MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 plasmid p174

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016907	GTCAC	2	10	4528	4537	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016907	CCGTG	2	10	6043	6052	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016907	GTTGG	2	10	7975	7984	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016907	GGCGA	2	10	11757	11766	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016907	CCCAC	2	10	12546	12555	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_016907	ATGTG	2	10	12674	12683	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016907	TCAGT	2	10	17888	17897	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016907	CACGA	2	10	26873	26882	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016907	AGAGG	2	10	28383	28392	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016907	CCCAC	2	10	32616	32625	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_016907	GATGA	2	10	35884	35893	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016907	CCTTC	2	10	35912	35921	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_016907	CTGAT	2	10	53379	53388	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016907	CGCCC	2	10	59666	59675	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_016907	GCCCG	2	10	67449	67458	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
16	NC_016907	CCACG	2	10	83928	83937	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_016907	CGAGC	2	10	88915	88924	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016907	CAGCC	2	10	90392	90401	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_016907	GTCTG	2	10	111611	111620	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016907	CCGTG	2	10	132427	132436	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016907	GTCGA	2	10	141799	141808	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016907	GGGGA	2	10	145542	145551	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016907	GGCCG	2	10	146399	146408	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016907	GCCGA	2	10	163620	163629	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016907	GTTGG	2	10	166832	166841	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016907	CGACG	2	10	170253	170262	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.