MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 plasmid p174

Total Repeats: 443

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016907	GGA	2	6	28	33	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016907	CGC	2	6	36	41	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016907	GCG	3	9	147	155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016907	CGT	2	6	164	169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016907	GCT	2	6	687	692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016907	GGT	2	6	714	719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016907	GCA	2	6	752	757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016907	CAT	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016907	TCG	2	6	872	877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016907	ACC	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016907	GGT	3	9	961	969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016907	CGA	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016907	CGC	2	6	1029	1034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_016907	TGG	2	6	1062	1067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016907	CGG	2	6	1125	1130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016907	GCC	2	6	1142	1147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016907	CGG	2	6	1263	1268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016907	GTT	2	6	1276	1281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016907	GTT	2	6	1285	1290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016907	GGT	2	6	1294	1299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016907	TCG	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016907	GCC	2	6	1385	1390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016907	GCC	2	6	1402	1407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016907	CTG	2	6	1482	1487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016907	GTG	2	6	2354	2359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016907	CAC	2	6	2701	2706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016907	CTC	2	6	2762	2767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016907	GCC	2	6	2772	2777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_016907	ACG	2	6	2809	2814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016907	GAG	2	6	2828	2833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016907	GGT	2	6	2866	2871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016907	CGA	2	6	2875	2880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016907	ACC	2	6	3043	3048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016907	TAC	2	6	3096	3101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016907	CTA	2	6	3170	3175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016907	TCG	2	6	3504	3509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016907	GAG	3	9	3581	3589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016907	CTG	2	6	3596	3601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016907	ATT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016907	GTC	2	6	3655	3660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016907	AAG	2	6	3711	3716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016907	TCG	2	6	3740	3745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016907	CGG	2	6	3859	3864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016907	GAG	2	6	3987	3992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016907	GCT	2	6	3998	4003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016907	GTG	2	6	4125	4130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016907	CAG	2	6	4146	4151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016907	ACG	2	6	4189	4194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016907	CGT	2	6	4236	4241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016907	TCG	3	9	4255	4263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016907	CGC	3	9	4270	4278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016907	CAA	2	6	4292	4297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016907	CGA	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016907	GAT	2	6	4377	4382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016907	TGG	2	6	4459	4464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016907	ATC	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016907	TCG	2	6	4648	4653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016907	CAG	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016907	GAA	2	6	4724	4729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016907	GCA	2	6	4802	4807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016907	ACG	2	6	5104	5109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016907	CGT	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016907	ACT	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016907	GCC	2	6	5296	5301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_016907	AGT	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016907	TGG	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016907	GGT	2	6	5470	5475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016907	GTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016907	CAG	2	6	5529	5534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016907	GTT	2	6	5564	5569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016907	GTT	2	6	5588	5593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016907	GCA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016907	TCT	2	6	5726	5731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016907	CTC	2	6	5736	5741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016907	CAG	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016907	TCG	2	6	5803	5808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016907	CTT	2	6	5829	5834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016907	CAC	2	6	5874	5879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016907	TCC	2	6	5962	5967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016907	CTT	2	6	5985	5990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016907	CGT	2	6	6005	6010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016907	GCT	2	6	6077	6082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016907	GCG	2	6	6091	6096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016907	CGA	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016907	GGC	2	6	6213	6218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016907	CTT	2	6	6532	6537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016907	TCA	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016907	ACC	2	6	6568	6573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016907	GCC	2	6	6610	6615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016907	GAA	2	6	6786	6791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016907	GAG	2	6	7859	7864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016907	AGG	2	6	7942	7947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016907	AAC	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016907	ACC	2	6	9230	9235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_016907	ACC	3	9	9249	9257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016907	GAC	2	6	9392	9397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016907	ACT	2	6	9936	9941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016907	TTG	2	6	9967	9972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016907	AGT	2	6	9981	9986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016907	ACG	2	6	10073	10078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016907	GGC	3	9	10099	10107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016907	CAC	2	6	10194	10199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_016907	CCG	3	9	10211	10219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016907	AGT	2	6	10227	10232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016907	CAC	2	6	11248	11253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_016907	CAC	2	6	11344	11349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016907	GTG	2	6	11380	11385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016907	ATC	2	6	11428	11433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016907	TGC	3	9	11524	11532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016907	CTC	2	6	11617	11622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016907	CTC	2	6	11636	11641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_016907	AAT	2	6	11648	11653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016907	TAT	2	6	11662	11667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016907	GGC	2	6	11672	11677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016907	CGT	2	6	11871	11876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016907	ACG	2	6	12067	12072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016907	CGG	2	6	12136	12141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016907	GAA	2	6	12201	12206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016907	CCA	2	6	12249	12254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016907	CGA	2	6	12277	12282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016907	CTA	2	6	12301	12306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016907	GGC	2	6	12379	12384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016907	CAG	2	6	12535	12540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016907	CGC	2	6	12602	12607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016907	CAA	2	6	12668	12673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016907	AGT	2	6	14072	14077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016907	GGT	2	6	14086	14091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016907	TTC	2	6	14249	14254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016907	TGA	2	6	14335	14340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016907	GCG	2	6	14379	14384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016907	CCG	2	6	14391	14396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_016907	CAA	2	6	14407	14412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016907	TCC	2	6	14442	14447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016907	CGA	2	6	14507	14512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016907	GTG	2	6	16180	16185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016907	ACC	2	6	17259	17264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_016907	ACC	2	6	17282	17287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016907	GGC	2	6	17294	17299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016907	CCT	2	6	17350	17355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_016907	GAC	2	6	17375	17380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016907	ATC	2	6	17393	17398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016907	CCA	2	6	17411	17416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_016907	ATT	2	6	17576	17581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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413	NC_016907	CAT	2	6	165171	165176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.