MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 1227

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016912	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013367
2	NC_016912	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379013370
3	NC_016912	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379013371
4	NC_016912	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379013371
5	NC_016912	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013371
6	NC_016912	GTAATG	2	12	9253	9264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013371
7	NC_016912	ACAATT	2	12	11252	11263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379013373
8	NC_016912	TAGCAT	2	12	11347	11358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013373
9	NC_016912	GCTTTA	2	12	17440	17451	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379013378
10	NC_016912	TTTGAA	2	12	18261	18272	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013378
11	NC_016912	TAAAGG	3	18	20308	20325	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379013380
12	NC_016912	TTGAAG	2	12	20511	20522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013380
13	NC_016912	TGATTG	2	12	21715	21726	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379013381
14	NC_016912	TGAAAT	2	12	22046	22057	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013381
15	NC_016912	AAGGAA	2	12	22484	22495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013382
16	NC_016912	TGAATT	2	12	25413	25424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013383
17	NC_016912	ATTTCA	2	12	27897	27908	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379013385
18	NC_016912	CTAAAG	2	12	29031	29042	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379013386
19	NC_016912	ATCAGC	2	12	31214	31225	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013388
20	NC_016912	AAAAGA	2	12	33855	33866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379013389
21	NC_016912	ACAAAT	2	12	34754	34765	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379013390
22	NC_016912	AATTAA	2	12	34845	34856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013390
23	NC_016912	TTAATG	2	12	37607	37618	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013392
24	NC_016912	AAGTCA	2	12	38815	38826	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379013394
25	NC_016912	AAAAAG	2	12	38929	38940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379013394
26	NC_016912	GAAAAA	2	12	39242	39253	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379013394
27	NC_016912	AATTAT	2	12	41481	41492	50 %	50 %	0 %	0 %	379013396
28	NC_016912	ACCCTT	2	12	43319	43330	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379013399
29	NC_016912	ATTTCT	2	12	47844	47855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379013405
30	NC_016912	ATATTT	2	12	47952	47963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013405
31	NC_016912	AAGGAA	2	12	48936	48947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013406
32	NC_016912	TTTAGC	2	12	49985	49996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379013407
33	NC_016912	AAATAA	2	12	50036	50047	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379013407
34	NC_016912	GTTAGA	2	12	52159	52170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013408
35	NC_016912	AAAAGA	2	12	52213	52224	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379013408
36	NC_016912	GCTAAA	2	12	55000	55011	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379013410
37	NC_016912	TAAAGA	2	12	58312	58323	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379013414
38	NC_016912	AACCAC	2	12	62181	62192	50 %	0 %	0 %	50 %	379013416
39	NC_016912	AACCGA	2	12	65501	65512	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379013418
40	NC_016912	CATTAC	2	12	67203	67214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013419
41	NC_016912	ATAGAT	2	12	70402	70413	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013421
42	NC_016912	TATCAT	2	12	71169	71180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379013422
43	NC_016912	TTTATT	2	12	71577	71588	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379013423
44	NC_016912	TATTTG	2	12	71663	71674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379013423
45	NC_016912	TAAATA	2	12	73096	73107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013423
46	NC_016912	TTTTTC	2	12	74964	74975	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	379013424
47	NC_016912	TAAGCC	2	12	76825	76836	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013426
48	NC_016912	ATCGCA	2	12	78040	78051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013427
49	NC_016912	TTTGAA	2	12	79071	79082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013428
50	NC_016912	GCAATG	2	12	88028	88039	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379013434
51	NC_016912	TGAAGA	2	12	88863	88874	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379013435
52	NC_016912	TTTCAT	2	12	89544	89555	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379013436
53	NC_016912	TGTATA	2	12	94221	94232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013441
54	NC_016912	TCGAAA	2	12	95722	95733	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379013443
55	NC_016912	CTATTG	2	12	98308	98319	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379013445
56	NC_016912	CATATG	2	12	99511	99522	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013446
57	NC_016912	GGTATG	2	12	102554	102565	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379013450
58	NC_016912	CAGATT	2	12	105152	105163	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013452
59	NC_016912	AGATAT	2	12	112551	112562	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013459
60	NC_016912	TAAAGC	2	12	114161	114172	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379013461
61	NC_016912	TTTTGA	2	12	114347	114358	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379013461
62	NC_016912	GATATG	2	12	122457	122468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013471
63	NC_016912	ATTTGA	2	12	126363	126374	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013474
64	NC_016912	GATTTT	2	12	130874	130885	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	379013479
65	NC_016912	ACAAAG	2	12	135394	135405	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379013483
66	NC_016912	TGTAAT	2	12	136418	136429	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013484
67	NC_016912	AAAGAT	2	12	137407	137418	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379013486
68	NC_016912	CAATAT	2	12	139878	139889	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379013487
69	NC_016912	TTGGTA	2	12	143733	143744	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379013492
70	NC_016912	GCGATT	2	12	143753	143764	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	379013492
71	NC_016912	AAATTT	2	12	143851	143862	50 %	50 %	0 %	0 %	379013492
72	NC_016912	ACCTGC	2	12	146753	146764	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379013495
73	NC_016912	AAGATA	2	12	146899	146910	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379013495
74	NC_016912	CGTTAA	2	12	149833	149844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013497
75	NC_016912	CTATTA	2	12	151684	151695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379013497
76	NC_016912	TATGAT	2	12	153218	153229	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013497
77	NC_016912	TTGAAA	2	12	153670	153681	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013497
78	NC_016912	AACATT	2	12	156110	156121	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	379013497
79	NC_016912	AGCAAC	2	12	159599	159610	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379013501
80	NC_016912	TGTTTG	2	12	159647	159658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013501
81	NC_016912	CACCTT	2	12	161651	161662	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	379013503
82	NC_016912	ACCTTT	2	12	162156	162167	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	379013503
83	NC_016912	GTAAAT	2	12	165892	165903	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013506
84	NC_016912	ATTTTA	2	12	167488	167499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013508
85	NC_016912	TATCTT	2	12	172103	172114	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379013511
86	NC_016912	ATTTGG	2	12	173116	173127	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379013512
87	NC_016912	CCCTGA	2	12	181036	181047	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	379013517
88	NC_016912	TCCTGA	2	12	181855	181866	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	379013517
89	NC_016912	TCAATT	2	12	184006	184017	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379013519
90	NC_016912	AATATG	2	12	185306	185317	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013520
91	NC_016912	AAAAAT	2	12	188798	188809	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	379013522
92	NC_016912	AGGACA	2	12	190659	190670	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379013524
93	NC_016912	ACATTT	2	12	190995	191006	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379013524
94	NC_016912	TTCTTG	2	12	195923	195934	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	379013528
95	NC_016912	GGACGT	2	12	206426	206437	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	379013537
96	NC_016912	ATATGA	2	12	209177	209188	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013539
97	NC_016912	TGGTAT	2	12	235570	235581	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	379013558
98	NC_016912	TATAGA	2	12	238924	238935	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379013562
99	NC_016912	ACGATG	2	12	245553	245564	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	379013567
100	NC_016912	AAGTAA	2	12	256535	256546	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379013577
101	NC_016912	ATAAAG	2	12	257516	257527	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	379013578
102	NC_016912	GACATT	2	12	259153	259164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013580
103	NC_016912	GATTTC	2	12	260972	260983	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379013582
104	NC_016912	TTCATA	2	12	261542	261553	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	379013583
105	NC_016912	GATTAT	2	12	266494	266505	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	379013588
106	NC_016912	ATGGTG	2	12	266627	266638	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	379013588
107	NC_016912	CAGCAA	2	12	267014	267025	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379013588
108	NC_016912	TTTATT	2	12	273758	273769	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379013593
109	NC_016912	AATCCT	2	12	273795	273806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013593
110	NC_016912	GAAAAA	2	12	276309	276320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379013597
111	NC_016912	GATACA	2	12	277474	277485	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379013597
112	NC_016912	AATCAA	2	12	278480	278491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379013597
113	NC_016912	TAATTA	2	12	279801	279812	50 %	50 %	0 %	0 %	379013599
114	NC_016912	ACAAGA	2	12	280641	280652	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379013600
115	NC_016912	AGGACA	2	12	281019	281030	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	379013600
116	NC_016912	TGAAGA	2	12	284130	284141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	379013602
117	NC_016912	TAAAAC	2	12	290584	290595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	379013609
118	NC_016912	CTGAAT	2	12	297623	297634	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013620
119	NC_016912	GAAAAA	2	12	301818	301829	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	379013623
120	NC_016912	TTTATT	2	12	302403	302414	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	379013624
121	NC_016912	ACGAAT	2	12	302881	302892	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379013624
122	NC_016912	GAAACA	2	12	304486	304497	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	379013625
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125	NC_016912	AATGAC	2	12	320473	320484	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379013639
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132	NC_016912	TTTAAA	2	12	341634	341645	50 %	50 %	0 %	0 %	379013659
133	NC_016912	ATTAAA	2	12	344325	344336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013664
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224	NC_016912	TTAAAA	2	12	548404	548415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013844
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228	NC_016912	GACTCA	2	12	550027	550038	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
229	NC_016912	GACTCA	2	12	550063	550074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
230	NC_016912	GACTCA	2	12	550099	550110	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
231	NC_016912	GATTCA	2	12	550117	550128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
232	NC_016912	GATTCA	2	12	550153	550164	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
233	NC_016912	TCAGAC	2	12	550198	550209	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
234	NC_016912	GACTCA	2	12	550213	550224	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
235	NC_016912	GATTCA	2	12	550231	550242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
236	NC_016912	TCAGAT	2	12	550252	550263	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
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239	NC_016912	TCAGAT	2	12	550324	550335	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
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241	NC_016912	GACTCA	2	12	550393	550404	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
242	NC_016912	GATTCA	2	12	550411	550422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
243	NC_016912	GACTCA	2	12	550429	550440	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013844
244	NC_016912	GATTCA	2	12	550465	550476	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
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246	NC_016912	TCAGAT	2	12	550522	550533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013844
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249	NC_016912	CCAAGA	2	12	553191	553202	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	379013845
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252	NC_016912	GACTCA	2	12	554527	554538	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013845
253	NC_016912	GATTCA	2	12	554545	554556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013845
254	NC_016912	TCAGAT	2	12	554566	554577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013845
255	NC_016912	TCAGAT	2	12	554620	554631	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013845
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257	NC_016912	TCAGAT	2	12	554656	554667	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013845
258	NC_016912	GACTCA	2	12	554707	554718	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013845
259	NC_016912	TCAGAT	2	12	554728	554739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	379013845
260	NC_016912	GACTCA	2	12	554833	554844	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013845
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262	NC_016912	GACTCA	2	12	554869	554880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013845
263	NC_016912	GACTCA	2	12	554923	554934	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	379013845
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341	NC_016912	ATTCTT	2	12	729845	729856	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	379014020
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343	NC_016912	CAAAAA	2	12	737312	737323	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	379014028
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455	NC_016912	GTAAAT	2	12	955423	955434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	379014239
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