MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1101

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016904	GC	3	6	157	162	0 %	0 %	50 %	50 %	378715378
2	NC_016904	CA	3	6	674	679	50 %	0 %	0 %	50 %	378715379
3	NC_016904	TG	3	6	818	823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016904	AT	3	6	1307	1312	50 %	50 %	0 %	0 %	378715380
5	NC_016904	CG	3	6	2271	2276	0 %	0 %	50 %	50 %	378715380
6	NC_016904	GC	3	6	3086	3091	0 %	0 %	50 %	50 %	378715381
7	NC_016904	GC	3	6	3296	3301	0 %	0 %	50 %	50 %	378715381
8	NC_016904	TC	3	6	3889	3894	0 %	50 %	0 %	50 %	378715381
9	NC_016904	GA	3	6	3900	3905	50 %	0 %	50 %	0 %	378715381
10	NC_016904	CA	3	6	4568	4573	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016904	CG	3	6	5785	5790	0 %	0 %	50 %	50 %	378715384
12	NC_016904	GA	3	6	5990	5995	50 %	0 %	50 %	0 %	378715384
13	NC_016904	CT	3	6	6159	6164	0 %	50 %	0 %	50 %	378715384
14	NC_016904	TG	3	6	6219	6224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016904	GA	3	6	6753	6758	50 %	0 %	50 %	0 %	378715385
16	NC_016904	AT	3	6	7161	7166	50 %	50 %	0 %	0 %	378715386
17	NC_016904	AT	3	6	7937	7942	50 %	50 %	0 %	0 %	378715386
18	NC_016904	GC	3	6	8176	8181	0 %	0 %	50 %	50 %	378715387
19	NC_016904	AT	3	6	8783	8788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016904	GT	3	6	9571	9576	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016904	AT	3	6	9907	9912	50 %	50 %	0 %	0 %	378715389
22	NC_016904	AG	3	6	9926	9931	50 %	0 %	50 %	0 %	378715389
23	NC_016904	TG	3	6	9992	9997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016904	TG	3	6	10230	10235	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016904	TG	3	6	11210	11215	0 %	50 %	50 %	0 %	378715390
26	NC_016904	GC	3	6	11473	11478	0 %	0 %	50 %	50 %	378715391
27	NC_016904	TG	3	6	12091	12096	0 %	50 %	50 %	0 %	378715392
28	NC_016904	GA	3	6	12698	12703	50 %	0 %	50 %	0 %	378715392
29	NC_016904	GC	3	6	12924	12929	0 %	0 %	50 %	50 %	378715392
30	NC_016904	CA	3	6	12933	12938	50 %	0 %	0 %	50 %	378715392
31	NC_016904	GC	3	6	13302	13307	0 %	0 %	50 %	50 %	378715393
32	NC_016904	CA	4	8	13783	13790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016904	GT	3	6	13965	13970	0 %	50 %	50 %	0 %	378715395
34	NC_016904	AC	3	6	14374	14379	50 %	0 %	0 %	50 %	378715396
35	NC_016904	TG	3	6	14579	14584	0 %	50 %	50 %	0 %	378715396
36	NC_016904	CA	3	6	15908	15913	50 %	0 %	0 %	50 %	378715398
37	NC_016904	GC	3	6	16139	16144	0 %	0 %	50 %	50 %	378715399
38	NC_016904	GC	3	6	16504	16509	0 %	0 %	50 %	50 %	378715400
39	NC_016904	TG	3	6	17440	17445	0 %	50 %	50 %	0 %	378715401
40	NC_016904	CT	3	6	18293	18298	0 %	50 %	0 %	50 %	378715402
41	NC_016904	GC	3	6	18720	18725	0 %	0 %	50 %	50 %	378715403
42	NC_016904	CG	3	6	19131	19136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016904	GT	3	6	19507	19512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016904	TG	3	6	20423	20428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016904	CG	3	6	21362	21367	0 %	0 %	50 %	50 %	378715407
46	NC_016904	TG	4	8	21917	21924	0 %	50 %	50 %	0 %	378715407
47	NC_016904	TG	3	6	22639	22644	0 %	50 %	50 %	0 %	378715407
48	NC_016904	TC	3	6	23005	23010	0 %	50 %	0 %	50 %	378715408
49	NC_016904	GT	3	6	25854	25859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016904	AT	3	6	26283	26288	50 %	50 %	0 %	0 %	378715413
51	NC_016904	GC	3	6	27219	27224	0 %	0 %	50 %	50 %	378715414
52	NC_016904	CT	3	6	28100	28105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016904	CG	3	6	28401	28406	0 %	0 %	50 %	50 %	378715416
54	NC_016904	CA	3	6	29641	29646	50 %	0 %	0 %	50 %	378715419
55	NC_016904	GT	3	6	30131	30136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016904	GA	3	6	30262	30267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016904	GC	3	6	30614	30619	0 %	0 %	50 %	50 %	378715420
58	NC_016904	TC	3	6	31532	31537	0 %	50 %	0 %	50 %	378715421
59	NC_016904	TC	3	6	31751	31756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016904	TC	3	6	32043	32048	0 %	50 %	0 %	50 %	378715422
61	NC_016904	CA	3	6	33827	33832	50 %	0 %	0 %	50 %	378715423
62	NC_016904	CA	3	6	34270	34275	50 %	0 %	0 %	50 %	378715423
63	NC_016904	GA	3	6	36313	36318	50 %	0 %	50 %	0 %	378715424
64	NC_016904	CA	3	6	36531	36536	50 %	0 %	0 %	50 %	378715424
65	NC_016904	CA	3	6	37623	37628	50 %	0 %	0 %	50 %	378715425
66	NC_016904	AG	3	6	38060	38065	50 %	0 %	50 %	0 %	378715425
67	NC_016904	CT	3	6	38847	38852	0 %	50 %	0 %	50 %	378715426
68	NC_016904	TG	3	6	39246	39251	0 %	50 %	50 %	0 %	378715426
69	NC_016904	AT	3	6	40067	40072	50 %	50 %	0 %	0 %	378715427
70	NC_016904	TA	3	6	40324	40329	50 %	50 %	0 %	0 %	378715427
71	NC_016904	AG	3	6	40755	40760	50 %	0 %	50 %	0 %	378715427
72	NC_016904	AT	3	6	41919	41924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016904	TG	3	6	42427	42432	0 %	50 %	50 %	0 %	378715431
74	NC_016904	AT	3	6	42524	42529	50 %	50 %	0 %	0 %	378715431
75	NC_016904	TA	3	6	42856	42861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016904	TC	3	6	42893	42898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016904	AT	3	6	42918	42923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016904	AT	4	8	43342	43349	50 %	50 %	0 %	0 %	378715432
79	NC_016904	CT	3	6	44178	44183	0 %	50 %	0 %	50 %	378715432
80	NC_016904	CA	3	6	45136	45141	50 %	0 %	0 %	50 %	378715432
81	NC_016904	AT	3	6	46080	46085	50 %	50 %	0 %	0 %	378715434
82	NC_016904	GT	3	6	46393	46398	0 %	50 %	50 %	0 %	378715434
83	NC_016904	AG	3	6	48005	48010	50 %	0 %	50 %	0 %	378715436
84	NC_016904	GC	3	6	48449	48454	0 %	0 %	50 %	50 %	378715436
85	NC_016904	AG	3	6	48842	48847	50 %	0 %	50 %	0 %	378715436
86	NC_016904	CA	3	6	48848	48853	50 %	0 %	0 %	50 %	378715436
87	NC_016904	TG	3	6	49747	49752	0 %	50 %	50 %	0 %	378715436
88	NC_016904	AG	3	6	50445	50450	50 %	0 %	50 %	0 %	378715436
89	NC_016904	AG	3	6	50906	50911	50 %	0 %	50 %	0 %	378715437
90	NC_016904	GT	3	6	51328	51333	0 %	50 %	50 %	0 %	378715437
91	NC_016904	AT	3	6	52184	52189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016904	TG	3	6	53219	53224	0 %	50 %	50 %	0 %	378715441
93	NC_016904	AT	3	6	54118	54123	50 %	50 %	0 %	0 %	378715442
94	NC_016904	AG	3	6	55386	55391	50 %	0 %	50 %	0 %	378715443
95	NC_016904	GA	3	6	56807	56812	50 %	0 %	50 %	0 %	378715446
96	NC_016904	CT	3	6	57719	57724	0 %	50 %	0 %	50 %	378715446
97	NC_016904	TG	3	6	57854	57859	0 %	50 %	50 %	0 %	378715446
98	NC_016904	GA	3	6	60767	60772	50 %	0 %	50 %	0 %	378715447
99	NC_016904	AT	3	6	60877	60882	50 %	50 %	0 %	0 %	378715447
100	NC_016904	AT	3	6	61688	61693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016904	GC	4	8	62738	62745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016904	AT	3	6	63309	63314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016904	GA	3	6	64702	64707	50 %	0 %	50 %	0 %	378715449
104	NC_016904	AC	3	6	65021	65026	50 %	0 %	0 %	50 %	378715450
105	NC_016904	GA	3	6	66305	66310	50 %	0 %	50 %	0 %	378715452
106	NC_016904	AT	3	6	67693	67698	50 %	50 %	0 %	0 %	378715453
107	NC_016904	AC	3	6	68731	68736	50 %	0 %	0 %	50 %	378715454
108	NC_016904	AT	3	6	69568	69573	50 %	50 %	0 %	0 %	378715454
109	NC_016904	TA	3	6	69837	69842	50 %	50 %	0 %	0 %	378715454
110	NC_016904	AC	3	6	70153	70158	50 %	0 %	0 %	50 %	378715455
111	NC_016904	TA	3	6	70171	70176	50 %	50 %	0 %	0 %	378715455
112	NC_016904	GT	4	8	70524	70531	0 %	50 %	50 %	0 %	378715455
113	NC_016904	GA	3	6	70638	70643	50 %	0 %	50 %	0 %	378715455
114	NC_016904	CT	3	6	70741	70746	0 %	50 %	0 %	50 %	378715456
115	NC_016904	TG	3	6	71372	71377	0 %	50 %	50 %	0 %	378715457
116	NC_016904	AG	3	6	72693	72698	50 %	0 %	50 %	0 %	378715458
117	NC_016904	GC	3	6	74018	74023	0 %	0 %	50 %	50 %	378715459
118	NC_016904	GA	3	6	74232	74237	50 %	0 %	50 %	0 %	378715459
119	NC_016904	TC	3	6	77632	77637	0 %	50 %	0 %	50 %	378715462
120	NC_016904	CT	3	6	77684	77689	0 %	50 %	0 %	50 %	378715462
121	NC_016904	AT	3	6	77926	77931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016904	TA	3	6	79461	79466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016904	GA	3	6	79547	79552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016904	AT	3	6	79857	79862	50 %	50 %	0 %	0 %	378715465
125	NC_016904	GT	3	6	80078	80083	0 %	50 %	50 %	0 %	378715465
126	NC_016904	TC	3	6	81599	81604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016904	AT	3	6	82621	82626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016904	GA	3	6	84007	84012	50 %	0 %	50 %	0 %	378715470
129	NC_016904	CA	3	6	84647	84652	50 %	0 %	0 %	50 %	378715470
130	NC_016904	GC	3	6	85076	85081	0 %	0 %	50 %	50 %	378715470
131	NC_016904	CA	3	6	85704	85709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016904	CA	3	6	86699	86704	50 %	0 %	0 %	50 %	378715472
133	NC_016904	TG	4	8	86722	86729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016904	TA	3	6	87495	87500	50 %	50 %	0 %	0 %	378715474
135	NC_016904	TA	3	6	87982	87987	50 %	50 %	0 %	0 %	378715475
136	NC_016904	CA	3	6	88057	88062	50 %	0 %	0 %	50 %	378715475
137	NC_016904	AT	3	6	88906	88911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016904	TC	3	6	88912	88917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016904	GC	3	6	90952	90957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016904	CT	3	6	91002	91007	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016904	AC	3	6	91039	91044	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016904	GA	3	6	91121	91126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016904	AG	3	6	91178	91183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016904	TG	3	6	92315	92320	0 %	50 %	50 %	0 %	378715478
145	NC_016904	TG	3	6	92613	92618	0 %	50 %	50 %	0 %	378715478
146	NC_016904	AT	3	6	93939	93944	50 %	50 %	0 %	0 %	378715480
147	NC_016904	TG	4	8	94733	94740	0 %	50 %	50 %	0 %	378715482
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149	NC_016904	AC	3	6	97033	97038	50 %	0 %	0 %	50 %	378715482
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.