MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 plasmid p174

Total Repeats: 373

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016907	CG	3	6	899	904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016907	GT	3	6	1516	1521	0 %	50 %	50 %	0 %	378720504
3	NC_016907	CG	3	6	2451	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	378720505
4	NC_016907	AC	3	6	2665	2670	50 %	0 %	0 %	50 %	378720505
5	NC_016907	GC	3	6	3293	3298	0 %	0 %	50 %	50 %	378720507
6	NC_016907	GT	3	6	3883	3888	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016907	GA	3	6	4027	4032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016907	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016907	CG	3	6	5045	5050	0 %	0 %	50 %	50 %	378720508
10	NC_016907	GT	3	6	5797	5802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016907	GC	4	8	5939	5946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016907	GT	3	6	6112	6117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016907	GA	3	6	6972	6977	50 %	0 %	50 %	0 %	378720510
14	NC_016907	GA	3	6	8560	8565	50 %	0 %	50 %	0 %	378720511
15	NC_016907	GC	3	6	8829	8834	0 %	0 %	50 %	50 %	378720511
16	NC_016907	CG	3	6	9625	9630	0 %	0 %	50 %	50 %	378720512
17	NC_016907	GA	3	6	9769	9774	50 %	0 %	50 %	0 %	378720512
18	NC_016907	GC	3	6	10488	10493	0 %	0 %	50 %	50 %	378720513
19	NC_016907	GA	3	6	10558	10563	50 %	0 %	50 %	0 %	378720513
20	NC_016907	GA	3	6	11260	11265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016907	TC	3	6	11556	11561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016907	CA	3	6	11574	11579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016907	AT	3	6	11652	11657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016907	TC	3	6	12157	12162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016907	AC	4	8	12211	12218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016907	CA	3	6	15328	15333	50 %	0 %	0 %	50 %	378720515
27	NC_016907	CA	4	8	15686	15693	50 %	0 %	0 %	50 %	378720516
28	NC_016907	CG	3	6	15724	15729	0 %	0 %	50 %	50 %	378720516
29	NC_016907	CA	4	8	15759	15766	50 %	0 %	0 %	50 %	378720516
30	NC_016907	GT	3	6	15973	15978	0 %	50 %	50 %	0 %	378720516
31	NC_016907	TC	3	6	16416	16421	0 %	50 %	0 %	50 %	378720517
32	NC_016907	GC	3	6	17343	17348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016907	AC	3	6	17403	17408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016907	CG	3	6	18383	18388	0 %	0 %	50 %	50 %	378720518
35	NC_016907	TC	3	6	18571	18576	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016907	AC	3	6	19085	19090	50 %	0 %	0 %	50 %	378720520
37	NC_016907	CG	3	6	19221	19226	0 %	0 %	50 %	50 %	378720520
38	NC_016907	TG	3	6	19409	19414	0 %	50 %	50 %	0 %	378720520
39	NC_016907	CG	3	6	20703	20708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016907	AC	3	6	20717	20722	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016907	CG	3	6	21814	21819	0 %	0 %	50 %	50 %	378720523
42	NC_016907	GT	3	6	21932	21937	0 %	50 %	50 %	0 %	378720523
43	NC_016907	GC	3	6	21946	21951	0 %	0 %	50 %	50 %	378720523
44	NC_016907	TG	3	6	22061	22066	0 %	50 %	50 %	0 %	378720523
45	NC_016907	GC	3	6	22118	22123	0 %	0 %	50 %	50 %	378720523
46	NC_016907	GC	4	8	22241	22248	0 %	0 %	50 %	50 %	378720523
47	NC_016907	GT	3	6	22416	22421	0 %	50 %	50 %	0 %	378720523
48	NC_016907	GC	3	6	23961	23966	0 %	0 %	50 %	50 %	378720525
49	NC_016907	AC	3	6	25217	25222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016907	GT	3	6	25314	25319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016907	CG	3	6	25493	25498	0 %	0 %	50 %	50 %	378720527
52	NC_016907	GT	3	6	25767	25772	0 %	50 %	50 %	0 %	378720527
53	NC_016907	CG	3	6	26422	26427	0 %	0 %	50 %	50 %	378720528
54	NC_016907	CG	3	6	26697	26702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016907	GT	3	6	27252	27257	0 %	50 %	50 %	0 %	378720529
56	NC_016907	GC	3	6	27659	27664	0 %	0 %	50 %	50 %	378720529
57	NC_016907	GC	3	6	29135	29140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016907	TC	3	6	29339	29344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016907	CG	3	6	29366	29371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016907	CA	3	6	29536	29541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016907	CG	3	6	29661	29666	0 %	0 %	50 %	50 %	378720531
62	NC_016907	GC	3	6	29873	29878	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016907	GC	3	6	29921	29926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016907	GC	3	6	29941	29946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016907	GT	4	8	30038	30045	0 %	50 %	50 %	0 %	378720532
66	NC_016907	TG	3	6	30125	30130	0 %	50 %	50 %	0 %	378720532
67	NC_016907	TC	3	6	30594	30599	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016907	CA	3	6	30876	30881	50 %	0 %	0 %	50 %	378720533
69	NC_016907	GT	3	6	32012	32017	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016907	CG	3	6	32746	32751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016907	GC	3	6	32777	32782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016907	GT	3	6	33496	33501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016907	GT	3	6	33610	33615	0 %	50 %	50 %	0 %	378720538
74	NC_016907	GC	3	6	34164	34169	0 %	0 %	50 %	50 %	378720538
75	NC_016907	CG	3	6	35673	35678	0 %	0 %	50 %	50 %	378720539
76	NC_016907	GA	3	6	36021	36026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016907	TG	3	6	36369	36374	0 %	50 %	50 %	0 %	378720540
78	NC_016907	CG	3	6	37209	37214	0 %	0 %	50 %	50 %	378720541
79	NC_016907	CG	3	6	39189	39194	0 %	0 %	50 %	50 %	378720544
80	NC_016907	GT	3	6	40459	40464	0 %	50 %	50 %	0 %	378720545
81	NC_016907	CG	3	6	40494	40499	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
82	NC_016907	CG	3	6	40791	40796	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
83	NC_016907	GC	3	6	40999	41004	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
84	NC_016907	CG	3	6	41046	41051	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
85	NC_016907	GC	3	6	42113	42118	0 %	0 %	50 %	50 %	378720547
86	NC_016907	CG	3	6	42543	42548	0 %	0 %	50 %	50 %	378720548
87	NC_016907	AC	3	6	42644	42649	50 %	0 %	0 %	50 %	378720548
88	NC_016907	GT	4	8	43318	43325	0 %	50 %	50 %	0 %	378720549
89	NC_016907	AC	3	6	43667	43672	50 %	0 %	0 %	50 %	378720549
90	NC_016907	CG	3	6	43673	43678	0 %	0 %	50 %	50 %	378720549
91	NC_016907	CG	3	6	44005	44010	0 %	0 %	50 %	50 %	378720549
92	NC_016907	CG	3	6	44478	44483	0 %	0 %	50 %	50 %	378720550
93	NC_016907	CG	3	6	44571	44576	0 %	0 %	50 %	50 %	378720550
94	NC_016907	GC	3	6	44749	44754	0 %	0 %	50 %	50 %	378720550
95	NC_016907	GT	3	6	45602	45607	0 %	50 %	50 %	0 %	378720551
96	NC_016907	CG	4	8	46098	46105	0 %	0 %	50 %	50 %	378720551
97	NC_016907	GC	3	6	46171	46176	0 %	0 %	50 %	50 %	378720551
98	NC_016907	CG	3	6	46289	46294	0 %	0 %	50 %	50 %	378720551
99	NC_016907	CG	3	6	46889	46894	0 %	0 %	50 %	50 %	378720552
100	NC_016907	CG	3	6	47114	47119	0 %	0 %	50 %	50 %	378720552
101	NC_016907	CG	3	6	47655	47660	0 %	0 %	50 %	50 %	378720552
102	NC_016907	CG	3	6	48792	48797	0 %	0 %	50 %	50 %	378720553
103	NC_016907	GC	3	6	48939	48944	0 %	0 %	50 %	50 %	378720553
104	NC_016907	GC	3	6	49114	49119	0 %	0 %	50 %	50 %	378720553
105	NC_016907	CG	3	6	49465	49470	0 %	0 %	50 %	50 %	378720553
106	NC_016907	CG	3	6	49715	49720	0 %	0 %	50 %	50 %	378720554
107	NC_016907	GC	3	6	50510	50515	0 %	0 %	50 %	50 %	378720554
108	NC_016907	CG	3	6	50582	50587	0 %	0 %	50 %	50 %	378720554
109	NC_016907	CG	3	6	50911	50916	0 %	0 %	50 %	50 %	378720554
110	NC_016907	CG	3	6	50960	50965	0 %	0 %	50 %	50 %	378720554
111	NC_016907	CG	3	6	52154	52159	0 %	0 %	50 %	50 %	378720555
112	NC_016907	GC	3	6	52272	52277	0 %	0 %	50 %	50 %	378720555
113	NC_016907	TC	3	6	52351	52356	0 %	50 %	0 %	50 %	378720555
114	NC_016907	GC	3	6	52935	52940	0 %	0 %	50 %	50 %	378720556
115	NC_016907	TC	3	6	53278	53283	0 %	50 %	0 %	50 %	378720556
116	NC_016907	GC	3	6	55045	55050	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
117	NC_016907	GC	3	6	55377	55382	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
118	NC_016907	CG	3	6	55659	55664	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
119	NC_016907	GC	3	6	56031	56036	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
120	NC_016907	CG	3	6	56098	56103	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
121	NC_016907	CG	3	6	56126	56131	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
122	NC_016907	TG	3	6	56367	56372	0 %	50 %	50 %	0 %	378720558
123	NC_016907	GC	3	6	57599	57604	0 %	0 %	50 %	50 %	378720559
124	NC_016907	CG	3	6	57747	57752	0 %	0 %	50 %	50 %	378720559
125	NC_016907	CG	3	6	57984	57989	0 %	0 %	50 %	50 %	378720560
126	NC_016907	CG	3	6	58976	58981	0 %	0 %	50 %	50 %	378720562
127	NC_016907	GC	3	6	59707	59712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016907	CG	3	6	60344	60349	0 %	0 %	50 %	50 %	378720564
129	NC_016907	CG	4	8	60616	60623	0 %	0 %	50 %	50 %	378720565
130	NC_016907	CG	3	6	60743	60748	0 %	0 %	50 %	50 %	378720565
131	NC_016907	CG	3	6	60897	60902	0 %	0 %	50 %	50 %	378720565
132	NC_016907	TC	3	6	61147	61152	0 %	50 %	0 %	50 %	378720565
133	NC_016907	GC	3	6	61304	61309	0 %	0 %	50 %	50 %	378720565
134	NC_016907	AC	3	6	62436	62441	50 %	0 %	0 %	50 %	378720567
135	NC_016907	CG	3	6	62476	62481	0 %	0 %	50 %	50 %	378720567
136	NC_016907	CG	3	6	62521	62526	0 %	0 %	50 %	50 %	378720567
137	NC_016907	CG	3	6	63057	63062	0 %	0 %	50 %	50 %	378720567
138	NC_016907	TC	3	6	64008	64013	0 %	50 %	0 %	50 %	378720567
139	NC_016907	CG	3	6	65242	65247	0 %	0 %	50 %	50 %	378720568
140	NC_016907	GA	3	6	66249	66254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016907	CG	3	6	66681	66686	0 %	0 %	50 %	50 %	378720571
142	NC_016907	CG	3	6	67060	67065	0 %	0 %	50 %	50 %	378720572
143	NC_016907	GA	3	6	67534	67539	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016907	GC	3	6	67869	67874	0 %	0 %	50 %	50 %	378720573
145	NC_016907	GC	3	6	68270	68275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016907	GC	3	6	68403	68408	0 %	0 %	50 %	50 %	378720574
147	NC_016907	CG	3	6	68734	68739	0 %	0 %	50 %	50 %	378720574
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.