MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 2826

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016913	TAAG	2	8	4176	4183	50 %	25 %	25 %	0 %	379015836
2	NC_016913	TGAC	2	8	4509	4516	25 %	25 %	25 %	25 %	379015836
3	NC_016913	TAAA	2	8	5130	5137	75 %	25 %	0 %	0 %	379015836
4	NC_016913	AGTA	2	8	5543	5550	50 %	25 %	25 %	0 %	379015836
5	NC_016913	CTAA	2	8	5890	5897	50 %	25 %	0 %	25 %	379015837
6	NC_016913	CTTA	2	8	6863	6870	25 %	50 %	0 %	25 %	379015837
7	NC_016913	AGAT	2	8	8124	8131	50 %	25 %	25 %	0 %	379015840
8	NC_016913	ATTA	2	8	8179	8186	50 %	50 %	0 %	0 %	379015840
9	NC_016913	AAGA	2	8	9558	9565	75 %	0 %	25 %	0 %	379015842
10	NC_016913	AATT	2	8	9702	9709	50 %	50 %	0 %	0 %	379015842
11	NC_016913	TCAT	2	8	9751	9758	25 %	50 %	0 %	25 %	379015842
12	NC_016913	TCTA	2	8	9838	9845	25 %	50 %	0 %	25 %	379015842
13	NC_016913	AAAT	2	8	10780	10787	75 %	25 %	0 %	0 %	379015844
14	NC_016913	TGCT	2	8	12242	12249	0 %	50 %	25 %	25 %	379015846
15	NC_016913	TAGT	2	8	12255	12262	25 %	50 %	25 %	0 %	379015846
16	NC_016913	TACT	2	8	12623	12630	25 %	50 %	0 %	25 %	379015847
17	NC_016913	GAAA	2	8	18539	18546	75 %	0 %	25 %	0 %	379015856
18	NC_016913	ATTA	2	8	18741	18748	50 %	50 %	0 %	0 %	379015856
19	NC_016913	ATTA	2	8	19199	19206	50 %	50 %	0 %	0 %	379015857
20	NC_016913	TAAT	2	8	19763	19770	50 %	50 %	0 %	0 %	379015858
21	NC_016913	TCAA	2	8	20237	20244	50 %	25 %	0 %	25 %	379015859
22	NC_016913	CTTA	2	8	20393	20400	25 %	50 %	0 %	25 %	379015859
23	NC_016913	GTCG	2	8	20412	20419	0 %	25 %	50 %	25 %	379015859
24	NC_016913	TCAT	2	8	20442	20449	25 %	50 %	0 %	25 %	379015859
25	NC_016913	GCAG	2	8	20603	20610	25 %	0 %	50 %	25 %	379015859
26	NC_016913	TACT	2	8	21247	21254	25 %	50 %	0 %	25 %	379015859
27	NC_016913	AAAG	2	8	22658	22665	75 %	0 %	25 %	0 %	379015861
28	NC_016913	ATAA	2	8	22674	22681	75 %	25 %	0 %	0 %	379015861
29	NC_016913	GATA	2	8	25104	25111	50 %	25 %	25 %	0 %	379015865
30	NC_016913	TAAT	2	8	25247	25254	50 %	50 %	0 %	0 %	379015865
31	NC_016913	TATT	2	8	25857	25864	25 %	75 %	0 %	0 %	379015866
32	NC_016913	TTTG	2	8	26001	26008	0 %	75 %	25 %	0 %	379015866
33	NC_016913	CTAA	2	8	26110	26117	50 %	25 %	0 %	25 %	379015866
34	NC_016913	TTCT	2	8	26153	26160	0 %	75 %	0 %	25 %	379015866
35	NC_016913	TTTA	2	8	27095	27102	25 %	75 %	0 %	0 %	379015866
36	NC_016913	AATT	2	8	27458	27465	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
37	NC_016913	CTTG	2	8	27514	27521	0 %	50 %	25 %	25 %	379015866
38	NC_016913	ATAG	2	8	27637	27644	50 %	25 %	25 %	0 %	379015866
39	NC_016913	TAGA	2	8	27914	27921	50 %	25 %	25 %	0 %	379015866
40	NC_016913	GAAT	2	8	27993	28000	50 %	25 %	25 %	0 %	379015866
41	NC_016913	GAAA	2	8	29030	29037	75 %	0 %	25 %	0 %	379015868
42	NC_016913	AAAT	2	8	29067	29074	75 %	25 %	0 %	0 %	379015868
43	NC_016913	GATG	2	8	30806	30813	25 %	25 %	50 %	0 %	379015870
44	NC_016913	TGGG	2	8	31098	31105	0 %	25 %	75 %	0 %	379015871
45	NC_016913	TTAA	2	8	31682	31689	50 %	50 %	0 %	0 %	379015871
46	NC_016913	CAAA	2	8	31691	31698	75 %	0 %	0 %	25 %	379015871
47	NC_016913	AAGC	2	8	31932	31939	50 %	0 %	25 %	25 %	379015871
48	NC_016913	TTAA	2	8	32153	32160	50 %	50 %	0 %	0 %	379015871
49	NC_016913	TTAA	2	8	32279	32286	50 %	50 %	0 %	0 %	379015871
50	NC_016913	GTGA	2	8	33675	33682	25 %	25 %	50 %	0 %	379015873
51	NC_016913	GCAC	2	8	34037	34044	25 %	0 %	25 %	50 %	379015873
52	NC_016913	TAAG	2	8	34063	34070	50 %	25 %	25 %	0 %	379015873
53	NC_016913	GCAG	2	8	34238	34245	25 %	0 %	50 %	25 %	379015873
54	NC_016913	AGTA	2	8	34577	34584	50 %	25 %	25 %	0 %	379015873
55	NC_016913	TAAA	2	8	34672	34679	75 %	25 %	0 %	0 %	379015873
56	NC_016913	AAAT	2	8	35705	35712	75 %	25 %	0 %	0 %	379015874
57	NC_016913	AGTT	2	8	35804	35811	25 %	50 %	25 %	0 %	379015874
58	NC_016913	ATGA	2	8	36791	36798	50 %	25 %	25 %	0 %	379015875
59	NC_016913	AAGC	2	8	37595	37602	50 %	0 %	25 %	25 %	379015876
60	NC_016913	ATAA	2	8	38133	38140	75 %	25 %	0 %	0 %	379015877
61	NC_016913	TTTA	2	8	38243	38250	25 %	75 %	0 %	0 %	379015877
62	NC_016913	ATTC	2	8	38470	38477	25 %	50 %	0 %	25 %	379015877
63	NC_016913	TTGG	2	8	38710	38717	0 %	50 %	50 %	0 %	379015877
64	NC_016913	AAGC	2	8	39667	39674	50 %	0 %	25 %	25 %	379015877
65	NC_016913	ATTT	2	8	39762	39769	25 %	75 %	0 %	0 %	379015877
66	NC_016913	AATT	2	8	39821	39828	50 %	50 %	0 %	0 %	379015877
67	NC_016913	AAAC	2	8	40578	40585	75 %	0 %	0 %	25 %	379015877
68	NC_016913	GTAA	2	8	41420	41427	50 %	25 %	25 %	0 %	379015879
69	NC_016913	AGCT	2	8	42079	42086	25 %	25 %	25 %	25 %	379015879
70	NC_016913	GCTA	2	8	42487	42494	25 %	25 %	25 %	25 %	379015879
71	NC_016913	AAAT	2	8	43081	43088	75 %	25 %	0 %	0 %	379015879
72	NC_016913	ATTA	2	8	43145	43152	50 %	50 %	0 %	0 %	379015879
73	NC_016913	TGAC	2	8	43158	43165	25 %	25 %	25 %	25 %	379015879
74	NC_016913	CCAA	2	8	43587	43594	50 %	0 %	0 %	50 %	379015880
75	NC_016913	GCTG	2	8	43761	43768	0 %	25 %	50 %	25 %	379015880
76	NC_016913	TACT	2	8	43867	43874	25 %	50 %	0 %	25 %	379015880
77	NC_016913	GATT	2	8	43931	43938	25 %	50 %	25 %	0 %	379015880
78	NC_016913	AGTT	2	8	44029	44036	25 %	50 %	25 %	0 %	379015880
79	NC_016913	TTAG	2	8	44109	44116	25 %	50 %	25 %	0 %	379015880
80	NC_016913	CTTT	2	8	44131	44138	0 %	75 %	0 %	25 %	379015880
81	NC_016913	ACGA	2	8	44806	44813	50 %	0 %	25 %	25 %	379015881
82	NC_016913	TATT	2	8	44864	44871	25 %	75 %	0 %	0 %	379015881
83	NC_016913	AGTT	2	8	45657	45664	25 %	50 %	25 %	0 %	379015882
84	NC_016913	GCAA	2	8	45697	45704	50 %	0 %	25 %	25 %	379015882
85	NC_016913	TAAT	2	8	46535	46542	50 %	50 %	0 %	0 %	379015883
86	NC_016913	TGTA	2	8	46854	46861	25 %	50 %	25 %	0 %	379015883
87	NC_016913	ATAG	2	8	47778	47785	50 %	25 %	25 %	0 %	379015883
88	NC_016913	ACAT	2	8	47821	47828	50 %	25 %	0 %	25 %	379015883
89	NC_016913	GATA	2	8	47913	47920	50 %	25 %	25 %	0 %	379015883
90	NC_016913	CAAA	2	8	48112	48119	75 %	0 %	0 %	25 %	379015884
91	NC_016913	CGAT	2	8	48247	48254	25 %	25 %	25 %	25 %	379015884
92	NC_016913	AATA	2	8	48773	48780	75 %	25 %	0 %	0 %	379015884
93	NC_016913	AAAT	2	8	49230	49237	75 %	25 %	0 %	0 %	379015884
94	NC_016913	TATT	2	8	49538	49545	25 %	75 %	0 %	0 %	379015884
95	NC_016913	AAAG	2	8	49696	49703	75 %	0 %	25 %	0 %	379015884
96	NC_016913	ATAA	2	8	50301	50308	75 %	25 %	0 %	0 %	379015885
97	NC_016913	TCAT	2	8	50373	50380	25 %	50 %	0 %	25 %	379015885
98	NC_016913	TTTA	2	8	50400	50407	25 %	75 %	0 %	0 %	379015886
99	NC_016913	AAAT	2	8	50967	50974	75 %	25 %	0 %	0 %	379015886
100	NC_016913	TTCT	2	8	51056	51063	0 %	75 %	0 %	25 %	379015887
101	NC_016913	GGTA	2	8	51095	51102	25 %	25 %	50 %	0 %	379015887
102	NC_016913	ACTC	2	8	51140	51147	25 %	25 %	0 %	50 %	379015887
103	NC_016913	TAAT	2	8	51283	51290	50 %	50 %	0 %	0 %	379015887
104	NC_016913	AGTT	2	8	51365	51372	25 %	50 %	25 %	0 %	379015887
105	NC_016913	AATA	2	8	51831	51838	75 %	25 %	0 %	0 %	379015889
106	NC_016913	CCAT	2	8	51964	51971	25 %	25 %	0 %	50 %	379015889
107	NC_016913	TTCA	2	8	52647	52654	25 %	50 %	0 %	25 %	379015889
108	NC_016913	GTTT	2	8	52720	52727	0 %	75 %	25 %	0 %	379015889
109	NC_016913	CCAG	2	8	52899	52906	25 %	0 %	25 %	50 %	379015889
110	NC_016913	TAAT	2	8	53648	53655	50 %	50 %	0 %	0 %	379015890
111	NC_016913	ATAA	2	8	53893	53900	75 %	25 %	0 %	0 %	379015890
112	NC_016913	AATA	2	8	54401	54408	75 %	25 %	0 %	0 %	379015891
113	NC_016913	CTAT	2	8	54579	54586	25 %	50 %	0 %	25 %	379015891
114	NC_016913	ATTT	2	8	54829	54836	25 %	75 %	0 %	0 %	379015891
115	NC_016913	AGCA	2	8	54996	55003	50 %	0 %	25 %	25 %	379015891
116	NC_016913	CTTT	2	8	55101	55108	0 %	75 %	0 %	25 %	379015891
117	NC_016913	ATTT	2	8	55197	55204	25 %	75 %	0 %	0 %	379015891
118	NC_016913	TTAT	2	8	56206	56213	25 %	75 %	0 %	0 %	379015892
119	NC_016913	TTAA	2	8	57388	57395	50 %	50 %	0 %	0 %	379015892
120	NC_016913	TACA	2	8	57629	57636	50 %	25 %	0 %	25 %	379015892
121	NC_016913	ATTG	2	8	57826	57833	25 %	50 %	25 %	0 %	379015892
122	NC_016913	GCTT	2	8	59057	59064	0 %	50 %	25 %	25 %	379015893
123	NC_016913	ATTA	2	8	59124	59131	50 %	50 %	0 %	0 %	379015893
124	NC_016913	ATAA	2	8	59175	59182	75 %	25 %	0 %	0 %	379015893
125	NC_016913	AAAT	2	8	59732	59739	75 %	25 %	0 %	0 %	379015893
126	NC_016913	TTTG	2	8	59783	59790	0 %	75 %	25 %	0 %	379015893
127	NC_016913	TAAT	2	8	60809	60816	50 %	50 %	0 %	0 %	379015893
128	NC_016913	TGTA	2	8	61011	61018	25 %	50 %	25 %	0 %	379015893
129	NC_016913	GTAA	2	8	61159	61166	50 %	25 %	25 %	0 %	379015893
130	NC_016913	ATCA	2	8	62339	62346	50 %	25 %	0 %	25 %	379015895
131	NC_016913	ATTA	2	8	62351	62358	50 %	50 %	0 %	0 %	379015895
132	NC_016913	ATAA	3	12	63337	63348	75 %	25 %	0 %	0 %	379015896
133	NC_016913	TTTC	2	8	63714	63721	0 %	75 %	0 %	25 %	379015897
134	NC_016913	ATAA	2	8	63745	63752	75 %	25 %	0 %	0 %	379015897
135	NC_016913	GCTA	2	8	63822	63829	25 %	25 %	25 %	25 %	379015897
136	NC_016913	ATAG	2	8	63912	63919	50 %	25 %	25 %	0 %	379015897
137	NC_016913	TTAT	2	8	64939	64946	25 %	75 %	0 %	0 %	379015897
138	NC_016913	GCTT	2	8	65100	65107	0 %	50 %	25 %	25 %	379015897
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