MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 4338

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016906	ACCCG	2	10	394	403	20 %	0 %	20 %	60 %	378715557
2	NC_016906	ACCAC	2	10	1653	1662	40 %	0 %	0 %	60 %	378715557
3	NC_016906	CCGTC	2	10	2418	2427	0 %	20 %	20 %	60 %	378715558
4	NC_016906	GCCGG	2	10	4115	4124	0 %	0 %	60 %	40 %	378715559
5	NC_016906	TCCGG	2	10	6087	6096	0 %	20 %	40 %	40 %	378715561
6	NC_016906	GTCAC	2	10	6360	6369	20 %	20 %	20 %	40 %	378715561
7	NC_016906	ACCGC	2	10	10712	10721	20 %	0 %	20 %	60 %	378715563
8	NC_016906	CCGGT	2	10	10878	10887	0 %	20 %	40 %	40 %	378715563
9	NC_016906	GGGGC	2	10	11178	11187	0 %	0 %	80 %	20 %	378715563
10	NC_016906	TCGAC	2	10	12123	12132	20 %	20 %	20 %	40 %	378715564
11	NC_016906	GACCC	2	10	13075	13084	20 %	0 %	20 %	60 %	378715565
12	NC_016906	GCCCA	2	10	15412	15421	20 %	0 %	20 %	60 %	378715569
13	NC_016906	CGGAG	2	10	16768	16777	20 %	0 %	60 %	20 %	378715570
14	NC_016906	GGTGA	2	10	17456	17465	20 %	20 %	60 %	0 %	378715571
15	NC_016906	ACCGA	2	10	18937	18946	40 %	0 %	20 %	40 %	378715573
16	NC_016906	GCCAG	2	10	19310	19319	20 %	0 %	40 %	40 %	378715574
17	NC_016906	CGTCG	2	10	21008	21017	0 %	20 %	40 %	40 %	378715576
18	NC_016906	GTCGG	2	10	21358	21367	0 %	20 %	60 %	20 %	378715576
19	NC_016906	CGGTC	2	10	21454	21463	0 %	20 %	40 %	40 %	378715576
20	NC_016906	TGACC	2	10	23237	23246	20 %	20 %	20 %	40 %	378715577
21	NC_016906	CCCGA	2	10	26297	26306	20 %	0 %	20 %	60 %	378715579
22	NC_016906	GGTGC	2	10	27193	27202	0 %	20 %	60 %	20 %	378715580
23	NC_016906	GTCCG	2	10	27288	27297	0 %	20 %	40 %	40 %	378715580
24	NC_016906	GTCCG	2	10	27496	27505	0 %	20 %	40 %	40 %	378715580
25	NC_016906	CCGCG	2	10	29760	29769	0 %	0 %	40 %	60 %	378715582
26	NC_016906	GCCGG	2	10	31882	31891	0 %	0 %	60 %	40 %	378715583
27	NC_016906	CGGGT	2	10	32483	32492	0 %	20 %	60 %	20 %	378715584
28	NC_016906	CGCGA	2	10	34962	34971	20 %	0 %	40 %	40 %	378715585
29	NC_016906	CTGGC	2	10	35921	35930	0 %	20 %	40 %	40 %	378715586
30	NC_016906	CGCAG	2	10	36499	36508	20 %	0 %	40 %	40 %	378715586
31	NC_016906	CAGCC	2	10	43301	43310	20 %	0 %	20 %	60 %	378715591
32	NC_016906	CGCGG	2	10	44121	44130	0 %	0 %	60 %	40 %	378715591
33	NC_016906	GGCGC	2	10	45358	45367	0 %	0 %	60 %	40 %	378715593
34	NC_016906	GGCCG	2	10	45950	45959	0 %	0 %	60 %	40 %	378715594
35	NC_016906	TGCCC	2	10	48983	48992	0 %	20 %	20 %	60 %	378715596
36	NC_016906	CGGTG	2	10	49936	49945	0 %	20 %	60 %	20 %	378715597
37	NC_016906	GACTC	2	10	51357	51366	20 %	20 %	20 %	40 %	378715598
38	NC_016906	GCGCG	2	10	55328	55337	0 %	0 %	60 %	40 %	378715602
39	NC_016906	CAGCG	2	10	55587	55596	20 %	0 %	40 %	40 %	378715602
40	NC_016906	TCGGC	2	10	56035	56044	0 %	20 %	40 %	40 %	378715602
41	NC_016906	CGATC	2	10	56126	56135	20 %	20 %	20 %	40 %	378715602
42	NC_016906	CGCAT	2	10	58687	58696	20 %	20 %	20 %	40 %	378715605
43	NC_016906	CCGCG	2	10	60529	60538	0 %	0 %	40 %	60 %	378715607
44	NC_016906	GCCGC	2	10	60912	60921	0 %	0 %	40 %	60 %	378715607
45	NC_016906	CGCGC	2	10	61844	61853	0 %	0 %	40 %	60 %	378715608
46	NC_016906	GCCGG	2	10	62969	62978	0 %	0 %	60 %	40 %	378715609
47	NC_016906	ATGGA	2	10	66115	66124	40 %	20 %	40 %	0 %	378715611
48	NC_016906	GGTGC	2	10	67142	67151	0 %	20 %	60 %	20 %	378715612
49	NC_016906	CCGGT	2	10	67178	67187	0 %	20 %	40 %	40 %	378715612
50	NC_016906	TCGCG	2	10	67456	67465	0 %	20 %	40 %	40 %	378715613
51	NC_016906	GTCCA	2	10	69920	69929	20 %	20 %	20 %	40 %	378715615
52	NC_016906	TTCGG	2	10	70641	70650	0 %	40 %	40 %	20 %	378715616
53	NC_016906	TGCGG	2	10	72224	72233	0 %	20 %	60 %	20 %	378715617
54	NC_016906	TCATC	2	10	73093	73102	20 %	40 %	0 %	40 %	378715617
55	NC_016906	CTGGC	2	10	73469	73478	0 %	20 %	40 %	40 %	378715618
56	NC_016906	GGCCG	2	10	74625	74634	0 %	0 %	60 %	40 %	378715618
57	NC_016906	CCCGA	2	10	76609	76618	20 %	0 %	20 %	60 %	378715621
58	NC_016906	GCCCG	2	10	78772	78781	0 %	0 %	40 %	60 %	378715622
59	NC_016906	CGGTG	2	10	81722	81731	0 %	20 %	60 %	20 %	378715625
60	NC_016906	TCACC	2	10	82691	82700	20 %	20 %	0 %	60 %	378715626
61	NC_016906	GCACC	2	10	83223	83232	20 %	0 %	20 %	60 %	378715627
62	NC_016906	CGACG	2	10	83497	83506	20 %	0 %	40 %	40 %	378715627
63	NC_016906	TCCGG	2	10	84196	84205	0 %	20 %	40 %	40 %	378715628
64	NC_016906	TCCGT	2	10	84300	84309	0 %	40 %	20 %	40 %	378715628
65	NC_016906	CATTC	2	10	86826	86835	20 %	40 %	0 %	40 %	378715629
66	NC_016906	GTGCG	2	10	87712	87721	0 %	20 %	60 %	20 %	378715631
67	NC_016906	TCGAA	2	10	89123	89132	40 %	20 %	20 %	20 %	378715633
68	NC_016906	ACCAC	2	10	90530	90539	40 %	0 %	0 %	60 %	378715633
69	NC_016906	GACGC	2	10	93589	93598	20 %	0 %	40 %	40 %	378715636
70	NC_016906	GCTGC	2	10	94161	94170	0 %	20 %	40 %	40 %	378715636
71	NC_016906	GCCGA	2	10	94700	94709	20 %	0 %	40 %	40 %	378715637
72	NC_016906	TGCCG	2	10	96172	96181	0 %	20 %	40 %	40 %	378715638
73	NC_016906	TGGCG	2	10	98444	98453	0 %	20 %	60 %	20 %	378715641
74	NC_016906	GGACC	2	10	99986	99995	20 %	0 %	40 %	40 %	378715642
75	NC_016906	CGGCG	2	10	100976	100985	0 %	0 %	60 %	40 %	378715643
76	NC_016906	GCCGC	2	10	105008	105017	0 %	0 %	40 %	60 %	378715646
77	NC_016906	CGGCG	2	10	105337	105346	0 %	0 %	60 %	40 %	378715646
78	NC_016906	AACAG	2	10	105368	105377	60 %	0 %	20 %	20 %	378715646
79	NC_016906	CCGAG	2	10	105380	105389	20 %	0 %	40 %	40 %	378715646
80	NC_016906	GCACG	2	10	106270	106279	20 %	0 %	40 %	40 %	378715648
81	NC_016906	GGCCT	2	10	115899	115908	0 %	20 %	40 %	40 %	378715652
82	NC_016906	CGAAC	2	10	122688	122697	40 %	0 %	20 %	40 %	378715659
83	NC_016906	ACCGG	2	10	122826	122835	20 %	0 %	40 %	40 %	378715659
84	NC_016906	GCCCA	2	10	123241	123250	20 %	0 %	20 %	60 %	378715659
85	NC_016906	CGGCA	2	10	123325	123334	20 %	0 %	40 %	40 %	378715659
86	NC_016906	CGTGC	2	10	124499	124508	0 %	20 %	40 %	40 %	378715660
87	NC_016906	GCCGG	2	10	125349	125358	0 %	0 %	60 %	40 %	378715660
88	NC_016906	GGCTG	2	10	131463	131472	0 %	20 %	60 %	20 %	378715667
89	NC_016906	CGGAG	2	10	132865	132874	20 %	0 %	60 %	20 %	378715669
90	NC_016906	GGCGA	2	10	135006	135015	20 %	0 %	60 %	20 %	378715671
91	NC_016906	CGGGT	2	10	135096	135105	0 %	20 %	60 %	20 %	378715671
92	NC_016906	TCGAG	2	10	135470	135479	20 %	20 %	40 %	20 %	378715671
93	NC_016906	CGTTG	2	10	138060	138069	0 %	40 %	40 %	20 %	378715673
94	NC_016906	ACACC	2	10	138782	138791	40 %	0 %	0 %	60 %	378715674
95	NC_016906	GACCG	2	10	139735	139744	20 %	0 %	40 %	40 %	378715675
96	NC_016906	TGCGG	2	10	140095	140104	0 %	20 %	60 %	20 %	378715675
97	NC_016906	GCCCG	2	10	141664	141673	0 %	0 %	40 %	60 %	378715676
98	NC_016906	GAGCT	2	10	142339	142348	20 %	20 %	40 %	20 %	378715677
99	NC_016906	CGATC	2	10	142943	142952	20 %	20 %	20 %	40 %	378715677
100	NC_016906	ACAGC	2	10	147019	147028	40 %	0 %	20 %	40 %	378715681
101	NC_016906	TGCGG	2	10	147615	147624	0 %	20 %	60 %	20 %	378715682
102	NC_016906	GGCCG	2	10	147906	147915	0 %	0 %	60 %	40 %	378715682
103	NC_016906	CCGTT	2	10	149081	149090	0 %	40 %	20 %	40 %	378715683
104	NC_016906	TGACC	2	10	150646	150655	20 %	20 %	20 %	40 %	378715684
105	NC_016906	CGGTG	2	10	152843	152852	0 %	20 %	60 %	20 %	378715686
106	NC_016906	GCACC	2	10	156521	156530	20 %	0 %	20 %	60 %	378715689
107	NC_016906	GGCCG	2	10	156704	156713	0 %	0 %	60 %	40 %	378715689
108	NC_016906	GCCGA	2	10	157158	157167	20 %	0 %	40 %	40 %	378715689
109	NC_016906	GGGCC	2	10	157619	157628	0 %	0 %	60 %	40 %	378715690
110	NC_016906	ACGAG	2	10	158661	158670	40 %	0 %	40 %	20 %	378715691
111	NC_016906	GTCGG	2	10	162173	162182	0 %	20 %	60 %	20 %	378715694
112	NC_016906	GCCCG	2	10	163485	163494	0 %	0 %	40 %	60 %	378715695
113	NC_016906	GTGAG	2	10	164870	164879	20 %	20 %	60 %	0 %	378715696
114	NC_016906	GTTGA	2	10	165978	165987	20 %	40 %	40 %	0 %	378715697
115	NC_016906	GGCCG	2	10	167412	167421	0 %	0 %	60 %	40 %	378715698
116	NC_016906	TCGAC	2	10	175007	175016	20 %	20 %	20 %	40 %	378715702
117	NC_016906	CGTCT	2	10	177359	177368	0 %	40 %	20 %	40 %	378715704
118	NC_016906	GCGAG	2	10	178341	178350	20 %	0 %	60 %	20 %	378715705
119	NC_016906	AGTCG	2	10	178681	178690	20 %	20 %	40 %	20 %	378715705
120	NC_016906	GGGTC	2	10	180090	180099	0 %	20 %	60 %	20 %	378715708
121	NC_016906	TTGGC	2	10	180230	180239	0 %	40 %	40 %	20 %	378715708
122	NC_016906	GCAGT	2	10	180892	180901	20 %	20 %	40 %	20 %	378715708
123	NC_016906	CGAAA	2	10	187826	187835	60 %	0 %	20 %	20 %	378715716
124	NC_016906	CGCGG	2	10	190111	190120	0 %	0 %	60 %	40 %	378715716
125	NC_016906	ATGCC	2	10	190145	190154	20 %	20 %	20 %	40 %	378715716
126	NC_016906	CGCAC	2	10	190530	190539	20 %	0 %	20 %	60 %	378715716
127	NC_016906	TCAGC	2	10	192889	192898	20 %	20 %	20 %	40 %	378715717
128	NC_016906	GCGAT	2	10	193210	193219	20 %	20 %	40 %	20 %	378715717
129	NC_016906	GTCGG	2	10	194457	194466	0 %	20 %	60 %	20 %	378715717
130	NC_016906	CGATC	2	10	197154	197163	20 %	20 %	20 %	40 %	378715719
131	NC_016906	CGTCG	2	10	197414	197423	0 %	20 %	40 %	40 %	378715720
132	NC_016906	TTCGG	2	10	197493	197502	0 %	40 %	40 %	20 %	378715720
133	NC_016906	CCGCA	2	10	200165	200174	20 %	0 %	20 %	60 %	378715720
134	NC_016906	CGCAC	2	10	200184	200193	20 %	0 %	20 %	60 %	378715720
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