MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Colombia chromosome

Total Repeats: 2808

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016908	TTAT	2	8	2697	2704	25 %	75 %	0 %	0 %	378720672
2	NC_016908	TTAT	2	8	2919	2926	25 %	75 %	0 %	0 %	378720672
3	NC_016908	AACT	2	8	3302	3309	50 %	25 %	0 %	25 %	378720673
4	NC_016908	TATT	2	8	3615	3622	25 %	75 %	0 %	0 %	378720673
5	NC_016908	TTGC	2	8	3745	3752	0 %	50 %	25 %	25 %	378720673
6	NC_016908	AATA	2	8	5316	5323	75 %	25 %	0 %	0 %	378720673
7	NC_016908	ATTC	2	8	5353	5360	25 %	50 %	0 %	25 %	378720673
8	NC_016908	TGTA	2	8	5910	5917	25 %	50 %	25 %	0 %	378720673
9	NC_016908	ATAA	2	8	6891	6898	75 %	25 %	0 %	0 %	378720675
10	NC_016908	ATTT	2	8	7680	7687	25 %	75 %	0 %	0 %	378720676
11	NC_016908	CTGT	2	8	8116	8123	0 %	50 %	25 %	25 %	378720677
12	NC_016908	CCTC	2	8	9845	9852	0 %	25 %	0 %	75 %	378720679
13	NC_016908	CAAT	2	8	9892	9899	50 %	25 %	0 %	25 %	378720679
14	NC_016908	TTTA	2	8	11714	11721	25 %	75 %	0 %	0 %	378720682
15	NC_016908	GATT	2	8	12158	12165	25 %	50 %	25 %	0 %	378720683
16	NC_016908	AAAT	2	8	12166	12173	75 %	25 %	0 %	0 %	378720683
17	NC_016908	AATT	2	8	12193	12200	50 %	50 %	0 %	0 %	378720683
18	NC_016908	TTAA	2	8	12374	12381	50 %	50 %	0 %	0 %	378720683
19	NC_016908	ATGA	2	8	13071	13078	50 %	25 %	25 %	0 %	378720684
20	NC_016908	TAAA	2	8	14094	14101	75 %	25 %	0 %	0 %	378720685
21	NC_016908	TAAA	2	8	14253	14260	75 %	25 %	0 %	0 %	378720685
22	NC_016908	TCAT	2	8	14374	14381	25 %	50 %	0 %	25 %	378720685
23	NC_016908	CTTT	2	8	14508	14515	0 %	75 %	0 %	25 %	378720685
24	NC_016908	GCAA	2	8	14849	14856	50 %	0 %	25 %	25 %	378720686
25	NC_016908	TCTT	2	8	14926	14933	0 %	75 %	0 %	25 %	378720686
26	NC_016908	AGTA	2	8	15184	15191	50 %	25 %	25 %	0 %	378720687
27	NC_016908	GCTT	2	8	15710	15717	0 %	50 %	25 %	25 %	378720688
28	NC_016908	AATT	2	8	16059	16066	50 %	50 %	0 %	0 %	378720688
29	NC_016908	AATA	2	8	16683	16690	75 %	25 %	0 %	0 %	378720689
30	NC_016908	TCTA	2	8	17150	17157	25 %	50 %	0 %	25 %	378720689
31	NC_016908	ACGT	2	8	17573	17580	25 %	25 %	25 %	25 %	378720689
32	NC_016908	CTTG	2	8	17688	17695	0 %	50 %	25 %	25 %	378720689
33	NC_016908	TAAA	2	8	19412	19419	75 %	25 %	0 %	0 %	378720692
34	NC_016908	GTAA	2	8	21049	21056	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
35	NC_016908	AGAT	2	8	21303	21310	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
36	NC_016908	AGCA	2	8	21422	21429	50 %	0 %	25 %	25 %	378720694
37	NC_016908	AAAT	2	8	21465	21472	75 %	25 %	0 %	0 %	378720694
38	NC_016908	AATG	2	8	21666	21673	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
39	NC_016908	ATTA	2	8	21967	21974	50 %	50 %	0 %	0 %	378720694
40	NC_016908	ATAG	2	8	22015	22022	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
41	NC_016908	ATAG	2	8	22027	22034	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
42	NC_016908	CGTT	2	8	22445	22452	0 %	50 %	25 %	25 %	378720694
43	NC_016908	TAGT	2	8	22892	22899	25 %	50 %	25 %	0 %	378720694
44	NC_016908	AAGC	2	8	23632	23639	50 %	0 %	25 %	25 %	378720694
45	NC_016908	TAAA	2	8	23957	23964	75 %	25 %	0 %	0 %	378720694
46	NC_016908	AAGT	2	8	24467	24474	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
47	NC_016908	AAGT	2	8	24554	24561	50 %	25 %	25 %	0 %	378720694
48	NC_016908	TTCA	2	8	25103	25110	25 %	50 %	0 %	25 %	378720694
49	NC_016908	AATA	2	8	25596	25603	75 %	25 %	0 %	0 %	378720694
50	NC_016908	TAAA	2	8	25742	25749	75 %	25 %	0 %	0 %	378720694
51	NC_016908	ATGT	2	8	26541	26548	25 %	50 %	25 %	0 %	378720696
52	NC_016908	TTAT	2	8	26595	26602	25 %	75 %	0 %	0 %	378720696
53	NC_016908	AGCA	2	8	26669	26676	50 %	0 %	25 %	25 %	378720696
54	NC_016908	TAAT	2	8	27470	27477	50 %	50 %	0 %	0 %	378720697
55	NC_016908	AAGA	2	8	27622	27629	75 %	0 %	25 %	0 %	378720697
56	NC_016908	AAAT	2	8	27714	27721	75 %	25 %	0 %	0 %	378720697
57	NC_016908	ATTA	2	8	27742	27749	50 %	50 %	0 %	0 %	378720697
58	NC_016908	TCTA	2	8	29438	29445	25 %	50 %	0 %	25 %	378720701
59	NC_016908	ATTT	2	8	29482	29489	25 %	75 %	0 %	0 %	378720701
60	NC_016908	TGTC	2	8	29546	29553	0 %	50 %	25 %	25 %	378720701
61	NC_016908	ATAC	2	8	30143	30150	50 %	25 %	0 %	25 %	378720703
62	NC_016908	ATAA	2	8	30567	30574	75 %	25 %	0 %	0 %	378720703
63	NC_016908	CACT	2	8	30661	30668	25 %	25 %	0 %	50 %	378720703
64	NC_016908	TATT	2	8	31485	31492	25 %	75 %	0 %	0 %	378720705
65	NC_016908	AATT	2	8	33119	33126	50 %	50 %	0 %	0 %	378720707
66	NC_016908	TACC	2	8	33209	33216	25 %	25 %	0 %	50 %	378720707
67	NC_016908	GTTA	2	8	33591	33598	25 %	50 %	25 %	0 %	378720707
68	NC_016908	AAAC	2	8	35014	35021	75 %	0 %	0 %	25 %	378720709
69	NC_016908	TTAG	2	8	35190	35197	25 %	50 %	25 %	0 %	378720709
70	NC_016908	TTGC	2	8	35485	35492	0 %	50 %	25 %	25 %	378720709
71	NC_016908	TTCC	2	8	35725	35732	0 %	50 %	0 %	50 %	378720709
72	NC_016908	TGTT	2	8	36193	36200	0 %	75 %	25 %	0 %	378720710
73	NC_016908	TTGT	2	8	36799	36806	0 %	75 %	25 %	0 %	378720711
74	NC_016908	TATT	2	8	36878	36885	25 %	75 %	0 %	0 %	378720711
75	NC_016908	GTAA	2	8	36889	36896	50 %	25 %	25 %	0 %	378720711
76	NC_016908	AATG	2	8	37661	37668	50 %	25 %	25 %	0 %	378720712
77	NC_016908	GTTT	2	8	38175	38182	0 %	75 %	25 %	0 %	378720712
78	NC_016908	TAAA	2	8	41051	41058	75 %	25 %	0 %	0 %	378720714
79	NC_016908	ATTT	2	8	41156	41163	25 %	75 %	0 %	0 %	378720714
80	NC_016908	GAAA	2	8	42787	42794	75 %	0 %	25 %	0 %	378720716
81	NC_016908	ATTT	2	8	42831	42838	25 %	75 %	0 %	0 %	378720716
82	NC_016908	ACAA	2	8	43098	43105	75 %	0 %	0 %	25 %	378720716
83	NC_016908	AAAT	2	8	43302	43309	75 %	25 %	0 %	0 %	378720717
84	NC_016908	TAAC	2	8	45187	45194	50 %	25 %	0 %	25 %	378720719
85	NC_016908	ATTC	2	8	45616	45623	25 %	50 %	0 %	25 %	378720720
86	NC_016908	ATGT	2	8	45972	45979	25 %	50 %	25 %	0 %	378720721
87	NC_016908	ATTT	2	8	46131	46138	25 %	75 %	0 %	0 %	378720721
88	NC_016908	TTAC	2	8	46210	46217	25 %	50 %	0 %	25 %	378720721
89	NC_016908	ATCA	2	8	46887	46894	50 %	25 %	0 %	25 %	378720722
90	NC_016908	TGCC	2	8	47197	47204	0 %	25 %	25 %	50 %	378720722
91	NC_016908	TATC	2	8	47756	47763	25 %	50 %	0 %	25 %	378720722
92	NC_016908	TTAA	2	8	47779	47786	50 %	50 %	0 %	0 %	378720722
93	NC_016908	TTGC	2	8	49248	49255	0 %	50 %	25 %	25 %	378720724
94	NC_016908	TGTT	2	8	49617	49624	0 %	75 %	25 %	0 %	378720725
95	NC_016908	CTTG	2	8	50121	50128	0 %	50 %	25 %	25 %	378720726
96	NC_016908	TGCT	2	8	50873	50880	0 %	50 %	25 %	25 %	378720728
97	NC_016908	TAAA	2	8	52773	52780	75 %	25 %	0 %	0 %	378720729
98	NC_016908	GAGG	2	8	52799	52806	25 %	0 %	75 %	0 %	378720729
99	NC_016908	ATTG	2	8	53182	53189	25 %	50 %	25 %	0 %	378720729
100	NC_016908	TTAT	2	8	53396	53403	25 %	75 %	0 %	0 %	378720729
101	NC_016908	TGCT	2	8	53478	53485	0 %	50 %	25 %	25 %	378720729
102	NC_016908	GTGA	2	8	53585	53592	25 %	25 %	50 %	0 %	378720729
103	NC_016908	CCGC	2	8	54352	54359	0 %	0 %	25 %	75 %	378720729
104	NC_016908	GTTC	2	8	54363	54370	0 %	50 %	25 %	25 %	378720729
105	NC_016908	GACC	2	8	54381	54388	25 %	0 %	25 %	50 %	378720729
106	NC_016908	AAAT	2	8	55101	55108	75 %	25 %	0 %	0 %	378720729
107	NC_016908	TAAG	2	8	55501	55508	50 %	25 %	25 %	0 %	378720730
108	NC_016908	ATAA	2	8	56128	56135	75 %	25 %	0 %	0 %	378720731
109	NC_016908	CTTT	2	8	56828	56835	0 %	75 %	0 %	25 %	378720731
110	NC_016908	ACTT	2	8	57340	57347	25 %	50 %	0 %	25 %	378720732
111	NC_016908	TTGC	2	8	57798	57805	0 %	50 %	25 %	25 %	378720732
112	NC_016908	ATAA	2	8	57830	57837	75 %	25 %	0 %	0 %	378720732
113	NC_016908	ATAA	2	8	57884	57891	75 %	25 %	0 %	0 %	378720732
114	NC_016908	CATC	2	8	58021	58028	25 %	25 %	0 %	50 %	378720732
115	NC_016908	ATTT	3	12	58197	58208	25 %	75 %	0 %	0 %	378720732
116	NC_016908	AGAA	2	8	59572	59579	75 %	0 %	25 %	0 %	378720734
117	NC_016908	AAAG	2	8	59952	59959	75 %	0 %	25 %	0 %	378720735
118	NC_016908	TAAA	2	8	60019	60026	75 %	25 %	0 %	0 %	378720735
119	NC_016908	AAGA	2	8	61140	61147	75 %	0 %	25 %	0 %	378720737
120	NC_016908	AGTC	2	8	61375	61382	25 %	25 %	25 %	25 %	378720737
121	NC_016908	TAAT	2	8	61791	61798	50 %	50 %	0 %	0 %	378720737
122	NC_016908	ATTA	2	8	61867	61874	50 %	50 %	0 %	0 %	378720737
123	NC_016908	ATCT	2	8	62124	62131	25 %	50 %	0 %	25 %	378720737
124	NC_016908	GAAT	2	8	62688	62695	50 %	25 %	25 %	0 %	378720738
125	NC_016908	CAAG	2	8	62919	62926	50 %	0 %	25 %	25 %	378720738
126	NC_016908	ATGG	2	8	63242	63249	25 %	25 %	50 %	0 %	378720738
127	NC_016908	AAGA	2	8	63527	63534	75 %	0 %	25 %	0 %	378720738
128	NC_016908	GAAA	2	8	63613	63620	75 %	0 %	25 %	0 %	378720738
129	NC_016908	TTAA	2	8	65302	65309	50 %	50 %	0 %	0 %	378720741
130	NC_016908	GGAA	2	8	65358	65365	50 %	0 %	50 %	0 %	378720741
131	NC_016908	GCAT	2	8	65410	65417	25 %	25 %	25 %	25 %	378720741
132	NC_016908	TGCT	2	8	65637	65644	0 %	50 %	25 %	25 %	378720741
133	NC_016908	AATT	2	8	66460	66467	50 %	50 %	0 %	0 %	378720743
134	NC_016908	TGTT	2	8	66720	66727	0 %	75 %	25 %	0 %	378720743
135	NC_016908	TGAT	2	8	67269	67276	25 %	50 %	25 %	0 %	378720743
136	NC_016908	AATT	2	8	67650	67657	50 %	50 %	0 %	0 %	378720743
137	NC_016908	CCTA	2	8	68027	68034	25 %	25 %	0 %	50 %	378720744
138	NC_016908	AAAC	2	8	68224	68231	75 %	0 %	0 %	25 %	378720744
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