %	50 %	0 %	0 %	379017197
45	NC_016914	AT	4	8	28326	28333	50 %	50 %	0 %	0 %	379017198
46	NC_016914	CT	3	6	28419	28424	0 %	50 %	0 %	50 %	379017198
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49	NC_016914	AT	3	6	29913	29918	50 %	50 %	0 %	0 %	379017201
50	NC_016914	AT	3	6	31724	31729	50 %	50 %	0 %	0 %	379017204
51	NC_016914	TG	3	6	31899	31904	0 %	50 %	50 %	0 %	379017204
52	NC_016914	AT	3	6	32534	32539	50 %	50 %	0 %	0 %	379017205
53	NC_016914	AT	3	6	33264	33269	50 %	50 %	0 %	0 %	379017206
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62	NC_016914	AT	3	6	43634	43639	50 %	50 %	0 %	0 %	379017217
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70	NC_016914	TC	3	6	47291	47296	0 %	50 %	0 %	50 %	379017222
71	NC_016914	AT	3	6	47938	47943	50 %	50 %	0 %	0 %	379017222
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102	NC_016914	AT	3	6	70734	70739	50 %	50 %	0 %	0 %	379017246
103	NC_016914	TA	3	6	71114	71119	50 %	50 %	0 %	0 %	379017246
104	NC_016914	TA	3	6	71346	71351	50 %	50 %	0 %	0 %	379017246
105	NC_016914	AT	3	6	71711	71716	50 %	50 %	0 %	0 %	379017246
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112	NC_016914	AT	3	6	76065	76070	50 %	50 %	0 %	0 %	379017253
113	NC_016914	TA	4	8	76812	76819	50 %	50 %	0 %	0 %	379017253
114	NC_016914	AT	3	6	77299	77304	50 %	50 %	0 %	0 %	379017253
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124	NC_016914	TA	3	6	82118	82123	50 %	50 %	0 %	0 %	379017258
125	NC_016914	AT	3	6	82448	82453	50 %	50 %	0 %	0 %	379017258
126	NC_016914	AT	3	6	82480	82485	50 %	50 %	0 %	0 %	379017258
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129	NC_016914	AT	3	6	86113	86118	50 %	50 %	0 %	0 %	379017262
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