MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 35482

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016912	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013366
2	NC_016912	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013366
3	NC_016912	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013366
4	NC_016912	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013366
5	NC_016912	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
6	NC_016912	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013366
7	NC_016912	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013366
8	NC_016912	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013366
9	NC_016912	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013366
10	NC_016912	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013366
11	NC_016912	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013366
12	NC_016912	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013366
13	NC_016912	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013366
14	NC_016912	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013366
15	NC_016912	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
16	NC_016912	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013366
17	NC_016912	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
18	NC_016912	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013366
19	NC_016912	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013366
20	NC_016912	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
21	NC_016912	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
22	NC_016912	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013366
23	NC_016912	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013366
24	NC_016912	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013366
25	NC_016912	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
26	NC_016912	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013366
27	NC_016912	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
28	NC_016912	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
29	NC_016912	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
30	NC_016912	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
31	NC_016912	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013367
32	NC_016912	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013367
33	NC_016912	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013367
34	NC_016912	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
35	NC_016912	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013367
36	NC_016912	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013367
37	NC_016912	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013367
38	NC_016912	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013367
39	NC_016912	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
40	NC_016912	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013367
41	NC_016912	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
42	NC_016912	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013367
43	NC_016912	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
44	NC_016912	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013367
45	NC_016912	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013367
46	NC_016912	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013367
47	NC_016912	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013367
48	NC_016912	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013367
49	NC_016912	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013367
50	NC_016912	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013367
51	NC_016912	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013367
52	NC_016912	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013368
53	NC_016912	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013368
54	NC_016912	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013368
55	NC_016912	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013368
56	NC_016912	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013368
57	NC_016912	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013369
58	NC_016912	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013369
59	NC_016912	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013369
60	NC_016912	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379013369
61	NC_016912	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013369
62	NC_016912	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013369
63	NC_016912	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013369
64	NC_016912	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013369
65	NC_016912	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013369
66	NC_016912	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013369
67	NC_016912	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013369
68	NC_016912	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013369
69	NC_016912	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013369
70	NC_016912	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013369
71	NC_016912	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013369
72	NC_016912	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013369
73	NC_016912	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013370
74	NC_016912	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013370
75	NC_016912	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013370
76	NC_016912	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013370
77	NC_016912	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013370
78	NC_016912	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013370
79	NC_016912	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013370
80	NC_016912	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013370
81	NC_016912	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013370
82	NC_016912	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013370
83	NC_016912	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013370
84	NC_016912	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013370
85	NC_016912	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013370
86	NC_016912	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013370
87	NC_016912	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013370
88	NC_016912	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013370
89	NC_016912	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013370
90	NC_016912	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013370
91	NC_016912	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379013370
92	NC_016912	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013370
93	NC_016912	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013370
94	NC_016912	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013370
95	NC_016912	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013370
96	NC_016912	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013370
97	NC_016912	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013370
98	NC_016912	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013370
99	NC_016912	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013370
100	NC_016912	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013371
101	NC_016912	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013371
102	NC_016912	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013371
103	NC_016912	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013371
104	NC_016912	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013371
105	NC_016912	TTA	2	6	7503	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013371
106	NC_016912	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013371
107	NC_016912	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	379013371
108	NC_016912	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013371
109	NC_016912	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013371
110	NC_016912	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013371
111	NC_016912	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013371
112	NC_016912	CAT	2	6	7990	7995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013371
113	NC_016912	TTA	2	6	8038	8043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013371
114	NC_016912	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013371
115	NC_016912	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013371
116	NC_016912	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013371
117	NC_016912	AGA	2	6	8094	8099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013371
118	NC_016912	ATT	2	6	8184	8189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013371
119	NC_016912	CAA	2	6	8238	8243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013371
120	NC_016912	TTA	2	6	8346	8351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013371
121	NC_016912	TGA	2	6	8384	8389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013371
122	NC_016912	TTA	2	6	8397	8402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013371
123	NC_016912	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013371
124	NC_016912	TCG	2	6	8453	8458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013371
125	NC_016912	AGA	2	6	8513	8518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013371
126	NC_016912	ATA	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013371
127	NC_016912	GTG	2	6	8593	8598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013371
128	NC_016912	GTG	2	6	8602	8607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013371
129	NC_016912	GAA	2	6	8628	8633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013371
130	NC_016912	ATG	2	6	8788	8793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013371
131	NC_016912	CTT	2	6	8843	8848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013371
132	NC_016912	GTG	2	6	8866	8871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013371
133	NC_016912	AGA	2	6	8942	8947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013371
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136	NC_016912	CAT	2	6	9013	9018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013371
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255	NC_016912	CAA	2	6	17405	17410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013378
256	NC_016912	ATT	2	6	17484	17489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013378
257	NC_016912	TTA	2	6	17552	17557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013378
258	NC_016912	AAC	2	6	17568	17573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013378
259	NC_016912	CAT	2	6	17604	17609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013378
260	NC_016912	ATT	2	6	17632	17637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013378
261	NC_016912	AAC	2	6	17685	17690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013378
262	NC_016912	TAC	2	6	17729	17734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013378
263	NC_016912	CCA	2	6	17752	17757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013378
264	NC_016912	AGA	2	6	17844	17849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013378
265	NC_016912	TCA	2	6	17885	17890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013378
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267	NC_016912	ATT	2	6	18025	18030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013378
268	NC_016912	TAT	2	6	18044	18049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013378
269	NC_016912	ACT	2	6	18237	18242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013378
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271	NC_016912	AAT	2	6	18314	18319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013379
272	NC_016912	TCA	2	6	18361	18366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013379
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275	NC_016912	CAT	2	6	18467	18472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013379
276	NC_016912	CAA	3	9	18535	18543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013379
277	NC_016912	ATA	2	6	18544	18549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013379
278	NC_016912	ATT	2	6	18848	18853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013379
279	NC_016912	AGA	2	6	19028	19033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013379
280	NC_016912	GCA	2	6	19374	19379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013379
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282	NC_016912	AAT	2	6	19407	19412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013379
283	NC_016912	ACG	2	6	19460	19465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013379
284	NC_016912	TGA	2	6	19468	19473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013379
285	NC_016912	TTA	2	6	19510	19515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013379
286	NC_016912	GAT	2	6	19521	19526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013379
287	NC_016912	ATG	2	6	19536	19541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013379
288	NC_016912	TTG	2	6	19564	19569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013379
289	NC_016912	GTT	2	6	19629	19634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013379
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292	NC_016912	TTG	2	6	19677	19682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013379
293	NC_016912	AAC	2	6	19753	19758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013379
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