MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 2786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016911	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	378723381
2	NC_016911	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	378723381
3	NC_016911	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	378723382
4	NC_016911	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	378723382
5	NC_016911	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	378723382
6	NC_016911	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	378723382
7	NC_016911	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	378723382
8	NC_016911	ATAA	2	8	6891	6898	75 %	25 %	0 %	0 %	378723384
9	NC_016911	ATTT	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	378723385
10	NC_016911	CTGT	2	8	8116	8123	0 %	50 %	25 %	25 %	378723386
11	NC_016911	CCTC	2	8	9845	9852	0 %	25 %	0 %	75 %	378723388
12	NC_016911	CAAT	2	8	9892	9899	50 %	25 %	0 %	25 %	378723388
13	NC_016911	TTTA	2	8	11714	11721	25 %	75 %	0 %	0 %	378723391
14	NC_016911	GATT	2	8	12158	12165	25 %	50 %	25 %	0 %	378723392
15	NC_016911	AAAT	2	8	12166	12173	75 %	25 %	0 %	0 %	378723392
16	NC_016911	AATT	2	8	12193	12200	50 %	50 %	0 %	0 %	378723392
17	NC_016911	ATGA	2	8	13071	13078	50 %	25 %	25 %	0 %	378723393
18	NC_016911	TAAA	2	8	14094	14101	75 %	25 %	0 %	0 %	378723394
19	NC_016911	TAAA	2	8	14253	14260	75 %	25 %	0 %	0 %	378723394
20	NC_016911	TCAT	2	8	14374	14381	25 %	50 %	0 %	25 %	378723394
21	NC_016911	CTTT	2	8	14508	14515	0 %	75 %	0 %	25 %	378723394
22	NC_016911	GCAA	2	8	14849	14856	50 %	0 %	25 %	25 %	378723395
23	NC_016911	TCTT	2	8	14926	14933	0 %	75 %	0 %	25 %	378723395
24	NC_016911	AGTA	2	8	15184	15191	50 %	25 %	25 %	0 %	378723396
25	NC_016911	GCTT	2	8	15710	15717	0 %	50 %	25 %	25 %	378723397
26	NC_016911	AATT	2	8	16059	16066	50 %	50 %	0 %	0 %	378723397
27	NC_016911	AATA	2	8	16682	16689	75 %	25 %	0 %	0 %	378723398
28	NC_016911	TCTA	2	8	17149	17156	25 %	50 %	0 %	25 %	378723398
29	NC_016911	ACGT	2	8	17572	17579	25 %	25 %	25 %	25 %	378723398
30	NC_016911	CTTG	2	8	17687	17694	0 %	50 %	25 %	25 %	378723398
31	NC_016911	AGTA	2	8	18753	18760	50 %	25 %	25 %	0 %	378723400
32	NC_016911	ATTA	2	8	18778	18785	50 %	50 %	0 %	0 %	378723400
33	NC_016911	AATA	2	8	18822	18829	75 %	25 %	0 %	0 %	378723400
34	NC_016911	CTTT	2	8	18867	18874	0 %	75 %	0 %	25 %	378723400
35	NC_016911	TAAA	2	8	19058	19065	75 %	25 %	0 %	0 %	378723400
36	NC_016911	AGAT	2	8	19246	19253	50 %	25 %	25 %	0 %	378723400
37	NC_016911	TAAA	2	8	19411	19418	75 %	25 %	0 %	0 %	378723401
38	NC_016911	GTAA	2	8	21038	21045	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
39	NC_016911	AGAT	2	8	21292	21299	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
40	NC_016911	AGCA	2	8	21411	21418	50 %	0 %	25 %	25 %	378723403
41	NC_016911	AAAT	2	8	21454	21461	75 %	25 %	0 %	0 %	378723403
42	NC_016911	AATG	2	8	21655	21662	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
43	NC_016911	ATTA	2	8	21956	21963	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
44	NC_016911	ATAG	2	8	22004	22011	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
45	NC_016911	ATAG	2	8	22016	22023	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
46	NC_016911	CGTT	2	8	22434	22441	0 %	50 %	25 %	25 %	378723403
47	NC_016911	TAGT	2	8	22881	22888	25 %	50 %	25 %	0 %	378723403
48	NC_016911	AAGC	2	8	23621	23628	50 %	0 %	25 %	25 %	378723403
49	NC_016911	TAAA	2	8	23946	23953	75 %	25 %	0 %	0 %	378723403
50	NC_016911	AAGT	2	8	24456	24463	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
51	NC_016911	AAGT	2	8	24543	24550	50 %	25 %	25 %	0 %	378723403
52	NC_016911	TTCA	2	8	25092	25099	25 %	50 %	0 %	25 %	378723403
53	NC_016911	AATA	2	8	25585	25592	75 %	25 %	0 %	0 %	378723403
54	NC_016911	TAAA	2	8	25731	25738	75 %	25 %	0 %	0 %	378723403
55	NC_016911	ATGT	2	8	26530	26537	25 %	50 %	25 %	0 %	378723405
56	NC_016911	TTAT	2	8	26584	26591	25 %	75 %	0 %	0 %	378723405
57	NC_016911	AGCA	2	8	26658	26665	50 %	0 %	25 %	25 %	378723405
58	NC_016911	TAAT	2	8	27459	27466	50 %	50 %	0 %	0 %	378723406
59	NC_016911	AAGA	2	8	27611	27618	75 %	0 %	25 %	0 %	378723406
60	NC_016911	AAAT	2	8	27703	27710	75 %	25 %	0 %	0 %	378723406
61	NC_016911	ATTA	2	8	27731	27738	50 %	50 %	0 %	0 %	378723406
62	NC_016911	TCTA	2	8	29427	29434	25 %	50 %	0 %	25 %	378723410
63	NC_016911	ATTT	2	8	29471	29478	25 %	75 %	0 %	0 %	378723410
64	NC_016911	TGTC	2	8	29535	29542	0 %	50 %	25 %	25 %	378723410
65	NC_016911	ATAC	2	8	30132	30139	50 %	25 %	0 %	25 %	378723412
66	NC_016911	ATAA	2	8	30556	30563	75 %	25 %	0 %	0 %	378723412
67	NC_016911	CACT	2	8	30650	30657	25 %	25 %	0 %	50 %	378723412
68	NC_016911	TATT	2	8	31474	31481	25 %	75 %	0 %	0 %	378723414
69	NC_016911	AATT	2	8	33108	33115	50 %	50 %	0 %	0 %	378723416
70	NC_016911	TACC	2	8	33198	33205	25 %	25 %	0 %	50 %	378723416
71	NC_016911	GTTA	2	8	33580	33587	25 %	50 %	25 %	0 %	378723416
72	NC_016911	AAAC	2	8	35003	35010	75 %	0 %	0 %	25 %	378723418
73	NC_016911	TTAG	2	8	35179	35186	25 %	50 %	25 %	0 %	378723418
74	NC_016911	TTGC	2	8	35474	35481	0 %	50 %	25 %	25 %	378723418
75	NC_016911	TTCC	2	8	35714	35721	0 %	50 %	0 %	50 %	378723418
76	NC_016911	TGTT	2	8	36182	36189	0 %	75 %	25 %	0 %	378723419
77	NC_016911	TTGT	2	8	36788	36795	0 %	75 %	25 %	0 %	378723420
78	NC_016911	TATT	2	8	36867	36874	25 %	75 %	0 %	0 %	378723420
79	NC_016911	GTAA	2	8	36878	36885	50 %	25 %	25 %	0 %	378723420
80	NC_016911	AATG	2	8	37650	37657	50 %	25 %	25 %	0 %	378723422
81	NC_016911	GTTT	2	8	38164	38171	0 %	75 %	25 %	0 %	378723422
82	NC_016911	TAAA	2	8	41042	41049	75 %	25 %	0 %	0 %	378723424
83	NC_016911	ATTT	2	8	41147	41154	25 %	75 %	0 %	0 %	378723424
84	NC_016911	GAAA	2	8	42778	42785	75 %	0 %	25 %	0 %	378723426
85	NC_016911	ATTT	2	8	42822	42829	25 %	75 %	0 %	0 %	378723426
86	NC_016911	ACAA	2	8	43089	43096	75 %	0 %	0 %	25 %	378723426
87	NC_016911	AAAT	2	8	43293	43300	75 %	25 %	0 %	0 %	378723427
88	NC_016911	TAAC	2	8	45178	45185	50 %	25 %	0 %	25 %	378723429
89	NC_016911	ATTC	2	8	45607	45614	25 %	50 %	0 %	25 %	378723430
90	NC_016911	ATGT	2	8	45963	45970	25 %	50 %	25 %	0 %	378723431
91	NC_016911	ATTT	2	8	46122	46129	25 %	75 %	0 %	0 %	378723431
92	NC_016911	TTAC	2	8	46201	46208	25 %	50 %	0 %	25 %	378723431
93	NC_016911	ATCA	2	8	46878	46885	50 %	25 %	0 %	25 %	378723432
94	NC_016911	TGCC	2	8	47188	47195	0 %	25 %	25 %	50 %	378723432
95	NC_016911	TATC	2	8	47747	47754	25 %	50 %	0 %	25 %	378723432
96	NC_016911	TTAA	2	8	47770	47777	50 %	50 %	0 %	0 %	378723432
97	NC_016911	TTGC	2	8	49239	49246	0 %	50 %	25 %	25 %	378723434
98	NC_016911	TGTT	2	8	49608	49615	0 %	75 %	25 %	0 %	378723435
99	NC_016911	CTTG	2	8	50112	50119	0 %	50 %	25 %	25 %	378723436
100	NC_016911	TGCT	2	8	50864	50871	0 %	50 %	25 %	25 %	378723438
101	NC_016911	TAAA	2	8	52763	52770	75 %	25 %	0 %	0 %	378723439
102	NC_016911	GAGG	2	8	52789	52796	25 %	0 %	75 %	0 %	378723439
103	NC_016911	ATTG	2	8	53172	53179	25 %	50 %	25 %	0 %	378723439
104	NC_016911	TTAT	2	8	53386	53393	25 %	75 %	0 %	0 %	378723439
105	NC_016911	TGCT	2	8	53468	53475	0 %	50 %	25 %	25 %	378723439
106	NC_016911	GTGA	2	8	53575	53582	25 %	25 %	50 %	0 %	378723439
107	NC_016911	CCGC	2	8	54342	54349	0 %	0 %	25 %	75 %	378723439
108	NC_016911	GTTC	2	8	54353	54360	0 %	50 %	25 %	25 %	378723439
109	NC_016911	GACC	2	8	54371	54378	25 %	0 %	25 %	50 %	378723439
110	NC_016911	AAAT	2	8	55091	55098	75 %	25 %	0 %	0 %	378723439
111	NC_016911	TAAG	2	8	55491	55498	50 %	25 %	25 %	0 %	378723440
112	NC_016911	ATAA	2	8	56118	56125	75 %	25 %	0 %	0 %	378723441
113	NC_016911	CTTT	2	8	56818	56825	0 %	75 %	0 %	25 %	378723441
114	NC_016911	ACTT	2	8	57330	57337	25 %	50 %	0 %	25 %	378723442
115	NC_016911	TTGC	2	8	57788	57795	0 %	50 %	25 %	25 %	378723442
116	NC_016911	ATAA	2	8	57820	57827	75 %	25 %	0 %	0 %	378723442
117	NC_016911	ATAA	2	8	57874	57881	75 %	25 %	0 %	0 %	378723442
118	NC_016911	CATC	2	8	58011	58018	25 %	25 %	0 %	50 %	378723442
119	NC_016911	ATTT	3	12	58187	58198	25 %	75 %	0 %	0 %	378723442
120	NC_016911	AGAA	2	8	59563	59570	75 %	0 %	25 %	0 %	378723444
121	NC_016911	AAAG	2	8	59943	59950	75 %	0 %	25 %	0 %	378723445
122	NC_016911	TAAA	2	8	60010	60017	75 %	25 %	0 %	0 %	378723445
123	NC_016911	AAGA	2	8	61131	61138	75 %	0 %	25 %	0 %	378723447
124	NC_016911	AGTC	2	8	61366	61373	25 %	25 %	25 %	25 %	378723447
125	NC_016911	TAAT	2	8	61782	61789	50 %	50 %	0 %	0 %	378723447
126	NC_016911	ATTA	2	8	61858	61865	50 %	50 %	0 %	0 %	378723447
127	NC_016911	ATCT	2	8	62115	62122	25 %	50 %	0 %	25 %	378723447
128	NC_016911	GAAT	2	8	62679	62686	50 %	25 %	25 %	0 %	378723448
129	NC_016911	CAAG	2	8	62910	62917	50 %	0 %	25 %	25 %	378723448
130	NC_016911	ATGG	2	8	63233	63240	25 %	25 %	50 %	0 %	378723448
131	NC_016911	AAGA	2	8	63518	63525	75 %	0 %	25 %	0 %	378723448
132	NC_016911	GAAA	2	8	63604	63611	75 %	0 %	25 %	0 %	378723448
133	NC_016911	TTAA	2	8	65293	65300	50 %	50 %	0 %	0 %	378723451
134	NC_016911	GGAA	2	8	65349	65356	50 %	0 %	50 %	0 %	378723451
135	NC_016911	GCAT	2	8	65401	65408	25 %	25 %	25 %	25 %	378723451
136	NC_016911	TGCT	2	8	65628	65635	0 %	50 %	25 %	25 %	378723451
137	NC_016911	AATT	2	8	66451	66458	50 %	50 %	0 %	0 %	378723453
138	NC_016911	TGTT	2	8	66711	66718	0 %	75 %	25 %	0 %	378723453
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