MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella baltica OS678 plasmid pSBAL67801

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016905	GT	3	6	114	119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016905	AC	3	6	482	487	50 %	0 %	0 %	50 %	378715493
3	NC_016905	TA	3	6	637	642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016905	CG	4	8	1496	1503	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
5	NC_016905	CG	3	6	2075	2080	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
6	NC_016905	TG	3	6	2219	2224	0 %	50 %	50 %	0 %	378715494
7	NC_016905	GC	5	10	3093	3102	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
8	NC_016905	GT	3	6	3287	3292	0 %	50 %	50 %	0 %	378715494
9	NC_016905	TG	3	6	3333	3338	0 %	50 %	50 %	0 %	378715494
10	NC_016905	GC	3	6	3649	3654	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
11	NC_016905	AT	3	6	4024	4029	50 %	50 %	0 %	0 %	378715494
12	NC_016905	GT	3	6	4683	4688	0 %	50 %	50 %	0 %	378715494
13	NC_016905	CT	3	6	5334	5339	0 %	50 %	0 %	50 %	378715494
14	NC_016905	CG	3	6	5473	5478	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
15	NC_016905	GC	4	8	6007	6014	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
16	NC_016905	CG	3	6	6632	6637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016905	GC	3	6	8181	8186	0 %	0 %	50 %	50 %	378715496
18	NC_016905	CA	3	6	8617	8622	50 %	0 %	0 %	50 %	378715496
19	NC_016905	TG	3	6	9120	9125	0 %	50 %	50 %	0 %	378715497
20	NC_016905	TG	3	6	9177	9182	0 %	50 %	50 %	0 %	378715497
21	NC_016905	GT	3	6	9479	9484	0 %	50 %	50 %	0 %	378715497
22	NC_016905	CG	3	6	9515	9520	0 %	0 %	50 %	50 %	378715497
23	NC_016905	TA	3	6	9526	9531	50 %	50 %	0 %	0 %	378715497
24	NC_016905	CT	3	6	10403	10408	0 %	50 %	0 %	50 %	378715499
25	NC_016905	CT	3	6	10443	10448	0 %	50 %	0 %	50 %	378715499
26	NC_016905	GC	3	6	11717	11722	0 %	0 %	50 %	50 %	378715499
27	NC_016905	CG	3	6	12124	12129	0 %	0 %	50 %	50 %	378715499
28	NC_016905	CG	3	6	13695	13700	0 %	0 %	50 %	50 %	378715500
29	NC_016905	TG	3	6	13937	13942	0 %	50 %	50 %	0 %	378715500
30	NC_016905	GA	3	6	15179	15184	50 %	0 %	50 %	0 %	378715503
31	NC_016905	GC	3	6	15451	15456	0 %	0 %	50 %	50 %	378715503
32	NC_016905	GC	3	6	15923	15928	0 %	0 %	50 %	50 %	378715503
33	NC_016905	GC	3	6	16186	16191	0 %	0 %	50 %	50 %	378715504
34	NC_016905	GC	3	6	16211	16216	0 %	0 %	50 %	50 %	378715504
35	NC_016905	AC	3	6	16259	16264	50 %	0 %	0 %	50 %	378715504
36	NC_016905	TG	3	6	18340	18345	0 %	50 %	50 %	0 %	378715505
37	NC_016905	CG	3	6	19279	19284	0 %	0 %	50 %	50 %	378715506
38	NC_016905	CG	3	6	19721	19726	0 %	0 %	50 %	50 %	378715507
39	NC_016905	GT	3	6	19783	19788	0 %	50 %	50 %	0 %	378715507
40	NC_016905	CG	3	6	19937	19942	0 %	0 %	50 %	50 %	378715507
41	NC_016905	CG	3	6	20563	20568	0 %	0 %	50 %	50 %	378715508
42	NC_016905	GC	3	6	20809	20814	0 %	0 %	50 %	50 %	378715509
43	NC_016905	CA	3	6	21174	21179	50 %	0 %	0 %	50 %	378715509
44	NC_016905	GT	3	6	22526	22531	0 %	50 %	50 %	0 %	378715509
45	NC_016905	AC	3	6	23510	23515	50 %	0 %	0 %	50 %	378715510
46	NC_016905	CG	3	6	25806	25811	0 %	0 %	50 %	50 %	378715512
47	NC_016905	GC	3	6	26007	26012	0 %	0 %	50 %	50 %	378715512
48	NC_016905	CA	3	6	27196	27201	50 %	0 %	0 %	50 %	378715515
49	NC_016905	TA	3	6	27349	27354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016905	GT	3	6	28379	28384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016905	GC	3	6	28882	28887	0 %	0 %	50 %	50 %	378715519
52	NC_016905	TC	4	8	29529	29536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016905	CT	3	6	30075	30080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016905	CT	3	6	31168	31173	0 %	50 %	0 %	50 %	378715521
55	NC_016905	AT	3	6	32135	32140	50 %	50 %	0 %	0 %	378715522
56	NC_016905	CA	3	6	32399	32404	50 %	0 %	0 %	50 %	378715522
57	NC_016905	AT	3	6	32896	32901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016905	TC	3	6	33263	33268	0 %	50 %	0 %	50 %	378715523
59	NC_016905	GT	3	6	33763	33768	0 %	50 %	50 %	0 %	378715523
60	NC_016905	TC	3	6	35050	35055	0 %	50 %	0 %	50 %	378715523
61	NC_016905	CT	3	6	35799	35804	0 %	50 %	0 %	50 %	378715523
62	NC_016905	TA	3	6	36233	36238	50 %	50 %	0 %	0 %	378715523
63	NC_016905	AT	3	6	38172	38177	50 %	50 %	0 %	0 %	378715524
64	NC_016905	AG	3	6	38752	38757	50 %	0 %	50 %	0 %	378715524
65	NC_016905	TC	3	6	39849	39854	0 %	50 %	0 %	50 %	378715526
66	NC_016905	TG	3	6	40699	40704	0 %	50 %	50 %	0 %	378715527
67	NC_016905	AT	5	10	42391	42400	50 %	50 %	0 %	0 %	378715528
68	NC_016905	TA	3	6	43082	43087	50 %	50 %	0 %	0 %	378715528
69	NC_016905	AT	3	6	44246	44251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016905	GC	3	6	44941	44946	0 %	0 %	50 %	50 %	378715529
71	NC_016905	TG	3	6	45253	45258	0 %	50 %	50 %	0 %	378715529
72	NC_016905	GA	3	6	45834	45839	50 %	0 %	50 %	0 %	378715529
73	NC_016905	CT	3	6	46538	46543	0 %	50 %	0 %	50 %	378715529
74	NC_016905	AG	3	6	48465	48470	50 %	0 %	50 %	0 %	378715531
75	NC_016905	TC	3	6	48538	48543	0 %	50 %	0 %	50 %	378715531
76	NC_016905	AC	3	6	49455	49460	50 %	0 %	0 %	50 %	378715531
77	NC_016905	GC	3	6	49923	49928	0 %	0 %	50 %	50 %	378715531
78	NC_016905	TG	3	6	50205	50210	0 %	50 %	50 %	0 %	378715531
79	NC_016905	CT	3	6	51003	51008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016905	CA	3	6	51464	51469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016905	TC	3	6	52360	52365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016905	GC	3	6	55495	55500	0 %	0 %	50 %	50 %	378715532
83	NC_016905	AT	3	6	57410	57415	50 %	50 %	0 %	0 %	378715533
84	NC_016905	GT	3	6	58961	58966	0 %	50 %	50 %	0 %	378715534
85	NC_016905	TA	3	6	59189	59194	50 %	50 %	0 %	0 %	378715535
86	NC_016905	TC	3	6	60181	60186	0 %	50 %	0 %	50 %	378715535
87	NC_016905	TG	3	6	61614	61619	0 %	50 %	50 %	0 %	378715535
88	NC_016905	TA	3	6	61807	61812	50 %	50 %	0 %	0 %	378715535
89	NC_016905	TC	3	6	62527	62532	0 %	50 %	0 %	50 %	378715536
90	NC_016905	AT	3	6	62848	62853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016905	TA	3	6	63552	63557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016905	AG	3	6	64457	64462	50 %	0 %	50 %	0 %	378715539
93	NC_016905	GA	3	6	65328	65333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016905	AG	3	6	66338	66343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016905	TA	3	6	67447	67452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016905	GA	3	6	67843	67848	50 %	0 %	50 %	0 %	378715541
97	NC_016905	TG	3	6	69350	69355	0 %	50 %	50 %	0 %	378715542
98	NC_016905	TG	3	6	69904	69909	0 %	50 %	50 %	0 %	378715542
99	NC_016905	AT	3	6	70259	70264	50 %	50 %	0 %	0 %	378715543
100	NC_016905	GT	3	6	70424	70429	0 %	50 %	50 %	0 %	378715543
101	NC_016905	TG	3	6	70523	70528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016905	GC	4	8	70926	70933	0 %	0 %	50 %	50 %	378715544
103	NC_016905	GA	3	6	71613	71618	50 %	0 %	50 %	0 %	378715545
104	NC_016905	GC	3	6	72007	72012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016905	CG	3	6	72561	72566	0 %	0 %	50 %	50 %	378715546
106	NC_016905	CG	3	6	73030	73035	0 %	0 %	50 %	50 %	378715546
107	NC_016905	TG	3	6	74046	74051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016905	GT	3	6	74057	74062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016905	GC	3	6	75883	75888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016905	AC	3	6	75973	75978	50 %	0 %	0 %	50 %	378715550
111	NC_016905	AG	3	6	76936	76941	50 %	0 %	50 %	0 %	378715551
112	NC_016905	CA	3	6	77512	77517	50 %	0 %	0 %	50 %	378715552
113	NC_016905	CG	3	6	77611	77616	0 %	0 %	50 %	50 %	378715552
114	NC_016905	CA	3	6	77794	77799	50 %	0 %	0 %	50 %	378715553
115	NC_016905	GC	3	6	78976	78981	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016905	AC	3	6	79067	79072	50 %	0 %	0 %	50 %	378715554
117	NC_016905	GT	3	6	79271	79276	0 %	50 %	50 %	0 %	378715554
118	NC_016905	TA	3	6	80157	80162	50 %	50 %	0 %	0 %	378715555

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.