MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 4695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016912	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016912	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016912	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016912	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	379013366
5	NC_016912	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	379013366
6	NC_016912	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	379013366
7	NC_016912	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016912	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016912	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016912	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016912	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	379013367
12	NC_016912	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016912	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	379013369
14	NC_016912	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	379013370
15	NC_016912	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	379013370
16	NC_016912	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	379013370
17	NC_016912	AG	3	6	7467	7472	50 %	0 %	50 %	0 %	379013371
18	NC_016912	AG	4	8	8312	8319	50 %	0 %	50 %	0 %	379013371
19	NC_016912	AT	3	6	10621	10626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016912	AT	3	6	10889	10894	50 %	50 %	0 %	0 %	379013373
21	NC_016912	CT	3	6	11306	11311	0 %	50 %	0 %	50 %	379013373
22	NC_016912	TA	3	6	11514	11519	50 %	50 %	0 %	0 %	379013373
23	NC_016912	AT	3	6	12505	12510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016912	AG	3	6	12524	12529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016912	AT	4	8	12558	12565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016912	TA	3	6	13462	13467	50 %	50 %	0 %	0 %	379013374
27	NC_016912	TA	3	6	14099	14104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016912	TA	3	6	14687	14692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016912	TA	3	6	14865	14870	50 %	50 %	0 %	0 %	379013375
30	NC_016912	AT	3	6	15183	15188	50 %	50 %	0 %	0 %	379013375
31	NC_016912	AT	3	6	16312	16317	50 %	50 %	0 %	0 %	379013377
32	NC_016912	AT	4	8	17077	17084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016912	CA	3	6	17224	17229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016912	GT	3	6	18065	18070	0 %	50 %	50 %	0 %	379013378
35	NC_016912	AT	3	6	18958	18963	50 %	50 %	0 %	0 %	379013379
36	NC_016912	GT	3	6	19384	19389	0 %	50 %	50 %	0 %	379013379
37	NC_016912	AG	3	6	19500	19505	50 %	0 %	50 %	0 %	379013379
38	NC_016912	AT	4	8	19683	19690	50 %	50 %	0 %	0 %	379013379
39	NC_016912	AC	3	6	20716	20721	50 %	0 %	0 %	50 %	379013380
40	NC_016912	TC	3	6	21796	21801	0 %	50 %	0 %	50 %	379013381
41	NC_016912	AT	3	6	22238	22243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016912	CG	3	6	22533	22538	0 %	0 %	50 %	50 %	379013382
43	NC_016912	AG	3	6	23311	23316	50 %	0 %	50 %	0 %	379013382
44	NC_016912	TA	3	6	23733	23738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016912	AT	3	6	24372	24377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016912	AT	3	6	24727	24732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016912	TA	3	6	24778	24783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016912	AT	3	6	25581	25586	50 %	50 %	0 %	0 %	379013383
49	NC_016912	TA	3	6	26090	26095	50 %	50 %	0 %	0 %	379013384
50	NC_016912	AT	3	6	27532	27537	50 %	50 %	0 %	0 %	379013385
51	NC_016912	CA	3	6	28893	28898	50 %	0 %	0 %	50 %	379013386
52	NC_016912	AG	3	6	29949	29954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016912	AT	3	6	30763	30768	50 %	50 %	0 %	0 %	379013387
54	NC_016912	CA	3	6	31362	31367	50 %	0 %	0 %	50 %	379013388
55	NC_016912	CG	3	6	31767	31772	0 %	0 %	50 %	50 %	379013388
56	NC_016912	GC	3	6	33202	33207	0 %	0 %	50 %	50 %	379013388
57	NC_016912	AT	3	6	33325	33330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016912	AT	3	6	34246	34251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016912	AT	3	6	34255	34260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016912	TA	3	6	34868	34873	50 %	50 %	0 %	0 %	379013390
61	NC_016912	TA	3	6	35025	35030	50 %	50 %	0 %	0 %	379013390
62	NC_016912	TA	3	6	35225	35230	50 %	50 %	0 %	0 %	379013390
63	NC_016912	AT	3	6	35493	35498	50 %	50 %	0 %	0 %	379013390
64	NC_016912	AT	3	6	35505	35510	50 %	50 %	0 %	0 %	379013390
65	NC_016912	AT	5	10	35568	35577	50 %	50 %	0 %	0 %	379013390
66	NC_016912	AC	3	6	35880	35885	50 %	0 %	0 %	50 %	379013390
67	NC_016912	AT	3	6	35926	35931	50 %	50 %	0 %	0 %	379013390
68	NC_016912	AT	3	6	36210	36215	50 %	50 %	0 %	0 %	379013390
69	NC_016912	TC	3	6	36386	36391	0 %	50 %	0 %	50 %	379013390
70	NC_016912	CA	3	6	36500	36505	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016912	TG	3	6	36627	36632	0 %	50 %	50 %	0 %	379013391
72	NC_016912	TG	3	6	36788	36793	0 %	50 %	50 %	0 %	379013391
73	NC_016912	AT	3	6	37101	37106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016912	TA	3	6	37132	37137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016912	AT	3	6	37636	37641	50 %	50 %	0 %	0 %	379013392
76	NC_016912	AT	3	6	37822	37827	50 %	50 %	0 %	0 %	379013392
77	NC_016912	AT	3	6	38264	38269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016912	AT	3	6	39578	39583	50 %	50 %	0 %	0 %	379013395
79	NC_016912	AT	4	8	39691	39698	50 %	50 %	0 %	0 %	379013395
80	NC_016912	AC	3	6	39821	39826	50 %	0 %	0 %	50 %	379013395
81	NC_016912	AG	3	6	40282	40287	50 %	0 %	50 %	0 %	379013395
82	NC_016912	CA	3	6	40329	40334	50 %	0 %	0 %	50 %	379013395
83	NC_016912	AC	3	6	40451	40456	50 %	0 %	0 %	50 %	379013395
84	NC_016912	AT	3	6	40677	40682	50 %	50 %	0 %	0 %	379013395
85	NC_016912	AT	3	6	41391	41396	50 %	50 %	0 %	0 %	379013396
86	NC_016912	AT	3	6	41950	41955	50 %	50 %	0 %	0 %	379013396
87	NC_016912	TG	3	6	42756	42761	0 %	50 %	50 %	0 %	379013399
88	NC_016912	TG	3	6	42917	42922	0 %	50 %	50 %	0 %	379013399
89	NC_016912	AT	3	6	43438	43443	50 %	50 %	0 %	0 %	379013399
90	NC_016912	AT	3	6	44310	44315	50 %	50 %	0 %	0 %	379013401
91	NC_016912	AG	3	6	44543	44548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016912	TA	3	6	45332	45337	50 %	50 %	0 %	0 %	379013402
93	NC_016912	AT	3	6	46400	46405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016912	GA	4	8	46706	46713	50 %	0 %	50 %	0 %	379013404
95	NC_016912	TA	3	6	47082	47087	50 %	50 %	0 %	0 %	379013404
96	NC_016912	AT	3	6	47697	47702	50 %	50 %	0 %	0 %	379013405
97	NC_016912	AT	3	6	47883	47888	50 %	50 %	0 %	0 %	379013405
98	NC_016912	AT	3	6	47939	47944	50 %	50 %	0 %	0 %	379013405
99	NC_016912	AT	3	6	48411	48416	50 %	50 %	0 %	0 %	379013406
100	NC_016912	AC	3	6	50672	50677	50 %	0 %	0 %	50 %	379013408
101	NC_016912	AT	3	6	51297	51302	50 %	50 %	0 %	0 %	379013408
102	NC_016912	AT	3	6	51477	51482	50 %	50 %	0 %	0 %	379013408
103	NC_016912	TA	3	6	53522	53527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016912	AT	3	6	53939	53944	50 %	50 %	0 %	0 %	379013409
105	NC_016912	TA	3	6	54092	54097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016912	AT	3	6	55409	55414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016912	TA	3	6	55737	55742	50 %	50 %	0 %	0 %	379013411
108	NC_016912	AT	3	6	56181	56186	50 %	50 %	0 %	0 %	379013411
109	NC_016912	AG	3	6	56269	56274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016912	AT	3	6	56796	56801	50 %	50 %	0 %	0 %	379013412
111	NC_016912	GA	3	6	57102	57107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016912	TA	3	6	58227	58232	50 %	50 %	0 %	0 %	379013414
113	NC_016912	TA	3	6	58265	58270	50 %	50 %	0 %	0 %	379013414
114	NC_016912	AT	3	6	58464	58469	50 %	50 %	0 %	0 %	379013414
115	NC_016912	CA	4	8	58726	58733	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016912	CA	3	6	58911	58916	50 %	0 %	0 %	50 %	379013415
117	NC_016912	AG	3	6	59365	59370	50 %	0 %	50 %	0 %	379013415
118	NC_016912	AT	3	6	59875	59880	50 %	50 %	0 %	0 %	379013415
119	NC_016912	AT	3	6	59928	59933	50 %	50 %	0 %	0 %	379013415
120	NC_016912	CA	3	6	60231	60236	50 %	0 %	0 %	50 %	379013415
121	NC_016912	AC	3	6	60975	60980	50 %	0 %	0 %	50 %	379013415
122	NC_016912	TA	3	6	62100	62105	50 %	50 %	0 %	0 %	379013416
123	NC_016912	TG	3	6	62175	62180	0 %	50 %	50 %	0 %	379013416
124	NC_016912	TA	4	8	63994	64001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016912	AT	3	6	64381	64386	50 %	50 %	0 %	0 %	379013418
126	NC_016912	AT	3	6	66015	66020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016912	AT	3	6	66623	66628	50 %	50 %	0 %	0 %	379013419
128	NC_016912	GC	3	6	67987	67992	0 %	0 %	50 %	50 %	379013419
129	NC_016912	TA	3	6	68516	68521	50 %	50 %	0 %	0 %	379013420
130	NC_016912	AT	3	6	68729	68734	50 %	50 %	0 %	0 %	379013420
131	NC_016912	TG	3	6	68823	68828	0 %	50 %	50 %	0 %	379013420
132	NC_016912	AT	3	6	68829	68834	50 %	50 %	0 %	0 %	379013420
133	NC_016912	TA	3	6	69502	69507	50 %	50 %	0 %	0 %	379013421
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135	NC_016912	TA	3	6	69913	69918	50 %	50 %	0 %	0 %	379013421
136	NC_016912	GA	3	6	71229	71234	50 %	0 %	50 %	0 %	379013422
137	NC_016912	AT	3	6	71326	71331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016912	TA	3	6	71484	71489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016912	AG	3	6	71491	71496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016912	AT	3	6	71742	71747	50 %	50 %	0 %	0 %	379013423
141	NC_016912	TA	3	6	71768	71773	50 %	50 %	0 %	0 %	379013423
142	NC_016912	GT	3	6	72815	72820	0 %	50 %	50 %	0 %	379013423
143	NC_016912	AT	3	6	73221	73226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016912	TA	3	6	73369	73374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016912	TC	3	6	75844	75849	0 %	50 %	0 %	50 %	379013425
146	NC_016912	AT	3	6	75912	75917	50 %	50 %	0 %	0 %	379013425
147	NC_016912	GT	3	6	76000	76005	0 %	50 %	50 %	0 %	379013425
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