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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 1709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016906	TGGA	2	8	1908	1915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016906	CTGA	3	12	6639	6650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016906	TGGG	2	8	15701	15708	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016906	GGTC	2	8	15744	15751	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016906	CCGG	2	8	15829	15836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016906	GGGC	2	8	16309	16316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016906	CCCG	2	8	16567	16574	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_016906	TGGA	2	8	17040	17047	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016906	AGCG	2	8	19469	19476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016906	CGGG	2	8	28716	28723	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016906	ACCG	2	8	28843	28850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016906	CGTG	2	8	30157	30164	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016906	GTGC	2	8	30381	30388	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016906	CCCG	2	8	32329	32336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15	NC_016906	CGAC	2	8	33022	33029	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016906	CGAT	2	8	37577	37584	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016906	GGAG	2	8	39528	39535	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016906	GAGC	2	8	42020	42027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016906	CGCC	2	8	42159	42166	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_016906	CGGA	2	8	43276	43283	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016906	ACCG	2	8	44396	44403	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016906	GATC	2	8	57689	57696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016906	GAGC	2	8	59242	59249	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016906	CGGG	2	8	59300	59307	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016906	TGGC	2	8	60116	60123	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016906	CCGA	2	8	60258	60265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016906	CCCG	2	8	61216	61223	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_016906	CAAG	2	8	73168	73175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016906	GACT	2	8	73232	73239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016906	CGTC	2	8	76297	76304	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016906	TGAC	2	8	76325	76332	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016906	CAAG	2	8	76399	76406	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016906	ACCC	2	8	78357	78364	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_016906	GGCG	2	8	82781	82788	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016906	GCCG	2	8	87373	87380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016906	CGGC	2	8	87381	87388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016906	ATCC	2	8	88310	88317	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016906	GCCG	2	8	95034	95041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016906	CGGT	2	8	95048	95055	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016906	GACC	2	8	102719	102726	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016906	TGGG	2	8	102751	102758	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016906	GCGG	2	8	102958	102965	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016906	ACGG	2	8	103038	103045	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016906	CCGG	2	8	103327	103334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016906	CGTC	2	8	103441	103448	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016906	ACGC	2	8	105701	105708	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016906	CGTG	2	8	106128	106135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016906	ACAG	2	8	106168	106175	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016906	GCCG	2	8	106688	106695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016906	TGGT	2	8	108429	108436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016906	GGGA	2	8	108853	108860	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016906	GTGG	2	8	109058	109065	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016906	GAAA	2	8	109315	109322	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016906	GCGA	2	8	109644	109651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016906	GTCT	2	8	109718	109725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016906	GTGA	2	8	109748	109755	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016906	CTTC	2	8	110683	110690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016906	GGGT	2	8	110714	110721	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016906	GACG	2	8	112301	112308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016906	CCTT	2	8	115387	115394	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016906	AACC	2	8	117058	117065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016906	TCGG	2	8	137337	137344	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016906	CTAC	2	8	138357	138364	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016906	CCGG	2	8	149540	149547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016906	CGGC	2	8	174800	174807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016906	TGCG	2	8	175524	175531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016906	CCGG	2	8	179473	179480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016906	CACC	2	8	182922	182929	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
69	NC_016906	GACG	2	8	185179	185186	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016906	TTGC	2	8	187556	187563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016906	GGCG	2	8	203773	203780	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016906	CGGT	2	8	206275	206282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016906	GTTC	2	8	206403	206410	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016906	TGGG	2	8	208378	208385	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016906	ATCC	2	8	209758	209765	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016906	GTTG	2	8	213823	213830	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016906	TGAT	2	8	214014	214021	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016906	GCAA	2	8	214350	214357	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016906	GCTA	2	8	214358	214365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016906	TTGG	2	8	214904	214911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016906	CGAA	2	8	215555	215562	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016906	GGGA	2	8	217276	217283	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016906	TCAG	2	8	217305	217312	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016906	CGAG	2	8	225257	225264	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016906	ATCG	2	8	229369	229376	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016906	CCGT	2	8	229664	229671	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016906	GCAG	2	8	232913	232920	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016906	CTGG	2	8	233252	233259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016906	GGCC	2	8	233311	233318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016906	GTGC	2	8	234777	234784	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016906	GATC	2	8	237234	237241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_016906	TCCG	2	8	247075	247082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016906	AGCG	2	8	250051	250058	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016906	GAAC	2	8	251384	251391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016906	GTGG	2	8	252043	252050	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016906	AGCG	2	8	252165	252172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016906	GAGG	2	8	257194	257201	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016906	GGTG	2	8	261366	261373	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016906	TCTT	3	12	265750	265761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016906	CCAT	2	8	278990	278997	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016906	GGTG	2	8	285169	285176	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016906	GTCG	2	8	297968	297975	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016906	GTCG	2	8	298151	298158	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016906	TCGG	2	8	300028	300035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016906	ACCG	2	8	300102	300109	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016906	CGCA	2	8	303111	303118	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016906	CGGC	2	8	304488	304495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016906	GGGA	2	8	305605	305612	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016906	GAGG	2	8	309003	309010	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016906	CTGG	2	8	311554	311561	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016906	GGCC	2	8	314455	314462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016906	CCAT	2	8	317062	317069	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016906	TTGC	2	8	318957	318964	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016906	GCGA	2	8	324468	324475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016906	GGGC	2	8	331395	331402	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016906	TCCC	2	8	335071	335078	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_016906	TGGT	2	8	336916	336923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016906	ACGA	2	8	343860	343867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016906	ACGG	2	8	343934	343941	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016906	CTCG	2	8	354987	354994	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016906	GCAA	3	12	357359	357370	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016906	TTGA	2	8	357460	357467	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016906	CACG	2	8	366796	366803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016906	CCTG	2	8	368152	368159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016906	AGGC	2	8	374468	374475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016906	CCGG	2	8	376327	376334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016906	TGTC	2	8	376610	376617	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016906	GTTG	2	8	380169	380176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016906	CACC	2	8	380692	380699	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_016906	CGCC	2	8	386532	386539	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
131	NC_016906	CGCC	2	8	386546	386553	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
132	NC_016906	CCCG	2	8	389094	389101	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_016906	GGAA	2	8	389381	389388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016906	TGTC	2	8	389433	389440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016906	GCTG	2	8	394410	394417	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016906	TCGT	2	8	397738	397745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016906	CTCC	2	8	399235	399242	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
138	NC_016906	GACG	2	8	408675	408682	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016906	TTTC	2	8	411906	411913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016906	GGGC	2	8	413962	413969	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016906	GGCG	2	8	413998	414005	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016906	CTGG	2	8	414039	414046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016906	CGGT	2	8	415006	415013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016906	CGGG	2	8	415122	415129	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016906	ATCG	2	8	416108	416115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016906	TGGC	2	8	416290	416297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016906	GAGC	2	8	416644	416651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016906	GCGA	2	8	417635	417642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016906	CGGG	2	8	417644	417651	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_016906	CGTG	2	8	417738	417745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016906	GGCG	2	8	418001	418008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
152	NC_016906	ACTC	2	8	418081	418088	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_016906	GGCC	2	8	418380	418387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016906	GGGT	2	8	420334	420341	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016906	TGAC	2	8	420512	420519	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
156	NC_016906	ATCG	2	8	420935	420942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_016906	ATCC	2	8	420973	420980	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
158	NC_016906	GGTG	2	8	422343	422350	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016906	AGTC	2	8	423590	423597	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_016906	CCGT	2	8	426531	426538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_016906	CGAC	2	8	427529	427536	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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165	NC_016906	GGTT	2	8	430774	430781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_016906	CCGA	2	8	433748	433755	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
169	NC_016906	CCGA	2	8	433918	433925	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
170	NC_016906	GGTT	2	8	436336	436343	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
171	NC_016906	CGGG	2	8	441225	441232	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
172	NC_016906	TGCA	2	8	446787	446794	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
173	NC_016906	ACTG	2	8	446875	446882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_016906	CGGG	2	8	452639	452646	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
175	NC_016906	CGGG	2	8	452866	452873	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
176	NC_016906	TCCA	2	8	452883	452890	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
177	NC_016906	GCGT	2	8	455396	455403	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
178	NC_016906	CGGG	2	8	455404	455411	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
179	NC_016906	TCGA	2	8	459464	459471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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181	NC_016906	CGGA	2	8	469646	469653	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
182	NC_016906	TCGG	2	8	469709	469716	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_016906	CCCA	2	8	478895	478902	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
187	NC_016906	GCCC	2	8	478903	478910	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
188	NC_016906	CGGC	2	8	485416	485423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
189	NC_016906	TCCA	2	8	492503	492510	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
190	NC_016906	TCCG	2	8	492598	492605	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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195	NC_016906	GTGG	2	8	514995	515002	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_016906	CCCG	2	8	524137	524144	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
198	NC_016906	GGTG	2	8	529925	529932	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_016906	AGCG	2	8	546722	546729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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261	NC_016906	GATC	2	8	769426	769433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
262	NC_016906	CATC	2	8	769503	769510	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
263	NC_016906	GCGG	2	8	769590	769597	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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272	NC_016906	GCCG	2	8	813724	813731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
273	NC_016906	GCCG	2	8	814745	814752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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489	NC_016906	CGGT	2	8	1456816	1456823	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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491	NC_016906	CGGC	2	8	1457181	1457188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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495	NC_016906	GCGT	2	8	1459311	1459318	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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498	NC_016906	CGAC	2	8	1462576	1462583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
499	NC_016906	CCGT	2	8	1469721	1469728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_016906	AACC	2	8	1470436	1470443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

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