MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli KO11FL plasmid pEKO1102

Total Repeats: 59

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016903	TGA	3	9	61	69	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715371
2	NC_016903	AAC	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715371
3	NC_016903	GCG	2	6	121	126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715371
4	NC_016903	CCG	2	6	179	184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715371
5	NC_016903	GGT	2	6	277	282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715371
6	NC_016903	GTC	2	6	329	334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715371
7	NC_016903	GAT	2	6	353	358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715371
8	NC_016903	GGT	2	6	384	389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715372
9	NC_016903	GAA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715372
10	NC_016903	GAA	2	6	503	508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715372
11	NC_016903	GCC	2	6	548	553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715372
12	NC_016903	GGA	2	6	555	560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715372
13	NC_016903	TAC	2	6	720	725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715372
14	NC_016903	TCC	2	6	826	831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715372
15	NC_016903	CGG	2	6	1007	1012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715372
16	NC_016903	ACG	2	6	1121	1126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
17	NC_016903	CAG	2	6	1131	1136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
18	NC_016903	GGA	2	6	1218	1223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715372
19	NC_016903	GAT	2	6	1260	1265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715372
20	NC_016903	GCA	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
21	NC_016903	CGG	2	6	1371	1376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715372
22	NC_016903	GAA	2	6	1396	1401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715372
23	NC_016903	GAA	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715372
24	NC_016903	CAG	2	6	1508	1513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
25	NC_016903	AGC	2	6	1604	1609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
26	NC_016903	AGA	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715372
27	NC_016903	CAG	2	6	1732	1737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715372
28	NC_016903	TCA	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715373
29	NC_016903	ATT	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715373
30	NC_016903	GTT	2	6	2582	2587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715373
31	NC_016903	AAC	2	6	2768	2773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715373
32	NC_016903	CAT	2	6	2971	2976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715373
33	NC_016903	ATG	2	6	3124	3129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715373
34	NC_016903	GTT	2	6	3134	3139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715373
35	NC_016903	ATT	2	6	3238	3243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715374
36	NC_016903	ATC	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715374
37	NC_016903	TGA	2	6	3270	3275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715374
38	NC_016903	TAT	2	6	3330	3335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715374
39	NC_016903	GAT	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715374
40	NC_016903	GTT	2	6	3421	3426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715374
41	NC_016903	TCT	2	6	3433	3438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
42	NC_016903	ATC	2	6	3453	3458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715374
43	NC_016903	ACC	2	6	3466	3471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715374
44	NC_016903	GCT	2	6	3531	3536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715374
45	NC_016903	TTG	2	6	3638	3643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715374
46	NC_016903	TCT	2	6	3697	3702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
47	NC_016903	TCT	2	6	3806	3811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
48	NC_016903	TAT	2	6	3894	3899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	378715374
49	NC_016903	TCT	2	6	3930	3935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
50	NC_016903	AAT	2	6	3980	3985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715374
51	NC_016903	CTT	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
52	NC_016903	TAG	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	378715374
53	NC_016903	AAT	2	6	4023	4028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	378715374
54	NC_016903	TTC	2	6	4057	4062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715374
55	NC_016903	CCA	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715375
56	NC_016903	CCA	2	6	4702	4707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715375
57	NC_016903	TTC	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715375
58	NC_016903	CGC	2	6	4855	4860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715375
59	NC_016903	TCA	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715376

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.