MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 15015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016913	ATA	2	6	3984	3989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015836
2	NC_016913	GAA	3	9	4083	4091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015836
3	NC_016913	GCG	2	6	4092	4097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379015836
4	NC_016913	GAA	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015836
5	NC_016913	ATT	2	6	4275	4280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
6	NC_016913	TTA	2	6	4288	4293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
7	NC_016913	TGA	2	6	4309	4314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015836
8	NC_016913	GAA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015836
9	NC_016913	TTA	2	6	4430	4435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
10	NC_016913	TTG	2	6	4467	4472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015836
11	NC_016913	TAG	2	6	4521	4526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015836
12	NC_016913	ATA	2	6	4641	4646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015836
13	NC_016913	GTT	2	6	4735	4740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015836
14	NC_016913	TTA	2	6	4814	4819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
15	NC_016913	AAT	2	6	4975	4980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015836
16	NC_016913	ATA	2	6	4995	5000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015836
17	NC_016913	ATT	2	6	5314	5319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
18	NC_016913	TAC	2	6	5332	5337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015836
19	NC_016913	TGA	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015836
20	NC_016913	TGA	2	6	5485	5490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015836
21	NC_016913	ATT	2	6	5507	5512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015836
22	NC_016913	TAG	2	6	5802	5807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
23	NC_016913	ACC	2	6	6000	6005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015837
24	NC_016913	AGC	2	6	6084	6089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015837
25	NC_016913	GAT	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
26	NC_016913	CAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015837
27	NC_016913	CAT	2	6	6310	6315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015837
28	NC_016913	GCA	2	6	6391	6396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015837
29	NC_016913	TAA	2	6	6450	6455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015837
30	NC_016913	ATG	2	6	6590	6595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
31	NC_016913	GAA	2	6	6636	6641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015837
32	NC_016913	TGA	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
33	NC_016913	CAA	2	6	6739	6744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015837
34	NC_016913	GTT	2	6	6782	6787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379015837
35	NC_016913	AGT	2	6	6801	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
36	NC_016913	AAT	2	6	6843	6848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015837
37	NC_016913	TAT	2	6	6894	6899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015837
38	NC_016913	AAG	2	6	6935	6940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015837
39	NC_016913	CAA	2	6	6956	6961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015837
40	NC_016913	ATT	2	6	7010	7015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015837
41	NC_016913	GTA	2	6	7046	7051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015837
42	NC_016913	CTA	2	6	7331	7336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015838
43	NC_016913	AAT	2	6	7405	7410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015838
44	NC_016913	TGG	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015839
45	NC_016913	ATT	2	6	7637	7642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015839
46	NC_016913	TAA	3	9	7665	7673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015839
47	NC_016913	TAG	2	6	7676	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015839
48	NC_016913	GAA	2	6	7714	7719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015839
49	NC_016913	TAA	2	6	7909	7914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015840
50	NC_016913	ATT	2	6	7980	7985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015840
51	NC_016913	AAG	2	6	8062	8067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015840
52	NC_016913	GAA	2	6	8138	8143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015840
53	NC_016913	TTA	2	6	8196	8201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015840
54	NC_016913	GAG	2	6	8214	8219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379015840
55	NC_016913	GTA	2	6	8244	8249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015840
56	NC_016913	ATA	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015840
57	NC_016913	ATT	2	6	8348	8353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015840
58	NC_016913	TAA	2	6	8367	8372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015840
59	NC_016913	GCT	2	6	8393	8398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015840
60	NC_016913	ATT	2	6	8426	8431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015840
61	NC_016913	AGA	2	6	8434	8439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015840
62	NC_016913	TGA	2	6	8576	8581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015841
63	NC_016913	TGC	2	6	8614	8619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015841
64	NC_016913	TAG	2	6	8625	8630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015841
65	NC_016913	ATT	2	6	8650	8655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015841
66	NC_016913	TAA	2	6	9030	9035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015842
67	NC_016913	TAA	2	6	9097	9102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015842
68	NC_016913	ATT	2	6	9132	9137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015842
69	NC_016913	CTT	2	6	9234	9239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015842
70	NC_016913	ACA	2	6	9293	9298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015842
71	NC_016913	GAT	2	6	9374	9379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015842
72	NC_016913	GTA	2	6	9380	9385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015842
73	NC_016913	GAA	2	6	9404	9409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015842
74	NC_016913	AAT	2	6	9538	9543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015842
75	NC_016913	GTA	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015842
76	NC_016913	ACC	2	6	9682	9687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379015842
77	NC_016913	GCA	2	6	9736	9741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015842
78	NC_016913	GAA	2	6	10138	10143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015843
79	NC_016913	TTA	2	6	10204	10209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015843
80	NC_016913	GTA	2	6	10313	10318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015843
81	NC_016913	AGA	2	6	10350	10355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015843
82	NC_016913	GAA	2	6	10396	10401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015843
83	NC_016913	TGC	2	6	10446	10451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015843
84	NC_016913	AAT	2	6	10672	10677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015844
85	NC_016913	AAG	2	6	10717	10722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015844
86	NC_016913	CCG	2	6	10824	10829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	379015844
87	NC_016913	TCA	2	6	10875	10880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015844
88	NC_016913	ATA	2	6	10953	10958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015844
89	NC_016913	GAC	2	6	10981	10986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015844
90	NC_016913	CTT	2	6	11017	11022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015844
91	NC_016913	AGT	2	6	11027	11032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015844
92	NC_016913	TTC	2	6	11047	11052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379015844
93	NC_016913	CTG	2	6	11059	11064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015844
94	NC_016913	AAT	2	6	11201	11206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015844
95	NC_016913	AAT	2	6	11431	11436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015845
96	NC_016913	GTC	2	6	11515	11520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015845
97	NC_016913	GGA	2	6	12332	12337	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379015846
98	NC_016913	AAT	2	6	12377	12382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015846
99	NC_016913	TAA	2	6	12430	12435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015846
100	NC_016913	CAA	2	6	12438	12443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015846
101	NC_016913	TCC	2	6	12590	12595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379015847
102	NC_016913	TCC	2	6	12696	12701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379015847
103	NC_016913	ATA	2	6	12710	12715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015847
104	NC_016913	ATG	2	6	13036	13041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015848
105	NC_016913	AGG	2	6	13118	13123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379015848
106	NC_016913	CTC	2	6	13166	13171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379015848
107	NC_016913	AGC	2	6	15465	15470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015849
108	NC_016913	AGG	2	6	15545	15550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379015849
109	NC_016913	TAA	2	6	15574	15579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015849
110	NC_016913	AAC	2	6	15605	15610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015849
111	NC_016913	TGA	2	6	15689	15694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015850
112	NC_016913	GTA	2	6	15718	15723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015850
113	NC_016913	TAC	2	6	15812	15817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379015850
114	NC_016913	TAA	2	6	15842	15847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015850
115	NC_016913	TAA	2	6	15856	15861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015850
116	NC_016913	TAA	2	6	15884	15889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015850
117	NC_016913	ATT	2	6	15913	15918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015850
118	NC_016913	AAC	2	6	15920	15925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015850
119	NC_016913	CAA	3	9	16285	16293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015851
120	NC_016913	AGC	3	9	16338	16346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379015851
121	NC_016913	TGC	2	6	16370	16375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379015851
122	NC_016913	TGG	2	6	16397	16402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379015851
123	NC_016913	GAT	3	9	16416	16424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379015851
124	NC_016913	GAA	2	6	16475	16480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379015852
125	NC_016913	TAT	2	6	16490	16495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015852
126	NC_016913	CAA	2	6	16538	16543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379015852
127	NC_016913	ATA	2	6	16559	16564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015853
128	NC_016913	TAA	3	9	16620	16628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379015853
129	NC_016913	TTA	2	6	16667	16672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379015853
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