MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 plasmid pSBAL67801

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016905	GTAA	2	8	1292	1299	50 %	25 %	25 %	0 %	378715494
2	NC_016905	CTTG	2	8	1429	1436	0 %	50 %	25 %	25 %	378715494
3	NC_016905	GAGT	2	8	1454	1461	25 %	25 %	50 %	0 %	378715494
4	NC_016905	GTTC	2	8	1585	1592	0 %	50 %	25 %	25 %	378715494
5	NC_016905	GTTA	2	8	2087	2094	25 %	50 %	25 %	0 %	378715494
6	NC_016905	TGAT	2	8	2817	2824	25 %	50 %	25 %	0 %	378715494
7	NC_016905	ATTG	2	8	3008	3015	25 %	50 %	25 %	0 %	378715494
8	NC_016905	TCAA	2	8	3111	3118	50 %	25 %	0 %	25 %	378715494
9	NC_016905	GTCT	2	8	3562	3569	0 %	50 %	25 %	25 %	378715494
10	NC_016905	TTTG	2	8	4261	4268	0 %	75 %	25 %	0 %	378715494
11	NC_016905	TTTG	2	8	4777	4784	0 %	75 %	25 %	0 %	378715494
12	NC_016905	CTTG	2	8	4855	4862	0 %	50 %	25 %	25 %	378715494
13	NC_016905	CTTT	2	8	5245	5252	0 %	75 %	0 %	25 %	378715494
14	NC_016905	GGTT	2	8	5344	5351	0 %	50 %	50 %	0 %	378715494
15	NC_016905	CAAA	2	8	5848	5855	75 %	0 %	0 %	25 %	378715494
16	NC_016905	GTGA	2	8	6048	6055	25 %	25 %	50 %	0 %	378715494
17	NC_016905	GCGT	2	8	7314	7321	0 %	25 %	50 %	25 %	378715496
18	NC_016905	CATC	2	8	7686	7693	25 %	25 %	0 %	50 %	378715496
19	NC_016905	CCAT	2	8	9048	9055	25 %	25 %	0 %	50 %	378715497
20	NC_016905	GGGT	2	8	9215	9222	0 %	25 %	75 %	0 %	378715497
21	NC_016905	GCAA	2	8	9261	9268	50 %	0 %	25 %	25 %	378715497
22	NC_016905	GGCT	2	8	9500	9507	0 %	25 %	50 %	25 %	378715497
23	NC_016905	CTTT	2	8	9738	9745	0 %	75 %	0 %	25 %	378715498
24	NC_016905	TAAG	2	8	9796	9803	50 %	25 %	25 %	0 %	378715498
25	NC_016905	TTGA	2	8	10303	10310	25 %	50 %	25 %	0 %	378715499
26	NC_016905	GATT	2	8	10920	10927	25 %	50 %	25 %	0 %	378715499
27	NC_016905	TGCG	2	8	10967	10974	0 %	25 %	50 %	25 %	378715499
28	NC_016905	CTTG	2	8	11584	11591	0 %	50 %	25 %	25 %	378715499
29	NC_016905	GTGA	2	8	12033	12040	25 %	25 %	50 %	0 %	378715499
30	NC_016905	TATT	2	8	12564	12571	25 %	75 %	0 %	0 %	378715499
31	NC_016905	CATA	2	8	12757	12764	50 %	25 %	0 %	25 %	378715499
32	NC_016905	GCAA	2	8	12879	12886	50 %	0 %	25 %	25 %	378715499
33	NC_016905	CTTG	2	8	13045	13052	0 %	50 %	25 %	25 %	378715499
34	NC_016905	AAGG	2	8	13774	13781	50 %	0 %	50 %	0 %	378715500
35	NC_016905	TCTT	2	8	13847	13854	0 %	75 %	0 %	25 %	378715500
36	NC_016905	GCAA	2	8	14561	14568	50 %	0 %	25 %	25 %	378715501
37	NC_016905	ATGC	2	8	14582	14589	25 %	25 %	25 %	25 %	378715501
38	NC_016905	GGAA	2	8	14855	14862	50 %	0 %	50 %	0 %	378715502
39	NC_016905	GAAA	2	8	14986	14993	75 %	0 %	25 %	0 %	378715502
40	NC_016905	AGCG	2	8	15195	15202	25 %	0 %	50 %	25 %	378715503
41	NC_016905	TAAC	2	8	15227	15234	50 %	25 %	0 %	25 %	378715503
42	NC_016905	TGGC	2	8	15293	15300	0 %	25 %	50 %	25 %	378715503
43	NC_016905	GTCT	2	8	15512	15519	0 %	50 %	25 %	25 %	378715503
44	NC_016905	GCTT	2	8	15766	15773	0 %	50 %	25 %	25 %	378715503
45	NC_016905	AGTT	2	8	16933	16940	25 %	50 %	25 %	0 %	378715504
46	NC_016905	TGAG	2	8	17032	17039	25 %	25 %	50 %	0 %	378715504
47	NC_016905	TCCT	2	8	17081	17088	0 %	50 %	0 %	50 %	378715504
48	NC_016905	AAGT	2	8	17863	17870	50 %	25 %	25 %	0 %	378715505
49	NC_016905	AATG	2	8	18458	18465	50 %	25 %	25 %	0 %	378715505
50	NC_016905	ATCT	2	8	19061	19068	25 %	50 %	0 %	25 %	378715506
51	NC_016905	TTGT	2	8	19579	19586	0 %	75 %	25 %	0 %	378715506
52	NC_016905	GCTT	2	8	19648	19655	0 %	50 %	25 %	25 %	378715507
53	NC_016905	GCCC	2	8	20852	20859	0 %	0 %	25 %	75 %	378715509
54	NC_016905	TGAG	2	8	21730	21737	25 %	25 %	50 %	0 %	378715509
55	NC_016905	TGCC	2	8	22109	22116	0 %	25 %	25 %	50 %	378715509
56	NC_016905	GATT	2	8	22484	22491	25 %	50 %	25 %	0 %	378715509
57	NC_016905	ATAG	2	8	22875	22882	50 %	25 %	25 %	0 %	378715509
58	NC_016905	GACT	2	8	23358	23365	25 %	25 %	25 %	25 %	378715510
59	NC_016905	CACT	2	8	23615	23622	25 %	25 %	0 %	50 %	378715510
60	NC_016905	AATT	2	8	23706	23713	50 %	50 %	0 %	0 %	378715511
61	NC_016905	ATCA	2	8	25013	25020	50 %	25 %	0 %	25 %	378715511
62	NC_016905	CAAT	2	8	25865	25872	50 %	25 %	0 %	25 %	378715512
63	NC_016905	CCAT	2	8	26492	26499	25 %	25 %	0 %	50 %	378715513
64	NC_016905	CATC	2	8	26877	26884	25 %	25 %	0 %	50 %	378715514
65	NC_016905	TTTA	2	8	27720	27727	25 %	75 %	0 %	0 %	378715517
66	NC_016905	TTTA	2	8	27930	27937	25 %	75 %	0 %	0 %	378715517
67	NC_016905	TGCT	2	8	29072	29079	0 %	50 %	25 %	25 %	378715519
68	NC_016905	ATGG	2	8	30917	30924	25 %	25 %	50 %	0 %	378715521
69	NC_016905	GGTT	2	8	31121	31128	0 %	50 %	50 %	0 %	378715521
70	NC_016905	CCCT	2	8	31231	31238	0 %	25 %	0 %	75 %	378715521
71	NC_016905	GTCA	2	8	31521	31528	25 %	25 %	25 %	25 %	378715521
72	NC_016905	AGCA	2	8	31671	31678	50 %	0 %	25 %	25 %	378715521
73	NC_016905	AAAT	2	8	31742	31749	75 %	25 %	0 %	0 %	378715522
74	NC_016905	AAGT	2	8	31805	31812	50 %	25 %	25 %	0 %	378715522
75	NC_016905	GTAA	2	8	32326	32333	50 %	25 %	25 %	0 %	378715522
76	NC_016905	TCAT	2	8	32464	32471	25 %	50 %	0 %	25 %	378715522
77	NC_016905	AATG	2	8	33232	33239	50 %	25 %	25 %	0 %	378715523
78	NC_016905	TAAA	2	8	33393	33400	75 %	25 %	0 %	0 %	378715523
79	NC_016905	TATT	2	8	34094	34101	25 %	75 %	0 %	0 %	378715523
80	NC_016905	ACAA	2	8	34376	34383	75 %	0 %	0 %	25 %	378715523
81	NC_016905	ATGC	2	8	34529	34536	25 %	25 %	25 %	25 %	378715523
82	NC_016905	GCAA	2	8	34609	34616	50 %	0 %	25 %	25 %	378715523
83	NC_016905	GTAC	2	8	34637	34644	25 %	25 %	25 %	25 %	378715523
84	NC_016905	TCAA	2	8	35932	35939	50 %	25 %	0 %	25 %	378715523
85	NC_016905	ACTT	2	8	36436	36443	25 %	50 %	0 %	25 %	378715523
86	NC_016905	CCAT	2	8	36799	36806	25 %	25 %	0 %	50 %	378715523
87	NC_016905	ACGA	2	8	39591	39598	50 %	0 %	25 %	25 %	378715525
88	NC_016905	CCTT	2	8	39619	39626	0 %	50 %	0 %	50 %	378715525
89	NC_016905	TTTC	2	8	39883	39890	0 %	75 %	0 %	25 %	378715526
90	NC_016905	TTCC	2	8	39986	39993	0 %	50 %	0 %	50 %	378715526
91	NC_016905	ATCA	2	8	41012	41019	50 %	25 %	0 %	25 %	378715527
92	NC_016905	AAGC	2	8	41032	41039	50 %	0 %	25 %	25 %	378715527
93	NC_016905	GGGT	2	8	41108	41115	0 %	25 %	75 %	0 %	378715527
94	NC_016905	TGAA	2	8	41393	41400	50 %	25 %	25 %	0 %	378715527
95	NC_016905	AAGA	2	8	41505	41512	75 %	0 %	25 %	0 %	378715527
96	NC_016905	ACTT	2	8	42031	42038	25 %	50 %	0 %	25 %	378715528
97	NC_016905	TGGG	2	8	42469	42476	0 %	25 %	75 %	0 %	378715528
98	NC_016905	AATA	2	8	42683	42690	75 %	25 %	0 %	0 %	378715528
99	NC_016905	AGCG	2	8	42803	42810	25 %	0 %	50 %	25 %	378715528
100	NC_016905	CAAC	2	8	42963	42970	50 %	0 %	0 %	50 %	378715528
101	NC_016905	GCAT	2	8	43569	43576	25 %	25 %	25 %	25 %	378715528
102	NC_016905	ATTA	2	8	44280	44287	50 %	50 %	0 %	0 %	378715529
103	NC_016905	ATCG	2	8	44300	44307	25 %	25 %	25 %	25 %	378715529
104	NC_016905	ACCT	2	8	45631	45638	25 %	25 %	0 %	50 %	378715529
105	NC_016905	AGCT	2	8	45748	45755	25 %	25 %	25 %	25 %	378715529
106	NC_016905	GGCA	2	8	46180	46187	25 %	0 %	50 %	25 %	378715529
107	NC_016905	GTCA	2	8	47543	47550	25 %	25 %	25 %	25 %	378715530
108	NC_016905	CGAG	2	8	47570	47577	25 %	0 %	50 %	25 %	378715530
109	NC_016905	AGCG	2	8	47799	47806	25 %	0 %	50 %	25 %	378715531
110	NC_016905	CAGC	2	8	48101	48108	25 %	0 %	25 %	50 %	378715531
111	NC_016905	CAAG	2	8	48425	48432	50 %	0 %	25 %	25 %	378715531
112	NC_016905	TTTG	2	8	48998	49005	0 %	75 %	25 %	0 %	378715531
113	NC_016905	TGGC	2	8	49044	49051	0 %	25 %	50 %	25 %	378715531
114	NC_016905	GGCA	2	8	49417	49424	25 %	0 %	50 %	25 %	378715531
115	NC_016905	CCAG	2	8	50243	50250	25 %	0 %	25 %	50 %	378715531
116	NC_016905	ATAG	2	8	50259	50266	50 %	25 %	25 %	0 %	378715531
117	NC_016905	AAGA	2	8	50541	50548	75 %	0 %	25 %	0 %	378715531
118	NC_016905	CAAT	2	8	53282	53289	50 %	25 %	0 %	25 %	378715532
119	NC_016905	AGTT	2	8	54555	54562	25 %	50 %	25 %	0 %	378715532
120	NC_016905	CATC	2	8	54648	54655	25 %	25 %	0 %	50 %	378715532
121	NC_016905	AAAT	2	8	55303	55310	75 %	25 %	0 %	0 %	378715532
122	NC_016905	TGAT	2	8	55329	55336	25 %	50 %	25 %	0 %	378715532
123	NC_016905	TTTG	2	8	55361	55368	0 %	75 %	25 %	0 %	378715532
124	NC_016905	AAAC	2	8	56517	56524	75 %	0 %	0 %	25 %	378715533
125	NC_016905	TGTT	2	8	56722	56729	0 %	75 %	25 %	0 %	378715533
126	NC_016905	ATTA	2	8	57023	57030	50 %	50 %	0 %	0 %	378715533
127	NC_016905	AAAG	2	8	57227	57234	75 %	0 %	25 %	0 %	378715533
128	NC_016905	TATT	2	8	58499	58506	25 %	75 %	0 %	0 %	378715534
129	NC_016905	CTTG	2	8	58527	58534	0 %	50 %	25 %	25 %	378715534
130	NC_016905	ACTT	2	8	58694	58701	25 %	50 %	0 %	25 %	378715534
131	NC_016905	TTGA	2	8	58710	58717	25 %	50 %	25 %	0 %	378715534
132	NC_016905	CTTA	2	8	58812	58819	25 %	50 %	0 %	25 %	378715534
133	NC_016905	ATCA	2	8	59151	59158	50 %	25 %	0 %	25 %	378715534
134	NC_016905	AGAT	2	8	59717	59724	50 %	25 %	25 %	0 %	378715535
135	NC_016905	TCAT	2	8	59838	59845	25 %	50 %	0 %	25 %	378715535
136	NC_016905	TCAA	2	8	59883	59890	50 %	25 %	0 %	25 %	378715535
137	NC_016905	AGTA	2	8	60212	60219	50 %	25 %	25 %	0 %	378715535
138	NC_016905	GCTT	2	8	60450	60457	0 %	50 %	25 %	25 %	378715535
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.