MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 104767

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016906	CGC	2	6	166	171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
2	NC_016906	CAT	2	6	173	178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715557
3	NC_016906	CAG	2	6	194	199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715557
4	NC_016906	CTG	2	6	251	256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
5	NC_016906	CAC	2	6	316	321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715557
6	NC_016906	GTC	2	6	327	332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
7	NC_016906	CGC	2	6	378	383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
8	NC_016906	GAG	2	6	386	391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715557
9	NC_016906	ACC	2	6	407	412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715557
10	NC_016906	CCA	2	6	435	440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715557
11	NC_016906	CGA	2	6	469	474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715557
12	NC_016906	TCC	2	6	641	646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715557
13	NC_016906	GTC	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
14	NC_016906	CAC	2	6	709	714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715557
15	NC_016906	GTT	2	6	856	861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715557
16	NC_016906	GAA	2	6	965	970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715557
17	NC_016906	TCA	2	6	984	989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715557
18	NC_016906	CGG	2	6	1007	1012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715557
19	NC_016906	CGC	2	6	1025	1030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
20	NC_016906	TCC	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715557
21	NC_016906	TCG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
22	NC_016906	AGG	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715557
23	NC_016906	TTC	2	6	1103	1108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715557
24	NC_016906	TCC	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715557
25	NC_016906	GCC	2	6	1240	1245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
26	NC_016906	ACA	2	6	1293	1298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715557
27	NC_016906	CGA	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715557
28	NC_016906	AAC	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715557
29	NC_016906	CGT	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
30	NC_016906	TGC	2	6	1452	1457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
31	NC_016906	GCC	2	6	1484	1489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
32	NC_016906	CCG	2	6	1506	1511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
33	NC_016906	CGA	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715557
34	NC_016906	GCG	2	6	1705	1710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715557
35	NC_016906	AGC	2	6	1752	1757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715557
36	NC_016906	CGT	2	6	2450	2455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715558
37	NC_016906	CCG	2	6	2548	2553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715558
38	NC_016906	CAA	2	6	2621	2626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715558
39	NC_016906	CGA	2	6	2695	2700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715558
40	NC_016906	CGC	2	6	2798	2803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715558
41	NC_016906	GAC	2	6	2811	2816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715558
42	NC_016906	CGT	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715558
43	NC_016906	CGC	2	6	2873	2878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715558
44	NC_016906	ACG	2	6	3093	3098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715558
45	NC_016906	GCT	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715558
46	NC_016906	CCG	2	6	3154	3159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715558
47	NC_016906	TGG	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715558
48	NC_016906	TAC	2	6	3262	3267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715558
49	NC_016906	CCG	2	6	3271	3276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715558
50	NC_016906	GCG	2	6	3277	3282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715558
51	NC_016906	CAC	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715558
52	NC_016906	CGG	2	6	3430	3435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715558
53	NC_016906	TGC	2	6	3436	3441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715558
54	NC_016906	CGA	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715558
55	NC_016906	TCG	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715558
56	NC_016906	TCG	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715559
57	NC_016906	CAC	2	6	3844	3849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715559
58	NC_016906	GAG	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715559
59	NC_016906	CGA	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715559
60	NC_016906	CGG	2	6	3985	3990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715559
61	NC_016906	CGG	2	6	4027	4032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715559
62	NC_016906	GCT	2	6	4204	4209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715559
63	NC_016906	CTG	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715559
64	NC_016906	AGG	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715559
65	NC_016906	ACC	2	6	4349	4354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715559
66	NC_016906	GAG	2	6	4382	4387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715559
67	NC_016906	CGG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715559
68	NC_016906	CGC	2	6	4557	4562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715559
69	NC_016906	CGG	2	6	4572	4577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715559
70	NC_016906	ATC	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715560
71	NC_016906	CGC	2	6	4757	4762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
72	NC_016906	TCG	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715560
73	NC_016906	CAA	2	6	4860	4865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715560
74	NC_016906	TCT	2	6	4905	4910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715560
75	NC_016906	GTT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715560
76	NC_016906	TCC	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715560
77	NC_016906	TCG	2	6	4988	4993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715560
78	NC_016906	CGC	2	6	5025	5030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
79	NC_016906	GCG	2	6	5100	5105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715560
80	NC_016906	CGC	2	6	5163	5168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
81	NC_016906	CCG	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
82	NC_016906	GCG	2	6	5242	5247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715560
83	NC_016906	CGC	2	6	5252	5257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
84	NC_016906	CGA	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715560
85	NC_016906	CCG	2	6	5327	5332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
86	NC_016906	GGC	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715560
87	NC_016906	TGG	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715560
88	NC_016906	GAC	2	6	5428	5433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715560
89	NC_016906	CGA	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715560
90	NC_016906	AGC	2	6	5636	5641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715560
91	NC_016906	ATC	2	6	5644	5649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715560
92	NC_016906	CGG	2	6	5692	5697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715560
93	NC_016906	GGT	2	6	5739	5744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715560
94	NC_016906	CCG	2	6	5860	5865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
95	NC_016906	GCC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715561
96	NC_016906	CGG	3	9	6039	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715561
97	NC_016906	GTC	2	6	6067	6072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715561
98	NC_016906	GGT	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715561
99	NC_016906	TCG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715561
100	NC_016906	TCG	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715561
101	NC_016906	CGT	2	6	6394	6399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715561
102	NC_016906	CAG	2	6	6829	6834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715562
103	NC_016906	GGT	2	6	6845	6850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715562
104	NC_016906	GAA	2	6	6859	6864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715562
105	NC_016906	GAA	2	6	6871	6876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715562
106	NC_016906	TCA	2	6	6979	6984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715562
107	NC_016906	GGT	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715562
108	NC_016906	CGA	2	6	7015	7020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715562
109	NC_016906	GGT	2	6	7081	7086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715562
110	NC_016906	CGA	2	6	7087	7092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715562
111	NC_016906	GTC	2	6	7145	7150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715562
112	NC_016906	CGG	2	6	7168	7173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715562
113	NC_016906	GGT	2	6	7205	7210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715562
114	NC_016906	GTG	2	6	7232	7237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715562
115	NC_016906	CAC	2	6	7357	7362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715562
116	NC_016906	GAC	2	6	7399	7404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715562
117	NC_016906	CAA	2	6	7456	7461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715562
118	NC_016906	CAC	2	6	7543	7548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715562
119	NC_016906	CCG	2	6	7554	7559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715562
120	NC_016906	CGA	2	6	7573	7578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715562
121	NC_016906	GGT	2	6	7805	7810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715562
122	NC_016906	GAG	2	6	7817	7822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715562
123	NC_016906	GAA	2	6	7870	7875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715562
124	NC_016906	GAC	2	6	7892	7897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715562
125	NC_016906	GAC	2	6	7910	7915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715562
126	NC_016906	GGC	2	6	7930	7935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715562
127	NC_016906	ATC	3	9	8081	8089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715562
128	NC_016906	GCG	2	6	8149	8154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715562
129	NC_016906	CGG	2	6	8173	8178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715562
130	NC_016906	GCA	2	6	8205	8210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715562
131	NC_016906	ATC	2	6	8321	8326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715562
132	NC_016906	ATC	2	6	8381	8386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715562
133	NC_016906	ACG	2	6	8409	8414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715562
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135	NC_016906	CTG	2	6	8507	8512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715562
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150	NC_016906	ACG	2	6	9416	9421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715563
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259	NC_016906	CGA	2	6	14316	14321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715567
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