MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia rickettsii str. Hauke chromosome

Total Repeats: 2884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016911	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	378723378
2	NC_016911	TC	3	6	1521	1526	0 %	50 %	0 %	50 %	378723380
3	NC_016911	AT	3	6	1646	1651	50 %	50 %	0 %	0 %	378723380
4	NC_016911	TA	3	6	1764	1769	50 %	50 %	0 %	0 %	378723380
5	NC_016911	GA	3	6	2332	2337	50 %	0 %	50 %	0 %	378723381
6	NC_016911	TA	3	6	2496	2501	50 %	50 %	0 %	0 %	378723381
7	NC_016911	TG	3	6	2612	2617	0 %	50 %	50 %	0 %	378723381
8	NC_016911	AT	3	6	2756	2761	50 %	50 %	0 %	0 %	378723381
9	NC_016911	TC	3	6	3069	3074	0 %	50 %	0 %	50 %	378723382
10	NC_016911	TG	3	6	3437	3442	0 %	50 %	50 %	0 %	378723382
11	NC_016911	GA	3	6	3544	3549	50 %	0 %	50 %	0 %	378723382
12	NC_016911	AT	3	6	4006	4011	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
13	NC_016911	AT	3	6	4316	4321	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
14	NC_016911	AG	3	6	4335	4340	50 %	0 %	50 %	0 %	378723382
15	NC_016911	TA	3	6	4423	4428	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
16	NC_016911	TA	3	6	4675	4680	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
17	NC_016911	AT	3	6	4867	4872	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
18	NC_016911	AT	3	6	5901	5906	50 %	50 %	0 %	0 %	378723382
19	NC_016911	TA	3	6	6247	6252	50 %	50 %	0 %	0 %	378723383
20	NC_016911	TA	3	6	8519	8524	50 %	50 %	0 %	0 %	378723386
21	NC_016911	TA	3	6	8947	8952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016911	GT	3	6	9627	9632	0 %	50 %	50 %	0 %	378723388
23	NC_016911	TA	3	6	9728	9733	50 %	50 %	0 %	0 %	378723388
24	NC_016911	TA	3	6	11523	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	378723390
25	NC_016911	AC	3	6	12239	12244	50 %	0 %	0 %	50 %	378723392
26	NC_016911	TA	3	6	12276	12281	50 %	50 %	0 %	0 %	378723392
27	NC_016911	TA	3	6	12542	12547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016911	TA	3	6	14117	14122	50 %	50 %	0 %	0 %	378723394
29	NC_016911	AG	3	6	14891	14896	50 %	0 %	50 %	0 %	378723395
30	NC_016911	AT	3	6	15304	15309	50 %	50 %	0 %	0 %	378723396
31	NC_016911	AT	3	6	15718	15723	50 %	50 %	0 %	0 %	378723397
32	NC_016911	TA	3	6	15746	15751	50 %	50 %	0 %	0 %	378723397
33	NC_016911	AT	3	6	17218	17223	50 %	50 %	0 %	0 %	378723398
34	NC_016911	TG	3	6	17757	17762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016911	AT	3	6	18968	18973	50 %	50 %	0 %	0 %	378723400
36	NC_016911	TA	3	6	19599	19604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016911	AT	3	6	19829	19834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016911	AT	3	6	20114	20119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016911	AG	3	6	22719	22724	50 %	0 %	50 %	0 %	378723403
40	NC_016911	CA	3	6	22751	22756	50 %	0 %	0 %	50 %	378723403
41	NC_016911	TC	3	6	23034	23039	0 %	50 %	0 %	50 %	378723403
42	NC_016911	TA	3	6	23277	23282	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
43	NC_016911	TA	3	6	23413	23418	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
44	NC_016911	AT	3	6	23456	23461	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
45	NC_016911	TA	3	6	24140	24145	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
46	NC_016911	TA	3	6	24239	24244	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
47	NC_016911	TA	3	6	25404	25409	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
48	NC_016911	AT	3	6	25461	25466	50 %	50 %	0 %	0 %	378723403
49	NC_016911	TA	3	6	25817	25822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016911	AT	3	6	26671	26676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016911	AG	3	6	27069	27074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016911	AT	3	6	28014	28019	50 %	50 %	0 %	0 %	378723407
53	NC_016911	AT	4	8	28238	28245	50 %	50 %	0 %	0 %	378723408
54	NC_016911	CT	3	6	28331	28336	0 %	50 %	0 %	50 %	378723408
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61	NC_016911	AT	3	6	32446	32451	50 %	50 %	0 %	0 %	378723415
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63	NC_016911	AT	3	6	33734	33739	50 %	50 %	0 %	0 %	378723416
64	NC_016911	AT	3	6	33883	33888	50 %	50 %	0 %	0 %	378723416
65	NC_016911	AT	3	6	34634	34639	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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69	NC_016911	AT	3	6	37464	37469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016911	AT	3	6	37474	37479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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91	NC_016911	AT	3	6	46894	46899	50 %	50 %	0 %	0 %	378723432
92	NC_016911	TA	4	8	46967	46974	50 %	50 %	0 %	0 %	378723432
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113	NC_016911	TA	3	6	59331	59336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016911	AT	3	6	60341	60346	50 %	50 %	0 %	0 %	378723446
115	NC_016911	AT	3	6	61188	61193	50 %	50 %	0 %	0 %	378723447
116	NC_016911	TA	3	6	61329	61334	50 %	50 %	0 %	0 %	378723447
117	NC_016911	AG	3	6	61493	61498	50 %	0 %	50 %	0 %	378723447
118	NC_016911	TA	3	6	61933	61938	50 %	50 %	0 %	0 %	378723447
119	NC_016911	AT	3	6	62196	62201	50 %	50 %	0 %	0 %	378723447
120	NC_016911	CT	3	6	62341	62346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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123	NC_016911	AG	3	6	65093	65098	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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127	NC_016911	AT	3	6	67180	67185	50 %	50 %	0 %	0 %	378723453
128	NC_016911	CT	3	6	67470	67475	0 %	50 %	0 %	50 %	378723453
129	NC_016911	TA	3	6	68206	68211	50 %	50 %	0 %	0 %	378723454
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139	NC_016911	TA	3	6	71051	71056	50 %	50 %	0 %	0 %	378723457
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