MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Arizona chromosome

Total Repeats: 15103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016909	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722020
2	NC_016909	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722020
3	NC_016909	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722020
4	NC_016909	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722020
5	NC_016909	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722020
6	NC_016909	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722020
7	NC_016909	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722020
8	NC_016909	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722020
9	NC_016909	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722020
10	NC_016909	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722020
11	NC_016909	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722020
12	NC_016909	ATA	2	6	1196	1201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722021
13	NC_016909	TGA	2	6	1255	1260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722021
14	NC_016909	GTA	2	6	1293	1298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722021
15	NC_016909	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722021
16	NC_016909	TAA	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722021
17	NC_016909	TCT	2	6	1503	1508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722022
18	NC_016909	ATA	3	9	1767	1775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722022
19	NC_016909	GTA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722022
20	NC_016909	TGA	2	6	1933	1938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722022
21	NC_016909	GAA	2	6	1990	1995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722022
22	NC_016909	AAT	2	6	2020	2025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722022
23	NC_016909	AAG	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722022
24	NC_016909	TTA	2	6	2075	2080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722022
25	NC_016909	CAA	3	9	2138	2146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722022
26	NC_016909	CGG	2	6	2359	2364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378722023
27	NC_016909	AGC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722023
28	NC_016909	ATA	2	6	2435	2440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722023
29	NC_016909	ATA	2	6	2573	2578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722023
30	NC_016909	TAA	2	6	2604	2609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722023
31	NC_016909	ATG	2	6	2834	2839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722023
32	NC_016909	TAT	2	6	2854	2859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722023
33	NC_016909	TTA	2	6	2868	2873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722023
34	NC_016909	CTC	2	6	3065	3070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378722024
35	NC_016909	ATT	2	6	3076	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722024
36	NC_016909	ATT	2	6	3089	3094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722024
37	NC_016909	AAG	2	6	3161	3166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722024
38	NC_016909	ATT	2	6	3202	3207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722024
39	NC_016909	AAT	2	6	3354	3359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722024
40	NC_016909	AGA	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722024
41	NC_016909	AGA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722024
42	NC_016909	AGC	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722024
43	NC_016909	TGC	2	6	3417	3422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722024
44	NC_016909	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722024
45	NC_016909	GTT	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722024
46	NC_016909	GAG	2	6	3685	3690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722024
47	NC_016909	TAT	2	6	3846	3851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722024
48	NC_016909	GCA	2	6	3874	3879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722024
49	NC_016909	AGA	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722024
50	NC_016909	CTA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722024
51	NC_016909	TAT	2	6	4123	4128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722024
52	NC_016909	TTA	2	6	4129	4134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722024
53	NC_016909	TGT	2	6	4149	4154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722024
54	NC_016909	ATA	2	6	4343	4348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722024
55	NC_016909	GGC	2	6	4594	4599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378722024
56	NC_016909	GCA	2	6	4618	4623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722024
57	NC_016909	GAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722024
58	NC_016909	AAG	2	6	4748	4753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722024
59	NC_016909	AAT	2	6	4759	4764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722024
60	NC_016909	GAA	2	6	4765	4770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722024
61	NC_016909	TAA	2	6	4785	4790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722024
62	NC_016909	CTA	2	6	4809	4814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722024
63	NC_016909	GAG	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722024
64	NC_016909	AAG	2	6	5201	5206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722024
65	NC_016909	ACG	2	6	5210	5215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722024
66	NC_016909	ATA	2	6	5237	5242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722024
67	NC_016909	ATT	2	6	5288	5293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722024
68	NC_016909	TAA	2	6	5310	5315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722024
69	NC_016909	GAT	2	6	5329	5334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722024
70	NC_016909	TGC	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722024
71	NC_016909	ATT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722024
72	NC_016909	TGC	2	6	5424	5429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722024
73	NC_016909	CTA	2	6	5519	5524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722024
74	NC_016909	AGT	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722024
75	NC_016909	CGC	2	6	5582	5587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722024
76	NC_016909	TTG	2	6	5618	5623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722024
77	NC_016909	TTA	2	6	5647	5652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722024
78	NC_016909	ATA	2	6	5669	5674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722024
79	NC_016909	TAA	2	6	5738	5743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722024
80	NC_016909	ATA	2	6	5761	5766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722024
81	NC_016909	GAA	2	6	5767	5772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722024
82	NC_016909	ATA	2	6	5815	5820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722024
83	NC_016909	ATG	2	6	5848	5853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722024
84	NC_016909	CTT	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722025
85	NC_016909	TCA	2	6	6120	6125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722025
86	NC_016909	ATA	2	6	6129	6134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722025
87	NC_016909	TGT	2	6	6211	6216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722025
88	NC_016909	GAT	2	6	6238	6243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722025
89	NC_016909	AAC	3	9	6263	6271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722025
90	NC_016909	CAA	2	6	6314	6319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722025
91	NC_016909	CTA	3	9	6468	6476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722026
92	NC_016909	ATT	2	6	6515	6520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722026
93	NC_016909	TTC	2	6	6581	6586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722026
94	NC_016909	ATC	2	6	6732	6737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722026
95	NC_016909	ATT	2	6	6786	6791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722026
96	NC_016909	TAC	2	6	6842	6847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722026
97	NC_016909	ATT	2	6	6848	6853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722026
98	NC_016909	ATT	3	9	6899	6907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722026
99	NC_016909	TCA	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722026
100	NC_016909	CCG	2	6	6927	6932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722026
101	NC_016909	TAT	2	6	6973	6978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722026
102	NC_016909	ATT	2	6	6987	6992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722026
103	NC_016909	TAC	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722026
104	NC_016909	GTA	2	6	7212	7217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722026
105	NC_016909	CTT	2	6	7431	7436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722027
106	NC_016909	TAG	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722027
107	NC_016909	AGC	2	6	7474	7479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722027
108	NC_016909	CTA	2	6	7620	7625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722027
109	NC_016909	ATA	3	9	7922	7930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722028
110	NC_016909	ATA	2	6	7949	7954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722028
111	NC_016909	GCC	2	6	7969	7974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378722028
112	NC_016909	ATA	2	6	8132	8137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722028
113	NC_016909	TAG	2	6	8235	8240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722028
114	NC_016909	ATT	2	6	8260	8265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722028
115	NC_016909	ACG	2	6	8366	8371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722028
116	NC_016909	TCG	2	6	8372	8377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722028
117	NC_016909	TGT	2	6	8405	8410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378722028
118	NC_016909	CTC	2	6	8439	8444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378722028
119	NC_016909	TAT	2	6	8475	8480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722028
120	NC_016909	TAA	2	6	8487	8492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722028
121	NC_016909	CAA	2	6	8556	8561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722028
122	NC_016909	ATT	2	6	8573	8578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722028
123	NC_016909	TAG	2	6	8580	8585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722028
124	NC_016909	TAA	2	6	8656	8661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722028
125	NC_016909	AGC	3	9	8710	8718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722028
126	NC_016909	AGG	2	6	8830	8835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378722028
127	NC_016909	TAC	2	6	8904	8909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722028
128	NC_016909	GGT	2	6	9275	9280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378722029
129	NC_016909	AGT	2	6	9356	9361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722029
130	NC_016909	GGT	2	6	9372	9377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378722029
131	NC_016909	GCT	2	6	9384	9389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722029
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256	NC_016909	CAT	2	6	20799	20804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722044
257	NC_016909	ACC	2	6	20872	20877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378722044
258	NC_016909	GCA	2	6	20894	20899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722044
259	NC_016909	CAA	2	6	20930	20935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722044
260	NC_016909	TCC	2	6	20974	20979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378722044
261	NC_016909	GAT	2	6	21067	21072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
262	NC_016909	TAA	2	6	21451	21456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
263	NC_016909	AAG	2	6	21522	21527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
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277	NC_016909	AAT	2	6	22544	22549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
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279	NC_016909	GAT	2	6	22622	22627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722044
280	NC_016909	GAA	2	6	22670	22675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378722044
281	NC_016909	ATT	2	6	22761	22766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722044
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285	NC_016909	CAA	2	6	23300	23305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722044
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316	NC_016909	AAT	2	6	25127	25132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722044
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352	NC_016909	CTT	2	6	28318	28323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722049
353	NC_016909	TAA	2	6	28340	28345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722049
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359	NC_016909	ATT	2	6	29195	29200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722050
360	NC_016909	GTA	2	6	29216	29221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722051
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362	NC_016909	TGC	2	6	29283	29288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378722051
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364	NC_016909	AGC	2	6	29313	29318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378722051
365	NC_016909	TAT	2	6	29546	29551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722051
366	NC_016909	TTC	2	6	29559	29564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378722051
367	NC_016909	AAT	2	6	29639	29644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722051
368	NC_016909	CAT	2	6	30125	30130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722053
369	NC_016909	CAA	2	6	30179	30184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378722053
370	NC_016909	ATA	2	6	30211	30216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722053
371	NC_016909	TAA	2	6	30276	30281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722053
372	NC_016909	CAT	2	6	30294	30299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722053
373	NC_016909	ATC	2	6	30364	30369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378722053
374	NC_016909	ATA	2	6	30493	30498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722053
375	NC_016909	TAG	2	6	30503	30508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722053
376	NC_016909	TAT	2	6	30849	30854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722054
377	NC_016909	TAT	2	6	30895	30900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378722054
378	NC_016909	ATA	2	6	30908	30913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378722054
379	NC_016909	TAG	2	6	31047	31052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378722054
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