MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 2803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016909	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	378722023
2	NC_016909	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	378722023
3	NC_016909	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	378722024
4	NC_016909	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	378722024
5	NC_016909	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	378722024
6	NC_016909	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	378722024
7	NC_016909	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	378722024
8	NC_016909	ATAA	2	8	6891	6898	75 %	25 %	0 %	0 %	378722026
9	NC_016909	ATTT	2	8	7682	7689	25 %	75 %	0 %	0 %	378722027
10	NC_016909	CTGT	2	8	8118	8125	0 %	50 %	25 %	25 %	378722028
11	NC_016909	CCTC	2	8	9847	9854	0 %	25 %	0 %	75 %	378722030
12	NC_016909	CAAT	2	8	9894	9901	50 %	25 %	0 %	25 %	378722030
13	NC_016909	TTTA	2	8	11716	11723	25 %	75 %	0 %	0 %	378722033
14	NC_016909	GATT	2	8	12160	12167	25 %	50 %	25 %	0 %	378722034
15	NC_016909	AAAT	2	8	12168	12175	75 %	25 %	0 %	0 %	378722034
16	NC_016909	AATT	2	8	12195	12202	50 %	50 %	0 %	0 %	378722034
17	NC_016909	ATGA	2	8	13073	13080	50 %	25 %	25 %	0 %	378722035
18	NC_016909	TAAA	2	8	14096	14103	75 %	25 %	0 %	0 %	378722036
19	NC_016909	TAAA	2	8	14255	14262	75 %	25 %	0 %	0 %	378722036
20	NC_016909	TCAT	2	8	14376	14383	25 %	50 %	0 %	25 %	378722036
21	NC_016909	CTTT	2	8	14510	14517	0 %	75 %	0 %	25 %	378722036
22	NC_016909	GCAA	2	8	14851	14858	50 %	0 %	25 %	25 %	378722037
23	NC_016909	TCTT	2	8	14928	14935	0 %	75 %	0 %	25 %	378722037
24	NC_016909	AGTA	2	8	15186	15193	50 %	25 %	25 %	0 %	378722038
25	NC_016909	GCTT	2	8	15712	15719	0 %	50 %	25 %	25 %	378722039
26	NC_016909	AATT	2	8	16061	16068	50 %	50 %	0 %	0 %	378722039
27	NC_016909	AATA	2	8	16685	16692	75 %	25 %	0 %	0 %	378722040
28	NC_016909	TCTA	2	8	17152	17159	25 %	50 %	0 %	25 %	378722040
29	NC_016909	ACGT	2	8	17575	17582	25 %	25 %	25 %	25 %	378722040
30	NC_016909	CTTG	2	8	17690	17697	0 %	50 %	25 %	25 %	378722040
31	NC_016909	AGTA	2	8	18756	18763	50 %	25 %	25 %	0 %	378722042
32	NC_016909	ATTA	2	8	18781	18788	50 %	50 %	0 %	0 %	378722042
33	NC_016909	AATA	2	8	18825	18832	75 %	25 %	0 %	0 %	378722042
34	NC_016909	CTTT	2	8	18870	18877	0 %	75 %	0 %	25 %	378722042
35	NC_016909	TAAA	2	8	19061	19068	75 %	25 %	0 %	0 %	378722042
36	NC_016909	AGAT	2	8	19249	19256	50 %	25 %	25 %	0 %	378722042
37	NC_016909	TAAA	2	8	19414	19421	75 %	25 %	0 %	0 %	378722043
38	NC_016909	GTAA	2	8	21041	21048	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
39	NC_016909	AGAT	2	8	21295	21302	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
40	NC_016909	AGCA	2	8	21414	21421	50 %	0 %	25 %	25 %	378722044
41	NC_016909	AAAT	2	8	21457	21464	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
42	NC_016909	AATG	2	8	21658	21665	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
43	NC_016909	ATTA	2	8	21959	21966	50 %	50 %	0 %	0 %	378722044
44	NC_016909	ATAG	2	8	22007	22014	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
45	NC_016909	ATAG	2	8	22019	22026	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
46	NC_016909	CGTT	2	8	22437	22444	0 %	50 %	25 %	25 %	378722044
47	NC_016909	TAGT	2	8	22884	22891	25 %	50 %	25 %	0 %	378722044
48	NC_016909	AAGC	2	8	23624	23631	50 %	0 %	25 %	25 %	378722044
49	NC_016909	TAAA	2	8	23949	23956	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
50	NC_016909	AAGT	2	8	24459	24466	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
51	NC_016909	AAGT	2	8	24546	24553	50 %	25 %	25 %	0 %	378722044
52	NC_016909	TTCA	2	8	25095	25102	25 %	50 %	0 %	25 %	378722044
53	NC_016909	AATA	2	8	25588	25595	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
54	NC_016909	TAAA	2	8	25734	25741	75 %	25 %	0 %	0 %	378722044
55	NC_016909	ATGT	2	8	26533	26540	25 %	50 %	25 %	0 %	378722046
56	NC_016909	TTAT	2	8	26587	26594	25 %	75 %	0 %	0 %	378722046
57	NC_016909	AGCA	2	8	26661	26668	50 %	0 %	25 %	25 %	378722046
58	NC_016909	TAAT	2	8	27462	27469	50 %	50 %	0 %	0 %	378722047
59	NC_016909	AAGA	2	8	27614	27621	75 %	0 %	25 %	0 %	378722047
60	NC_016909	AAAT	2	8	27706	27713	75 %	25 %	0 %	0 %	378722047
61	NC_016909	ATTA	2	8	27734	27741	50 %	50 %	0 %	0 %	378722047
62	NC_016909	TCTA	2	8	29430	29437	25 %	50 %	0 %	25 %	378722051
63	NC_016909	ATTT	2	8	29474	29481	25 %	75 %	0 %	0 %	378722051
64	NC_016909	TGTC	2	8	29538	29545	0 %	50 %	25 %	25 %	378722051
65	NC_016909	ATAC	2	8	30135	30142	50 %	25 %	0 %	25 %	378722053
66	NC_016909	ATAA	2	8	30559	30566	75 %	25 %	0 %	0 %	378722053
67	NC_016909	CACT	2	8	30653	30660	25 %	25 %	0 %	50 %	378722053
68	NC_016909	TATT	2	8	31477	31484	25 %	75 %	0 %	0 %	378722055
69	NC_016909	AATT	2	8	33111	33118	50 %	50 %	0 %	0 %	378722057
70	NC_016909	TACC	2	8	33201	33208	25 %	25 %	0 %	50 %	378722057
71	NC_016909	GTTA	2	8	33583	33590	25 %	50 %	25 %	0 %	378722057
72	NC_016909	AAAC	2	8	35006	35013	75 %	0 %	0 %	25 %	378722059
73	NC_016909	TTAG	2	8	35182	35189	25 %	50 %	25 %	0 %	378722059
74	NC_016909	TTGC	2	8	35477	35484	0 %	50 %	25 %	25 %	378722059
75	NC_016909	TTCC	2	8	35717	35724	0 %	50 %	0 %	50 %	378722059
76	NC_016909	TGTT	2	8	36185	36192	0 %	75 %	25 %	0 %	378722060
77	NC_016909	TTGT	2	8	36791	36798	0 %	75 %	25 %	0 %	378722061
78	NC_016909	TATT	2	8	36870	36877	25 %	75 %	0 %	0 %	378722061
79	NC_016909	GTAA	2	8	36881	36888	50 %	25 %	25 %	0 %	378722061
80	NC_016909	AATG	2	8	37653	37660	50 %	25 %	25 %	0 %	378722063
81	NC_016909	GTTT	2	8	38167	38174	0 %	75 %	25 %	0 %	378722063
82	NC_016909	TAAA	2	8	41045	41052	75 %	25 %	0 %	0 %	378722065
83	NC_016909	ATTT	2	8	41150	41157	25 %	75 %	0 %	0 %	378722065
84	NC_016909	GAAA	2	8	42781	42788	75 %	0 %	25 %	0 %	378722067
85	NC_016909	ATTT	2	8	42825	42832	25 %	75 %	0 %	0 %	378722067
86	NC_016909	ACAA	2	8	43092	43099	75 %	0 %	0 %	25 %	378722067
87	NC_016909	AAAT	2	8	43296	43303	75 %	25 %	0 %	0 %	378722068
88	NC_016909	TAAC	2	8	45181	45188	50 %	25 %	0 %	25 %	378722070
89	NC_016909	ATTC	2	8	45610	45617	25 %	50 %	0 %	25 %	378722071
90	NC_016909	ATGT	2	8	45966	45973	25 %	50 %	25 %	0 %	378722072
91	NC_016909	ATTT	2	8	46125	46132	25 %	75 %	0 %	0 %	378722072
92	NC_016909	TTAC	2	8	46204	46211	25 %	50 %	0 %	25 %	378722072
93	NC_016909	ATCA	2	8	46881	46888	50 %	25 %	0 %	25 %	378722073
94	NC_016909	TGCC	2	8	47191	47198	0 %	25 %	25 %	50 %	378722073
95	NC_016909	TATC	2	8	47750	47757	25 %	50 %	0 %	25 %	378722073
96	NC_016909	TTAA	2	8	47773	47780	50 %	50 %	0 %	0 %	378722073
97	NC_016909	TTGC	2	8	49242	49249	0 %	50 %	25 %	25 %	378722075
98	NC_016909	TGTT	2	8	49611	49618	0 %	75 %	25 %	0 %	378722076
99	NC_016909	CTTG	2	8	50115	50122	0 %	50 %	25 %	25 %	378722077
100	NC_016909	TGCT	2	8	50867	50874	0 %	50 %	25 %	25 %	378722079
101	NC_016909	TAAA	2	8	52766	52773	75 %	25 %	0 %	0 %	378722080
102	NC_016909	GAGG	2	8	52792	52799	25 %	0 %	75 %	0 %	378722080
103	NC_016909	ATTG	2	8	53175	53182	25 %	50 %	25 %	0 %	378722080
104	NC_016909	TTAT	2	8	53389	53396	25 %	75 %	0 %	0 %	378722080
105	NC_016909	TGCT	2	8	53471	53478	0 %	50 %	25 %	25 %	378722080
106	NC_016909	GTGA	2	8	53578	53585	25 %	25 %	50 %	0 %	378722080
107	NC_016909	CCGC	2	8	54345	54352	0 %	0 %	25 %	75 %	378722080
108	NC_016909	GTTC	2	8	54356	54363	0 %	50 %	25 %	25 %	378722080
109	NC_016909	GACC	2	8	54374	54381	25 %	0 %	25 %	50 %	378722080
110	NC_016909	AAAT	2	8	55094	55101	75 %	25 %	0 %	0 %	378722080
111	NC_016909	TAAG	2	8	55494	55501	50 %	25 %	25 %	0 %	378722081
112	NC_016909	ATAA	2	8	56121	56128	75 %	25 %	0 %	0 %	378722082
113	NC_016909	CTTT	2	8	56821	56828	0 %	75 %	0 %	25 %	378722082
114	NC_016909	ACTT	2	8	57333	57340	25 %	50 %	0 %	25 %	378722083
115	NC_016909	TTGC	2	8	57791	57798	0 %	50 %	25 %	25 %	378722083
116	NC_016909	ATAA	2	8	57823	57830	75 %	25 %	0 %	0 %	378722083
117	NC_016909	ATAA	2	8	57877	57884	75 %	25 %	0 %	0 %	378722083
118	NC_016909	CATC	2	8	58014	58021	25 %	25 %	0 %	50 %	378722083
119	NC_016909	ATTT	3	12	58190	58201	25 %	75 %	0 %	0 %	378722083
120	NC_016909	AGAA	2	8	59567	59574	75 %	0 %	25 %	0 %	378722085
121	NC_016909	AAAG	2	8	59947	59954	75 %	0 %	25 %	0 %	378722086
122	NC_016909	TAAA	2	8	60014	60021	75 %	25 %	0 %	0 %	378722086
123	NC_016909	AAGA	2	8	61135	61142	75 %	0 %	25 %	0 %	378722088
124	NC_016909	AGTC	2	8	61370	61377	25 %	25 %	25 %	25 %	378722088
125	NC_016909	TAAT	2	8	61786	61793	50 %	50 %	0 %	0 %	378722088
126	NC_016909	ATTA	2	8	61862	61869	50 %	50 %	0 %	0 %	378722088
127	NC_016909	ATCT	2	8	62119	62126	25 %	50 %	0 %	25 %	378722088
128	NC_016909	GAAT	2	8	62683	62690	50 %	25 %	25 %	0 %	378722089
129	NC_016909	CAAG	2	8	62914	62921	50 %	0 %	25 %	25 %	378722089
130	NC_016909	ATGG	2	8	63237	63244	25 %	25 %	50 %	0 %	378722089
131	NC_016909	AAGA	2	8	63522	63529	75 %	0 %	25 %	0 %	378722089
132	NC_016909	GAAA	2	8	63608	63615	75 %	0 %	25 %	0 %	378722089
133	NC_016909	TTAA	2	8	65297	65304	50 %	50 %	0 %	0 %	378722092
134	NC_016909	GGAA	2	8	65353	65360	50 %	0 %	50 %	0 %	378722092
135	NC_016909	GCAT	2	8	65405	65412	25 %	25 %	25 %	25 %	378722092
136	NC_016909	TGCT	2	8	65632	65639	0 %	50 %	25 %	25 %	378722092
137	NC_016909	AATT	2	8	66455	66462	50 %	50 %	0 %	0 %	378722094
138	NC_016909	TGTT	2	8	66715	66722	0 %	75 %	25 %	0 %	378722094
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