MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1101

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016904	GTTGTG	2	12	5246	5257	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016904	CCGTAG	2	12	5553	5564	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378715384
3	NC_016904	AACAGC	2	12	9742	9753	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	378715389
4	NC_016904	AGCCTC	2	12	20332	20343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	378715405
5	NC_016904	GGCGCT	2	12	21338	21349	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378715407
6	NC_016904	CAGGTG	2	12	21369	21380	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	378715407
7	NC_016904	GTGGCG	2	12	21459	21470	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378715407
8	NC_016904	GCCGGA	2	12	21710	21721	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	378715407
9	NC_016904	GGCTGT	2	12	23248	23259	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	378715409
10	NC_016904	GATATC	2	12	36231	36242	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	378715424
11	NC_016904	TATCAA	2	12	42474	42485	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	378715431
12	NC_016904	ACCGGT	2	12	48822	48833	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	378715436
13	NC_016904	CTTTTC	2	12	51245	51256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715437
14	NC_016904	TTCCGG	2	12	51437	51448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715437
15	NC_016904	AGTGTC	2	12	57551	57562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378715446
16	NC_016904	CGGCAA	2	12	59664	59675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715446
17	NC_016904	TTCGTC	2	12	72974	72985	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	378715459
18	NC_016904	CGTAGT	2	12	76640	76651	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378715462
19	NC_016904	GTTTAT	2	12	82702	82713	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016904	GTGAAA	2	12	84928	84939	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378715470
21	NC_016904	GGATGG	2	12	85978	85989	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016904	ATAGAT	3	18	86975	86992	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	378715473
23	NC_016904	AGTACA	2	12	87120	87131	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016904	ATGCTC	2	12	90009	90020	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	378715477
25	NC_016904	TGCTGA	2	12	91196	91207	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016904	AGCCGC	2	12	93188	93199	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016904	TGTTTT	2	12	93626	93637	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016904	TGACAC	2	12	95584	95595	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	378715482
29	NC_016904	TACGGT	2	12	95841	95852	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	378715482
30	NC_016904	CGGTGG	2	12	96727	96738	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	378715482
31	NC_016904	ACGGAA	2	12	97733	97744	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	378715483
32	NC_016904	ATGGGA	2	12	98844	98855	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	378715485
33	NC_016904	TTACTG	2	12	98927	98938	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	378715485
34	NC_016904	AGTGAA	2	12	99141	99152	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	378715485
35	NC_016904	ATTTTG	2	12	100983	100994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	378715488

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.