MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 1751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016912	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	379013366
2	NC_016912	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	379013367
3	NC_016912	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	379013367
4	NC_016912	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	379013367
5	NC_016912	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	379013370
6	NC_016912	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	379013370
7	NC_016912	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	379013371
8	NC_016912	GGTGT	2	10	10123	10132	0 %	40 %	60 %	0 %	379013372
9	NC_016912	ATCGC	2	10	10185	10194	20 %	20 %	20 %	40 %	379013372
10	NC_016912	CGTTG	2	10	11728	11737	0 %	40 %	40 %	20 %	379013373
11	NC_016912	TTATT	2	10	15442	15451	20 %	80 %	0 %	0 %	379013376
12	NC_016912	GCAAG	2	10	16616	16625	40 %	0 %	40 %	20 %	379013377
13	NC_016912	TTTGA	2	10	16775	16784	20 %	60 %	20 %	0 %	379013377
14	NC_016912	AGTTA	2	10	22094	22103	40 %	40 %	20 %	0 %	379013381
15	NC_016912	ATGTA	2	10	23652	23661	40 %	40 %	20 %	0 %	379013382
16	NC_016912	ACCAA	2	10	26263	26272	60 %	0 %	0 %	40 %	379013384
17	NC_016912	ATCAA	2	10	26975	26984	60 %	20 %	0 %	20 %	379013384
18	NC_016912	GAAAC	2	10	27596	27605	60 %	0 %	20 %	20 %	379013385
19	NC_016912	GAAGT	2	10	27746	27755	40 %	20 %	40 %	0 %	379013385
20	NC_016912	ATTAT	2	10	29389	29398	40 %	60 %	0 %	0 %	379013386
21	NC_016912	AAGGT	2	10	32482	32491	40 %	20 %	40 %	0 %	379013388
22	NC_016912	CATTA	2	10	33909	33918	40 %	40 %	0 %	20 %	379013389
23	NC_016912	TAGTA	2	10	36244	36253	40 %	40 %	20 %	0 %	379013390
24	NC_016912	TACTA	2	10	37422	37431	40 %	40 %	0 %	20 %	379013392
25	NC_016912	ATCAA	2	10	40175	40184	60 %	20 %	0 %	20 %	379013395
26	NC_016912	TAATA	2	10	42007	42016	60 %	40 %	0 %	0 %	379013396
27	NC_016912	ATTTT	2	10	44615	44624	20 %	80 %	0 %	0 %	379013402
28	NC_016912	TATGG	2	10	46628	46637	20 %	40 %	40 %	0 %	379013404
29	NC_016912	TAACT	2	10	46933	46942	40 %	40 %	0 %	20 %	379013404
30	NC_016912	ATTGC	2	10	48205	48214	20 %	40 %	20 %	20 %	379013405
31	NC_016912	TATAT	2	10	49699	49708	40 %	60 %	0 %	0 %	379013407
32	NC_016912	CTAAA	2	10	51339	51348	60 %	20 %	0 %	20 %	379013408
33	NC_016912	CAAAA	2	10	51370	51379	80 %	0 %	0 %	20 %	379013408
34	NC_016912	TTACC	2	10	54486	54495	20 %	40 %	0 %	40 %	379013410
35	NC_016912	GATAT	2	10	56061	56070	40 %	40 %	20 %	0 %	379013411
36	NC_016912	TACTA	2	10	56597	56606	40 %	40 %	0 %	20 %	379013412
37	NC_016912	TTTAC	2	10	57006	57015	20 %	60 %	0 %	20 %	379013412
38	NC_016912	ATTGC	2	10	59489	59498	20 %	40 %	20 %	20 %	379013415
39	NC_016912	CATGG	2	10	60893	60902	20 %	20 %	40 %	20 %	379013415
40	NC_016912	TGAAA	2	10	61561	61570	60 %	20 %	20 %	0 %	379013416
41	NC_016912	TCAAT	2	10	61933	61942	40 %	40 %	0 %	20 %	379013416
42	NC_016912	GTATT	2	10	62422	62431	20 %	60 %	20 %	0 %	379013417
43	NC_016912	AGATA	2	10	68293	68302	60 %	20 %	20 %	0 %	379013420
44	NC_016912	TAAAA	2	10	68853	68862	80 %	20 %	0 %	0 %	379013420
45	NC_016912	AAAGA	2	10	70486	70495	80 %	0 %	20 %	0 %	379013421
46	NC_016912	CAATT	2	10	71137	71146	40 %	40 %	0 %	20 %	379013422
47	NC_016912	ATGTT	2	10	71971	71980	20 %	60 %	20 %	0 %	379013423
48	NC_016912	TTGCG	2	10	72542	72551	0 %	40 %	40 %	20 %	379013423
49	NC_016912	AGTTA	2	10	74102	74111	40 %	40 %	20 %	0 %	379013424
50	NC_016912	AGATG	2	10	77475	77484	40 %	20 %	40 %	0 %	379013426
51	NC_016912	GGTGA	2	10	78071	78080	20 %	20 %	60 %	0 %	379013427
52	NC_016912	GAAAA	2	10	81508	81517	80 %	0 %	20 %	0 %	379013430
53	NC_016912	TTATT	2	10	81675	81684	20 %	80 %	0 %	0 %	379013430
54	NC_016912	AATCA	2	10	84697	84706	60 %	20 %	0 %	20 %	379013432
55	NC_016912	GCACG	2	10	85101	85110	20 %	0 %	40 %	40 %	379013433
56	NC_016912	ATTTT	2	10	85395	85404	20 %	80 %	0 %	0 %	379013433
57	NC_016912	ATCAA	2	10	85422	85431	60 %	20 %	0 %	20 %	379013433
58	NC_016912	ATCAC	2	10	86655	86664	40 %	20 %	0 %	40 %	379013434
59	NC_016912	AACGA	2	10	87332	87341	60 %	0 %	20 %	20 %	379013434
60	NC_016912	ACACA	2	10	89388	89397	60 %	0 %	0 %	40 %	379013436
61	NC_016912	GACAA	2	10	90539	90548	60 %	0 %	20 %	20 %	379013437
62	NC_016912	ATTAC	2	10	93180	93189	40 %	40 %	0 %	20 %	379013440
63	NC_016912	TATCT	2	10	93840	93849	20 %	60 %	0 %	20 %	379013441
64	NC_016912	ATACG	2	10	96273	96282	40 %	20 %	20 %	20 %	379013443
65	NC_016912	TTATA	2	10	96931	96940	40 %	60 %	0 %	0 %	379013444
66	NC_016912	TTTTA	2	10	97729	97738	20 %	80 %	0 %	0 %	379013444
67	NC_016912	GTATT	2	10	98242	98251	20 %	60 %	20 %	0 %	379013445
68	NC_016912	AATAA	2	10	98835	98844	80 %	20 %	0 %	0 %	379013445
69	NC_016912	TACGC	2	10	99102	99111	20 %	20 %	20 %	40 %	379013445
70	NC_016912	GACAA	2	10	100444	100453	60 %	0 %	20 %	20 %	379013447
71	NC_016912	TCCCT	2	10	101908	101917	0 %	40 %	0 %	60 %	379013449
72	NC_016912	GCTTT	2	10	104142	104151	0 %	60 %	20 %	20 %	379013451
73	NC_016912	TAATT	2	10	104227	104236	40 %	60 %	0 %	0 %	379013451
74	NC_016912	ATACT	2	10	105408	105417	40 %	40 %	0 %	20 %	379013453
75	NC_016912	TAATA	2	10	106574	106583	60 %	40 %	0 %	0 %	379013454
76	NC_016912	ATTTT	2	10	107565	107574	20 %	80 %	0 %	0 %	379013455
77	NC_016912	TTGTA	2	10	109789	109798	20 %	60 %	20 %	0 %	379013457
78	NC_016912	TGCAA	2	10	110794	110803	40 %	20 %	20 %	20 %	379013458
79	NC_016912	ATATG	2	10	112812	112821	40 %	40 %	20 %	0 %	379013459
80	NC_016912	AATAT	2	10	113680	113689	60 %	40 %	0 %	0 %	379013460
81	NC_016912	ATTTT	2	10	115069	115078	20 %	80 %	0 %	0 %	379013463
82	NC_016912	GATTT	2	10	115123	115132	20 %	60 %	20 %	0 %	379013463
83	NC_016912	GGGGC	2	10	115392	115401	0 %	0 %	80 %	20 %	379013465
84	NC_016912	TGGTA	2	10	118020	118029	20 %	40 %	40 %	0 %	379013467
85	NC_016912	CGAAC	2	10	118110	118119	40 %	0 %	20 %	40 %	379013467
86	NC_016912	TTCAA	2	10	120137	120146	40 %	40 %	0 %	20 %	379013468
87	NC_016912	ACATC	2	10	120980	120989	40 %	20 %	0 %	40 %	379013470
88	NC_016912	TAATT	2	10	123203	123212	40 %	60 %	0 %	0 %	379013471
89	NC_016912	AGAGA	2	10	126229	126238	60 %	0 %	40 %	0 %	379013474
90	NC_016912	AATCC	2	10	126585	126594	40 %	20 %	0 %	40 %	379013474
91	NC_016912	CTAAT	2	10	130480	130489	40 %	40 %	0 %	20 %	379013478
92	NC_016912	TGAAT	2	10	135341	135350	40 %	40 %	20 %	0 %	379013483
93	NC_016912	TGATT	2	10	136472	136481	20 %	60 %	20 %	0 %	379013485
94	NC_016912	AGCAA	2	10	136723	136732	60 %	0 %	20 %	20 %	379013485
95	NC_016912	TTCAT	2	10	139578	139587	20 %	60 %	0 %	20 %	379013487
96	NC_016912	TTTAC	2	10	139961	139970	20 %	60 %	0 %	20 %	379013487
97	NC_016912	TTATT	2	10	140942	140951	20 %	80 %	0 %	0 %	379013489
98	NC_016912	GGATT	2	10	141930	141939	20 %	40 %	40 %	0 %	379013490
99	NC_016912	TAACT	2	10	144970	144979	40 %	40 %	0 %	20 %	379013493
100	NC_016912	TTTAT	2	10	147877	147886	20 %	80 %	0 %	0 %	379013496
101	NC_016912	ATGCA	2	10	149480	149489	40 %	20 %	20 %	20 %	379013497
102	NC_016912	TATGA	2	10	156726	156735	40 %	40 %	20 %	0 %	379013498
103	NC_016912	GTGAA	2	10	156760	156769	40 %	20 %	40 %	0 %	379013498
104	NC_016912	TTAAT	2	10	157203	157212	40 %	60 %	0 %	0 %	379013499
105	NC_016912	ATATA	2	10	160033	160042	60 %	40 %	0 %	0 %	379013502
106	NC_016912	AAGAT	2	10	163762	163771	60 %	20 %	20 %	0 %	379013504
107	NC_016912	CGTTT	2	10	164207	164216	0 %	60 %	20 %	20 %	379013505
108	NC_016912	AAATG	2	10	166688	166697	60 %	20 %	20 %	0 %	379013508
109	NC_016912	GTAAA	2	10	166852	166861	60 %	20 %	20 %	0 %	379013508
110	NC_016912	TTTAA	2	10	166872	166881	40 %	60 %	0 %	0 %	379013508
111	NC_016912	TTTGC	2	10	167388	167397	0 %	60 %	20 %	20 %	379013508
112	NC_016912	TTGTT	2	10	168394	168403	0 %	80 %	20 %	0 %	379013508
113	NC_016912	CAAAA	2	10	171607	171616	80 %	0 %	0 %	20 %	379013511
114	NC_016912	AGTTT	2	10	172143	172152	20 %	60 %	20 %	0 %	379013511
115	NC_016912	CAACA	2	10	172373	172382	60 %	0 %	0 %	40 %	379013511
116	NC_016912	AAAAT	2	10	173001	173010	80 %	20 %	0 %	0 %	379013512
117	NC_016912	AAATG	2	10	173410	173419	60 %	20 %	20 %	0 %	379013512
118	NC_016912	TTGAA	2	10	174684	174693	40 %	40 %	20 %	0 %	379013513
119	NC_016912	TAGAT	2	10	177622	177631	40 %	40 %	20 %	0 %	379013514
120	NC_016912	CTAAG	2	10	180122	180131	40 %	20 %	20 %	20 %	379013516
121	NC_016912	CATGT	2	10	180547	180556	20 %	40 %	20 %	20 %	379013517
122	NC_016912	TTGAA	2	10	180622	180631	40 %	40 %	20 %	0 %	379013517
123	NC_016912	AATTG	2	10	181947	181956	40 %	40 %	20 %	0 %	379013517
124	NC_016912	TTTTC	2	10	182196	182205	0 %	80 %	0 %	20 %	379013518
125	NC_016912	TCAAT	2	10	182635	182644	40 %	40 %	0 %	20 %	379013518
126	NC_016912	TTATT	2	10	182668	182677	20 %	80 %	0 %	0 %	379013518
127	NC_016912	CTATG	2	10	184924	184933	20 %	40 %	20 %	20 %	379013520
128	NC_016912	GATTG	2	10	186987	186996	20 %	40 %	40 %	0 %	379013521
129	NC_016912	TTATT	2	10	188741	188750	20 %	80 %	0 %	0 %	379013522
130	NC_016912	GTAAA	2	10	191799	191808	60 %	20 %	20 %	0 %	379013525
131	NC_016912	GGAAT	2	10	192461	192470	40 %	20 %	40 %	0 %	379013525
132	NC_016912	ATCGT	2	10	192573	192582	20 %	40 %	20 %	20 %	379013525
133	NC_016912	ATTCA	2	10	195094	195103	40 %	40 %	0 %	20 %	379013527
134	NC_016912	ATGTG	2	10	196333	196342	20 %	40 %	40 %	0 %	379013529
135	NC_016912	TAAAT	2	10	196676	196685	60 %	40 %	0 %	0 %	379013529
136	NC_016912	AAAGC	2	10	198016	198025	60 %	0 %	20 %	20 %	379013530
137	NC_016912	TGGAT	2	10	198326	198335	20 %	40 %	40 %	0 %	379013531
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175	NC_016912	ATTCA	2	10	249734	249743	40 %	40 %	0 %	20 %	379013570
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257	NC_016912	TCGTA	2	10	383159	383168	20 %	40 %	20 %	20 %	379013705
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