MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1101

Total Repeats: 1399

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016904	CTT	2	6	81	86	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016904	ATT	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715378
3	NC_016904	TGC	2	6	374	379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715378
4	NC_016904	TGC	2	6	533	538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715379
5	NC_016904	CGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715379
6	NC_016904	GAA	2	6	759	764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715379
7	NC_016904	ACC	2	6	864	869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715380
8	NC_016904	CAG	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715380
9	NC_016904	GAA	2	6	1158	1163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715380
10	NC_016904	CAA	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715380
11	NC_016904	CTG	2	6	1364	1369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
12	NC_016904	TCA	2	6	1450	1455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715380
13	NC_016904	CAG	2	6	1488	1493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715380
14	NC_016904	TGA	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715380
15	NC_016904	GGT	2	6	1665	1670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715380
16	NC_016904	AAG	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715380
17	NC_016904	CCG	2	6	1722	1727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715380
18	NC_016904	GTC	2	6	1728	1733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
19	NC_016904	CAG	2	6	1919	1924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715380
20	NC_016904	GCT	2	6	2152	2157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
21	NC_016904	AAT	2	6	2187	2192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715380
22	NC_016904	GGT	2	6	2216	2221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715380
23	NC_016904	TGC	2	6	2392	2397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715380
24	NC_016904	GTC	2	6	2436	2441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016904	GAC	2	6	2490	2495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016904	CCA	2	6	2515	2520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016904	TCA	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016904	TGA	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016904	TCA	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016904	TAT	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016904	CCA	2	6	3097	3102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715381
32	NC_016904	GAT	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715381
33	NC_016904	CTG	2	6	3177	3182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
34	NC_016904	CAC	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715381
35	NC_016904	CTG	2	6	3222	3227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
36	NC_016904	TTG	2	6	3283	3288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715381
37	NC_016904	GTC	2	6	3410	3415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
38	NC_016904	CAG	2	6	3456	3461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715381
39	NC_016904	CTG	2	6	3480	3485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
40	NC_016904	CGT	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715381
41	NC_016904	GAT	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715381
42	NC_016904	AGC	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715381
43	NC_016904	CGC	2	6	3724	3729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715381
44	NC_016904	CGG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016904	TGT	2	6	4004	4009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016904	ACC	2	6	4063	4068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016904	TGC	2	6	4122	4127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016904	CCA	2	6	4165	4170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715382
49	NC_016904	CAA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715382
50	NC_016904	ACC	2	6	4278	4283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715382
51	NC_016904	GCA	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715382
52	NC_016904	AAG	2	6	4310	4315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715382
53	NC_016904	CCT	2	6	4480	4485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016904	GTT	3	9	4492	4500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016904	ATC	2	6	4522	4527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016904	ATG	2	6	4623	4628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016904	TCC	2	6	4641	4646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016904	TTG	2	6	4858	4863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016904	CAC	2	6	5146	5151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715383
60	NC_016904	CCT	2	6	5231	5236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016904	GAT	2	6	5237	5242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016904	CAC	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715384
63	NC_016904	TCT	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715384
64	NC_016904	CAG	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715384
65	NC_016904	TTC	2	6	5634	5639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715384
66	NC_016904	CAC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715384
67	NC_016904	CTC	2	6	5870	5875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715384
68	NC_016904	AGC	2	6	5892	5897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715384
69	NC_016904	CGG	2	6	6127	6132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715384
70	NC_016904	CGT	2	6	6169	6174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715384
71	NC_016904	CTT	2	6	6333	6338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016904	CCT	2	6	6395	6400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016904	CTA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016904	TGT	2	6	6447	6452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016904	ATG	2	6	6502	6507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016904	TTA	2	6	6611	6616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016904	GAT	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016904	AAT	2	6	6816	6821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715385
79	NC_016904	TGC	2	6	6827	6832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715385
80	NC_016904	TGC	2	6	6955	6960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715385
81	NC_016904	TCT	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016904	TTA	2	6	7113	7118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016904	TGA	2	6	7191	7196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715386
84	NC_016904	GAG	2	6	7204	7209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715386
85	NC_016904	GAA	2	6	7237	7242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715386
86	NC_016904	CTG	2	6	7266	7271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715386
87	NC_016904	AGG	2	6	7370	7375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715386
88	NC_016904	GAA	2	6	7380	7385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715386
89	NC_016904	AGC	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715386
90	NC_016904	TAA	2	6	7563	7568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715386
91	NC_016904	CCG	2	6	7577	7582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715386
92	NC_016904	TGC	2	6	7685	7690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715386
93	NC_016904	CAT	2	6	7725	7730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715386
94	NC_016904	ATG	2	6	7778	7783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715386
95	NC_016904	GCT	2	6	7849	7854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715386
96	NC_016904	ATC	2	6	7918	7923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715386
97	NC_016904	TGA	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715386
98	NC_016904	CGG	2	6	8035	8040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715387
99	NC_016904	CTG	2	6	8091	8096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715387
100	NC_016904	TGC	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715387
101	NC_016904	AGC	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715387
102	NC_016904	GCC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715387
103	NC_016904	CAG	2	6	8313	8318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715387
104	NC_016904	TGG	2	6	8374	8379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715387
105	NC_016904	TAA	2	6	8408	8413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715387
106	NC_016904	GCC	2	6	8493	8498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715387
107	NC_016904	GGT	2	6	8955	8960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715388
108	NC_016904	TTG	2	6	8989	8994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715388
109	NC_016904	AAG	2	6	9354	9359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715388
110	NC_016904	TGA	2	6	9409	9414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715388
111	NC_016904	AGG	2	6	9503	9508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715388
112	NC_016904	GAA	2	6	9531	9536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715388
113	NC_016904	TGG	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715389
114	NC_016904	CTT	3	9	9726	9734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715389
115	NC_016904	GTC	2	6	9792	9797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715389
116	NC_016904	TTC	2	6	10020	10025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016904	ATG	2	6	10139	10144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016904	TGA	2	6	10392	10397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
119	NC_016904	GGA	2	6	10428	10433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715390
120	NC_016904	GAT	2	6	10498	10503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
121	NC_016904	TGT	2	6	10611	10616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715390
122	NC_016904	CAG	2	6	10636	10641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715390
123	NC_016904	CAA	2	6	10707	10712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715390
124	NC_016904	TTC	2	6	10811	10816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715390
125	NC_016904	GAT	2	6	10861	10866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
126	NC_016904	GGT	2	6	10891	10896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715390
127	NC_016904	TTA	2	6	11156	11161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715390
128	NC_016904	ATG	2	6	11171	11176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
129	NC_016904	TCA	2	6	11177	11182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715390
130	NC_016904	TGG	3	9	11217	11225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715390
131	NC_016904	GAA	2	6	11250	11255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715390
132	NC_016904	TGA	2	6	11271	11276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
133	NC_016904	GGT	2	6	11338	11343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715390
134	NC_016904	TGA	2	6	11356	11361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715390
135	NC_016904	GCT	2	6	11376	11381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715391
136	NC_016904	GCG	2	6	11495	11500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715391
137	NC_016904	GAT	2	6	11567	11572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715391
138	NC_016904	TAA	2	6	11575	11580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715391
139	NC_016904	CTC	2	6	11682	11687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715391
140	NC_016904	AGA	2	6	11732	11737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715391
141	NC_016904	TCA	2	6	11953	11958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715392
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143	NC_016904	GCG	2	6	12064	12069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715392
144	NC_016904	AAT	2	6	12072	12077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715392
145	NC_016904	GTC	2	6	12172	12177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715392
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149	NC_016904	CTT	2	6	12323	12328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715392
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153	NC_016904	TCT	2	6	12848	12853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715392
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157	NC_016904	AAC	2	6	13416	13421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715393
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162	NC_016904	TAA	2	6	13770	13775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_016904	ATT	2	6	13801	13806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016904	CTG	2	6	13850	13855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715395
165	NC_016904	CTG	2	6	13860	13865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715395
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170	NC_016904	GCG	2	6	14195	14200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715396
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253	NC_016904	GCG	2	6	19186	19191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_016904	GGC	2	6	19319	19324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_016904	GTC	2	6	19330	19335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_016904	GCT	2	6	19356	19361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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258	NC_016904	CGC	2	6	19461	19466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
259	NC_016904	GCA	2	6	19534	19539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_016904	GCC	2	6	19552	19557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
261	NC_016904	AGG	2	6	19777	19782	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
262	NC_016904	CTC	2	6	19791	19796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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385	NC_016904	GTT	2	6	26594	26599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715413
386	NC_016904	GCT	2	6	26772	26777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715413
387	NC_016904	GAT	2	6	26953	26958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715413
388	NC_016904	TCA	2	6	27000	27005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715413
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391	NC_016904	GAT	2	6	27478	27483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715414
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396	NC_016904	CAG	2	6	27647	27652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715415
397	NC_016904	CAG	2	6	27762	27767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715415
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401	NC_016904	CCG	2	6	28192	28197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715416
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500	NC_016904	GTT	2	6	34686	34691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715423

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