MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 plasmid pSBAL67801

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016905	TACCCG	2	12	3397	3408	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378715494
2	NC_016905	TTTTGA	2	12	3486	3497	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378715494
3	NC_016905	ATAGAA	2	12	7809	7820	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	378715496
4	NC_016905	GCTTCG	2	12	10380	10391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715499
5	NC_016905	ATAGGT	2	12	14909	14920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715502
6	NC_016905	GGCTTG	2	12	17507	17518	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378715504
7	NC_016905	GATAGC	2	12	18712	18723	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378715506
8	NC_016905	TGCTAC	2	12	31893	31904	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378715522
9	NC_016905	CGCTTA	2	12	35285	35296	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378715523
10	NC_016905	TTGTCG	2	12	36315	36326	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	378715523
11	NC_016905	GCACTT	2	12	36734	36745	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378715523
12	NC_016905	CCCAGC	2	12	45543	45554	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	378715529
13	NC_016905	TGCACC	2	12	45704	45715	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378715529
14	NC_016905	AGCGCA	2	12	46350	46361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715529
15	NC_016905	GAGATC	2	12	50571	50582	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378715531
16	NC_016905	TTACGG	2	12	53831	53842	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378715532
17	NC_016905	TCAATT	2	12	55373	55384	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	378715532
18	NC_016905	TTCATT	2	12	58626	58637	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	378715534
19	NC_016905	AGAACC	2	12	61656	61667	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378715535
20	NC_016905	TAATGA	2	12	71402	71413	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378715544
21	NC_016905	AACGTG	2	12	73268	73279	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	378715546
22	NC_016905	TAGCGT	2	12	80211	80222	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378715555

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.