MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1101

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016904	GCAA	2	8	2687	2694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016904	TCGT	2	8	2722	2729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016904	TGTC	2	8	4647	4654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016904	ATCC	2	8	4887	4894	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016904	ATAC	2	8	7086	7093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_016904	AACA	2	8	9634	9641	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016904	TGTT	2	8	10336	10343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016904	CGGG	2	8	15059	15066	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016904	ACGG	2	8	18444	18451	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016904	TCAG	2	8	19849	19856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016904	GCCT	2	8	25529	25536	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016904	CTAT	2	8	28147	28154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016904	ATAA	2	8	29958	29965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016904	TACA	2	8	30225	30232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016904	AACT	2	8	31790	31797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016904	ATTT	2	8	39683	39690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016904	AGTT	2	8	40868	40875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016904	GCGG	2	8	40956	40963	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016904	TGGT	2	8	41017	41024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016904	TAAT	2	8	41801	41808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016904	AATG	2	8	41828	41835	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016904	CAAA	2	8	42192	42199	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016904	CCTG	2	8	61883	61890	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016904	TGCC	2	8	63658	63665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016904	CCGA	2	8	63686	63693	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016904	TGGT	2	8	63724	63731	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016904	ACAG	2	8	65227	65234	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016904	GTTT	2	8	65241	65248	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016904	AAAT	2	8	65271	65278	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016904	CTGG	2	8	65335	65342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016904	GTTA	2	8	79474	79481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016904	TAAG	2	8	79492	79499	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016904	GTTG	2	8	80433	80440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016904	GGCC	2	8	81624	81631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016904	TTTC	2	8	81672	81679	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016904	GGAT	2	8	81731	81738	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016904	TGCC	2	8	83185	83192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016904	CAAA	2	8	85440	85447	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016904	ACCC	2	8	85723	85730	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_016904	CCCG	2	8	85756	85763	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_016904	ATCA	2	8	86004	86011	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016904	CTGA	2	8	87219	87226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016904	GGCT	2	8	88731	88738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016904	ATAA	2	8	88937	88944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016904	ATTC	2	8	88950	88957	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016904	TACT	2	8	89035	89042	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016904	GCAG	2	8	91109	91116	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016904	TGCT	2	8	91306	91313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016904	TGAT	2	8	91498	91505	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016904	ATGG	2	8	91513	91520	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016904	TAGA	2	8	93295	93302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016904	CTTT	2	8	93781	93788	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016904	TCAG	2	8	103694	103701	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.