MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Shewanella baltica OS678 plasmid pSBAL67801

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016905	AC	3	6	482	487	50 %	0 %	0 %	50 %	378715493
2	NC_016905	CG	4	8	1496	1503	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
3	NC_016905	CG	3	6	2075	2080	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
4	NC_016905	TG	3	6	2219	2224	0 %	50 %	50 %	0 %	378715494
5	NC_016905	GC	5	10	3093	3102	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
6	NC_016905	GT	3	6	3287	3292	0 %	50 %	50 %	0 %	378715494
7	NC_016905	TG	3	6	3333	3338	0 %	50 %	50 %	0 %	378715494
8	NC_016905	GC	3	6	3649	3654	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
9	NC_016905	AT	3	6	4024	4029	50 %	50 %	0 %	0 %	378715494
10	NC_016905	GT	3	6	4683	4688	0 %	50 %	50 %	0 %	378715494
11	NC_016905	CT	3	6	5334	5339	0 %	50 %	0 %	50 %	378715494
12	NC_016905	CG	3	6	5473	5478	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
13	NC_016905	GC	4	8	6007	6014	0 %	0 %	50 %	50 %	378715494
14	NC_016905	GC	3	6	8181	8186	0 %	0 %	50 %	50 %	378715496
15	NC_016905	CA	3	6	8617	8622	50 %	0 %	0 %	50 %	378715496
16	NC_016905	TG	3	6	9120	9125	0 %	50 %	50 %	0 %	378715497
17	NC_016905	TG	3	6	9177	9182	0 %	50 %	50 %	0 %	378715497
18	NC_016905	GT	3	6	9479	9484	0 %	50 %	50 %	0 %	378715497
19	NC_016905	CG	3	6	9515	9520	0 %	0 %	50 %	50 %	378715497
20	NC_016905	TA	3	6	9526	9531	50 %	50 %	0 %	0 %	378715497
21	NC_016905	CT	3	6	10403	10408	0 %	50 %	0 %	50 %	378715499
22	NC_016905	CT	3	6	10443	10448	0 %	50 %	0 %	50 %	378715499
23	NC_016905	GC	3	6	11717	11722	0 %	0 %	50 %	50 %	378715499
24	NC_016905	CG	3	6	12124	12129	0 %	0 %	50 %	50 %	378715499
25	NC_016905	CG	3	6	13695	13700	0 %	0 %	50 %	50 %	378715500
26	NC_016905	TG	3	6	13937	13942	0 %	50 %	50 %	0 %	378715500
27	NC_016905	GA	3	6	15179	15184	50 %	0 %	50 %	0 %	378715503
28	NC_016905	GC	3	6	15451	15456	0 %	0 %	50 %	50 %	378715503
29	NC_016905	GC	3	6	15923	15928	0 %	0 %	50 %	50 %	378715503
30	NC_016905	GC	3	6	16186	16191	0 %	0 %	50 %	50 %	378715504
31	NC_016905	GC	3	6	16211	16216	0 %	0 %	50 %	50 %	378715504
32	NC_016905	AC	3	6	16259	16264	50 %	0 %	0 %	50 %	378715504
33	NC_016905	TG	3	6	18340	18345	0 %	50 %	50 %	0 %	378715505
34	NC_016905	CG	3	6	19279	19284	0 %	0 %	50 %	50 %	378715506
35	NC_016905	CG	3	6	19721	19726	0 %	0 %	50 %	50 %	378715507
36	NC_016905	GT	3	6	19783	19788	0 %	50 %	50 %	0 %	378715507
37	NC_016905	CG	3	6	19937	19942	0 %	0 %	50 %	50 %	378715507
38	NC_016905	CG	3	6	20563	20568	0 %	0 %	50 %	50 %	378715508
39	NC_016905	GC	3	6	20809	20814	0 %	0 %	50 %	50 %	378715509
40	NC_016905	CA	3	6	21174	21179	50 %	0 %	0 %	50 %	378715509
41	NC_016905	GT	3	6	22526	22531	0 %	50 %	50 %	0 %	378715509
42	NC_016905	AC	3	6	23510	23515	50 %	0 %	0 %	50 %	378715510
43	NC_016905	CG	3	6	25806	25811	0 %	0 %	50 %	50 %	378715512
44	NC_016905	GC	3	6	26007	26012	0 %	0 %	50 %	50 %	378715512
45	NC_016905	CA	3	6	27196	27201	50 %	0 %	0 %	50 %	378715515
46	NC_016905	GC	3	6	28882	28887	0 %	0 %	50 %	50 %	378715519
47	NC_016905	CT	3	6	31168	31173	0 %	50 %	0 %	50 %	378715521
48	NC_016905	AT	3	6	32135	32140	50 %	50 %	0 %	0 %	378715522
49	NC_016905	CA	3	6	32399	32404	50 %	0 %	0 %	50 %	378715522
50	NC_016905	TC	3	6	33263	33268	0 %	50 %	0 %	50 %	378715523
51	NC_016905	GT	3	6	33763	33768	0 %	50 %	50 %	0 %	378715523
52	NC_016905	TC	3	6	35050	35055	0 %	50 %	0 %	50 %	378715523
53	NC_016905	CT	3	6	35799	35804	0 %	50 %	0 %	50 %	378715523
54	NC_016905	TA	3	6	36233	36238	50 %	50 %	0 %	0 %	378715523
55	NC_016905	AT	3	6	38172	38177	50 %	50 %	0 %	0 %	378715524
56	NC_016905	AG	3	6	38752	38757	50 %	0 %	50 %	0 %	378715524
57	NC_016905	TC	3	6	39849	39854	0 %	50 %	0 %	50 %	378715526
58	NC_016905	TG	3	6	40699	40704	0 %	50 %	50 %	0 %	378715527
59	NC_016905	AT	5	10	42391	42400	50 %	50 %	0 %	0 %	378715528
60	NC_016905	TA	3	6	43082	43087	50 %	50 %	0 %	0 %	378715528
61	NC_016905	GC	3	6	44941	44946	0 %	0 %	50 %	50 %	378715529
62	NC_016905	TG	3	6	45253	45258	0 %	50 %	50 %	0 %	378715529
63	NC_016905	GA	3	6	45834	45839	50 %	0 %	50 %	0 %	378715529
64	NC_016905	CT	3	6	46538	46543	0 %	50 %	0 %	50 %	378715529
65	NC_016905	AG	3	6	48465	48470	50 %	0 %	50 %	0 %	378715531
66	NC_016905	TC	3	6	48538	48543	0 %	50 %	0 %	50 %	378715531
67	NC_016905	AC	3	6	49455	49460	50 %	0 %	0 %	50 %	378715531
68	NC_016905	GC	3	6	49923	49928	0 %	0 %	50 %	50 %	378715531
69	NC_016905	TG	3	6	50205	50210	0 %	50 %	50 %	0 %	378715531
70	NC_016905	GC	3	6	55495	55500	0 %	0 %	50 %	50 %	378715532
71	NC_016905	AT	3	6	57410	57415	50 %	50 %	0 %	0 %	378715533
72	NC_016905	GT	3	6	58961	58966	0 %	50 %	50 %	0 %	378715534
73	NC_016905	TA	3	6	59189	59194	50 %	50 %	0 %	0 %	378715535
74	NC_016905	TC	3	6	60181	60186	0 %	50 %	0 %	50 %	378715535
75	NC_016905	TG	3	6	61614	61619	0 %	50 %	50 %	0 %	378715535
76	NC_016905	TA	3	6	61807	61812	50 %	50 %	0 %	0 %	378715535
77	NC_016905	TC	3	6	62527	62532	0 %	50 %	0 %	50 %	378715536
78	NC_016905	AG	3	6	64457	64462	50 %	0 %	50 %	0 %	378715539
79	NC_016905	GA	3	6	67843	67848	50 %	0 %	50 %	0 %	378715541
80	NC_016905	TG	3	6	69350	69355	0 %	50 %	50 %	0 %	378715542
81	NC_016905	TG	3	6	69904	69909	0 %	50 %	50 %	0 %	378715542
82	NC_016905	AT	3	6	70259	70264	50 %	50 %	0 %	0 %	378715543
83	NC_016905	GT	3	6	70424	70429	0 %	50 %	50 %	0 %	378715543
84	NC_016905	GC	4	8	70926	70933	0 %	0 %	50 %	50 %	378715544
85	NC_016905	GA	3	6	71613	71618	50 %	0 %	50 %	0 %	378715545
86	NC_016905	CG	3	6	72561	72566	0 %	0 %	50 %	50 %	378715546
87	NC_016905	CG	3	6	73030	73035	0 %	0 %	50 %	50 %	378715546
88	NC_016905	AC	3	6	75973	75978	50 %	0 %	0 %	50 %	378715550
89	NC_016905	AG	3	6	76936	76941	50 %	0 %	50 %	0 %	378715551
90	NC_016905	CA	3	6	77512	77517	50 %	0 %	0 %	50 %	378715552
91	NC_016905	CG	3	6	77611	77616	0 %	0 %	50 %	50 %	378715552
92	NC_016905	CA	3	6	77794	77799	50 %	0 %	0 %	50 %	378715553
93	NC_016905	AC	3	6	79067	79072	50 %	0 %	0 %	50 %	378715554
94	NC_016905	GT	3	6	79271	79276	0 %	50 %	50 %	0 %	378715554
95	NC_016905	TA	3	6	80157	80162	50 %	50 %	0 %	0 %	378715555

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.