MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Brazil chromosome

Total Repeats: 2870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016913	AT	3	6	2831	2836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016913	AG	3	6	3135	3140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016913	TA	3	6	3164	3169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016913	TA	3	6	3813	3818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016913	TA	3	6	3826	3831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016913	TA	3	6	4943	4948	50 %	50 %	0 %	0 %	379015836
7	NC_016913	AT	3	6	5459	5464	50 %	50 %	0 %	0 %	379015836
8	NC_016913	CA	3	6	5674	5679	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016913	AT	3	6	6125	6130	50 %	50 %	0 %	0 %	379015837
10	NC_016913	AT	3	6	6238	6243	50 %	50 %	0 %	0 %	379015837
11	NC_016913	TA	4	8	8304	8311	50 %	50 %	0 %	0 %	379015840
12	NC_016913	TA	3	6	9460	9465	50 %	50 %	0 %	0 %	379015842
13	NC_016913	TA	3	6	9891	9896	50 %	50 %	0 %	0 %	379015842
14	NC_016913	AT	3	6	9924	9929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016913	TA	3	6	9964	9969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016913	GA	3	6	10489	10494	50 %	0 %	50 %	0 %	379015843
17	NC_016913	GA	3	6	11558	11563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016913	TA	3	6	12016	12021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016913	TA	3	6	12101	12106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016913	AT	3	6	12177	12182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016913	TA	3	6	12187	12192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016913	TA	3	6	12412	12417	50 %	50 %	0 %	0 %	379015846
23	NC_016913	AT	3	6	13462	13467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016913	AT	3	6	13523	13528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016913	AT	3	6	15529	15534	50 %	50 %	0 %	0 %	379015849
26	NC_016913	AT	3	6	15563	15568	50 %	50 %	0 %	0 %	379015849
27	NC_016913	GA	3	6	18011	18016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016913	AG	3	6	18084	18089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016913	TA	3	6	18359	18364	50 %	50 %	0 %	0 %	379015856
30	NC_016913	TA	3	6	18370	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	379015856
31	NC_016913	AC	3	6	19012	19017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016913	TA	3	6	19031	19036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016913	AT	3	6	20899	20904	50 %	50 %	0 %	0 %	379015859
34	NC_016913	AG	3	6	21354	21359	50 %	0 %	50 %	0 %	379015859
35	NC_016913	TA	3	6	21498	21503	50 %	50 %	0 %	0 %	379015859
36	NC_016913	CT	3	6	22333	22338	0 %	50 %	0 %	50 %	379015861
37	NC_016913	TA	3	6	22379	22384	50 %	50 %	0 %	0 %	379015861
38	NC_016913	TA	3	6	22466	22471	50 %	50 %	0 %	0 %	379015861
39	NC_016913	TA	3	6	22905	22910	50 %	50 %	0 %	0 %	379015862
40	NC_016913	AT	3	6	23034	23039	50 %	50 %	0 %	0 %	379015863
41	NC_016913	AT	3	6	23343	23348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016913	TA	3	6	23500	23505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016913	AT	6	12	24349	24360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016913	AG	3	6	24517	24522	50 %	0 %	50 %	0 %	379015865
45	NC_016913	AG	3	6	25074	25079	50 %	0 %	50 %	0 %	379015865
46	NC_016913	AG	3	6	25458	25463	50 %	0 %	50 %	0 %	379015865
47	NC_016913	TA	3	6	25607	25612	50 %	50 %	0 %	0 %	379015865
48	NC_016913	TA	3	6	25780	25785	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
49	NC_016913	GT	3	6	25907	25912	0 %	50 %	50 %	0 %	379015866
50	NC_016913	GA	3	6	26353	26358	50 %	0 %	50 %	0 %	379015866
51	NC_016913	TA	3	6	26419	26424	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
52	NC_016913	CT	3	6	26628	26633	0 %	50 %	0 %	50 %	379015866
53	NC_016913	AT	3	6	27573	27578	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
54	NC_016913	AT	3	6	27999	28004	50 %	50 %	0 %	0 %	379015866
55	NC_016913	AT	3	6	29292	29297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016913	TA	3	6	29400	29405	50 %	50 %	0 %	0 %	379015869
57	NC_016913	TA	3	6	29823	29828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016913	TG	3	6	29861	29866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016913	AT	3	6	29952	29957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016913	TA	3	6	30084	30089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016913	AT	3	6	30301	30306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016913	TA	3	6	30328	30333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016913	TA	3	6	30716	30721	50 %	50 %	0 %	0 %	379015870
64	NC_016913	AT	3	6	31168	31173	50 %	50 %	0 %	0 %	379015871
65	NC_016913	AG	3	6	31247	31252	50 %	0 %	50 %	0 %	379015871
66	NC_016913	TA	3	6	31844	31849	50 %	50 %	0 %	0 %	379015871
67	NC_016913	AT	3	6	32361	32366	50 %	50 %	0 %	0 %	379015871
68	NC_016913	TA	3	6	32491	32496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016913	AG	3	6	32664	32669	50 %	0 %	50 %	0 %	379015872
70	NC_016913	TA	3	6	33092	33097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016913	AG	3	6	33741	33746	50 %	0 %	50 %	0 %	379015873
72	NC_016913	AT	3	6	34259	34264	50 %	50 %	0 %	0 %	379015873
73	NC_016913	AG	3	6	34443	34448	50 %	0 %	50 %	0 %	379015873
74	NC_016913	TG	3	6	34799	34804	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016913	TA	3	6	35436	35441	50 %	50 %	0 %	0 %	379015874
76	NC_016913	TA	3	6	35954	35959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016913	AT	3	6	36398	36403	50 %	50 %	0 %	0 %	379015875
78	NC_016913	AT	3	6	36444	36449	50 %	50 %	0 %	0 %	379015875
79	NC_016913	GA	3	6	36614	36619	50 %	0 %	50 %	0 %	379015875
80	NC_016913	TA	3	6	36985	36990	50 %	50 %	0 %	0 %	379015875
81	NC_016913	TA	3	6	37700	37705	50 %	50 %	0 %	0 %	379015876
82	NC_016913	AT	3	6	38084	38089	50 %	50 %	0 %	0 %	379015877
83	NC_016913	AT	3	6	39856	39861	50 %	50 %	0 %	0 %	379015877
84	NC_016913	TA	3	6	40644	40649	50 %	50 %	0 %	0 %	379015877
85	NC_016913	AG	3	6	40679	40684	50 %	0 %	50 %	0 %	379015877
86	NC_016913	TA	4	8	40921	40928	50 %	50 %	0 %	0 %	379015878
87	NC_016913	TA	3	6	41139	41144	50 %	50 %	0 %	0 %	379015878
88	NC_016913	AT	3	6	41168	41173	50 %	50 %	0 %	0 %	379015878
89	NC_016913	AT	3	6	41623	41628	50 %	50 %	0 %	0 %	379015879
90	NC_016913	TC	4	8	42161	42168	0 %	50 %	0 %	50 %	379015879
91	NC_016913	AT	3	6	42657	42662	50 %	50 %	0 %	0 %	379015879
92	NC_016913	AT	3	6	42797	42802	50 %	50 %	0 %	0 %	379015879
93	NC_016913	AT	3	6	43382	43387	50 %	50 %	0 %	0 %	379015880
94	NC_016913	TA	3	6	43714	43719	50 %	50 %	0 %	0 %	379015880
95	NC_016913	AT	3	6	44164	44169	50 %	50 %	0 %	0 %	379015880
96	NC_016913	AT	3	6	44555	44560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016913	AT	3	6	45081	45086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016913	AT	3	6	45293	45298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016913	AT	3	6	45404	45409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016913	TA	3	6	46024	46029	50 %	50 %	0 %	0 %	379015882
101	NC_016913	TA	3	6	46577	46582	50 %	50 %	0 %	0 %	379015883
102	NC_016913	AT	3	6	47058	47063	50 %	50 %	0 %	0 %	379015883
103	NC_016913	GT	3	6	47214	47219	0 %	50 %	50 %	0 %	379015883
104	NC_016913	AT	3	6	47439	47444	50 %	50 %	0 %	0 %	379015883
105	NC_016913	AT	3	6	47593	47598	50 %	50 %	0 %	0 %	379015883
106	NC_016913	TA	4	8	47829	47836	50 %	50 %	0 %	0 %	379015883
107	NC_016913	AT	3	6	47878	47883	50 %	50 %	0 %	0 %	379015883
108	NC_016913	TA	3	6	48150	48155	50 %	50 %	0 %	0 %	379015884
109	NC_016913	TA	3	6	48320	48325	50 %	50 %	0 %	0 %	379015884
110	NC_016913	TA	3	6	48470	48475	50 %	50 %	0 %	0 %	379015884
111	NC_016913	AT	3	6	48529	48534	50 %	50 %	0 %	0 %	379015884
112	NC_016913	AT	3	6	50120	50125	50 %	50 %	0 %	0 %	379015885
113	NC_016913	AT	3	6	50211	50216	50 %	50 %	0 %	0 %	379015885
114	NC_016913	AT	3	6	50275	50280	50 %	50 %	0 %	0 %	379015885
115	NC_016913	AT	3	6	50367	50372	50 %	50 %	0 %	0 %	379015885
116	NC_016913	AT	3	6	50462	50467	50 %	50 %	0 %	0 %	379015886
117	NC_016913	TA	3	6	50997	51002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016913	AT	3	6	51970	51975	50 %	50 %	0 %	0 %	379015889
119	NC_016913	AT	3	6	52519	52524	50 %	50 %	0 %	0 %	379015889
120	NC_016913	AT	3	6	52924	52929	50 %	50 %	0 %	0 %	379015889
121	NC_016913	TA	3	6	53022	53027	50 %	50 %	0 %	0 %	379015889
122	NC_016913	TA	3	6	53464	53469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016913	AT	5	10	53909	53918	50 %	50 %	0 %	0 %	379015890
124	NC_016913	AT	3	6	54046	54051	50 %	50 %	0 %	0 %	379015890
125	NC_016913	TA	3	6	54052	54057	50 %	50 %	0 %	0 %	379015890
126	NC_016913	TA	3	6	54166	54171	50 %	50 %	0 %	0 %	379015890
127	NC_016913	TA	3	6	54389	54394	50 %	50 %	0 %	0 %	379015891
128	NC_016913	TA	3	6	54452	54457	50 %	50 %	0 %	0 %	379015891
129	NC_016913	TA	3	6	54539	54544	50 %	50 %	0 %	0 %	379015891
130	NC_016913	AT	3	6	54810	54815	50 %	50 %	0 %	0 %	379015891
131	NC_016913	AT	3	6	55428	55433	50 %	50 %	0 %	0 %	379015892
132	NC_016913	AT	3	6	56509	56514	50 %	50 %	0 %	0 %	379015892
133	NC_016913	TA	3	6	56523	56528	50 %	50 %	0 %	0 %	379015892
134	NC_016913	TC	3	6	56636	56641	0 %	50 %	0 %	50 %	379015892
135	NC_016913	AT	3	6	56659	56664	50 %	50 %	0 %	0 %	379015892
136	NC_016913	TC	3	6	57806	57811	0 %	50 %	0 %	50 %	379015892
137	NC_016913	TC	3	6	58569	58574	0 %	50 %	0 %	50 %	379015892
138	NC_016913	TA	3	6	58847	58852	50 %	50 %	0 %	0 %	379015893
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142	NC_016913	AT	4	8	60887	60894	50 %	50 %	0 %	0 %	379015893
143	NC_016913	TA	4	8	61220	61227	50 %	50 %	0 %	0 %	379015893
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