MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 plasmid p174

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016907	GT	3	6	1516	1521	0 %	50 %	50 %	0 %	378720504
2	NC_016907	CG	3	6	2451	2456	0 %	0 %	50 %	50 %	378720505
3	NC_016907	AC	3	6	2665	2670	50 %	0 %	0 %	50 %	378720505
4	NC_016907	GC	3	6	3293	3298	0 %	0 %	50 %	50 %	378720507
5	NC_016907	CG	3	6	5045	5050	0 %	0 %	50 %	50 %	378720508
6	NC_016907	GA	3	6	6972	6977	50 %	0 %	50 %	0 %	378720510
7	NC_016907	GA	3	6	8560	8565	50 %	0 %	50 %	0 %	378720511
8	NC_016907	GC	3	6	8829	8834	0 %	0 %	50 %	50 %	378720511
9	NC_016907	CG	3	6	9625	9630	0 %	0 %	50 %	50 %	378720512
10	NC_016907	GA	3	6	9769	9774	50 %	0 %	50 %	0 %	378720512
11	NC_016907	GC	3	6	10488	10493	0 %	0 %	50 %	50 %	378720513
12	NC_016907	GA	3	6	10558	10563	50 %	0 %	50 %	0 %	378720513
13	NC_016907	CA	3	6	15328	15333	50 %	0 %	0 %	50 %	378720515
14	NC_016907	CA	4	8	15686	15693	50 %	0 %	0 %	50 %	378720516
15	NC_016907	CG	3	6	15724	15729	0 %	0 %	50 %	50 %	378720516
16	NC_016907	CA	4	8	15759	15766	50 %	0 %	0 %	50 %	378720516
17	NC_016907	GT	3	6	15973	15978	0 %	50 %	50 %	0 %	378720516
18	NC_016907	TC	3	6	16416	16421	0 %	50 %	0 %	50 %	378720517
19	NC_016907	CG	3	6	18383	18388	0 %	0 %	50 %	50 %	378720518
20	NC_016907	AC	3	6	19085	19090	50 %	0 %	0 %	50 %	378720520
21	NC_016907	CG	3	6	19221	19226	0 %	0 %	50 %	50 %	378720520
22	NC_016907	TG	3	6	19409	19414	0 %	50 %	50 %	0 %	378720520
23	NC_016907	CG	3	6	21814	21819	0 %	0 %	50 %	50 %	378720523
24	NC_016907	GT	3	6	21932	21937	0 %	50 %	50 %	0 %	378720523
25	NC_016907	GC	3	6	21946	21951	0 %	0 %	50 %	50 %	378720523
26	NC_016907	TG	3	6	22061	22066	0 %	50 %	50 %	0 %	378720523
27	NC_016907	GC	3	6	22118	22123	0 %	0 %	50 %	50 %	378720523
28	NC_016907	GC	4	8	22241	22248	0 %	0 %	50 %	50 %	378720523
29	NC_016907	GT	3	6	22416	22421	0 %	50 %	50 %	0 %	378720523
30	NC_016907	GC	3	6	23961	23966	0 %	0 %	50 %	50 %	378720525
31	NC_016907	CG	3	6	25493	25498	0 %	0 %	50 %	50 %	378720527
32	NC_016907	GT	3	6	25767	25772	0 %	50 %	50 %	0 %	378720527
33	NC_016907	CG	3	6	26422	26427	0 %	0 %	50 %	50 %	378720528
34	NC_016907	GT	3	6	27252	27257	0 %	50 %	50 %	0 %	378720529
35	NC_016907	GC	3	6	27659	27664	0 %	0 %	50 %	50 %	378720529
36	NC_016907	CG	3	6	29661	29666	0 %	0 %	50 %	50 %	378720531
37	NC_016907	GT	4	8	30038	30045	0 %	50 %	50 %	0 %	378720532
38	NC_016907	TG	3	6	30125	30130	0 %	50 %	50 %	0 %	378720532
39	NC_016907	CA	3	6	30876	30881	50 %	0 %	0 %	50 %	378720533
40	NC_016907	GT	3	6	33610	33615	0 %	50 %	50 %	0 %	378720538
41	NC_016907	GC	3	6	34164	34169	0 %	0 %	50 %	50 %	378720538
42	NC_016907	CG	3	6	35673	35678	0 %	0 %	50 %	50 %	378720539
43	NC_016907	TG	3	6	36369	36374	0 %	50 %	50 %	0 %	378720540
44	NC_016907	CG	3	6	37209	37214	0 %	0 %	50 %	50 %	378720541
45	NC_016907	CG	3	6	39189	39194	0 %	0 %	50 %	50 %	378720544
46	NC_016907	GT	3	6	40459	40464	0 %	50 %	50 %	0 %	378720545
47	NC_016907	CG	3	6	40494	40499	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
48	NC_016907	CG	3	6	40791	40796	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
49	NC_016907	GC	3	6	40999	41004	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
50	NC_016907	CG	3	6	41046	41051	0 %	0 %	50 %	50 %	378720545
51	NC_016907	GC	3	6	42113	42118	0 %	0 %	50 %	50 %	378720547
52	NC_016907	CG	3	6	42543	42548	0 %	0 %	50 %	50 %	378720548
53	NC_016907	AC	3	6	42644	42649	50 %	0 %	0 %	50 %	378720548
54	NC_016907	GT	4	8	43318	43325	0 %	50 %	50 %	0 %	378720549
55	NC_016907	AC	3	6	43667	43672	50 %	0 %	0 %	50 %	378720549
56	NC_016907	CG	3	6	43673	43678	0 %	0 %	50 %	50 %	378720549
57	NC_016907	CG	3	6	44005	44010	0 %	0 %	50 %	50 %	378720549
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60	NC_016907	GC	3	6	44749	44754	0 %	0 %	50 %	50 %	378720550
61	NC_016907	GT	3	6	45602	45607	0 %	50 %	50 %	0 %	378720551
62	NC_016907	CG	4	8	46098	46105	0 %	0 %	50 %	50 %	378720551
63	NC_016907	GC	3	6	46171	46176	0 %	0 %	50 %	50 %	378720551
64	NC_016907	CG	3	6	46289	46294	0 %	0 %	50 %	50 %	378720551
65	NC_016907	CG	3	6	46889	46894	0 %	0 %	50 %	50 %	378720552
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67	NC_016907	CG	3	6	47655	47660	0 %	0 %	50 %	50 %	378720552
68	NC_016907	CG	3	6	48792	48797	0 %	0 %	50 %	50 %	378720553
69	NC_016907	GC	3	6	48939	48944	0 %	0 %	50 %	50 %	378720553
70	NC_016907	GC	3	6	49114	49119	0 %	0 %	50 %	50 %	378720553
71	NC_016907	CG	3	6	49465	49470	0 %	0 %	50 %	50 %	378720553
72	NC_016907	CG	3	6	49715	49720	0 %	0 %	50 %	50 %	378720554
73	NC_016907	GC	3	6	50510	50515	0 %	0 %	50 %	50 %	378720554
74	NC_016907	CG	3	6	50582	50587	0 %	0 %	50 %	50 %	378720554
75	NC_016907	CG	3	6	50911	50916	0 %	0 %	50 %	50 %	378720554
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81	NC_016907	TC	3	6	53278	53283	0 %	50 %	0 %	50 %	378720556
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84	NC_016907	CG	3	6	55659	55664	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
85	NC_016907	GC	3	6	56031	56036	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
86	NC_016907	CG	3	6	56098	56103	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
87	NC_016907	CG	3	6	56126	56131	0 %	0 %	50 %	50 %	378720558
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91	NC_016907	CG	3	6	57984	57989	0 %	0 %	50 %	50 %	378720560
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95	NC_016907	CG	3	6	60743	60748	0 %	0 %	50 %	50 %	378720565
96	NC_016907	CG	3	6	60897	60902	0 %	0 %	50 %	50 %	378720565
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104	NC_016907	CG	3	6	65242	65247	0 %	0 %	50 %	50 %	378720568
105	NC_016907	CG	3	6	66681	66686	0 %	0 %	50 %	50 %	378720571
106	NC_016907	CG	3	6	67060	67065	0 %	0 %	50 %	50 %	378720572
107	NC_016907	GC	3	6	67869	67874	0 %	0 %	50 %	50 %	378720573
108	NC_016907	GC	3	6	68403	68408	0 %	0 %	50 %	50 %	378720574
109	NC_016907	CG	3	6	68734	68739	0 %	0 %	50 %	50 %	378720574
110	NC_016907	GC	3	6	69471	69476	0 %	0 %	50 %	50 %	378720575
111	NC_016907	CG	3	6	69903	69908	0 %	0 %	50 %	50 %	378720575
112	NC_016907	CG	3	6	70327	70332	0 %	0 %	50 %	50 %	378720575
113	NC_016907	GC	3	6	70439	70444	0 %	0 %	50 %	50 %	378720575
114	NC_016907	GC	3	6	70610	70615	0 %	0 %	50 %	50 %	378720575
115	NC_016907	GT	3	6	71124	71129	0 %	50 %	50 %	0 %	378720575
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124	NC_016907	CG	3	6	76724	76729	0 %	0 %	50 %	50 %	378720578
125	NC_016907	CG	3	6	77409	77414	0 %	0 %	50 %	50 %	378720579
126	NC_016907	GC	3	6	79139	79144	0 %	0 %	50 %	50 %	378720580
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.