MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli KO11FL chromosome

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016902	ACATAA	2	12	23634	23645	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016902	TGACCG	2	12	50698	50709	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016902	TTGATT	2	12	57031	57042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016902	GATAAA	2	12	126431	126442	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016902	TAAATA	2	12	192901	192912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016902	GGCAAA	2	12	203200	203211	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016902	TCTCCC	2	12	234129	234140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016902	TGAAAT	2	12	245635	245646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016902	GCATCT	2	12	255745	255756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016902	TATTTC	2	12	256634	256645	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016902	GTTTTT	2	12	304638	304649	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016902	GAATGA	2	12	323465	323476	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016902	TAAATT	2	12	361259	361270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016902	ATAGGG	2	12	364052	364063	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016902	GTATCT	2	12	563939	563950	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016902	ATGCAG	2	12	582653	582664	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016902	TTATAT	2	12	598762	598773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016902	ATAAAA	2	12	609528	609539	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016902	AATGCA	2	12	611425	611436	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016902	CGGTTA	2	12	622295	622306	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016902	AGGGAG	2	12	654199	654210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016902	ATCATT	2	12	676811	676822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016902	AAAAAG	2	12	677646	677657	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016902	TACAAC	2	12	682321	682332	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016902	GGGGTG	2	12	690111	690122	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016902	TTAAAT	2	12	755661	755672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016902	ACGAAA	2	12	768860	768871	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016902	CTCAGT	2	12	823954	823965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016902	ACGCAG	2	12	837627	837638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016902	CCTCAC	2	12	860219	860230	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016902	TCGCGA	2	12	868042	868053	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016902	AAATAA	2	12	919160	919171	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016902	AAAATT	2	12	920890	920901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016902	ATGATT	2	12	928602	928613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016902	TTGCAT	2	12	988508	988519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016902	AACAAA	2	12	1005475	1005486	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016902	TCTTGT	2	12	1030249	1030260	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016902	AAAACC	2	12	1034580	1034591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016902	AAACCG	2	12	1048724	1048735	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016902	ATATCA	2	12	1139681	1139692	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016902	AAACTG	2	12	1230602	1230613	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016902	TGTCCA	2	12	1245207	1245218	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016902	TGCACT	2	12	1395422	1395433	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016902	CATAAC	2	12	1408543	1408554	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016902	CATCAG	2	12	1426385	1426396	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016902	ATATTT	2	12	1442441	1442452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016902	GTTAAC	2	12	1445134	1445145	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016902	GTTAAC	2	12	1445198	1445209	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016902	TTTTCT	2	12	1523384	1523395	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016902	GTGACA	2	12	1533664	1533675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016902	GGGTAA	2	12	1565164	1565175	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016902	TAGTGG	2	12	1596091	1596102	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016902	GGAAGA	2	12	1672620	1672631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016902	GAAAAT	2	12	1708382	1708393	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016902	GTAAGG	2	12	1732178	1732189	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016902	GTAAGG	2	12	1732786	1732797	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016902	AGGGGG	2	12	1814124	1814135	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016902	TGTCTG	2	12	1903664	1903675	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016902	TCAGCG	2	12	1907680	1907691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016902	GTCAGG	2	12	1908200	1908211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016902	TAAATA	2	12	1920500	1920511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016902	ATACAC	2	12	1941927	1941938	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016902	ATAAGA	2	12	1956745	1956756	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016902	TGAATT	2	12	1970561	1970572	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016902	CATTAA	2	12	1977686	1977697	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016902	GACAGT	2	12	2020182	2020193	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016902	ATGGTT	2	12	2063836	2063847	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016902	AAAGAA	2	12	2067781	2067792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016902	CTGTTC	2	12	2156022	2156033	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016902	CTTTTT	2	12	2194878	2194889	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016902	AGTCTT	2	12	2203800	2203811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016902	AAAACA	2	12	2204060	2204071	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016902	TTATTT	2	12	2204692	2204703	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016902	TAAGTA	2	12	2218349	2218360	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016902	GTTTTT	2	12	2320826	2320837	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016902	GAAAAA	2	12	2354259	2354270	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016902	ATATTT	2	12	2355980	2355991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016902	CAGAAA	2	12	2376946	2376957	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016902	CATAAC	2	12	2417460	2417471	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016902	TAACGG	2	12	2426291	2426302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016902	TATGAA	2	12	2429578	2429589	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016902	ATTAAT	2	12	2440476	2440487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016902	GTTTTT	2	12	2441165	2441176	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016902	GCTTAT	2	12	2465046	2465057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016902	TCACTT	2	12	2587783	2587794	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016902	TTAAAT	2	12	2598797	2598808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016902	AGTTAT	2	12	2660377	2660388	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016902	AACTTT	2	12	2700356	2700367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016902	GATCAG	2	12	2704610	2704621	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016902	ACCCCC	2	12	2706868	2706879	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
91	NC_016902	CGCAGC	2	12	2733499	2733510	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016902	AGCCTG	2	12	2772692	2772703	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016902	GCCTGT	2	12	2791128	2791139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016902	ACTGTC	2	12	2791466	2791477	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016902	ACAAAA	2	12	2793480	2793491	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016902	CTTTTT	2	12	2807229	2807240	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016902	TTTTTG	2	12	2876669	2876680	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016902	AAATAA	2	12	2878758	2878769	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016902	GCCATC	2	12	2933471	2933482	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016902	ATCATT	2	12	2933858	2933869	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016902	CATTAT	2	12	2965831	2965842	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016902	TCCTTA	2	12	2967245	2967256	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016902	TGGACA	2	12	2989512	2989523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016902	ATCTTT	2	12	3010310	3010321	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_016902	TTTGTT	2	12	3046378	3046389	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016902	CAAAAA	2	12	3046395	3046406	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016902	TGGCCG	2	12	3047999	3048010	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016902	GCTGGC	2	12	3050949	3050960	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016902	CGGTTA	2	12	3083352	3083363	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016902	CATGCA	2	12	3144336	3144347	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016902	CTTCTG	2	12	3145099	3145110	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016902	ACGCAG	2	12	3240564	3240575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016902	AGGTAA	2	12	3321362	3321373	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016902	TATTTT	2	12	3336525	3336536	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016902	CGTCCC	2	12	3351572	3351583	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016902	CGATAA	2	12	3418798	3418809	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016902	ATTTGC	2	12	3428360	3428371	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016902	TCACCA	2	12	3432686	3432697	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016902	CGCCTG	2	12	3542325	3542336	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016902	ATTGTT	2	12	3628534	3628545	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016902	TATCAA	2	12	3649614	3649625	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016902	GAAATA	2	12	3719585	3719596	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016902	AAGAAA	2	12	3720621	3720632	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016902	TTCATT	2	12	3729916	3729927	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016902	TCCACA	2	12	3731008	3731019	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016902	CCCTTA	2	12	3732155	3732166	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016902	ACCAGA	2	12	3740357	3740368	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016902	CTGCAC	2	12	3746501	3746512	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016902	TCGTTT	2	12	3765423	3765434	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_016902	TCTCCC	2	12	3772508	3772519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_016902	TCTCCC	2	12	3772572	3772583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_016902	TCTCCC	2	12	3779775	3779786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_016902	AAAAAC	2	12	3782556	3782567	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_016902	AAAGGA	2	12	3802485	3802496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016902	GCTTAT	2	12	3843322	3843333	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_016902	AGGGTG	2	12	3945940	3945951	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016902	AGGGAG	2	12	3945991	3946002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016902	TCCCTT	2	12	4025885	4025896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016902	AAACAA	2	12	4059028	4059039	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_016902	AGTGAA	2	12	4091013	4091024	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016902	ATTTTC	2	12	4100000	4100011	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_016902	ATGGTG	2	12	4111672	4111683	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016902	TGATAA	2	12	4146338	4146349	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016902	ATCATT	2	12	4146431	4146442	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_016902	AATGAA	2	12	4156171	4156182	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016902	TCCTGT	2	12	4206128	4206139	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016902	TTTAAA	2	12	4256887	4256898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016902	TTTATT	2	12	4275261	4275272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016902	ATTTTA	2	12	4277970	4277981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016902	GTGAAA	2	12	4281775	4281786	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016902	ATTAAA	2	12	4330192	4330203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016902	AGAAAA	2	12	4351268	4351279	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016902	AATAAA	2	12	4362730	4362741	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016902	GTTTTT	2	12	4375559	4375570	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016902	ATTGAA	2	12	4386038	4386049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016902	AAATTA	2	12	4386317	4386328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016902	GAAAAA	2	12	4390023	4390034	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016902	ACCATC	2	12	4437374	4437385	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_016902	TCGGCC	2	12	4437756	4437767	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
160	NC_016902	TCTCCC	2	12	4446351	4446362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_016902	GATATT	2	12	4456143	4456154	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016902	AAAGAC	2	12	4482510	4482521	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_016902	AAAATG	2	12	4539886	4539897	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016902	AAGAAA	2	12	4628833	4628844	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016902	GGTGAA	2	12	4652655	4652666	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016902	TTAGTT	2	12	4668656	4668667	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016902	TGAATG	2	12	4684361	4684372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016902	TTTTAT	2	12	4699189	4699200	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016902	TCACCC	2	12	4706086	4706097	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_016902	ACTCCC	2	12	4714629	4714640	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
171	NC_016902	CTTACG	2	12	4741667	4741678	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_016902	TATTTA	2	12	4757961	4757972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016902	TCTCCC	2	12	4842316	4842327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_016902	AAAAAG	2	12	4860460	4860471	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.