MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016908	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016908	ATTT	2	8	1401	1408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016908	TAAA	2	8	6434	6441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016908	ATTA	2	8	10889	10896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016908	ATTA	2	8	11103	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016908	ATCT	2	8	11409	11416	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016908	TTAG	2	8	14750	14757	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016908	TTGC	2	8	16332	16339	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016908	AGTA	2	8	18754	18761	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016908	ATTA	2	8	18779	18786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016908	AATA	2	8	18823	18830	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016908	CTTT	2	8	18868	18875	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016908	TAAA	2	8	19059	19066	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016908	AGAT	2	8	19247	19254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016908	AGTA	2	8	19812	19819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016908	AAAC	2	8	19862	19869	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016908	TAAA	2	8	19937	19944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016908	TTAT	2	8	20135	20142	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016908	ACTA	2	8	25878	25885	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016908	TAAA	2	8	28589	28596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016908	AGGA	2	8	28647	28654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016908	TAAA	2	8	28679	28686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016908	GCTA	2	8	28689	28696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016908	TAAT	2	8	29936	29943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016908	ATAA	2	8	38670	38677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016908	AACA	2	8	38767	38774	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016908	TAAA	2	8	39869	39876	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016908	CTTG	2	8	40711	40718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016908	CTGA	2	8	40719	40726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016908	ATTG	2	8	40895	40902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016908	ATTA	2	8	41322	41329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016908	ATTA	2	8	41379	41386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016908	TGCT	3	12	41502	41513	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016908	GCTT	2	8	41629	41636	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016908	TTTA	2	8	41669	41676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016908	ATTA	2	8	42110	42117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016908	TAAT	2	8	42403	42410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016908	ATTA	2	8	42473	42480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016908	AAAT	2	8	42576	42583	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016908	TACC	2	8	44656	44663	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016908	AAAC	2	8	44664	44671	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016908	TAAT	2	8	44740	44747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016908	ATTT	2	8	44767	44774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016908	ATTA	2	8	44775	44782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016908	AAAT	2	8	44794	44801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016908	ATGA	2	8	44997	45004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016908	AGTA	2	8	48885	48892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016908	ATAC	2	8	49103	49110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016908	AAGT	2	8	49654	49661	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016908	ATCT	2	8	50700	50707	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016908	TTTA	2	8	51284	51291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016908	ACTC	2	8	51395	51402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016908	TAAA	2	8	51433	51440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016908	ATTA	2	8	52548	52555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016908	TAAA	2	8	55983	55990	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016908	ATCT	2	8	57188	57195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016908	AACG	2	8	58568	58575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016908	GTTA	2	8	58939	58946	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016908	TTAA	2	8	59169	59176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016908	ACAA	2	8	60828	60835	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016908	TAAA	2	8	62315	62322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016908	ATTT	2	8	62336	62343	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016908	ATTT	2	8	64332	64339	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016908	TTAA	2	8	65905	65912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016908	TAGT	2	8	66393	66400	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016908	ATAA	2	8	68443	68450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016908	AAGT	2	8	72391	72398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016908	CAAT	2	8	74726	74733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016908	TAAA	2	8	75668	75675	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016908	TTTA	2	8	75713	75720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016908	AAAT	2	8	75787	75794	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016908	TAAA	2	8	77358	77365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016908	ATGA	2	8	77422	77429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016908	ATTT	2	8	77479	77486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016908	AAAT	2	8	83429	83436	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016908	TATC	2	8	87077	87084	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016908	TAGC	2	8	87180	87187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016908	TAAA	2	8	92587	92594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016908	TTTA	2	8	95256	95263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016908	AAAT	2	8	95280	95287	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016908	AATT	2	8	95503	95510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016908	TAAA	2	8	96861	96868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016908	ATTA	2	8	97099	97106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016908	AATG	2	8	98308	98315	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016908	TCCA	2	8	100138	100145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016908	AAGC	2	8	100233	100240	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016908	ATGT	2	8	102288	102295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016908	AAAG	2	8	107061	107068	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016908	ATTT	2	8	107212	107219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016908	ATTC	2	8	113035	113042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016908	ATTA	2	8	113116	113123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016908	GAAA	2	8	113237	113244	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016908	ACTC	2	8	117176	117183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016908	CAAA	2	8	117198	117205	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016908	CTAT	2	8	117269	117276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016908	AAGT	2	8	120526	120533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016908	CTAC	2	8	122342	122349	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016908	CGCT	2	8	125046	125053	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016908	TCAC	2	8	125075	125082	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016908	GCAG	2	8	125095	125102	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016908	ACGT	2	8	128163	128170	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016908	ATTC	2	8	129547	129554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016908	TAAT	2	8	129568	129575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016908	TTTA	2	8	129741	129748	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016908	GTTA	2	8	130509	130516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016908	AATT	2	8	131387	131394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016908	TTTG	2	8	132220	132227	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016908	AAAC	2	8	151474	151481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016908	TGAT	2	8	151669	151676	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016908	ATTA	2	8	151937	151944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016908	CGAT	2	8	152177	152184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016908	TAAT	2	8	152312	152319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016908	TAGA	2	8	152710	152717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016908	ATTT	2	8	152957	152964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016908	ATAA	2	8	153145	153152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016908	TTGC	2	8	153847	153854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016908	GGTG	2	8	154668	154675	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016908	ATAA	2	8	154678	154685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016908	TCTA	2	8	167397	167404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016908	TTTA	2	8	167407	167414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016908	TTTA	2	8	169995	170002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016908	TCAT	2	8	172848	172855	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016908	TAAT	2	8	176890	176897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016908	ATTA	2	8	178039	178046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016908	TTAA	2	8	180198	180205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016908	TCAA	2	8	180769	180776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016908	ATAA	2	8	181349	181356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016908	TCAG	2	8	181575	181582	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016908	CTAG	2	8	190373	190380	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016908	ATAA	2	8	191796	191803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016908	TTAC	2	8	193448	193455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016908	AGTA	2	8	201088	201095	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016908	CTTT	2	8	206248	206255	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016908	TTTA	2	8	207379	207386	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016908	TATT	2	8	210377	210384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016908	TGAT	2	8	210453	210460	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016908	TATT	2	8	211058	211065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016908	CTAA	2	8	215089	215096	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016908	TAAT	2	8	215109	215116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016908	AGCA	2	8	215148	215155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016908	ATTT	2	8	217099	217106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016908	ATTT	2	8	217845	217852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016908	TAAA	2	8	218999	219006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016908	TTAA	2	8	228845	228852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016908	AAGT	2	8	228960	228967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016908	TTCA	2	8	229814	229821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016908	ATTT	2	8	230106	230113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016908	ATCC	2	8	230697	230704	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016908	TTTC	2	8	230777	230784	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016908	TTTA	2	8	230999	231006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016908	TTTC	2	8	233894	233901	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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153	NC_016908	TACT	2	8	235540	235547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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